Ll_transcript_174282

Id TrinityFTRINITY_DN52183_c5_g1_i1
Name TranscriptLl_transcript_174282
SequenceCGTGGTCCAATTATCTCGTCTCTCATTTTTAATAACTTCTTTATCTCTCATTGAACCCTCACATCAAGCCCATTTCTCCCTCCGCCGTGTCCATTTCCGA CCAACCACCTCTATAACCACTGCGGCTTCCACATCACCCACCGCAAATTTCTCTCTCCGCCGCGCAAACCTCCGTGACTAAATCCCTTTCGCACTATCTC TCTCCTCGTTTTCGTCCTGCTTCAGTTCCTATTCTCTCACCAGGTTTCTTTTTCTTTAGCCACCTTTTTAACTCAGGTTTCCTTGTACTGTCTCTGTCTT GGGTGCTTGCCCATTTATGGCCTACTCTGATTTCTTGAATTTGTTGTTCGCTATTGGGGTTTGGTGTACTGCTTACATTATTGTTGCATCTATTGCCACT TTTCGAGCCATCACTTTTCTTTGCACTTTCTGAACTTCAGAGGTAAACTTCTTGGAATTTGATAAGGCTATCATGGGTTATGCTCAACTTGTTATAGGCC CAGCCGGTAGTGGCAAGTCTACCTACTGCTCAAGTTTGTACGAACACTGTGTGGCTACTCGGCGAACGATACATATTGTGAACCTAGACCCTGCTGCTGA AAATTTTGACTATCCTGTCGCGATGGATATAAGGGAACTCATTTCGCTGGATGATGTTATGGAGGAACTTGGATTAGGTCCTAATGGTGGTCTTGTATAC TGCATGGAGTATCCTTTTCATCAGTTTTTAAAACTTTTATATTGTCTATCTTTTGAATCTTCTTTGAACTAGTAATTCTGCATCATTGCTTATGTCAGAT TGCCTTTGGAGATCACATTTACAATCTTATCTATCTATTTCTATGTTCCTTTTCTCTCCTTTATTTACATTCTATAGCTATTAGCTATTTAAATAATTTG ATTAGAAGTTTTGCTGCCTTAATAATCTTGTTTAGACACCTTGAAGATAACCTGGATGATTGGTTCAATGATGAACTGGACAATTATTTAGATGATGATT ACTTGGTTTTTGACTGCCCTGGCCAGATAGAACTTTATTCACATGTGCCAGTGCTTCGGAATTTTGTGGAACATTTGAAACGTAAAAATTTCAATGTTTG TGCCGTGTACTTGCTTGATTCACAGTTCATGACAGATGTGACCAAATTTATAAGTGGATGCATGGCATGCCTTTCTGCAATGGTTCAACTTGAACTTCCT CATGTTAACATCCTTTCAAAAATGGACCTTGTGACTAACAAAAAGGATGTTGAAGAATTCTTGGATCCTGAGCCCACCTTTTTACTGTCTGAATTAAATC AACGGATGGCTCCTCAGTTTGCAAAGCTGAATAAATCTTTGATTGAACTGGTGAATAATTATAGTATGGTGAGTTTTATACCACTGGATCTGAGGAAGGA GAGAAGGTAAACTCCTCTTTATCTTTTGTCTGCTTCTTATCATTGTTCTTTTTTTAAATTATCTTATATTGCTAGCATGCAAGGGATATATTTCTATTGG CTTGTATAGTTTATAGATTTATAAAAGCCATTGATGGTCATGATTCTACAATATTAAAATTGAAAGGTAGAATGTTTAAATTAAGTTGTCCCCAGGCTTG GAGCTTGTGTTTTCCAGTGCTCTTCGAAACTCTTGACTATAGATGTGACTATATAACAACAACAGGCTTGATCTCGCAAAAGGGCATCTCTAGGTTATTT GGCCAAACAAATAGAAATTACAGTGACTCAGTATGAACTGCTGACTACAGGTTTATGTCGCAAAAGAGTACGATTGATTCGATTTTCTTCACAATCATAC TGCCAAAAAGTTTCTGATGTGAATTATGCTGTGCTCTGGATTTGAAATGACAGATTTTCTGTTGTGATTGTGAATTTTAATTCAAACTTGATAATAGTTC AAGAATCTGTATTTCACTCCATCCTGACCTCCTAAGCATGTCACTCCATTCGCACCTTCAAGGCATCTCAAAAGCTTCTAATAGTTTCCAACTTTTTACT AGAAAAAAATTGCTTCTGGGTATATTGAATGAATCGGTGGAGTTTGATTCATTTGTTTCACCTTGAATACAATGCATGGTTTTTCAGATGCTATTGTCCT AGTTAGAGAGAGAAATTAAATAGGAACCTTGAAATGTGGAAACAAGCTTTAGGCACATGACTTTCATATAAATTGAAGTATGACACAGAGTATATGATGT GTAAGTTTAGCAAGATGCAGATAAACCATATTGGAGAGGTGAAAATTGGATATCATACTATACTAGAAGTCACTATTCACTAATATTGGGTGGATGAAGT GGCTGAGTGTTTTTCAGGCACCACTCAAGCTTAAGAGAATAATTTCAATGTAGCCAAGATGATAATATTATGTTACATAAATGAAAACAATAGACAAGAT AAAATTACAAATGAATGCATTAGGAAGAAAGTTGGGATAACTTTTAGTGTAAAAAAGATGATAGAGTAACGCCTTAGGTGGTTTCGACATGGGTGGAGGA AATTGTTGGAAACCTCACTGCCCTAGTAAAGAGACTAGATCAAATGAAGGTCAGTCTAATCCCCAGAGGCAGAGGGAGTTCAAAAAAATCATAGGCAAAA CTATTAGAAAATAGTTAGAGATTGTTTTGCCAATGGACATGATTGATGATAAAGAATTATGATGTCGTTTGATTCATGTAACTGATCCTTCCTAGTGGGA TTAAGGCTTGTTTGTTGTGTTTTACCTTGAATGCAGCTTGAGTGTATCTGTATTTGAAGGATGGGTGGCCTATGAAAGAACTCAATTGATTTATTTTTAC AAGGCTATGAAGTGTGTTTATGTTCATTAATTTGAAAAGTTATGCTTATTTAATTCTAATAAGTTTTTTATCAATTAAATCTAGCCCTTGAATTAACCCA AGTATAATAGGTCATCTTTTGGTGAACTAGCCAAGAACTTTGTACTCTACTTGTTATTAAGCACATGGGGTAGTAGTACAAGCCATTAAATTCTATTAAG TTTTCTTTGCTTCATCAACTCAAACCTACACAAAATACAAACTATTTTGCTATATATTTAATTTTGGATTTTGTCAATGACAGTATACAATATGTATTGG CCCA BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_24114; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_174282

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_174282

BlastpGPN-loop GTPase 3 from Xenopus with 66.3% of identity
BlastxGPN-loop GTPase 3 from Debaryomyces with 48.5% of identity
Eggnog-
KeggLink to kegg annotations (734520)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019449856.1)
PfamConserved hypothetical ATP binding protein (PF03029.16)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;