Id Trinity | FTRINITY_DN51006_c0_g1_i4 |
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Name Transcript | Ll_transcript_271772 |
Sequence | TTTTATTTCCTCTGAATACTGAATCAAACAAAAACAAGTAAAAAAACCCATTAGCATAAAACGTGTCCCCTTCTCGCTCTAGATATCTAACGAAACGACG CCGTAAAAGACAATTCACATGTTATAGGCGGTGACATAGTTCACTATTTGCATGACATTATTATTACATTCAACAAAATTTTACTCTCCTTCCTTCTCAT GGATCCAATTACAAACAAACCTCTCAATATGCACCTAGTTTCCTCCACCGACTCGCCCGAGTTCACTCTCTTCACTCAGACATTGACTCAGACCTCACTC GTTGGCCTCGATGCCGAGTGGAAACCCGTCCGCACTCACCAAACGGCGTCGTTTCCCACCGTGTCGCTGCTCCAAATTGCGTGCCAGCTCCACGACGGTG ACTCCGTTGTTTTTCTACTTGACCTGTTTTCCATTCCTCTCTCTTCGCTCTGGGAACCGCTTCGAGAAATGTTCGTTTCACCTGATATATTGAAATTGGG ATTCATATTCAAGCAGGATTTGATTTATCTCTCATCCACTTTCTGCTCCCTAGGCTGCGAACCCGGATTTGATACGGTTGAGCCGTATTTGGATATCATG AGCGTGTACAATCATCTGCAGCAGCAGAAGAAACATGGAAGGAATGTGTCGAAGCAAAGTAAGAGCTTATCAACTATATGTGGAGAAGTGTTGGGTTTTC CTCTGTCAAAGGTTTTGTTTTATAACCTATTCAACAATCTTTTTTATTATACATTTTTTCATTAAGAAGACTAGCAGTGGCGTTGGAGCACCGTGTATGA TTTGAATTTTATCATTTGGTCTGTGTGTTGCTTCTATGCTCAACCGGATTTTAATTTTAGACGTTTGTGAATAAATTACAAGAATCATTGTGTATAATTT TGTTTTAGGTAAAATGAGTTTTTTGTTTGCATTTGGGGAAGTTAGTTTTATAATATTATGGCGGTTAGGCTCTTAGCTTCCTGCCTTCCATCCGCATCTT ATCATCCATCTGTAAAATCGACATTTATTTGTCAAAAATCAAGCATCTTAGGAAATTAAGGAGGCACATGGATATTTTTTAATCTCTATCATGCCCCCTC ACACCAGAATCAGTTAAGCTTGAAGCATAGACAATGCTTAGGTTTACTTTTACCCTATGATAAAATTTAGTTTAATTATGAAAGTAAGTTTAGCAAGGGC CCAAGAACTGACCGCTGAAGCTTGGATTGGGTTATGTGTGAAGAACCAACCATCTTCAAAGCTCTCGGTGGAAGCACATAAATTGTTTTGAATCTTCATA CTAGTATTTTATTCATGACATCATAATTAGGTGCTTCTTCTCTGGTCAGTATAACGAATGTTAGGGTTGTGTTCTGCATCTAGAAGATTCCCAGATTCTG GTCTTAATTGAATTCTCAGCCTTACATTACTGATCGTTGACGTTGTTTTAATTCTACCAGACCTTATCTTTTTTATGTTGTGAGTTGTCTTCAATTAGAA GTGATAGGTGCATATTAAATTATGGCTTTAAGATTTACATTTATATCTAATAACAAAACATGTTTGCTCTCCTATTTTCAAGACTATATCAATCAAAATA TTTTAGCATTGCATACTGATTTCTAAATGGATCAGTATGTTTTGTCACAAAACAGATATTGCAAGTTACTCAAATTATGTTAATTAACTGATCCACCAAA TGGGAAAAGGATCTGGATGTTGTTGTAGTATATCCAGTTATGTTTATTGAGTACTTAAGCAATAATAGGATTGAGCTGAACACAATTAAATGGTGATACT GTAGATAATTTTGTATTTTTATAGAAACAGGAGGCCTATTATGAGACATGAAGGTGAATCTCTTCCTCACACGAGGGTGTGTTTTGTTCACTTGGATTTC AAGATCCAGACTTGCTCCAAGTGGCATTATTCAATCACTATAAGGTGTTAACCAAAGTTATGTATGCTTTAGGAACTCCAATGTAGTGACTGGTCACACC GTCCGCTCACAGAAGAGCAGATGAAATATGCAGCTATGGATGCTCATTGCTTGCTTGAAATATTTAAGTTCTTCCAGGAAAATGTTGCCAAAGAAGGTTT GTAATGCCTGGAAATTTTATGCCCCCAACTCTGGACAAACCACCAGCCTTTAATTATGTTATTTTTTAATTGCAACTTCAAACTTATGCTTTATTGCTTA ATTGAGTTTTTTTGGCATCCTACATTGCAAAAGGTTGCAAATTCATAATCGAACTTCACTTGTAGCAATGTCTTCCTCACAATTTCTGACCTTAACCCTT GCTAAAGGGATGCGCTGGTAGCCTGATATGGCACTAGCAAAAGCTGACAAAGGATGTAGTGCGACAGGTGGGGGTGTGCAGTCATTATTTTATGACTAGA GCCTATGTATATTGCTCTACATGTCAACCCACTTGTATTCTCCTTGTAAAAAAAGTATTTCACTGTTATTTGGTTGGGCTTGTACTAGTTGTACTAACAG ATACTTTATGCGTGTTAGTACTAAAAATGATAGTGATTTTTATCCGTCGGTTACATCTCATGTAGTCAGCATGATTTGGCATATTATACTATCACCAAAG GTTTTCAATATAAAAAAGGAAAACGAAAAATTGGAAGTGTCAAGACCAACTAACATCAAAATTATGACCACTTGGTCGTTGAGGCTCTTATACCATGCTT AGGATCAATTCTCCTAAAAGGTTAAGTGGCTCATAGTTGTGAGATTGTAGCATATAGTTGTGATGTTAGATGAAAGCTTATAATTGTGCACCTAGGTGAT GATTTTATTAAAGCTGTTGGCAAACAAGTTGTGCAACTAGCTAAAAGTTGTTAAATGACTTGAGGGACATAATATTATATTTGATGTAATATTGATATAA TTTGTCATTGGATACATTATTGGTGGCTCCAATGGTAGCTTTTGGAAAGCTAGCTTTTAAAAGTTACACTCTCCCTTTATTGGCAGCTCACTAAAGAACT CCAAAGGTTTGTTGACTAAGTTAATAAGACATAATACACTGAATAAGACAAGCTGTTTTACCAAACACAGTCGAAGGCTTACGAATAGTTTTTCGCCTAT CAGGAATTTAAATTGATATTTTATGGGTTGGCCCGCTCTTCTTAAACATCTTGATATTTTGTATCACTTGTAGTTCTAAGAACCCTGCCTTTTCATGTGG TAGTTTTTGTTTCCTCACATCCGTGTCCAGACATAATTTATTTAAGTGCAAGAAATATGGAAAATTTTCTCTATATATTTTGTGATCTTTAATATCAGAG GATATTCATTTTGTTCACATCTGTCCTTTTAGATTTAAAACAAATTTGTATTTTCTCATTCTTACCGTGCTGCTTTATACAGAGACGTTTGGTTATCACA TTTTTCT BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_21197; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_271772
Blastp | - |
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Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019430744.1) |
Pfam | 3'-5' exonuclease (PF01612.19) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |