Id Trinity | FTRINITY_DN52161_c0_g2_i3 |
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Name Transcript | Ll_transcript_173324 |
Sequence | GAATTTCATTTTTTTTTGAGGTAACTAAATAGATAATTCAGATTAACTTGTTATATATAATATATCTTTCTCTCTCTCTGAACCATTATCAAAACCCCAT TAGAACTTTAGAAACCAAACCTATAGCAGCTTCTTCAATTCATCAATGGAACATTGTTTAGCTTCAACATGTATTATGCCATTGAGTTTCAATTTCAACA ATTCTAAAAGAACAATCCTTTTTCCAACAACAACCTTAACCAAATCAAAACCTTTGTTGTCTCTTGTCAATGCTTCCAACACCAAAAGAAACACCTTGTC TTCTAATTGGCTTGTCTCAAATGATGATTTCTCTTCTCTATCAACTGCTTCTCCTTGGCTTCCTACACTTCAACAACTTGATACCACTAACATGCTCCTT CGTCAAAGGATTATCTTTTTGGGTTCTCAGGTTTTTGTTTTGTTCATGTTTTTTGTATATTCCTAGGCTACCCTTTTGTTTTCTGATTATGTTTTTTTAG GAAAGATTCAAACTTGTTCATGTGGGTTGGTTTATTCTGAAACATCCCTAGTACAAGCCGTCACCATCGAGTTGTTTGTCTAATTGTGTAAGGCTCTGTT AGATCCCCAGGATGAGTAAAAAGTCAAGGGTTCGATTACCGGGAGCTATACTTATTGGGAATGGTAGTCACGCCGGAAAGGGGATTATTTCCTTACCTCG GGATGAGTAAAAGGTGAAGGGTTCGATTACCGGGAGCTATACTTATTGGAATGGGCAATTACGTCCGAAAGGGGATTAGTTCCTTACCAATATGGTTGGG TATGCAGTTGGTAGTACCAAAAAAACAAGTCATCAAAATAATGAACATATAGAGAGAAAGAAAGGGAACATAGTTTGTATATTTGTCTAGACCCTCACTA 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Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_24038; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_173324
Blastp | ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 3, chloroplastic from Arabidopsis with 68.92% of identity |
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Blastx | ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 3, chloroplastic from Arabidopsis with 68% of identity |
Eggnog | Cleaves peptides in various proteins in a process that requires ATP hydrolysis. Has a chymotrypsin-like activity. Plays a major role in the degradation of misfolded proteins (By similarity)(COG0740) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT1G66670) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019453049.1) |
Pfam | Clp protease (PF00574.22) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |