Ll_transcript_29674

Id TrinityFTRINITY_DN52297_c0_g1_i4
Name TranscriptLl_transcript_29674
SequenceGGCTGGTTCTTGCATTGGGAGCTGAAGCTAAACTGGATGTTGTACCAGGTGCAGCAGAGTTTGCATTTCCATTCACAACACTAGAGAATGCACGAGTGAG TGCATGACAGGGTGTATGAATTATTTAATAATTAATATCAGGACTAATGGGATAAAATATCAATCTATATGTTGCAATCTTTATAGCATTGGTTTTACAT GCTAGTTTTTTTTGGCAGAAAGTTAATGATAAATTAACAACATTAGAGAGAACGACCTTTGGAAAGGACTTCCAAATTAGTGTGGCCATTGTTGGTTGTG GATACTCTGGAGTTGAGTTAGCTGCAACAGTAGCAGAGCGATTACAGAATAAGGGAATTGTTAGAGCAATTAATGTTGATCCAATTATTTGCCCAAATGC CCCACCCAGCAATAGAGAAGCTGCACTGAAAGTAAGTTGTTAAGACCTTTAAATTTATGTTTACCGGAACTTGAATATCTTTCTTGTAAAACTCATGAAG ACACATGCAATTAGGATTATGGTCCACTAAGATTTTGACTTTGTTTTACTTTCTATGGCGAGGCAGTGAGATATATTAGCTCTATTTAAGCATTTATTTT AGAACTTATACTATCTCATGGTTGTAAGATTTAACAGAGTGGAATCAAATGTTTTAAGTTGTCTATAACCACTGTTGATGATCTTAAAAAAATTAAATTA GCAAGTTTAACGAATTAGTGCATAGATTTAATTATGATTGTTCATTTTTTAAGTTGAAATTGTGTAACCTTGGTTATGTATAAGGCAAGATTATCCTTAA ATTATGTTTGTTGAATTTGAAAGCTCTGTCCTTCTCTGAGCAGGACTAAGAGTGCGTTGCCTTCTAATTCTAGTTGGACTAAGATTGTTGTTTGAGATTC ATACTGATTTTTTCATAAGCTTGGTGGTGCCTAAGGAAAGATATTTAGCCCTTGTAGAAGGACTAGGTGACATTTTGTCTGTTTTTTTTTCTTTCCGGAA GAACTCAAATAGGTCCCGAAAATTTTCCATTTCACATTTGTAATCAGGTGCTTAAAATTTGAAAAATTATTTTAATTTGATCTTTGAATCTACCGTACGG GTTATATCACAGCACGGGTACCCAATTAAAAAAAATTTAAAAAACTTTTGAAGCTATAGTGATTATATCACAATATTAATAGGGGATCTATTTGAATTTT TCCCAAAAAATAGAGACCTTGATACCTATGTTGTAATTCAGCCTATTTTTTTCATAAAGTGTTCTGAAGAAATAAATAGTGAACAGTTTAAAATCATAAT TTTTCCTTCCTGGTAACTTCAATAAACCTTATTCTCTATTTTAACTAAAGATCAAGTTTAAATGGATTTCAAATGAACTTAAAACTTTGAAACCATGAGT ATCAATTATTAACTATATTCAAATTCCCTGAGGGTGCTACTCCATGAAATTGAAAAGCTGAATTTCTGAAACCATGAAGTTGACGACCTGCTTTGGATGT TAAAAGCTTCTTCTCCAGCATGCAGCTAACCTATTTCTTCAACTATGGATAGCTCTGGTTGTTACATGCCATTCATTCAAGTCATTTAGTTCCGTTACCA ATGTTATTGCAAATAATGCTTATGATTTCTTAATGGAAATGTTATGCTATGGATGTTAGGTTCTTTCATCCAGGAAGGTTGAACTTTTGTTGGGTTATTT TGTTCGTTGTATTCGGAGGGTGAGTGAATCAGACTCATCAGATACCTTGGCCGGGGTAGATGAAAATCACATTGAAGTAGCACATAATTTGGAGAAATAT ATATTGGAGCTGCAACCTGCTGAAAGGGGGATACAAAGTAAAATCATTGAAGCAGATCTAGTGTTATGGACTGTTGGATCTAAGCCTCCTCTCCCTCAGC TGGAACCTTCAGATTTTCCATTTGTACTTCCACTTAATGCCCGGGGACAAGCTGAAACAGATGAAACCCTACGTGTTAAGGGTCACCCACGAATATTTGC CCTTGGCGACTCTTCTGCGTTGAGGGATTCAAATGGAAGGATCCTTCCCGCCACTGCACAGGTTGCTTTTCAGCAAGCTGATTTTACGGGTTGGAATCTG TGGGCTGCAATCAATGGACGACCCCTTTTACCATTTAGGTTTCAAAATTTAGGAGAGATGATGACCCTCGGTAGATATGACGCTGTCATTTCTCCTAGTT TTGTTGAGGGGCTAACCCTGGAAGGTCCTATTGGCCATACTGCCAGGAAGCTAGCATATTTGATCAGGTTACCAACAGATGAACATAAGCTTAAAGTGGG GATTAGCTGGCTCACAAAATCTGCTATTGATTCAGTGTCATTGCTGCAAAGTACCTTAACCAAGGTCCTCTCCAACTCATAGCTCATTCAAATCGGAGGG ATTTGTGTTATAACTACCAATTGTGATGAACATTTCAAACATTTGATCATTTGTCTTTTCTAGAATCAATTATCAGACAGTAAGGAGTCTCATTAAACTG GTCATATATTTTTATATATAAAATCATGACTCCAAACTATTTTCTCGCACATTTTTTCATCTGATGACTAATGGTCTATACTCTATAACTTAGTACTTAA TGACATATATTTGATā€ƒBLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_24691; 
Additional information-

Expression of Ll_transcript_29674

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_29674

Blastp-
BlastxAlternative NAD(P)H-ubiquinone oxidoreductase C1, chloroplastic/mitochondrial from Arabidopsis with 75.42% of identity
EggnogNadh dehydrogenase(COG1252)
KeggLink to kegg annotations (AT5G08740)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019458586.1)
Pfam-
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;