| Id Trinity | FTRINITY_DN50617_c0_g1_i2 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_194542 |
| Sequence | CGATCTCAGATATCAACCTTTAGTTATAAAGACACCGTATGGCTGCCATTCATGCACGATTGTCACGTTTTCACCGTTAGATATAAAATAATCAAACGGC TACGAGTTGTGCATTAGAACAGCAGAACATGCGCAGCGGAACATTCAACTACTGAAGAGAGAGAAAGAAAGTTGAGTTGGAGAAGAAGCAAGATGAAGCA AAGTGGAGGAATGGGAAATGGGTCGCAGGAAAGGAACCAACTTGTTCGAGCTAGTCATGGTTCAGATAATGGGGTTGTTTTTTTTATGACTTATATGTAC AATGTTATTTTTTTATTTTTATATTGGCTTCTGATTTTGGTCTTGGAATTTTGTTTTTATTCTTGAAATGGAGTTGGGGATGCAATTTTTAGTTTATTAT CATACATGAGTGCCTTGTTTTTTCATCCTTAGGTTGCTGTTCTTCTTGGGTCCTATCCTTAGTTTATTATCTATTTGACTGATTCGTTTCTGTTGATAGT TTGAATCTGATGTTTCTCTTTAGGGTGAGTTCATGAATTGAATTAGTTGCTTTAGTTTATTTTTTACTTACTTTTTACTTTTTTACAATTTAATGTTTTG AGAATTCCAGTTCATTAGTTTTGTGTGGATTTGGCATGTCATTTTCATTTATTATCTTGTCAGAGATTGATCTGTGTAGATTTTATATTTTCTTGTATAG TTCTATTTCTAACTTGTATAATCCCTATACAGTCTAATAAACCCTTGAAGAATCTGAATGGTCAAGTTTGTGAAGTATGTGGTGATACTGTTGGATTTAC CACCACTGGTGATGTGTTTGTTGATTGTCAAGAGTGTGGCTTCCCACTTTGCCATAATTGCTATGAATATGAGCTGAAAAATGGGAACCAATCTTGCCCC AAGTGCAAGACTAGATACAAGAGTCACAAAGTGATTCCTCAATTGGGGGGAGATGATCAGGACGATGATGTTGATAATCCAGAGAATGAGGCCAGTTATG GACAAGGAAATACTAAGACAGGGCTGCAGTGGGAAGAAGAAGCTGACCTATCTTCGTCTTCCGGACATGATTCTCAACAACCAAAATCCCATCTCACAAA TGGGCAGCTGGTAATGTACTGAACTTATTTTTGCGACTCTTAACTTGGGAAAACTGATGAGTTTTACAGCAAAAATGGGTCAACTTAGTTATCAACTTAA TTGGTCAAAACCTTGCTTTGACTCAGTTGCATTTACACAAACATGAGTGAACTTTGAAAATTATGAAACTTTTGAAGATCTTGCTCTCCTTTTTCCTTCT TGACATTGTGATTTGCCTGCAATAGTCATGTTGCTTGATTAGACATTTAATATTAATGTGACATTAGTTGTTTCAAAGTTTGTTATGCATTTTGGTTATG GATGTTAACATAGCATTGTTTTCATGGACACTAACATTTATAATGTTGGCTAACTTAACAAGTTTATGATTCAAGTGTACCCACTCTCCAAAAGTTTACT TAAATAGCCTTGTGAGTTTCACAACTTTGCTCGTCGCTTGTCAAATGTTGTCAGTGTTCTTTAATCTTTATCTGTGATGTAAAATTGGGATCTCTTGTTT AAACTTTAAAATAAGTGAACTTTAGATTATGTAAACAAGTGATTATAGTTTATAGGTTCTGGTGTAAAGAAGAAAGCTAAACTCAAAATGTCAAAATTTG AGATTCTAATTAAATTTGGTTAAACCCAAACAGTCAATTTTCTTCTCAAAATTATCAGAAATCTGATTATTCTGGGGTTCTGAACTTCTGATTATTGTAA ATATCTTATATGTGATATTTTCAATAAAAAAATGATTTTTATAAAGACATAATCCCAAATGGGCTCTTGATCAAACATAAAAAATGTCCAGATGAACTTC TTTTTCATTTTTAATTGTCTGTAATCAGTACTACATATGTTCTACAGGTAAGAGTATATGCTACATAAGTTACTTGTAGGCTTTGTTGACAACCAATTGA CAAATAGTTCCGTGTTCATACTGGTGGGATTATTTAGTTTGCAAGAATATTAACTAATAATTAGTGCTTTATATGGTCAGATGTCTGGTAAGATTGCATG TGCTACTCATAAAAATCAATCTCTGCGAGCCACATGTATTCCTTTGGGTCCATCTGGAAGGGTTCACTCACTTCCTTATATTGATCCAAAGCAACCAGGT ATGTAGTTTACTTGATGCCATTGTTGCATATCACCTACTATGGATATTATTGATTCTCAATTCAATATATCCTTATTATTGTAGTTCTAGCAAGAGTTGT TTACCCATCAACAGACTAAACATTCTTATTTTCATTTCCTTAAATATTGAAATAATGGATGGAAGTCTTTTTTTATTTATCAGAAGCTCCTAGTATTGTT TTATGGAATACCTACACTTAAACTAATTAAAAATAAATTTTCGAAGATTCTTTTTCAATGTCCGAACTCTTAAGTAATGAATGATTGAGAGTGTAATATT AAAATTTTACACTTGGTATATAGGCTTTATGGTATTGAATATTTCCTTTTCTATACCCAGTCTTATTTTCCTGAAATCTACTTCATCGAAAGAGCTCCTT AAGTCAATTTATCATTGTTGTCTGTTGTTCTCATAAACTTGAATAAAATGATTATCTTGATTCTCCAGATAATTTACTGGGGTTTGAACTTCATTGAAAT TGGCATAATCCAGGTCTTGAGAGTGATGAGGAGATCAGAAGAGTGCCGGAGATAGGAGGTGAATTTGCTGGAACATCAGCCGCTCGCCCAGACACTGGTT CAACCATGGCTCCTGAAAGTGTTCATGGTACAAGAGAGGGTCAGAGGAAGAGAGGGAGAAACCCAGCTGACAAAGAAAGCAAGCGATTAAAGAGGTATGC ATTTAATTAAGCTTTGTTTTGTTCGGCATCTACTAAAAGCCTAGTGGTACTTTCTTGTCCCTTTTCTTTGGGATAGATGTATTGAAATTTGTGATTTTGT AACTTTGGTGGGGTGTGAAAATGGAAATAGGCTACTGAGGAACAGAGTTTCAGCTCAGCAAGCAAGGGAGAGAAAAAAGGCTTACTTGAATGATTTAGAA ACTAAAGTCAAAGACTTGGAGAAGAAGAATTCCGAGCTCAAAGAGAGACTATCTACTTTGCAGAATGAGAATCAAATGCTAAGACAGGTATGCTAATTTT TCAAATTCAATTACCATGTTTTCATCATCATCATAATGTTTTACATGCTATCTAAATCATCAATATCATCATGATGTTTTACATGCTCTATGGTCTGCAC CAGCTTATCGCTAGTTTGATACTACCTTTCGCTTTTCTTTCGCTTATGATATGAACCATCATATTTCATAGTTTATGTATTATGTGTGATTGTTCTTTTG CAGATACTGAAAAACACAACAGCTACCAGGAGAGGGAGCAATAGTGGTGCCAATGCTGAATGAACTTGATGAGAAATATGGATTACCAGATAAAGTTATA GGTATTGTAGATGTAGAGTGTGAAAGTGAGAGAGGAGAGTAAACTAGCGAGAAAGGGAAAAGTAATAGTGAAAAATTAGTTTTGATAATTCTTTAATGGT GTTTGGTTGTAATATTATGCAGTGCTTTATCCTAGGATATTGTGATGTGTGTAATATATATGCACTTTCCGTGTAAAGATTTATAGACGGTCACTATGTT ATACACTATTCATTTGGATTAGTTTTTTTGAAGAGTTAATGATTATTAAATATGAATGCTGGATGATACAGTGTCAGTGTATAAAACTCTTTTTTTTCTC TTGTGATTTGATGTGAATTTATTCATTGTTTTACCTCAAAAA BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_20452; |
| Additional information | - |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_194542
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Transcription factor HY5 from Arabidopsis with 85.19% of identity |
| Eggnog | Transcription factor(ENOG4111CH5) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT5G11260) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019437116.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |