Ll_transcript_271611

Id TrinityFTRINITY_DN51001_c0_g1_i1
Name TranscriptLl_transcript_271611
SequenceGTTACATTTTACTGAGGGTGACGCCACGCCGCAAAGTGCAGCAGAATTCGAGAGAGAGAGAGAGGAGTGAGTGGCGGAAGCGAAGAGAGACCCAAAAATC GCATTTTGAAATCTGGGTTATCTTCAAAACTCACCATTCTATTCATTTTCGATAACTATAACGATGATGTTGCTCAATACTACTATTAGGTATGTTATCC CCAAATTCCTTTTCTATTTCCCTTTTCCTCATAACATAAGATTCCTCACCCATTTCCCACAACAACAAAAAGAACCAAAATTTGCTCACAAATTTGACAA TATTAATGATGCTGTTTCTTCCTTCAACCACTTAATCCACACGCGCCCTCCACCTTATATTGGTTTAATCGACAAGGTTTTAGGTGCTATTGTTAGAATG GGTCATTATCCCACTGCTATTTCACTTTTCACACAATTGGAATTAATGGGTATCACACCTTCAATTGCTACTTTCACCATTTTGATTAATTGTTTCTGCC ATGAGGGTCACATGGCTTTTGCTTTTTCTTTATTGGGTACCATTTTTAAGAAGGGCTACGACCCGAATATTGTTACTTTCAATACGCTCGTCAATGGGTT TTGCGTGAATGGGATGATGACAAAAGCTTTGGGGTTTGTCGATGAGCTTATGGCGAAAGGGTATGTGTTTGATGAGTTTACGTATGGGAGTTTGATCAAT GGGTTGTGTAAGGATGGACAAACTAGTGCTGCTCTACGATTGTTGTATAAGATGGAGGAAGTTTTGGTTAGGCCGAATGTGGTAATGTATAGCGCGGTTA TTGATGGGCTATGCAAAGATGGGCTTGTAAATGAAGCGCTTGGGTTGTGCTCTCGAATGAGTGCTAAGGGGATTTTGGTCGATGTTGTTACTTACAATTC GTTAGTCCGTGGTTGTTGCAGGGTGGGTCAATGGCAAGAAGCAACTCGATTACTAACGATAATGGTGCGGGAAAATGTTGGCCCGGATGTTTGTACGTAT AACATATTGGTTGACGCATTATGTAAAGAAGGAAGGATAGTAGAAGCTCAAGGCGTGTTTGCTATGATGACGAAAAGAGGTGAGGAACCTGATGTTGTTA CTTACAATGCTATGATGGATGGGTATTGTTTAAAGAATAATGTTATTGAGGCAAAACAATTATTCAATACGATGGTGGAAAGAGGCTTGGAACCTGATGT CTTGAATTATAATGTCTTGATTAATGGATATTGCAAGATTGACAAGGTGGATGAAGCCATGATTCTCTTTAAAGAGATACGTGATAGAAACTTAGTCCCT AATATTGCTACTTATAATTCTCTTATTGGTGGCTTGTGCAAAATAAGGAGATTACCATATGTGCAGGAGCTTCTTAATGAAATGCGAGAGAGTGGTCAAC CCCCTGATGTAGTCACTTATAATATCTTACTTGATGTTTTTTGCAAAACCGAAATTTTTGATGAGGCAATCTCATTATTTCGACAGATTGTTGTACAAGG AAGTTGTTCTGATTTTTACATGTTTGATGTAACTGTTGATGATTTGTACAATGGTGAAAAATTAAAGACTGCAGAAAAAGTTCTTCAACATCTTTTGATA CACAGTTGTCGTCCAAATGTCCAAACATACACCATTATGATCAGTGCACTTTGTAAAGATGGCTCTTTCGATGAAGCAATGACCATGTTATTAAAAATGG ATGACAATGGCTGCCCCCCTGATGCTGTAACTTTTGACACAATAATTGGTGCTTTGCTAGAAAGAAATGAGACTGATAAGGCAGAAAAACTTCATCAAGA AATGATTGCGAGAGGTCTAGTGAAGAACGAAACAAGGTTTTTGCATGAACAGCAAGGGAATATGTGACCTGTGAACTTGGTGATCTTGTTCTACTTAAAA AAGTGAGCGGTGCAAATCCACATTTGCATGTGAGGATATCCCAGGCTGTGGAAATTGTAGCAATAATGAAATAAGAATACAGATTTTGAATGCCAAAATC AGATCTTTTTATATGCTACAGTTCGTTGGAGTCAACAGCATCATCCATAGTTATGCTGTTTTCTTTCTAGCCAGCATTGCCTTTCAGTGTGGTTGACCTC TCTACTTCCCTTTTTTCTCATGATCTCTCTCAACCCTGCATTTTTCCTTACATCTAAGCTGTAATTAGAGCCCGAGAATTAGAATTGTTGTGATACATGT TCTATGCTATCTACTTCCAGGCTTACCTTATTCTAACCATGTTCCACACTTCTGACCTCAATCCCGGTATTCCTTCATATTCTCTGGATAATTGCACTTC CCATGACCAATGAAGAACTCAGATTACTCGATTTTTCATCCTTGGAGCTTGTGAAGATTCATTATCAGTACATAGCCTTGTGGACTTTGCCAGAGTTATG TTAGTAGGGGGGTTTACAGTTCAATTGTCTAGAAATACCCAGCAGCTTCTTAATGTTTTATATTTTTAAGTGGTTGCTTGGAAACCTAGTATCAAGACAA TGCCTATGAGGTACGGCCAGCCGAGCCATGCTAATTTCGGGCTATCGGCGAGGGATTTGAATAACTTGCATGAGGACATAGGTTCAAACCTCATTGCCAC CATTGTATCCAAAGAAAGAAGTACAGACAGCCAGAAATAATTAAGGTATAATATAAGATGAAAAGTAGATTAAAAAGTTAGTTGATTTGCAAATTGCAAT GATTGTCTAGTTGATAATAGTATGGTATGTGAGAAGATTGGTGTTTAAGCTCTAGGATTCTAGTGAGGATCAAGAAGTTGGCAAGGGTATTTTTATTAAC TATTACCTTATTTTTTGTATTTTCTTAAATTTTAAGGTTCATTACAAAAATTATGTTAACCCTTCTTGCTGAAATAATGTCATCGGATG BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_21184; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_271611

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_271611

BlastpPentatricopeptide repeat-containing protein At3g22470, mitochondrial from Arabidopsis with 37% of identity
BlastxPutative pentatricopeptide repeat-containing protein At1g12700, mitochondrial from Arabidopsis with 39.09% of identity
EggnogPentatricopeptide repeat-containing protein(ENOG410Z7Z7)
KeggLink to kegg annotations (AT3G22470)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019446141.1)
PfamPentatricopeptide repeat domain (PF13812.5)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;