| Id Trinity | FTRINITY_DN52108_c0_g1_i11 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_174238 |
| Sequence | GATAGTTTGGATAGATTTTACACTCTTCTAAATTGCATTTTGATGTTGATGACCTTCTTTAATCGTGCATGTCATAATATAACCTTTTTATAAGAAAGAA AATCCAAAACAAAAAAATAACAGAAGAAGGTAGTGATTGAGTGGTGGTTGTGGTTGGTAAAGGGAAGAAGAAATGTTAGGACAGATAATGGGTGCAAACG TGGGACTCATATCCCCTTCACTTCTTCCACCTTCTCTCTCCAAAACCAAATCCAAACTATCACCAAGTAACTCATATTAATCTTTTTGTACTTTTATTTC AATCCATTCCAGTTTGTCACAGAACTCAGTACTAGGTTTTTGAGATATTACCATGAATGATGTATATTAATAATATTTGAAGTAATGTCTATGGATTTTT ATTTGTCATTTCCTATAGACTTGCTTTGGTTTGAGATGTTTCCCATCCATGAATTTTTGGGTCATGAATTATGGCTTATTTCCTGTAGAAAAAATTATCT GTGAACAAATTTTATGCAATGTTGCATTCAATTTCATGATTTTTAATGTCTCTATATGTATGGGCTTTTCTTAGATTGTGGGTAATTTGAGTTGTAATGG TGAAAAGTTATTGAGTTGCAGTTAATCTGTTGTGTGCTTATGTAGTTCTTAATTCTTAGGGTATGGTAAGAGCCCTTTGTTAAGATTTTTTTTTATTAAA AAAATCTGAATTTCTTGTTTGGTTGGACTTTTACTAAAAAGATTGATTTTTTCAGCCTCTTACAAAACTGTTTCTACCAAAATTGATTCTAGAGAATCAC TCTTTCGAAACAAAAACAAACGGGGATTATTGAAATCTTAGTTTGACGATCGATAAATGGACTATATAGCAGGATTGCAATATGAGGCCTATGACTTTGT GCAGAATTTGTATCCTGCTTGAGCTATTTAATGTCATTGACTTATAGCTTGTTGAAAGATATGCAAGGTTTAGGTTCTTTTAAGCTTATAATTCTATGGC AGTGGCCAGTATGAGCGTGAGTCAAGATCCAGTTCGTGAGTGGATTCTTTCTGAAGGGCAAGCTACAAAGATAACCAAAATTAGTCCTGTTGGTGGTGGT TGTATCAATCTCGCTAGTCGCTATGACACCGATGCTGGTTCTTTTTTTGTGAAAACAAACAGGTATGTCTATGTTATAACACATTCAAACTTCTGTTCCG GCTTGATGATTGAATTGTCCTTCACCTTTGGGGTTGAAACTGGAAAATTCCATGTTGAATGTATTGGATTGTTTCGATTATCTTTGAGTAAAAGCTTCAT TCCCTCTGCATCTTATATATGACAATTTCAATGCTGATGAAACTTGAAACTCTATATCAGAAGTATTGGACCGTCCATGTTTGAAGCAGAGGCTATCGGT TTAGAAGCTATGTATGAAACTGGGACCATTCGTGTGCCTAAGCCACATAAGGTTGGAAGACTTAACATTAATTTTGTGAAAGCTGCAACTATTTGCTAGC TATAGCAAGCTGGAGAGAACATGAGAGTTAACTTGTTTCTAGGAAATTGTAGGTTGGACCGCTACCTACGGGTGGTTCATTCATTGTTATGGAATTCATA GAATTTGGTGCATCTAGAGGCAATCAGGTCAGTTACCTAGAACTAACTGCTAATTAGGAAAGCTTTTGAAGCTTAATTGTAATTTATTGTTCCCAGTCTG CTCTAGGGAGGAAGCTTGGTGAAATGCATAAAGCCGGAAAATCTAGTAAAGGATATGGTTTCGATGTTAATAACACCATTGGCAGGTATTATATGCCTTC ATCTTGAAAGTTACCATTTCTGTTTCAATTGATATTCCTATAATTATTGTGCCTCTTTATATTTTACCGAGACATGTGTTGCATGTTAGATATATCCACA GAACAGTACAAGCTGATGTTTATAAACATTTAGAAGGGATGTTTGGTAACTAATTCATTTCCTGTGATGTTATGCATATTATGCCGTAGCACTCCGCAAA TAAACACTTGGTCATCAGATTGGATTCAATTTTATGGAGAGTGTAGATTGGGTTACCAGTTAAAGCTTGCATTAGATCAGTATGGTGACAAAACCATTTA CGAAAAGGGACAGAGACTAGTTAAAAGCATGGGGCCCCTTTTTGACAATGTAGTAATAGAACCATGCTTACTACATGGAGACCTTTGGAGTGGAAACATC AGCTCTGACAAAAATGGAGAGCCTGTCATACTGGACCCTGCATGTTACTATGGACACAGTGAAGCAGAATTTGGAATGTCTTGGTGTGCAGGCTTTGGAG GATCATTCTATAATTCTTATTTTGAGGCATGTAGTTCTTATCTCTCTCTCTTCCGGATTTCCTTTCTCTTTTTGTTGTTTGTTTCAAATTAAAGGAAAGT TTTGCCTGAGAGTTTATCGGTGCATTCTATTTCTTCCCCCTTTTACTCTTAGAATCTTGGTTGAATATGGCATCTGTGAGTTAGATAATATTTGAGGATT TATCATCTATATTTGTTTGTGTAAGATCAAATTGCATGAAACCAAATAAACAATAATTCCAAAAGTCATTGGGTCCATCCAATTTGCATTACATCAATAT ATAGAACTATCAAAACAGCAAGATGGTTTTCATCAACAATGTGACTACTTGCTTAGCTTCTCAGTATACTTCTTAAAATAGCTTATAATAGATTTACTTG CCGTGTTTCAACGAAACCAATCGTGCCAACGGCTGGCATGTCAAATGTCAGTTTCACACATTAATATTGTTACGTTCATAATTGCATATGATTTTTCCAG GTGATACCTAAACAGCCAGGCTTTGAGCAGAGGAGAGACCTTTATATGCTGTATCACTATTTAAATCATTATAATCTCTTTGGTTCCGGATACCGGTCAT CATCGATGTCTATAATTGATGACTATCTGGCAATTTTAAAAGCTTAGGATTGTAAGCATAATTGGCAAGCATGCTTGAAAGAGGTTCTCTTCTTGAACAT TTCACTACTTTCATTTCCCTGCTCAGCTCTCAATGAATTGAAGATATAATTCATTCCAATGCAAAGTCAATTAGTTTTGTTTGAAAGTTAGACTAGACTA TGTTTTACCCTATATATATAAGAGTCAAATTTAATACAATCATGCAAGATAAGTCATCAAGACATGAAACATGTTATATATCTCAAATAGGCATTGTCAT GTTATATATCAAGACATGGTTCACACTTCAAGTTAGAGGTGCACCATGGCAGGAATCCTGCTATGCTAGTTAGACTTGTAGTGATGTATGATTTTAGGCT TTAATAATTTAAGCTTCTGTCATCATTCATGTATTTATAGTGTTTTTCTTCTAGTATTGAAATGACTACAAATTTTGATATTCACCTTAATCTTGTTATT TGAAGTGCTTTTCTTCTAGTGTTTAAGACTTCTTATTTTGGGGTGTACTATTGATATCCATGGGAAATGTAAGAAAAATTACAAAGCCAACAATTACTTC AAGTATTATATTTGGTTATTTACTAAAATGACATTGTGGAGAAAACTGGAGGATTTGAAAGATATAATTGGAGGGCATAAATGGCTCAACCCCATTGTAT GTTTGGTGGAATCTGGCAAATGGTTACAACCTTTTGTGTGGGCCAATGAGCTTGTATGTATGATCTAAAGAAGCTTACAGCATCTCCG BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_23841; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_174238
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Protein-ribulosamine 3-kinase, chloroplastic from Arabidopsis with 80.7% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019461137.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |