Ll_transcript_26377

• Id Trinity: FTRINITY_DN51704_c0_g1_i13
• Name Transcript: Ll_transcript_26377
• Sequence: AAATGATATTTCGAACAATCTCGAAATTCATAATTTTTTTAGTATAAATAGCAATTTCTCATTCTCATTCTCATTCTCGTTTTTGTTTCATATCAAAATC CAGCGTTTCGAAACGGAGCTTCGTGCCAATCGCAATCGGAGTCGAAAGTTCGTTGTGCCGTTTCGTAATAATTTTGTGTCGTTTCTTAACTTTTGATGCT TTCGTTTTGTGTTTTTGAGTGATATATGATAATGTTTGTGTTGTTTTGTGTGTAATAACTCTTTTCCTTTTTGCTTTATCATGTTATATTTTGTGTTCTT TCACGCTAATTATTTATTTATTAATTGTGTATGATATTATTTCATTTTATAGTTTTTGAATTTTTATGCGGTAGTGTTTAGCATTTGTTTACAATAATCG TGGATTATTATCGGAAAATGTAGCTGATGTGATCGCAATCACATCAATAAATAGTAGCATAGACTTATGTATCATTGTGAATTGAGCCTCGACGCGATGG TTGTTTGTGTTGTGACATGAAGATCGTGTGTTCAAAATCCGGAAACAATCTGTTCAATTACGAGGGCAAGGTTGTGTACATCTATTATCCTCTGCCTTAC TTGGTTGGAGCCTAATATACTAATTAGGATGTGAGATTGCTAATTTTGGGAGGGTTAAAGTAGAAGAGTGATTAAGTAACATTAGATAGATTTTGTCTTT GTGAGTCATGAGGTGGTCATGGTGAAGATGAAGGTCTTAAAGGAATGGAGTGCTGGAGGTTGTGGGCTCAAATCCCACTATCTACAAAAAACGGAATTAT AAGGTGGTTAGGGTGAAGGAGATTGAGGTTGAAGTCTCACCCACAACAAATATTAACATACTAACGGTTTACATATTAAAAATTGCAGATAAAAAAAATG AAGATAGATTTTTGCCTACATAGCTAATGCTACAATGACACTTATTTTGAAGAAAGAGTGGAGTGACCAAAAGTATATCTCTGAACCCGTGTCCCTTTTG CCTATGCTACCTTTCAACAGCACTGTCTACTATGGTGCACAGTTTGGACTTTGCAGCCAGTTTTTTATGTTGCAAAATTTCCATTGTGCATGAGAAACTA CCCATTTTGTATACTGTCCCGTTTATGAACAGTGATGAGGCTGGCTTGATGTTATCCCTGAGGTATTAAAATGACGGTTGTCGTTGCGTTTCAAATACTT CCAAAACTTGACATTATCGACTATTTTTGGGTAAATGCAGTTGATGCATTCACAACTGTGATGTAGCACAGTTTTGGAAACCTTAATATTTTGATGCCAA TAACAGATGCGGACCCAGATTTAAAACCTTCGCCATCACACCCATTTTTCGGTCTCACATTTGATCACCTGTCCTACTCGCCAATTACCCCTTCTTCCAG CCTTTATTTTGTTTATGATGGTAAAAAGAATAGCCCTCATTACAAAGATAAGGACACTGTTCTTGAACATGGAGTTGAGTGAATTTTTGTTTTGGCAGTG AATTCATCTTTCACTGCCAACTTACCTAGATAATGAAGGATCCGTGATCTGATTTGACCAAAAATGACCTACCAAGGTGCAGAGATATGAAGTTTTTTAG TATTTGCTATTGGTAAGTTTCAGTTCTTGGAGGAAACAAAGCAGACCTGCCGATTAAGGTTGGAGTGTCTATTGGTTGGCTACAATATAATTGGATTTGG TTCTGGGAGTAGTGCTGATTGGAGCTGCATAATTCAATTTTGTTGTTGCTGATTTCAATTGGTCTGCGGCAGTGTAGAAGAAACCAAGAATACATTCGGT GTTTGCGTGGCTTGATGGGGTGACTAAATATGCCTTTAGAGGTTTTAGGACTATTTCTAAATGTGTTGCTACATGCAGGTCCCTAAGCTTCTAGATAGTT GGTAATCTTTTGCTAACATCATGGGAGAGGTGGCAGTAATGCACTCTGAGCCTCTGCAGTTAGAGTGCTATGGCATGAACCGTATGACTGAGAATGATGT GCATACTCCAAAATCAAATGAGCCCATGCCTGAAGAAGAATCAAATCAATCAACAGATGACATTAATATCATTGACTTGCAAGGGAAAGGGTACATGGAG CATGGATGTCAACATTACCGAAGAAGATGCCTAATCAGGGCCCCCTGTTGCGATGAGATTTTTGATTGTCACCATTGTCACAACGAGGCAAAAAATGATA CCAATATTGATCAAAAGCATAGGCACAATATCCCCCGCCACCAAGTCAAACAGGTGATATGTTCACTTTGTGGGACTGAGCAAGAGGTTCAGCAAAACTG TATTAATTGTGGTGTTTGTATGGGCAAATACTTCTGTGAGACATGCAAGCTCTTTGATGATGATATATCTAAACAGCAGTACCACTGCAGTGACTGTGGA ATTTGCAGAACTGGGGGAAGAGAGAATAATTTCCATTGCGATAAGTGTGGTTGTTGCTATTCAATTCTGCTGAAAAACAGTCACCCGTGTGTGGAACGAG CAATGCATCACGATTGCCCCATTTGTTGTGAGTATTTATTTGAAACCACAAAAGATATCCTTGTTCTGCCCTGTGGACATACCATCCATAAGTGTTGCCT GGAAGAAATGAGAAAGCATTTACAATATGCATGTCCTCTATGCTCTAAGTCCATTTATGATATGTCCAAGGTTTGGGAGAAACTTGACCTGGAGATTGCT GCTACACCCATGCCTCCACCATATCGGAATAAAATGGTTTCGATCCTGTGCAATGATTGTGGCAAATATTCTCACAATGTTCGATTCCATTTTGTGGGAC ATAAGTGTTTGCACTGCAATTCCTACAACACAAGACAGACAAGTGGGTGAGGAAGTGGCAACTTATTATAAGGTTTCATTAAAGCATTCATTTAATTGCA CTTTCTGTTGTTGAAGCATTGGTTATAGGTTGAAGAAAGTGCAATACAATATTCAAGTGGAGAGAACAACGGTTCTTATTCAACTACAATTTATTACTGT ATTATACTTTACTTCAACTCACTCTTCTTATTAATCGAAGTTGAATGTATGGAAATTCGGACATGATTTTAAGTTAATGTTATTTATAATATATTAATGA ATATTATTTATAATAGAAGTATCTTTTCATCTAAAA
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_22648;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_26377

FPKM

• FPAB: 17.3
• FPNAB: 8.8
• LF1: 10.4
• LF2: 10.2
• LF3: 11.4
• LF4: 11.2
• UF1: 7.5
• UF2: 10.2
• UF3: 14.8
• UF4: 14.1

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_26377

• Blastp: Probable E3 ubiquitin-protein ligase RZFP34 from Oryza sativa with 67.53% of identity
• Blastx: Probable E3 ubiquitin-protein ligase RZFP34 from Oryza sativa with 67.53% of identity
• Eggnog: ring finger and CHY zinc finger(ENOG410XXHF)
• Kegg: Link to kegg annotations (4324695)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019457803.1)
• Pfam: CHY zinc finger (PF05495.11)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;