Ll_transcript_29356

• Id Trinity: FTRINITY_DN52231_c5_g6_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_29356
• Sequence: ATTGTCTTCAAAAGAGATAAAAAAATTATGCTGTAAAATTGAGACATTGCCATATATAAAGTTTGAAAATAGTAGACACACAATTTTCTAAATCCCAAAA AAGCTATCTATGACTTTTTTAATTAATTAAGCACTGATATTTTTCTAAGGCACGCCTCAGATTTGTTCTGTTCAGTATACAACGGGACAACCTTCTCCTA TGGGCTAAAATTTTAATTAATAAATAAAATCGCCACATTAATGCTGAAAATAATCTATATTAATGTTATATACGATGGATTAGAGTGGAGGAATAAGAAT TTTATATCATTTTGTTTAGTATAAATGTAAAGCCACCTAAGTAAGTTGTATGTGCCCAAAGTTTTAAATTGTGGTCGCGATTGTGGTCAGTATGATTGCG GTCATTACAGCTGTGAATTGTAGGCGTTGTGGTGTGAATTATTTTGTGATTAAAAAAATAATTTTGAACTTCATATGGCCTAATGCGGTTTGATGTGGCT TGATGCATTCTGATGTAGCCTAATGAGTTGTGTTGCGGCCAAGTGCGGCCACATCATTGTGAGTCAAAGTCACATTATAATTGCGGTGTGATGCGGTTCT GCATGTCACCGTAACTGCAATATTGCAGTGACATTAGGTGATGCGGTCTGCTCTTTAAATCAGTGTATGTGCCTTAAATGTAATAGTTCTTCATAGCTTT GAGAGATTCCTTTGGGTATGTATAGCTATAACCTGATTACTTTTATGCTGATTTCGTCAAGACTAGATCATTTCTGCAAATTTATGCAGAAATGATGGAA TGCACACTTCATCAACTCCTATGACATGAAATTGGGTTGAAACTTATATGGAATTATTGACTATACAGCATTTCCTTTTTGTTTCCTAAGTTGCAGTTTA CAGTAGTTCTGTCTGGCTGCATTTTTTTGTTTCTGAAAATTTTACAATGACCACAGAAAATCAATTGTTGATTAGATATATGCAGTATGCACTCACAACA TATATCGCTGACAATATCGGTGTTGTCAGTATCTAAATAATGAAGGTCCAGAAATGAATGCAAATGATGCTGAAATTCATTACACAATTGAAGTTGGGGA AAAGAACTTGGAGTCATTTTGCTGGTTATATAGGGCAAGGAACTTAGAGACCAAGTAGGAATGAAGTTTGATGAGAAAAGTACTCAAAATTGCTAAATAT AATATTAAGAGGAAAATTTAGCTTTCATGGTTTACGGTCTATCATTGGTGGAAAGTGTCAAAGTTGGCCTTTGGCATAGAATTAAGCATTATGCTTTGCA ATAATAAGCAAAGGCCAGTTACATGATGTACTCCATTGCTAGAGTGTTATTATTGTTTGGGATATAAAGCAAATGGGCATGGATTGTAACACCCCAATCT TGACAGTAGTTTAGTGGTAGTGATTCAATGGAATCAATGACTATACCTCCTTGAGATCATGGGTTCGAGTCGCAGAAGACTCCCTTTAGGGGGAATAAAA TACTGCAGGGGTATTTAAACTTAATAGGTGGCAAGCTCAGTAAATTCATGGGTCGATGGGTCGCATGCCAAGGCTGGGGTTTTACAAAGATCATGATACT TGTGAGGATCAGGATGGCTTATATTAATTCAATATCACAGTTGTCGTAGTTCTGTTGTGGCTGTTGCAGGCTGATGTTAATGCTATAGTTGCGATGTGGT CTGCATTTTAATCATTGGCTGCTTGCATTACTTAGTTTAGCTTTCATCAGAATAGTCTTGGTTTTGTGTTTGGCCATATGCATAGTGGATTTTATTCATG AAGTTACATGGACGTATCATGTGACCTAAATAATGATCCACCGGTCTTGTCATCAGTTATTCAAGGGCAAAGCAAGCTTTTTCTGGATTTAAATATATCC AATGTTACCCTTAGGATTCGTGTGGGCTTCACATCCCAACTCAAATGCCTCCACATCTTAAGGAAATGAGGTCGCGCCCTGACTAACAGCTATAGGTATT GGCCTACTGGTAAGCGCGTGATCCAACAAGTGGTATTTCTTAGGAGTAGAGTGGGCTTAACATCTCAACTCGTTGCACTCAACATCACAATCCCTCAAAG GTCTCTATGTCTTGAGGAAATAAAGTTGTGCCCTAACTAACAGTTATAGCTTTTGGATTAGTAGTAAGCGCCTAATCCTACAGCTTATTCAGTAGTAACC AGTTGGACGTGTTATCATAAAAACAGAGCTAGTACGCCAAAGGTTAATCTCAGATCTTTTAAGTTTACTGATTTTAGTTCTTTTCAGTTTTGGTTCTGTG GGAATGTTTGTTTCTTCATGGCATTATTATCCCGGCTGCAAAATGCATCTCCTATAAGAGTTGCAATGTTTGTCCAACTATTTCATAAGATCATCTCCAA TTGTACAGTTGCAGAATACTTGCATAGCCAAGCAACTATTTGTCCATAGTAAAATGGTTCCCTCAAAATTATATGTATGAATCCACGGCTTAATTAAATG ATTTCACAACCAAAACCCAGATACATTTTAATTTTTTACCTTTTTATGAGTTTCTAAGAGCTCATGGTTGAAGACTTAGAGTGAATAATGCATGGTTAAC CCATGCATGGTTGGGATTGGAGATGCTCTAAATACTAACTGGATATTTGTATAATAGATATGAATTTATGAATTGTGCAGGTGTGGTCCGTGCAAAGTGA TGGCTCCAAAGTTTCAAGAATTATCTGAAAAGTATCTAGATGTTGTTTTTCTAAAGCTTGATTGCAACCAAGAAAACAAGCCCTTAGCAAAAGAGCTTGG AATTAGAGTGGTTCCCACTTTCAAAATTCTGAAGGACAATAAGGTTGTAAAAGAAGTTACTGGAGCTAAATTTGATGATTTGGTCGTTGC
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_24360;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_29356

FPKM

• FPAB: 0.3
• FPNAB: 0.7
• LF1: 0.2
• LF2: 0.2
• LF3: 0.2
• LF4: 0.2
• UF1: 0.4
• UF2: 0.3
• UF3: 0.2
• UF4: 0.3

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_29356

• Blastp: -
• Blastx: Thioredoxin F2, chloroplastic from Arabidopsis with 85.51% of identity
• Eggnog: Thioredoxin(COG0526)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G16400)
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0001269)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_016194020.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;