Ll_transcript_232904

• Id Trinity: FTRINITY_DN50342_c0_g1_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_232904
• Sequence: CCCTAGGTGGTGCTATCACAGTGTCGTTACTCCAAAGAGAATAAAAGAGTTGAATTGAAACCTAAACATTTGAACCTCTTCTTCTCCGCGAAACCCTAAC AATGGCTACCTCCATAGCCTCTCAGCTCCAAGCTATCAGATCACTCGTCCAATCCGACTCTCACTCTCTCAAGAGACCTTTCTCTCGCCCTTCCATCCTG TTCGATCCTAAGGAAGCTGCTGATATCGATCTCCAATCTATTTTCAACATCGCACTCGAAGGTTTGGAGGTTCTTATAAGCGCAGATGAGCGGTTCAGGA ACTATAAGAACGATTTGTTCAGCCACCGAAGTAAAGAGTTGGATAGAGAGTTGATGGGCATAGAGCAGAACAATCAACTCAATTCATCCATTGCTTCATA TTTAAAGTTACTTTCAGGCTATTTTCATCTTCCGTCAGCTCTTAAAACAATTGAGTACTTGATACGTAGACACAAGGTTCATGTATACAACACCGAAGAG TTGATTCTATGTGCTCTGCCTTTCCATGACACACATGAATTTGTTCGAATAGTACAGATACTTGACACAAGGAATAATACCAAATGGGGGTTTCTCGATG GTGTGAAAGTCTCTGGTGCACCACCACCTAGAACTGTCATAGTGCAGCAGTGTATACGTGACAAGGGTATCTTAGAAGTTCTAAGTAACTATGCATCCCC GTCAAAAAAGTTTCAACCTTCAAGGCATGTAATAGGTTTCTGTACTGCTGTTTTTGTTGAAGTTTTGGGTAGTTCTGTAACGGTTAATGATGATGTAGTC AAGAGAATACTTCCTTACGTGGTCTCTGGTCTTCAGTCTGGCATTAAGGGCATTTCAGACCACAAGGCTGGTTCTTTAATGATTGTTGGTTTACTTGGAA ATAGAGCTGCATTAGCTCCCAAACTTCTGAACAGTCTGATACGTTCAGTCGCTGAGGTTGCTCGTGAGGAGGCAAAAGAGTTAACTGATCTTCAGTGGTT TCGGCTGTCCATAATTGCCTTGATAAATCTTGTTCAGTCACAAAATGTTGACATACTTCCTACCAAGGCATTGGAGATTCTAAAAGAAATAAGGGACTTG GCAGAGGTTTTGTTAGAATTGTCTAGGGAGTTCAATATTGAAAAATTTCTTCTTGTGCTTTTGGACTCCCTGATTAACTGCAGTTCTTCTGATGAATACT GTCAACGGGCTTTGCTATCTATAATAGAAAAAGTCCCCATCAGTGGATCTGTTTATCATGTGGTCACTAAGATCCTATCAACTTGTGTGAAATTATCACA AAAAACTGGTGACTCAGCATCTTCCGTGTCAGCTGGGTGGGCAAAAAAAATTATGATAATTGTTAATACGAAGTATCCTTCTGCACTACGTGGAGCAGTT CAGCATTTCCTTCAGGATAATAAAGCGCATTCTATGAAAGATGACAAACTATATAAGGTTTTATGTAAGATGTTGGATGGCAATTTGGACTCATCACATG GTATATCAGATTCAAAAATTTGGTTTGCCTTGCATCATCCGAAGGCTGATGTTAGACGTGCTACATTGCTTGATTTAAATTCATCTGGCATGCTGAAGAC CAAAGCAGTTGCTTCAGAGAGTCTTATAGACATCGAAGAGGCAATATTGAGACAGCTTGATGATAAAGATCTAACAGTTGTTCAAGCAGCATTATCTATT GATGGCTTGCAAAATGCAATAGATTCTTCTAAGCTTCTTGATGCACTGCAGAAGGTGCTAAGAAAATGTTTTGGCATGCTGGTGTCTGGTTCAACTGAAA ACATTAGTTTAACCGTCAATGTTTGTGTCATTTGTCTAAAGAATGCCATTTCATACTTCCATGATCTTAGTGGTTACTTGAACAAAGTTGCTTCCATGAT TTTTCCTTTACTCCTTGTTTTACTACAGACACAACACTTGAATTTGAAGGCTCTTGGTTTAGTTGAAAAAATAAACTGGCCACTTTATCAGAACATTGCT GTTTCTTCCCCTGGAGAATTGACATCAATACCTGGAAGTTTATCTTCAATTAACTTGAGAACTATCAATAACATGGCCGAGAATTTCATGGTCCAACCTG AAGATCATATTGCTTGGTTTGTTGACAACTGCAGTGATTTGGAATTGTCGAAGACATTGTTCTTTTTTGTTGTATTGCAATCTCTTTTGATCAAACCAAA AGGCGATGACTTCTCTGCACTTTTTGAAAGTGTATTTCCTATTCTAAAGGCTGAGTGGAAATCCTTAGTGACTGCTGGTGATGTTCCCTTGGAAGAGTTT AATTCGGAAATGTTAGACTGGGATTGCAGTGCATTCTTTGATCATCTTTCGGTTGCTAGTCTTGGACCTTTAAATACAAAACTATTGGTTTGCATATTTT GGAGGCTGCTATCAGCACTAATATCAGTAGTTCCTTCAGATATTATACTGGATGATGATAATAAGTGGGTCAGCAGGATAAAGGACCTGTTTGTATTTTT TGCAACCTCACAATTCAAGAATTCTTTCAATGAACACCTCCATTACTTAGCGGCACATTGCAAAATATCACCTGCCCGCCTCTTATCTAAGTTCTTCACA GGGGAAGGTGTTCCTGTTGCAGTCCAGGTTGAAAGTCTGCAGTGCTATACTTTTCTCTGTAGTTTGTCACAAGATAGATGGCAAATTGAACTTTTAGCCG AATTTCCTTCCGTGCTTGTTCCATTGGCTGGTGATAACCAGACTATAAGGATTGCTGCCATGAACTGTATCGATGGGCTACATGCATTGTGGTGTCGTAT CGAACCTCCTGGCAAGAAAAATGGTAGCAATTTTCTTGGTGAATGCAATTTTCTCGGTGAACTTCTACGGTTGATGGATGAGCAAAAAACACTTATATTG TCTGACAGGAAATTTCTTCCTTCTCTGTTTGCATCCATGCTGAGCTTATCCTGTCATAACATCTTAGTACCTCAAAATATAGAAAACAGGTTTGATCAGC CTGCAAAAGAAAAAATTCTTGGATTCATATTGCGTTCTGTTCCGAAATTCTCTAACTATGGGAAGCTAATGATTTTATCCTTGCTCAAAGGAATTGGGAG TGTTATTATGCACGTCAAAGAATACTGTGATGTGCTAGATACATCTTGTCAGAAATTGTCAAAAACTGAAATTCAGATAAAGTGCCTTTTGCTGGAGAGC TGTGTTATGTCATATTCTTCTGGTGGAAATGATCTGCAAGGTCATTTACTGAAGGCTTTGCAGTTGGATGCTACGACTTCAGATGACCCTGCGTATGTAG AGCCATGTATCACTGTCTTAAACAAACTTCACAACGAATTCTATAAGGGGTTGAAGAATGAAGTGAAGGAGCTTTTATTTTGTGAGCTTGTATTTTTGTG CCGCAATGCTAATGGTGCCATACAGAGTGCAACCAGAGATGCCATAATGCGTATAGATATTGATTTCTCGACTGTTGGTCACATGCTTGATCTCATAATT AAACATGAAAATTTTGTGGGTAGTTCAATGTATGAAAAGACGGCGAAGAAACAGAAATTGACAGTAAATCAAGACGCAGACCTTCCCCCAAGTGACATAT GTGGAGGAGTTGATCCAGTCTACGTCATTAGTTCTCTTCTTGATGTTTTGCTGCTAAAGAAAGACATAACATCCAGAGATTTGCTTTTAGGCCCCTTATT TAAGCTGCTTAGCACAGTATTTTCAAAAGAATGGGTAAACAATGCACTTTCCCTCGAGACAACGTTAAGTCAACCTTTGTCAAGTTCATCTGAAGCCCAC ACTGCCATAATCTGTCATATTCAACAGACACTGTTGATTATCCTCGAGGATATAGTTAGGTCATTTAAGAGCATAGCTCCACTAAAAGGAAAAATAGCAA ATGTAATTGACATTAAGCTACTGATAGAGTGTGCACGTACTTCAAACGATGTGGCCACCCGCAACCATGTATTTTCTCTTCTTGCTACCGTTACCAGAGT CTTACCAGAAGAAGTTTTGGGGCATATACTTGATATTATTGAAATTATTGGACAATCAGCAGTCATACAGATTGACACCCATTCAAAGCATGTTTTTGAG GATCTTATATCTGCGATTGTTCCTTGTTGGTTGTCTAAGACAGACGACGTGGAGAAGCTACTGAAGATTTTTGTAGATATATTGCCTGAAATTGTTGAGC ACAGAAGACTCTCAATTGTTTTATATTTGTTAAGAACTTTGGGTGAGGGTAAAAGCTTGGCCTCATTGCTTAGCCTGCTTCTCTCTTCGTTAGTTTCAAG GAAAGCTACCTCTTTCCTTAACAGCGAGACTACAGATGCTTTAGCATTTTATACCAGAGAGTGGGAATTTAATTTTGCAGTGCAAATTTGCGAACAATAT ACAAGTATTAACTGGCTTCCTGCTTTAGTTGCGGTTTTTGAGCAGAATGGAATTAGTAACATTGGCCAGGGACAGTTTCTGGAGTTGTTTCTTGCAATGC AATTGACGCTGCAAAAATTCCAAGAACCAGAATTTGTGTTGAAGTTGGAATCAGGAGAGGACACGGATGTGATCCAGAGAGCATTGGGACAACTGATGGA ACAGATCGTTTTCCTCTTGCATGTTGTAGATGCAAGAAAAAAGCAACTCAATTTGCCTGTCATTGTGAGGAAAGAGTTAAAGGAAATTATGCGTGCTGTT GTGAGGAATATAACCTTGGTCATGACACCGTCGGCATACTTTAAAAGCATAATTAATTTGCTCCAGCATGCTGATAAAAATGTTGGGAAAAAGGCTCTTG GTTTGTTATGTGAGACTGCAAGAAGTCATAAAAATGTCAGTTTAAAGCTGAAAGACAAGAAAGGTTCAAGGTCAAATCCAAGTTTTAGTTGGCTTCATAT GAATGAAAGTTCTCAAGAATCACTTAATAATATGTGTTTAGAAATTATTCGAGTACTTGATGATTCGTCTGATGTCTCTTTGAAAGTGGCTGCTGTTTCA GCATTAGAAATTTTGGCAGACAGATTTTCTTCAAATAGTTCCATCTTTAGTGTTTGCCTTGGACCTGTTACCAGATGTATCACATCTAACATCCCGGTTG TTACTTCTAGCTGCCTTCGAGCAACTGCTGCCTTGGTCAATGTTTTAGGTCCTAAAGCACTGGCAGAACTTCCTCAGATTATGGACAGTGTGATGAAGTC CTCTCGTCAAGTGTTGTCTAAATCTGATACAAAACCCAAAACTAATGAGGTTTTATCAGCCTCCAATGAGTCCCATTTGTTTTCAGTTCTCATCACTTTG GAAGCAGTTGTGGACAAGCTTGGTGGATTTCTAAATCCATATCTGACTAATATCATGGAGCTTCTGGTGCTTCATCCCGAGTATGTCTCAGGAATAGATG CAAAGTTGGAGTCTAGAGCTCATGGAGTACGAAAGCTTCTAGCTGAAAAAATTCCTGTTCGACTTGTGCTGCCACCATTGTTAAAATTATACTCTGCTGC CATTGAGGCTGGGGATAATAGCTTGACAATTGTATTTGATATGTTGGCAACCTTGGTTGGTACAATGGACAGATCATCTATTGTGGCGTTCCATGCTAAA GTTTTTGAATTTTGTTTGGTTGCTCTTGATCTTCGGTTCCAAAGTCCTCCTTCAGTTCAAAACATTGATGCAGTAGAGAAGAATGTCATTAATGCAATGG TTGCTCTGACCCTAAAACTTACTGAGAGCATGTTCAAGCCTCTTTTTGTTAAAAGTATTGAGTGGGCAGAATCCGAAGTGGATGAAACTGCATCTGCAGG AAACGTTGATAGGGCCATATCATTCTATGCCATGGTAAATAAACTTGCGGAGAGCCACAGGTCATTATTTGTTCCATACTTTAAACACTTGCTTGGTAAC TGTGTTCATCATCTTGATGATGGTGGAGATGTGAAAGCATCCGGATTGAATAGGAAGAAAAAGAAGGCCAAGACTCAGGAAGGGGACAGTGTGTCTATAA AGAGCTGGCATCTCAGGACATTAGTTCTGTCATCCTTACACAAGTGTTTCCTCTATGACACTGGGAATTTGAAATTTCTTGACTCCTCAAATTTCCAGGT GCTTTTGAAACCTACAGTCTCACAACTTATCGTAGATCCACCAGCTTCGCTGGAAGACAGCACGAATATACCTAGCGTGAAGGAAGTCGATGACCTACTA GTTGTGAGCATTGGTCAAATGGCTGTGACTGCTGGATCTGATCTTTTGTGGAAACCCTTAAACCATGAGGTGCTGATGCATACAAGGAGTGAAAAGTTGA GACCTAGAATATTGGGACTCAGAATAGTGAAATATCTAGTGGAGAACTTGAAAGAAGAGTATCTGGTATTATTGGCCGAAACAATACCCTTCCTTGGTGA ACTGCTTGAGGATGTGGATCTTTCAGTTAAAACTCTTGCTCAGGAAATTCTCCAAGAAATGGAATCTATGAGTGGGGAAAGCCTTCGCCAATATCTGTGA TGTATCTTATGAATCTATTACTTTTACTGCTAATTGTATTTTGTCATCTAATGTGTACTATGCTTATGTTTTTTAAGGAAGAGAAGCATTTTTGGTAGTA TAAGGGTGATAAATTTATTCTTATTTATAAACCGAGAGTCCAAAGAAGATTACAAATAAACTGTTGTTTTTATATAGCTTCGTGAAAGAGACATTATGTT AAGAAATGAAATCAACAAGAGAATTGACC
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_19993;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_232904

FPKM

• FPAB: 5.5
• FPNAB: 10.2
• LF1: 6.3
• LF2: 4.3
• LF3: 5.3
• LF4: 6.6
• UF1: 4.7
• UF2: 5.1
• UF3: 7.6
• UF4: 5

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_232904

• Blastp: Uncharacterized protein At3g06530 from Arabidopsis with 46.64% of identity
• Blastx: Uncharacterized protein At3g06530 from Arabidopsis with 46.57% of identity
• Eggnog: U3 small nucleolar RNA-associated protein 10(ENOG410XNQQ)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT3G06530)
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0001374)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019435540.1)
• Pfam: U3 small nucleolar RNA-associated protein 10 (PF12397.7)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;