| Id Trinity | FTRINITY_DN51453_c0_g2_i5 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_109548 |
| Sequence | AGACAAACCCTAGAAGCCATTTTGTATATAAACGGTGTCAAATCTTCAGTCTCTCACATCACAAAATCAGAATGGGTCTTTGTACAGTTCAATCTATTAA TGCGTCGGCCCCTCTTCTTCTCCCAAACCCTAAATCATCTATTCCAATCAGACAAATTCCAACCATTCGCACCGCTTCCCTCTTATCACGGTCAATTTGC TTGAGAAATGTTTTATCAAAGGCGACAACATCCGAGGATTCTTCAAGCAAGACAAGTCAATTTTTTGATGAGAAACGTGACAATGCTGTTGTCTCGGATG ATGTTGAAGCAGTTGATAAGAAGGGATTCAATGGAATAAACCCAAAACAAGAGTTACCTGTGGTAGAACAAGAAGGCCTGTCATTAAATTTGTTGGATAA TCTTAACATAAAGGTCTTCTTAACAACATTACCTGTTTAGTTTTCACTTTTCATTAATATTTGCTGTGTCTTTACACATTGATGGAATGACTTTGCGTTT GGTAGGTCACTGTTTTTCAATTATAGCGTTTTTACCAGTTATACATGCATACATTTTGTTGATTCTGATCTGGGTGTAAATTTTTTCCTATTGAGTTGCT ATGATGACATATCAGTTTATTGATTGTTGATGATATTTCGACATTCATGTCGAACCTGAGCGGTTAACTGAGCAACTCCACACAGTTTCATGTATTTTGT CCCCTTTTCATTTACTTGATGTAATTGTTTTTAGTTTACAAAGATTTTCTATTTTGTTGAGTTTTCCCTGCACAAAATATTGTTCTTCATGTGTTATTTA CATATATTCTATATTCCACTGATTCTGAACTGGATGAATTTGTCCCCAATTAAGTTGCTATGATGACATATCAGTTTATTGATTGTTTGATGATATTTTG GCAGTCATGTCGAACCTGAGCGGTTAACTGAGCAACTCTGATGTTTTCATGTATTTTATATCGTTTTTTTGTTTGCTTGATAATATCAATTTTTCCCTCT AATTTTTTTTCCAGAGCTGCGCTTCCTGTTTTATATACATATCTTTCACTGTTTCTGATTTAAACGTATTTTCCCAATTGAGTTGCAATGATGATATATC AGTTTATTGATTGTTTGGTGATATTTCGGCAGTCTTGTCGAACCTGAGCGGTTAACTGAGCAGCTATGCATATTTCCATGTATTTTGTTTCTTTGTCATT TGCGTGATGACATTGTTTAGTTTACAAGGCTTTTTACTTGAATTTTCCCTGTACAAAATTATTTTTCTCTCGAGCTTATCTTCCTGTGTTATTTACATAT ATTTCACTAATTCTGGTTTGGATGTATTCCCCCCAGCTGAGTTGCTATGATGATATATCAGTTTATTGATTGTTTGGTGATATTTCGGCAGTAATGTCGA ACCTGAGCGGTTAACTGAGCAACTATGCACATTTTCATGTATTTTGTTTCTTGTTCTTTGCTGAGATTGTTTAGTTTATATGACTTTTTCTTGAATTTTC CCTGTACAGAATTATTGTTCTTTCTGAGCCTGCTACTCCGGTGTTATTTACATATATTACACTGATTCTGATTTGGATGCGTTCCCCCAATTAAGTTGCT ATGATGAGATATCAGTTTATTGATTATTTGATGATATTTCGGCATTCATGTCGAACCTGAGCGGTTAACTGAGCAACTCTGCACATTTTCATGTATTTTG TTTCCTTTTCATTTGCTTGATTTAATTGTTTAGTTTATAAGGCCTTTTTCTTGAGTTTTCCCTGCACAAATATATTGTTCTTTCTGAGTTGTTCTTCCTG TGTTATTTACATATATTTCACCGATTCTGTTTTGGATAAATTTCCCCCAATTGAGTTGCAATGATGACATATCAGTTTATTGATTGTTTGATGATATTTC GGCAGTCATGTCGAACCTGAGCGGTTAACTTCGCAACTCCACATGTTTTAATTTATTTTGTTTGCTTTTCATTTGCTCGGATGAGATTGTTTTTAGTTTT AAGGCCTTTTCTTTTTCTTGAGTTTTTCATTTACGTAAATATTGTTCTTCCTGTGTCATTTACTTGTATAGTTTACCAAAATTTACCAGACTTTTATTGA AAACTGACTAAAGCATTGATGATGTCTTTTGTATTTTATTTAATTTAAGTAACCATCACATTATCACTGTTGGCTATCCAGATGATTTTATTGTTTTAAC TTTCTCTTGATTTTTTTATGGTCTACTACCCTTGTTGTCATAATTGATTACTAAAGGTTGAATTCTCCTTTAAATTTTTTGCCATGATTAGTCTGTCCTA TTATGCTTAATATTAGCTATTAACATTGCTATGACATCATCATCGAGTTATTACCAGAGCAACCAAGTTCAAGTATCCATTTATAATTTGACGCAGACGA TACTGCTTCAATTGTCTTGTATGCTGGGGGCGTTGTAGTGTCTCTATGGTTAACATCAGCTGTTATTGGTGCTATTGATTCTATCCCATTGTTTCCCAAA CTGCTGGAAGCTGTAGGACTTGGATATACAATATGGTTCACTTCCCGATATCTGCTTTTCAAGAAAAATAGAGATGAGCTTACTGCCAAAATAGAGGAGC TCAAAGAACAAGTTCTTGGTTCAGATGATAATTAATTATCCTGAAAACATGAAATTAGATTTGTGTTTTGCTTAAACTGTGAGGGAACAAATTTTCCATC AGCTCATACAGCCTACATGCTAACAGAGGCAATTGCTGTGTTTTTAGTTTCGAAGTAAAACAATCTGATTCAGCACCCACCCTTTTGGTAATCTTGGTTT ATACAACATTGTTCTTTGGGGCATTCCACTCTTTCTGTTTTCTCACTGGTTGAAGATTCTTCATTAGAGTGTGTATTTTTGAAGGTACGTGCAAGCAAAT ATACAGTGAAACGAAGAGATATTAAACAGTGTACCGTTACTGGAAGATTCTATTTACATATGAGATTGTCGCCAATATGTTTATGAAGATAATAGAAATG AGTTTCATAAACTTGCTGTGGTTGCTTTTACCCGGTTGTTAATTCAGTTTACTCTTCCCTGTTTCCCGTTACAATTCAGTGAAAATATGTTTAGAACTCA GAAGGAGTTATTTTCACTCATACAAGCATTAAAGTGTGAATTATCAGAAGTTTCGAACAATTGCATTACTTTTTTCCCTGACATTTACTTTTTCAAATTG ATACAAACTACAATTGCATTACTTTTTTCCCTGACATTTACTTTTTCAAATTGATACAAACTACAATTGCATTACTTTTTTCCCT BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_22077; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_109548
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Protein CURVATURE THYLAKOID 1D, chloroplastic from Arabidopsis with 62.5% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019424296.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | snoR128 (RF01428) |
| GO | - |