| Id Trinity | FTRINITY_DN51961_c0_g1_i4 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_144292 |
| Sequence | CAGCCATGGAACTCATGCTACCTATCTTAATTTCATGCATCTACTCCATCTATATATCTCTTTATATGTCATAATAATGACTCTTCAAATCTACCCTTCA CACTCTGTTTTATTCCTTTTTCTTTCTCTGTGGGGTCACTCCTCTTCATTTACGCCATCTTTTCTTTATTTCTTTTTCTCTTAACTTTGAAAGAGTGTTA TTTCTATGCCAATGCACCTAACGTTACTCCATCCTGACAGCCAGGAAATGAGCTGAATCAGTTTAATTTATTGGTTTAACTTGAAACTTAACTCGAGTCT GATATGAATTATTTTTTTAATTTTAGTTTATATCGGTTAAAGTTCGTGAATTGTTCGGTTTAGTTCGAATTGGTTAATTTAATAAGTTCTTTATTTTGTT TTTAAATAAATAGGCACGTGGTTATATATACATATATGAATAAAATTAAAAGCATGTCATAGTTTTAAGTTGGGCCGAAAGATGGGGATAACAAATTTGC AGCCCAAAATATAGGAATATTTAAAGAATATAATATATGAAAAAATGGAAGCAGAGTAGAGAGTGAGAGATGAGATCTGTTGGTTGAAGAAAGTAGTTTA TTTGATTATTATGAGATAGAAATATATAGATCTGTGTTGTGTGTGAGAGTGAGAGTGAGAGTGAGATAAAGAAGAGCAAGGTGGAAATGGAGTACAGGAA AATGAAAGACGAGGAGGATGAAGATAGGAGCGTGGGCGTTGAAGATAACATCGATAAATCATTTTTGATTTCAGTCCCAGATAACAGCAATTTAGTGGGA GAAACCAAACTTGAAACCCACAGGACCCAAGTACAGTGGAAGCGCAAGTCAGTGGTTACGCTTTCATTGACTATTCTGACTAGTTCCCAAGCCATTCTAA TTGTTTGGTCCAAGAGAGCTGGCAAGTATGAGTACAGTGTCACTACTGCTAACTTTTTGGTCGAGACTTTAAAATGTGCTATATCCCTCTTGGCCTTGGC AAGATTATGGAACAAACATGGTGTCACCGACGACAACAGGTCATCTCTCTCCCTCTCAATTCAATGATAATAATAACGACTCGCAACACTGAAATAGCTC ACCACTATATTGTTTCTTACACTAGATTCAATTAACTGTCCATTGCATTTGCCAAAAAAGAAGAACAAAAAACATGGATGGCTAATTCATACAGGAATAT GCTATCCGTTTACGTTATCACAGCTCCATTACCATTATTTCATATTTCAAAAGCTAAATGCAAATTCTGTTGAATGATGTGAGAACCGATCTGAGCATTA AAACTCCTGAGGCTAGAACCTATATCTTCAGTAGTGTTTTCAGCAGGCCAGTGTTTCCACCTTACTTTTTCTGCTGGCGCTGTTCAAATATTTGCAACTT CATCTTCTTATTCAAGCTATATCTTTTCCCTTGTTGATATACTATGAATTTAAACAACTTAACATATTTTATGCCCTTAACATAGGTTGACTACAACATT AAATGAAGTTATAGTGTATCCTATTCCAGCAGTGCTTTACCTCATAAAAAATTTGCTCCAGGTTGGATATGTTTGGTATGACGGCAATGTGGTTTTCTTA AACATATATGTCAATCCTTTCTGAAATCTGATTGTTTTTATCTTTCAATTTTACGGCAGTATTACATCTTTGCATATGTAGATGCTCCAGGGTATCAAAT ATTAAAGAACTTCAATATTATCAGTACAGGAGTCCTATACAGAATTATACTTAAGAAAAGGTTAAGTGAGATTCAGTGGGCTGCTTTTATTCTACTCACT GCTGGGTGCACCACAGCTCAGTTGAATTCGAAGTAAGACTAATCCAAGCCTGAATCTTGGCCATTATTTGTGTTAGTATATTGACCTTATTATGTATCAT ACATAAATATAGTGTGGATTGAAGTATTGCCACTGTAATATAGATTCCAATAAAAAAATCGTACATGTCATGTGTCAAGAAGCGAGTCAAATACTTTAAA GAAATTGAAAGCATGAGAAAAACATGACTCAACTCATCTAATATTTAATTATAGTAATTGAGAGAGGAAATAAAATCATAGTTAATCAAATTCAGAACAT AGTTAAAAATAAATTAATATAGCGTTGCTAACTAAATCAAGGTTTCATCTTCCCCTTGGTACTCGTCTCAAATCCTTGTGATACACTGCTCTCAAATTCT CTCTCTTGCAGCACTAGTTTCCTCAAATTGTGTTGTGGCGCACTTCTGTTTATAACTGAAGCATATTGTAGGTTTCAATTCAAAACAAATCTGGCATCTC GTTTTGCCGGCTCCACTTATGTTTCTCCCTACAATTTTTCTTGATACCAAATTTATACGGCTGCATCTTGGTGTGATAATATAAACAAATATAGTCATTA TAATTATCATTAAGCTTCACATGTGACATGTGACCTATTTGAGTTTGACCCCATATCAAGTATACAAATTTAAACCTGCACTTTATCATAAAAGATTAAT AAGTCATCCATTTATATCAGTGCCAGACCTGCATTGATAGGTCTGGGGACACATGCCCCCACTGATTTTGAAAAGAAAAAAATTAGAAATATATATCCAT TTTTGTTCTTGTTTTAACAATTTCAAGAAACTTGTCCACATTGCATGTTAGAGTGAAAGAACAAACAGTTTCAAATATATTTTTATGTGCATTTATAATC TTTGTCTCCACATCCTGATACTGTATTTATAATGATATTATGAATCTGAAGATATGTTGTATACGAAGTGATAACCTAATACCCATAATTATACCTATAT TAGTAAAATACTGATGTAGTACAACTTGCATATGCCTCGTCCCTCAATTTTGGACGGCTAATCTATAAGGTTCCTACAACAGTAAGGATCCTGATAGTCT AACAATTACAGTTCCCACAAAGGTTAAGGCTCTGTATGGACTGTGGTACTAGATAAAATCAATACCTTTGATCTATTTGCATATTTGTAGCAATACTGTT GATCTGTTTATGTATTTGTAGTAATACCATCGGTCTGTTTATGTACTTGTAGCTTATGAGCCTCACTGGGCTATTTCTGTTGATTTTTATGTTAGGTTTT TTTATTTCAGAGATCAATATTCGTCCTTTTATCTTTTTGCACTCTGAAGTTGCTTGGTAGGTGGTAGCTTGGTAGCTAACATTTTTATGGTTGCCTTGGG AGGATTTATTATTCTCCTTTTCTGTATGCCCCTTCTATCTTCTAACAGATTCTTTTGTTATCACAGAAAAATACTGTGCAAGTTCATATTTATTGATAAT CATGTGCTAAATTACCTTAATATTTAATTTGTTTTTTCAGTTCTGATCATGTTCTTCAAACTCCCTTTCAAGGTTGGGTTATGGCAATTGTGAGTTGTCA ACATTTGTGGTTCTCTCACATTGGAAATATAAAGTAGTGTAGTCTAAAGTTATGGCTTGAAAATGATCATGAGCTTTTCCTTTTCAGGTCATGGCACTCT TGAGTGGTTTTGCAGGGGTATATACAGAGGCTATTATTAAAAAGCGTCCTTCACGAGACATTAATGTTCAGAACTTTTGGTTGTATATCTTCGGCATGGG CTTCAATGCTGTTGCAATACTAGTTCAAGATTTTGATGCAGTGATGAACAAGGGATTCTTCCATGGATATTCATTTGTTACTGTTCTCATGATTTTCAAT CACGCACTCAGTGGGATTGCTGTATCAATGGTAATGAAGTATGCTGACAATATTGTGAAGGTGTATTCTACTTCGGTGGCAATGATTCTTACAGCAATTG TTTCGGTGTTCCTTTTTGGCTTCCATCTCTCCCTTGCCTTCTTCCTTGGCACAATCGTTGTCTCTGTTGCAATTTATCTGCACTCTGCTGGGAAGATCCA AAGATAGCTATGACTGCCTACTAGTTTTATTTTTTATTTTTATTGTTGTTTAGCAATTTATTTCTTTTGAAACTGTTAATTCAATATCTTTAGTGAATAC TTTGAAATCTTTCTCAGTAAATATATCTCTATATGGATCAAAGCAATCTATGTATAAGGCTTTGTTTACATTTTCACTGCTGCTAGCCTGCTACAAATAT GTGATTTGCAAGTTTCACTATAAACTATTGTGGTGAGTTTGAATGGGATAATTGACCCTTCTCCCACCGGGGAATTTTGAATTTCCAGCAAGAAAAGATT AGTAAATTGAGCG BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_23369; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_144292
| Blastp | CMP-sialic acid transporter 2 from Oryza sativa with 89.78% of identity |
|---|---|
| Blastx | CMP-sialic acid transporter 2 from Oryza sativa with 89.86% of identity |
| Eggnog | membrane(COG0697) |
| Kegg | Link to kegg annotations (4343687) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019460205.1) |
| Pfam | Nucleotide-sugar transporter (PF04142.14) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |