| Id Trinity | FTRINITY_DN51939_c0_g1_i14 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_143884 |
| Sequence | CAAGAGTAGTCATAGTCACAATCAACACAAACACACTCAAAACTTCTTCTCTCTCCTCTCACTTTTCAAACCTTCTCTTTCTCTCTCTCGTCGTTACAGA AGAACATATGCTCCGAATATCTCATTCCTCATTCTTCATTCAACCTTATTCTCTCACAAACCTTTTTCTTCTTCCAACATGGTATGCTTCTACCTCAAGC AAAAACCTTTCACAAGTTTGAGACAAGAAGGGGAAAGAGAATAAAAAGTTAATTGATTCTTTTCAAGCTCATATGTGAGGAAAAAAAATTGTATTTTTAT TATTTTTCATTATGATTCTCTTCTTGTAGCTATAGAACAGGGTTTTTGATTTATTTTTTAAACTATGGAGATGTTCTTCATGTAGAAAAATTGGATTTTT TATTCCCCTTTTATTTATTTTTTCACTTTAAAGTTTTGAGAAGCCGTGGTTCTAGAATATAGGAATCGGGGTTTTGTTGTGTTGTTGGATTTAAAAGATA GTTTTTTTATAAAAAGAACTTGAACTTGTTATGTGGGTAATGATTGAAATGAGGATTTGGGATATAGTTTAAGGTTGCAGCATGAGTTTCAGAGAAGGGA ATGAATGTGAAGAATCAAAATCAGTGAGTCAAAATGTGTCACTTACAAATTCTCAGTTAACAGTTGATGAGAGTCTTCTGGTTGATCCCAAGTTATTGTT TATTGGTGATAAGATTGGTGAAGGAGCTCATGGCAAAGTTTATAAAGGAAGGTAAGTTGCAAAGTTTATGGTCTTTTTTTTAGTATTTTAAATAGTGGTT GTCCAAGAAAAACTATAGGGGAACCTTTAAGAAGTGTTTAGATGTAAATATTTTATCTATAGACATGATTTACGATAGGATATTATGGTGTTGTTTGATC ATAATTATGTGGTTGTGGTTGTTTTAATTTATGGTTGTGAGTTCATGTAGATATATTAGTTGCTTATAATCCCTTGCATGTTAGACCCTACAATGGTAGG ATATTTATTTACAATTCTGGGTTTGTTTGAGCAAACAACTTAATTCAATAAGCTAATTTAAAATAGGGTAGCAAGAGCTTATTTTCATATGTTTTTCTGA TAAATTTACTAAAGTAAGCTAAAAGGAGTTTATAAAAAAGCATATTAGTTATTTTTTAAGCTAATATCATGAGCTTATTTTATAAACTGTTCTCATAAAC ACAAATAAGCTCTCTATAGGTTATTCCAAACACTCCTTAGTTTACATAATTTTTATATTTTTGCACCAATAGCTGGAGGAATTATTAAATGTGTGAAAGT CAATGTTTTCTGTGGTTCCTTTACTTTCTCATGGAGTAAATAACTGTGCTTCATTGTTGGTATATAAAACTTGCTTCAAACATCAATGATTTTCCTGTTC TGCTAATTCGAAAATCGACAGTGTAGATTCCACCATCATGATAAGACTGTTGGAATGGTATTCATAATTTGATTTTACTTAATAACTACTGATATCTAAC TGAAGGCGAAACGGTATTTGATTTTTTATTCCACTGATGTAACTATTAATGGTTACTAGAGGTAAGCTCAACTGTATAGTTTTGTGTATTCATGATACAT CAATTGATTTGTCAACAACTAGAGTCTTGGTTTATGTAGGAATAGTTAATAATTTTCCAGGTATCACGACCAAATTGTTGCAATTAAAGTTCTGCACCGT GGGAGCACTTCAGAAGAAAGAGCTGCGCTTGAAAATCGTTTTGCTCGGGAAGTTATTATGATGTCCCGTGTCCACCATGAGAATCTTGTTAAGTTTATTG GAGCTTGCAAGGACCCTCTTATGGTGATAGTTACTGAGCTATTACCGGGAATGTCACTCCGGAAATATTTAATGAGCGTCCGTCCTAAACAATTAGAACT TCATGTGGCTATAAACTTTGCCCTTGATATTGCTAAAGCAATGGATTGGCTGCATGCCAACGGCATCATACACAGAGATCTAAAACCTGGTACTTTCATG TATATATAGTACACTGCGTGTAATAGTCATTATCCAGTTCATATCAATATATCCATATAATGAAGGGGTTATTAATTTATTGCACTAGGCACATCAAAAT TACTAGTATATGTTATGAAAGAGGAAAAAAGAAAAAGGTTTCTTTTCCTATTTGAATTAAGACATTCTTTACAATATACGGTACTGAAATATTTTTATTT TTAGTGTTTACAAGGTGGATAATGAATCTGGTTGCCGCATCTATCGTATAATTTTTGTTGTTGTCGCAAATCTTTGTTCTTCATGACTGACTTTTATCAA ACTTATCTCTGCTTACCATTCTTCAAAACATAGGAGAGACAGAAGTACTGCTAATTACATGCGAAAAACATGCTAATCATAGTAGTTTTTACATTATTGT TCTAGCATGAAATATAGGTATATGATATATAGGTGTGTCTCTCTTCAACTATGTTTTGAAACTGTCACAATGCAGACAATCTGTTGCTTACAGCAAATCA GAAGTCTGTTAAACTTGCAGATTTCGGTCTCGCAAGAGAAGAATCTGTGACTGAAATGATGACTGCAGAAACTGGAACTTACCGTTGGATGGCACCAGAG GTATGTAGTATTCTCCATTGAAAACTATCCATGGTCTGATAAAACTGGCACTTTTTGGTGTTTATCATCTTGATCCATGGTATTAAAACCATCAAGTTGC AGTAATCTGAAATTAATTTGAAGAGTGATCTGAACTTAATTCTGGGTTTGCCATAATGGCAGACAATTGTACTTCTCTGTCTAAAACTGATAGATTTGAT TTTAGCATTGATTTGGTCCTTGAAATTGGCATAATCAGTCTATTTTTTTTCCTGACATTATGAAGAAGAAAAAACAAATTTAGTCTGACTTTGAAAACCG ACAATCCATTTAGTCCCTGACAATAATCAACCAACTTGGTCCCTGAAATTTGGTTTGCTTTGTCAATTTTTTGGCCCCTTAAATTTGGTCCCTGCAAAGC TTCAATGTTTGACTTTGGGTTTGTTTATGCTGCAAAGGTTGAATGATCATTTTGATCAAGGTTTGTCACATAGGTGCTAATTTGTATATGCTTTATGTTG ACATAAGGGACTACGTTGATTGATAATTGTATTGCTGGGGACTAAATTTGTGTTTTCGAAATATTAGGGACTAAGTTGACTGATGGCGCCAATTTTAGGG ACTAATTGATGTTTTACTTGATAAATTTGATGTACTTCCTTGTCTATTTTGTGTAACCGCTGCATTGCTTGTGAGTGGATATTGGCAGTACCATAGTTTC GTTTTACCCAATTAAGTGAGTTCCATTCCGGAGTTATTTAATTTCTAATAATGAAGGGACCTGGTACAAGCTTGTCAACTAAGTTTTAATTATTTCGCTG AATAGATAAAGGTAATTTATGCATATAGGATCCCTACAAGTCACTGATTATGTACATTAAAAATGTATTATGGATTTTCCGCCATATAGGTTTTGTTTAT ATACATGGATTTTTTTATGAACGGTCATGTTTTCGCAGTTGTACAGTACTGTGACATTGCGACAGGGAGAGAAAAAGCATTACAACAACAAGGTTGATGT GTATAGCTTCGGAATTGTTTTGTGGGAGTTACTAACAAACCGCATGCCTTTTGAAGGGATGTCTAATTTACAGGCTGCATATGCCGCTGCGTTTAAGGTA TTATATTTGTTATTACTTTGCTTCTTCTTCATTAAAGCTCGGGGAAATTGCACTTGATATCTTTGATATTTGTCACTACGACACACCCCTCCCTTTTTGG TTCAAAAATAACGTAGACTTCCCCTATTTTTTTAATTTTGTATTGCTATCGCACTCCCCCCGGCCTAAAGCCAAAGATAAATGTATACCATGTGTTGTAC ATGCTGTTTGAGGCTTCAAATATTTGGAAATGACATTTAATACGTCAAACTTGCGGTATTTGCCCGATGCAAGAGGATCAATTTGCCCATAGCAACCTTC GTTGCTGTTATCCAATATAGGCGTGTAAGATGTATTATCCAAGTGTAAATGTCATTTCTTTAGTTTCTCTCGGGGGAAGGGATGAGTGTAATGTGGAATG CAAAATTCGGGGAGGTCGGCGTCATTTTTTAAACTACTGGTGGGGTGCATGTGTCATCGTGATAACCTTGCGGTATGAGTGCAATTTCCCCTGAAGGGTA ATATATTGATTGGTAAACATCCTGACATATTTCTTTGGGAGTTATTGGATTTGTTGCTATCTGCTAATCATGAAGTGGCATACATTTGAGATTGCAGCAA GAGAGGCCTAGCATTCCTGACGATATATCTCCCGATCTCACGTTTATCATACAATCATGTTGGGTCGAAGAACCCAACATGAGACCAAGCTTTAGTCAGA TCATCCGCATGCTCAATGCGTTTCTCTTCACACTCTCACCACTATCTCCTCCTTTGCCATCAGAACCTGACAATGATGAACCCGAAGTAGCAGCAGCAAC AACGACAAGTAATGGTGCTATTACCGAGTTTTCTGCCCGGAATAAAGGAAAGTTTGCTTTTCTACGCCATTTGTTTTCTTCAAAGAGGACGAAGAACTAA CAGTGTGAGTGGTAAAAAAAATGAAATTACCTTTTGTTGTAGATGAAAAAGATATGGCATGGTATGGTACATAATCTATGAGTAAGACCATCTAATGTAA CAAGTAGAAGGATGTAACATGTTCCACAAAAGAATAGAATGTTGTTTATAGGCTTTATGAAAGAGTAAGAAAGAAAAATAGGATTTGTTTACCTTATCTA GTTAATCTTGTTGTAAAGGAACACATTGGTATAAACATATTCTTGTTTTGAGAATGTTATTAATTAATGCATAGTAATTCATCATAAATT BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_23300; |
| Additional information | - |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_143884
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Serine/threonine-protein kinase HT1 from Arabidopsis with 40.87% of identity |
| Eggnog | Serine Threonine protein kinase(COG0515) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT1G62400) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019412787.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |