Id Trinity | FTRINITY_DN51484_c0_g1_i1 |
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Name Transcript | Ll_transcript_109021 |
Sequence | TTAATGTTGAATAACAATTTCAATTCAATAATATTTGGTCATTTTGAACACGTTATTCTATTTCCTTCCGTATTCGTCTCCATTGAAACTTCAAAGCAAC GCTGTCATAGTCAACCTTACACCACACAACACCTATGCCAAACCCCAAACCCTAATCCCCAATTTCTTCAAAATCATAATCCAACTACCACTCAACCTTC CAATTCCAGAAATTCCTAACTTCCACAACCAGATCTTCCATTGTTGTTAGGGTTTTCAATTCCATCTTCTGATGACGATCCTACAGTTCAGTTTCATAAG AAAGACGAAGGAACAAAAGCCATATGTGAATCCTGATCTCAACCCCGTGTTATTGGTGCCTGGAATTGGTGGTTCTATATTGAACGCTGTAGATGAACAA AACGGCACCGAAGAACGCGTTTGGGTTCGATTCCTCTCAGCTGAGTATAAGTTGAAAACCAAGCTTTGGTCACGTTATGATCCTTCTACTGGGAAAACTG AATCTTTGGATACAAATACAAGAATTACCGTTCCCGAAGATCGGAATGGGCTCTACGCACTTGATATTTTGGACCCTGACTTGTTAATTGGGTATGAGTC TGTGTATTACTTCCATGACCTGATCATTCAAATGCTTAAATGGGGGTATCAAGAAGGAAAGACGCTTTTTGGCTTTGGGTATGATTTTCGCCAAAGCAAC AGGTTACAGGAAACAATGGATCGGTTGGCTGCAAAATTAGAATCAGTGTATAATGCTGCTGGAGGGAAAAAGATAGACATTATTTCTCATTCTATGGGCG GTCTTTTGGTGAAATGTTTCATGGGCCTGCATAGTGATGTAACATATCCATTAACCTTCTCAAATCAGTTTAATTTTGTTTTGTAGCTTCCTATAACCTT TTCATTTCTATCCGTCAATTTATATCTTGGAGTTTATTTACTGCTAAAAGGTAAATTCTACAATTATGTTTTCTATTCACTGTGCAGATTTTTGAGAAAT ATGTTAACAATTGGATTGCGATTTGTGCGCCATTCCAGGGCAAGTAATTCTATTCTATATTTTCTTATAAGTCCAGTATAAATTAAAGAAATTGGATGGA AATGCTTCGTCTAGTATTTCATTAAAATTGTTAATCCTGGGCTGTTAGAAATTTATTTTCCTTGTCAAATATATTTGAAGAAGGCAATTTCATCTTTTCC TTATCGCCTAAAACTTAAATAATTGATGCACAACTAATGTGCATAAAGGAATGATTTTCTAATATCGATAACAGTTAAGAAGGAAAAGAGATGTCGGTTA TGGTGTTGTGTATGCCATGGTGGCATGGTGAAAGAGATTAAGCAGAAAATAAATGTTGGAAGTTATTTCATCAGTGATCTCACTGTCATGTCACTTGTTT TTACCTTAAAAATGTTTAAATTTTAAACATATTAACAATGATATATAATTTGATACCATCTGTATAAACTTATTAAAAATGTTTTGGTTGCCTTCAATAT TGCTTTTTATATCATCTGTATTGTTTCATATAGTTAGAGGTTTTTTAAATATTTTCCCATCGCAAGTTCATCATATTGAAGTTATAAATTGGTCTATAGG TGCACCTGGAATGGTCAATTCTACCCTTTTAAATGGCATGTCGTTTGTGGAGGGATGGGAGCAGAACTTTTTCATTTCCAAATGGAGCATGCACCAGTTG GTACAGATCAATTATTTGTCTTTTGGATTAGTGTTTTGAGTTCACTTATTACTACAACTCCTATTATGGAGACTTCTCTGAGCCCCCTGTCTTTTACATG TATATTAAATCATCACTGTCATCATTATTATTATTGTTAATGCTATGCTATTTGTCTGTTGCATACAGAAATTTGAGGGAGCTGAGTTCTTAAGTTTGTG TGCTTTGTAATAATGTAAAAGTGTATTTATTTTAGCGTCTTAGTGATTTACCCTTACTTTATGGTGCTGGTAACATACTTTAGTGTGGAATAGTATCATA GATTAGGTGTATATTAATGAGTATGAAGAAACAGGAAAATATGAATAACACCATCCTTAAACCAAGGACAAAGACCCAAATGCTTGAAGAGCCATTTTAG TCATCACAATTCGCAGTCATGAAGTATGCAGTGACCCAATACAGTAGACAAACATATGAAACATAATTTTGGCTGCTATTATTCATGGTTTTGTACTGGT TATTTGATTATTTGGTTGCACTTTCATGCATGATCACTTGATATTGTTGACTACATGATTTGGATTTTCCAATGTATTATTGTTGGGTGGTGTCTTGACT GTATTCTCTGTTGCGTGACTTAAGCATAATCTTGCATGTGGATATTTTTTATACATGCATCTTGTGATTCAGTTTCTTCTTCTTTTTCATATTTGAATAG ACATTGTAGAATTGTTTATTGAAGCTTGTTACAATGTTACAGCTGATTGAATGTCCATCAATATATGAACTGATGGGCTCTCCCAATTTTAATTGGCAAC ACATTCCTCTTCTGGAATTGTGGCATGAGAAACATCATTCTGATGGCAAATCTGATATAATTCTGGAGTCATATCCACCAGGTGATAGCATTGAGGTTTT GAAGGAAGCTCTTGCAAATAACACAGTGAGTTACCAGCACTACCTTTGTCAGCATGCAGCTTAGTTAAACTTTTTTATAATTGAGTATCTTCAATGTTAT CATGAAAATGAATGTGATAATTTAAATCTGGTTTCTGGAGTATTTAACAAATAAATTCTAGAAATTGAGAAACCATTAATAATTTGAAAAATAAGCAAAC GCGTATTTAATATATGGAAGCTTTGCCTTCTCCATATCTAGAGTTGAACTTGGAACTTAACTCGATGTGATTTCTTCTGAAGTTGAAGGAAATCTTACTT TTTTTCTTCTTTTTTCATGCACTTTAGAAATACATCAATACATTTGAGAAGTACAGGTGCTTCTGTTCATTTAAGTTTTATCATATACGATGTTTAGTGG TACAGAGCTTAATCAGATTGGTATGGATCATAACTATCTTAATATCCAGGTTAATTATGATGGTAAGGATTTGCCGCTGCCCTTCAACTTGGAGATCATG AAATGGGCAAATAAAACATGGGAGATTCTGTCTTCGGCCAAACTTCCTTCGGAAGTTAAATTTTACAATATTTATGGGACCAGTCTTGGGACAGCTCACA GTGTTTGGTAATGCCTTAACCAATTCCGATATAGATTTTATCAAATGTATTAAGAATGGTCTAGTGCATGTAGGTATAAATAGTACTTTTGAAACCATGT GACCCTCACTTTACATAACTACTATTCTGCAGCTATGGAAATGAGGACAATCCTGTCTCAGATCTGCAACAGCTACACAGTCTCCAGGTCATTACATTTG TAATTTTACCAAATGTATAATTCTTATTGTATGCGCAATGAACATATGCTTTAGTGCATGCAATATTAATTCTCCTAGTTTACAATACAACTTTTATCTA TATTTCTATACTTCTATTTATGAGAAATGTTACATTTGTGTTTTTATCTGTCCTTATTTATTCTAGTATTTGCTGAACAAAATAATTAAAAATGTGTTTA GAAATGTTAATAGATTCCAAAATAACTTTGTTAAAGCCCGGCATTGGTTTGTTATTTTTCCTTCAGTTGGCATGTCTAACTTTTTTATTATGTATTTTAA ACATTCAGGCCAAACACATATATGTTGATGGTGATGGAACAGTTCCAATAGAGTCAGCAAAGGCTGATGGGCTCAATGCGGAGGCGAGGGTTGGAATCCC GGGTGAACATCGTGGTATCCTTTGTGAACCTCATTTATTCCGTATTCTCAAGCACTGGTTGAAGGCTGGAGATCCAGATCCTTTTTACAATCCCCTCAAT GATTATGTGGTTTTACCCACCGCTTTTGAAATGGAGAGTTTCAAAGAGAAGGGTCTGGAAGTAGCATCCGTTAAAGAAGAGTGGGAAATCATTTCCAAAG ACCAAGATGGCCAAAGCAATCATACTGCTGGTGTAACGTCGTTGAGCTCCATGTCTGTTTCGCATGGAGCAGCCAATCAATCTTATTCTGAGGCTCACGC TACCGTCATTGTTCACCCTCGCAAAGATGGAAAACACCATGTTCAACTGAATGCTTTAGCTGTTTCAGTTGATGCCTCATGAATCAGTTTCTGATGAAAT ATGAGGGAACAAGGAGGGAACCCTCTCTGCAATCTGTGGTTGACATCTCTTGTATATAGAAGGATATTTCCACTATGATGTTGCCATATTCCTCAGTGTG CTATGTATATATGATATATGAATGTCTATGCACTTATTGAGTTATGAAAATGAATATCATCTGACATTCTATCTCATAAGTTCAGTATTTATTCGCCTAT ACTGTTATTGTTATGGTAATACCTTAGTCTTTTAAATACGTTTTCATTGTTTCCTCA BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_22140; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_109021
Blastp | Lecithin-cholesterol acyltransferase-like 4 from Arabidopsis with 58.49% of identity |
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Blastx | Lecithin-cholesterol acyltransferase-like 4 from Arabidopsis with 70% of identity |
Eggnog | Acyl-transferase(ENOG410Y9CF) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT4G19860) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019423651.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |