| Id Trinity | FTRINITY_DN51429_c0_g1_i1 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_109278 |
| Sequence | CATTACTGACTCCTTTATTACACGTAAATCATTGAGTGGTGGAAGGGTGGGGCCTGCGGTTTTGGTTGGATCTGGGGTGTGGAACCACTGATTGATGGAG CTTTAAATAGTGCTGATTTTAAGGAAGAGAATGGACATGTTAATACAATTCTCTGCATGGAAAGTGGGGATTTTTGTGTTGATACGGCTTTTAATTGTAT CAAAGAGGGTGACCCCACTATTCACTCTGTGTCTAATGGATCTCTTGAATTAGTTGATGTGGGCCCTACAAAGGTGATTGATAATGTTTCTAAAAAAGTC AGTGTTGTGTTGCTTGAGGGAAACGTGGGATCTGATACGGTTTCTAATTTTGATGAGGTTCTGCTGACCGTAGAGAAATTGAGAGGTATGGATTATCTAA TGCAAAGTCTTCTTCTCGGGTGGAGATCTATTCTCTTTCTACCCCTTGGTGTGCTCAAATTGAGAAGATTTCTCCGTAAGCTTTGTCTCCATCTTCTACT CAGAGTACGGGTGGGCCGGTTTCTAAACAGGTTCCGTTGGTGGTAAGTGAGGGTTTCCCAAGTCATAGTGAAGACGTCAATGGTTTCTCTAATGCGGTTG TTCTGACTGCTTTGGTTGATGAAACCCTGGTTTTTTCTCAGTGTCAAATTGCTTTAAATAATGTGGTTCCTGCGAAGATGTGTCTGGGGAGACCTGCCCT CTACTACAACACTCGTGGTGCATAAGGGTAGGCAGCCAAAGCTTAGTAAGAAGGCTAAGCAGAAAAAAGCTTTGATTGAGTGGAAGAATTTATGTGTTGA TTTGGGGGATGTCCCTTTAATGTCTTCTTCTGACCAACTTCTTGTTCCTGTGTTGATGGATAGTTCTGTTTCCATGGAAGGAGCTTGTTCTATTCATGAT CAACTTCTTCAAACCTCTCTGAGCCCCGCTGAGAATATTAGGCAGTGTCATCCATGCTCACCGGGTTCCTTGGGTGACAGGCGCTTGGAAGCTTCAGAAT TATGGAAGATTGGTAAATCTATTGGAGTTTGTGATTTTAGTATCCATTAATATTCGGGGGCTCGGAGGGAGACTGAAAAAGAAGGAGATTAGGACCTTAT CAGGTGTCATAAGCCTGACTTTATTTGCATTTAGGAGACCAAACTTCAGTATGTGGATGTTAACCTTTGTTTGTCCCTCTAGGGGGTGATGATTTTGGGT AGGCGAATGTCCTGCGGTTGGGTTTTCAGGTGGTATTTTGAGTCTCTGGAAGAAATATGTGTTTGTATCTGAAGAGGTGAGGTTTGGGTCAAATTTTATC ACGGTTAAAGGGAATTGGTTGCATCATAATATTTGTTGTAATATCATGAATGTTTATAGCACGTACAACTTGGCTGGTAAAATGGCGTTTTGGGAAGAGG CTAAGGGTGATCATTTGGGTCGGTCCGACGAGCTTTGGTGTATGGCATGTGATTTTAATTATGTGTTGCATTAGGATGAGCGAAGGGGTTTTGGTTCTCA TTTGGCTAGTTTTGATTGTGTTTTCTCGTTTCGTAGAGGACTTGGACTTGCTTGACTTACCCCTTGTTGGTTCGAAGTTCACTTGGTTCCTCTCTAATGG GTCTGCGATGAGCCGGCTTGACAGATTTCTGTGAATGGTCCCTGGTTATTGTAGTGGGGTCAACTGGTTCAATTGAGTTTGAAGAGGACCTTTTCTGATC ATTGCCCTATTCTGTTGAAGGATGAGGTTCACAATTGGGGTTCGTCTCCTTTCAGAACAAACAACTATTGGTTTTCGGATGTGAGGTTCAGTAAGTTTGT CAGCGATACTTGGAGTAACTTGGAGGTGTACGGTAGGGGGTCCTTTGTCCTCAAAGAAAAGTTGAAACTTCTTAAGAGCGCCTTGAAGGTCTGGAATAAG GATCACTTTGGCTTGTTAGGTAAGGAAATCAACGATCAGGTAAACATTATTAACGCTATTGATAGTAAAGGGAGTGTTGGTGTGCTTTTGGAGGAGGACA TTGCTGCTAGGAGATCTGCTACTGCTGAACTTTGGAGGTTATCATCTCAAAAATATAATCTTCCTTTTCAGAAATCTAGACAGAGATGGCTTAAGGAAGG TGATTCAAACTCTAAATTCTTCCATTCTTCTATTAATAGGAGAAGAAGGAATAACGAGATTCTTGGGTTGAGCATTGTGGGGTTTAGGTGGAAGACCCAT CTGAGGTTAAAGATCACATTCGATCTTTCTTTCTTAGAGACATTTGCTGAATCACACTAGAATAGACCGTCACTTGATGGAATTGATTTTATGAGAATCA CCAATGTGGATAATGTCTTCCTTAGTACTAGGTTTGAGGAAAGTGAGATAAAAAATGTTGTTTGGATTTGTGAGGGTGATAAAAGCCCTGGACTGGATGG GTATAATTTCACCTTTATCAAATGTTTCTGGGAGGTGTTGAAATCTGATATTTTGGTTATGGTGGACGACTTTTATTCCTCAGGTGACCTGGCTAGAGGA TGTAATGCCTCATTTACAATGTTGATCCCTAAGAATGGGTGCCCGCAAGGGCTCATTGAGTTTTAACCTATCTCCCTGGTTGATTGCATTCAGAAGATCA TCTCTAAACTTCTCGTCGGGCGCCTCAAGAAAATTATTCCTTCAGTTATTTCTGAATGCCAGACGACCTTCATTCAGCATCGTTACATCATGGACGGTGT TGTGATTGCTAATGAGATTTTGAAAAGGCCTACGACTCAGTCAACTGCGGTTTTCTTCTTTATATGTTGGATAGAATGGGATTCTGCTTTAAGTGGCAAA ATTGGATTAAGAGTTGTCTTCAATCTAATTCTGTATCTATCCTTGTTAACGGTTTTCCAACAAGGGAGTTTTACATGGCCCGAGGTTTGAGACAAGGCGA TTCGTTGGCACCTTTCCTTTTTCTGATTGTTCTGGAGGGTCTTGCTGGGATTATGAGATCAACAATGACTAAGAAGATCTTCAAGGGCTATCTGGTGGGT AAGAATGAGGTTCCCATTTCTCATCTCCAATATGCTGATGATACACTATTGATTGGGAAGAATTATGCTGATAATATCAATGCTCTAAAAAAGATGATAG GTTTGAGGGTTAACTTCCAAAAGAGCAGTTTTATTGGGCTTAATGCTGATGATAGGTTTACTCAGATGGCGGCTAACAAACTGTTTTGTAGTGTTGGTTC TGTGCCTTTCAAGTTTCTCAGAATTCCGGTTAGTGCTAATCCAAAAAGATCATGTACTTGGTCTATTGTCATCGACTCTTTTAAAAGAAGACTCTCTCTT TGGCAACATAAACTTTTATCTTTTGGAGGTCGTGTTATTCTCATTAAATCTATCCTTAGCTCTTTATCGATCTACTTTCTTTCATTATATAAAGCTTCTG TCTCTGTTATTCTAGAATTGGAAACAATTCAGAGGAGGTTTCTATGAGGTAAGGGGGAGGCCAACAAAGGGTATTCATTGGGTGAATTGGAGTTCGGTGT ATAGGTCCAAAGAGGAAGTGGGTCTGGGGATTAAGAATTTGAGTCTTTTTAACCTCTCTTTGTTTGGTAAATGGAGGTGGCGGATTTTGGTGGACTGGAG TACTCTTTGGGTGAGAGTTTTGAAGTCTAGATATAGTGTCGGGTCAGGGGTGTCAAGAGGGCTGTCTAATCGTGAGTGTTTTAAGAGGGGGTCAACTTCG TGGAGAGATCTTGGGGGCTGGGTAGTAGAGTTAATGGGGTGCCGACTACTTGGTTCTATGAGGGTAGTCGTAGGAAAGTTGGTAACAGGGAGTCTATCGA GTTTTGGAGAAATGTGTGGGTAGGTGAGGTTAGTCTAGAGTGTAGGTTTGAGAGATTATTTCAGGTTCCGATGGACAAAGGTGCTTATATTTCCTCCACG GGTTTTTGGAGGAATGGTGTTTGGCAGTGGACACCCTCTTGGCGTAAGAGATTATTCGAGTGGGAATAAGTTGTTGTAGATTACCTTATTTGTTGTTTAC AACAGGTGAGACCGGTTCTAGATTATGAGGATGAATGACGTTAGATGCATGCTAAAGATGATATCTACTTCGTTCAAAGCGCTTGTAGGGTTCTTACAAA AGATCTATCTTTTTGTTGATAAAAAAATGACTTTTCATATGTAACAAATGAAAATTTGTCTTACATATGCATCAAAGTTATTTCCTAAATATTTACATTT TAAATGTTTAGTGACACACTATTGGCATAAGGACAATGAAAATGACCTCATTAGCATGTATGTAAGATAGCGGTTTCATTTTGCCCTAAATGTTGCAAAA AAAAAGTAAAAGATGTATTTTTTTGAAAAGGAAATTAGAAATTATTTTACTATTCG BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_22022; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_109278
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein from Mus with 34.72% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019465331.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |