Ll_transcript_231590

• Id Trinity: FTRINITY_DN52334_c4_g1_i7
• Name Transcript: Ll_transcript_231590
• Sequence: AAACCATGGGTCGTTTACTCCTTCTAAGTTCTAACTTTAAACACACTTCAACATAAGGTAATAAGCCTCGTAATTAACATAAATAACATGTCCACATTTA TTTCCCTAACCCTTTAAACACAGAAAATAACCACCAACGTTGTCTACTACACCTTTTTCCACCACTTTCTCTCTCTAAAATCCTAGAGAGAGAGAGAAGA AGAGAAAGACATGGAAAGTGAGAAAAGGTATGGAGTTTTAATGTGTGGAGAGGATTCAGATTACGTGAGGAAGAAGCACGGAGGGTATTTTGGGGTATTT GTGAGAATGCTGGCGGAGGAAGGAGAGAGATGGGAGGTGTACACGGTGGCGCGTGGTGAGTTTCCAGATGAAGAGAAGTTATGTGATTATGATGGGTTTG TGATAACTGGAAGTTGCAGTGATGCATATGGGAATGATCCTTGGATTCATCAACTTATCAATCTCATTATCAGATTGAATTCCATCAATAAGAAAATACT TGGCATTTGCTTTGGTCACCAGGTAAGTAATAATCACACTCACCTTTGTAATTAGATGAAGTATCACATAAAACAAACCTCTCCATAGAGACAACTAGTT ATTTAAATTATGGCCGCAAAGCAGTATTATGGCCGCAATATTACGGTTGCAACAGTCACCGCAACCGCATCACACCGTAATTATATTTACGATTTTGAAT CACAATGATGCGGCTGCATCGGCCGCAATGTCCTACATCGGCCGCAATGCAACCGCATTAGACTGCATCGAATTCATAAATAGTTTTATAATTACAAAAT AATTCACACCGCAACAGTCGCAATCCGCATTGCAACCACCACAATAACTACAATAGCAGTGATCGCAACCATAATTTAAAATATCAGAGACAAGTTATTT CAACAAAAGAGCATAATAAATTTAAATTTTACTTAAACAATGAAAACTCCTCCGTAACATAGATTAATAAATGATAAACATAACTACAAATGAGTTAAAA GCACTTCAATATTTTCATCTCAAAACAACATTGTTTTGGTTGTTTTTCAAAAACAAAACAAAACATTGATTTACTCGGTTATACTGAGCGGTCTGATTAT CTAAGTCACTAATTTTAAGCTTAAATCGATTGAATCAATCCAAATTTGATGCAAAGTAAAACCAATTTTTCATAAGCAAAAGTAATAGATTCTCTCCGGA AAAAGAGTATTTTCTATTTTTTTGTTGTAAAATCTAAGGATGGAAATTTGAGGTACATAGACACTACATTTATACAAGCCAATCAACCACCACATTATAT CCCTCAATTTTGTTACATCACTCCATTTTAGATGGGTAATTGTAAGAAATGGATAAAATGAAAGAATGTTGTATAAAATATACTGATTACAACAATAAAA ATCTGTTTCAAAATATAAATACTTCAAAAGTGATTAGTATCGGAGGATATGCTTTGAAGTACCCAAAAAATTATTATTGTTTCAATAAAATCCTTATAAA GTTTAAATGGTAAAATATAAACTGAATATTAGTTTTCTGAATTTTAATGACATTAATTCTTCTCTTTTGAGTTTGAAACAAAGGCAGTATATTTTATGTT TACATTTTATGATACATTATTTACAGCTTAATGGTCCCCCTTGGGTCACTTTCATCCAATGCCTGACATTTTCACGTGTTGAAATTGATGAATGCCATTC AGATTCTTTTTTAAATTAATGTAACGTTTTGTGTACATGTTATAATTTAATTTTCTGAAAATGTCCTTTTTTGGGTACTGACTTGTTTTAGGCGTGCCTA ATAGGATCCATATCAGTTTTTAACCAATAAAAATATTTTTACTTTGTTTTATAAAATAATGTTTAGAATTTAAATAAGAATGAAAATTATAATAAATTAT AAAAAATAATTCCAGATCTAAATAAGAATGAAAATTATAATAAATTATAAAATAATGTTTGAGATCCAAATAAGAATGAAAATCAGAAGATAGAAGATGT TGTAAGTGGTTATAGAGTCTTAGCTTCAATGAATTTGTTTTTTTCTCTATTTGTTTGGCTTTTTTAATTTGATACCATCATCCATTATTTTCAGCTTATT GTGCTTAATTATTTAAAACTTCCTTGTTTCTATCCGTAGTTGTTAGACTCATTAAAACCATAACATAGTGTATTTACTGTATATTATTTAACATTTATAT TACTTTGTTTCAATTTTTTAAGTTAATAATTGTTAACATATAAATGACTTAGTAAAAGTGTAAAAACAATTAAATTGTGTAAATCTTAAATACTTAATTT AGTTCCTTCTTTTGGATAATGTTTATTATTGGTGATATCAATTTATTAGTAAAGTGTGATTACTTGGTTGTAGACCACGTACCATGTTGGATTTTCACAT GCTTCATTCAAGCATCTGCTAAAGATTATGGAATCTCATTATTGATATGCCTTTTAATAAATACGAAGATGGGTTTATGACATGTCAGATAATGTTTGGT CAGTGCATTGGATTAATCAAAAAATACAAATGACTGAACTCATCCCATTTGCTCTTTTAATTTTTTATTATTCCTTCAAGGTTTGCCTTTTATTTTCTGC TAAAATTTGTGTTTAGTCCCTAAAAACATATAAAATATTGATTTTAGTAACTTGATTTTTCTTCTTCAATTACTTTCTTCTTCATAGTCTTTATTAATCA TGTGCCAACATCAAAATTGATCACATTATCAATTAGTATAATATGTAATAGTATTTAATGGATAGTTGTTATATGTATAAAAATCATATGAATCGTAACA AGAATGTGAATGGTGTTTGTTTGATTAGATACTAGGGCGTGCATTAGGCGGGAAAGTGAGTCGATCTCCAAGCGGATGGGACATTGGTGTTAGAACCATA ACATTTTCATCATCCTCACTTTTCCCACCCTCATCTCTCAAACTCCCATCTAATCTTTCTGTTATTGAATGCCACCGTGATGAGATAAGAGAGCTCCCTT CAAAAGCAGAAGTGATAGCATGGTCAGAGAAAACTGGAATAGAGATGTTTAGATATGGAGATCATATAATGGGGATTCAAGGCCACCCTGAATACACCAA AGACATACTTTTACACCTCATTGACCGTCTTACTCAACGCAACTTCATCATTGTATATATCTTCACCTTCTTCTACTTCATGGTTATTTGTTGCATGGTG TATATATTCTTTTGGTGAATCAATGTTACTACAAGAGACATTATTACATGTTATTAACAATAATAATAATAACTCAAGATGTGGTTCAGAACCCTTGTCT TAATCATTTATTACATTATTTTCAATAGTTAAATTAAGATTTGATTGTTGTTATCCATCCTTGTTTAGCCTGAAATTTCTACAAGTGGTGTAGTCATTGA TGATTATGGATGTTTTGGTATGACAGGAAAGTTTTGCTGTGGAGACAAAGTTAAAGTCAGGAATGTGGGAGCCAGATAAAGAGGCATGGCAAAGACTGTG CATCAGTTTTCTTAAAGGTCGATTATGACAATAAATATTTGTTTTTCGTAGAGGGGATTTGTAGATATAAGAAGTAATATTCTTGAATGATTTGTCATGT TAAAGTAGAAGACAAGTGTAGGGAACTAAGTGTTTGTATATGTTATGTTTGCATGAATTGAACCAGAATTATCTAATTAAGACAAGTTATGCC
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_24928;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_231590

FPKM

• FPAB: 0
• FPNAB: 0
• LF1: 0.2
• LF2: 0
• LF3: 0.1
• LF4: 0.1
• UF1: 0.1
• UF2: 0.1
• UF3: 0.1
• UF4: 0.1

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_231590

• Blastp: Gamma-glutamyl peptidase 5 from Arabidopsis with 50% of identity
• Blastx: Gamma-glutamyl peptidase 5 from Arabidopsis with 49.49% of identity
• Eggnog: Catalyzes the synthesis of GMP from XMP (By similarity)(COG0518)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT2G23970)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019425905.1)
• Pfam: Glutamine amidotransferase class-I (PF00117.27)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;