Id Trinity | FTRINITY_DN52297_c0_g1_i4 |
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Name Transcript | Ll_transcript_29674 |
Sequence | GGCTGGTTCTTGCATTGGGAGCTGAAGCTAAACTGGATGTTGTACCAGGTGCAGCAGAGTTTGCATTTCCATTCACAACACTAGAGAATGCACGAGTGAG TGCATGACAGGGTGTATGAATTATTTAATAATTAATATCAGGACTAATGGGATAAAATATCAATCTATATGTTGCAATCTTTATAGCATTGGTTTTACAT GCTAGTTTTTTTTGGCAGAAAGTTAATGATAAATTAACAACATTAGAGAGAACGACCTTTGGAAAGGACTTCCAAATTAGTGTGGCCATTGTTGGTTGTG GATACTCTGGAGTTGAGTTAGCTGCAACAGTAGCAGAGCGATTACAGAATAAGGGAATTGTTAGAGCAATTAATGTTGATCCAATTATTTGCCCAAATGC CCCACCCAGCAATAGAGAAGCTGCACTGAAAGTAAGTTGTTAAGACCTTTAAATTTATGTTTACCGGAACTTGAATATCTTTCTTGTAAAACTCATGAAG ACACATGCAATTAGGATTATGGTCCACTAAGATTTTGACTTTGTTTTACTTTCTATGGCGAGGCAGTGAGATATATTAGCTCTATTTAAGCATTTATTTT AGAACTTATACTATCTCATGGTTGTAAGATTTAACAGAGTGGAATCAAATGTTTTAAGTTGTCTATAACCACTGTTGATGATCTTAAAAAAATTAAATTA GCAAGTTTAACGAATTAGTGCATAGATTTAATTATGATTGTTCATTTTTTAAGTTGAAATTGTGTAACCTTGGTTATGTATAAGGCAAGATTATCCTTAA ATTATGTTTGTTGAATTTGAAAGCTCTGTCCTTCTCTGAGCAGGACTAAGAGTGCGTTGCCTTCTAATTCTAGTTGGACTAAGATTGTTGTTTGAGATTC ATACTGATTTTTTCATAAGCTTGGTGGTGCCTAAGGAAAGATATTTAGCCCTTGTAGAAGGACTAGGTGACATTTTGTCTGTTTTTTTTTCTTTCCGGAA GAACTCAAATAGGTCCCGAAAATTTTCCATTTCACATTTGTAATCAGGTGCTTAAAATTTGAAAAATTATTTTAATTTGATCTTTGAATCTACCGTACGG GTTATATCACAGCACGGGTACCCAATTAAAAAAAATTTAAAAAACTTTTGAAGCTATAGTGATTATATCACAATATTAATAGGGGATCTATTTGAATTTT TCCCAAAAAATAGAGACCTTGATACCTATGTTGTAATTCAGCCTATTTTTTTCATAAAGTGTTCTGAAGAAATAAATAGTGAACAGTTTAAAATCATAAT TTTTCCTTCCTGGTAACTTCAATAAACCTTATTCTCTATTTTAACTAAAGATCAAGTTTAAATGGATTTCAAATGAACTTAAAACTTTGAAACCATGAGT ATCAATTATTAACTATATTCAAATTCCCTGAGGGTGCTACTCCATGAAATTGAAAAGCTGAATTTCTGAAACCATGAAGTTGACGACCTGCTTTGGATGT TAAAAGCTTCTTCTCCAGCATGCAGCTAACCTATTTCTTCAACTATGGATAGCTCTGGTTGTTACATGCCATTCATTCAAGTCATTTAGTTCCGTTACCA ATGTTATTGCAAATAATGCTTATGATTTCTTAATGGAAATGTTATGCTATGGATGTTAGGTTCTTTCATCCAGGAAGGTTGAACTTTTGTTGGGTTATTT TGTTCGTTGTATTCGGAGGGTGAGTGAATCAGACTCATCAGATACCTTGGCCGGGGTAGATGAAAATCACATTGAAGTAGCACATAATTTGGAGAAATAT ATATTGGAGCTGCAACCTGCTGAAAGGGGGATACAAAGTAAAATCATTGAAGCAGATCTAGTGTTATGGACTGTTGGATCTAAGCCTCCTCTCCCTCAGC TGGAACCTTCAGATTTTCCATTTGTACTTCCACTTAATGCCCGGGGACAAGCTGAAACAGATGAAACCCTACGTGTTAAGGGTCACCCACGAATATTTGC CCTTGGCGACTCTTCTGCGTTGAGGGATTCAAATGGAAGGATCCTTCCCGCCACTGCACAGGTTGCTTTTCAGCAAGCTGATTTTACGGGTTGGAATCTG TGGGCTGCAATCAATGGACGACCCCTTTTACCATTTAGGTTTCAAAATTTAGGAGAGATGATGACCCTCGGTAGATATGACGCTGTCATTTCTCCTAGTT TTGTTGAGGGGCTAACCCTGGAAGGTCCTATTGGCCATACTGCCAGGAAGCTAGCATATTTGATCAGGTTACCAACAGATGAACATAAGCTTAAAGTGGG GATTAGCTGGCTCACAAAATCTGCTATTGATTCAGTGTCATTGCTGCAAAGTACCTTAACCAAGGTCCTCTCCAACTCATAGCTCATTCAAATCGGAGGG ATTTGTGTTATAACTACCAATTGTGATGAACATTTCAAACATTTGATCATTTGTCTTTTCTAGAATCAATTATCAGACAGTAAGGAGTCTCATTAAACTG GTCATATATTTTTATATATAAAATCATGACTCCAAACTATTTTCTCGCACATTTTTTCATCTGATGACTAATGGTCTATACTCTATAACTTAGTACTTAA TGACATATATTTGATāBLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_24691; |
Additional information | - |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_29674
Blastp | - |
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Blastx | Alternative NAD(P)H-ubiquinone oxidoreductase C1, chloroplastic/mitochondrial from Arabidopsis with 75.42% of identity |
Eggnog | Nadh dehydrogenase(COG1252) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT5G08740) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019458586.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |