Ll_transcript_231090

• Id Trinity: FTRINITY_DN52347_c3_g1_i4
• Name Transcript: Ll_transcript_231090
• Sequence: AAGACATACACAGATTTGTGGAGATTGAAACTCCAATACTTTCTAGATCCACACCAGAAGGTGCACGGGATTATTTAGTTCCATCAAGAATCCAGGTATT TACTTATGCTACCTCTTGACAATCTTAAAATTGTCATATTCACATGAATATTATAGTTGAAGACTATCTTAGAACTTTTCAAATATACTCTACTAATTTT TCTACATATTATTCATTGGGTTTCTTCCTCTAGTATAAGGAGTTCAGTTACCAATTTGAGCAACCTTGCATTAGATATCTCTAAAAAGTTAGGATATAAA TTATGGTTTTTAAATGTGTTTCAATTTACAATAGAGTAAAGACCACAACTTATCTATTCCTGATGTAATTAGGTTTAACTTCTTTACAATTAGATCAATT TAATGTTCTTACAATTGTCAAATTAGAAATTACAATGTTGAATTTTAAGAGTTGATGGGTTCCTTCATCGCTTATGCACACACCTTGTTAGCAACACTCT TGATTTTTACCTTATTATGCATGTGCCCTCAAAGCATCATCATGGTGCATATGTACTTTATTTTTGGTGGGGGCTAGTATAAAATATGATAGCAAAAGTC ATATGTTTGCTGCCTATTTTTGTCTAAATTAGGCCACAAAATGATTTATATTCTATTGGAGCAGCATCTGTGATGTGCAAAGCATTGATATGAGCAAAAT CATTCTAAGTCCTTTTATCTATATTTTGCTAATTTATACTATTTAAAATTTAGTGTTGTTTATTCACTAATCACATGAATTATGAAGACAGGGACGTTCT ATGCCTTGCCACAAAGTCCACAGCTATTTAAGCAAATGTTAATGGTAGCTGGTTTTGATAAATATTATCAGGTAGCAAGGTAATAATTTGTTGGTTTAGT TTCTAATGATATTTATGTGTTCAAGATATGCGAAGAGTTTGGTTAGTCTTGACGCATTGTTGTTTTTTGTTTGTTCCTTGTCTCTCGACTTCTGTTTTGG AGGATATGTCGTCCTCCCCCCTTTAGTGCTTTTCCTTTTTTTCTGTTTACCAACTATGTCCTTTCTATTAAAAAATGCATTTGGTTCTAACTTACATAAA CTAAGAAAACAGAATGTTTTTGGTAGATGTTTCCGTGATGAAGATTTAAGAGCTGATAGACAACCTGAGTTCACCCAATTAGATATGGAGTTGGCTTTTA CTCCTTTAGAAGATATGTTGACCCTTAATGAAGAATTGATCAGAAAGGTTTTTCTTGATATTAAAGGTGTGGAGTTACCAAACCCTTTCCCGAGGCTGAC ATACGCTGAAGCAATGGCTAGATATGGTTCAGACAGGCCAGACACCCGATTTGATCTTGAGTTAAAAGATGTATCCGACATTTTCTCAGGGTCTTCCTTC AGGGTTTTGTCTGATTCCTTGGAGAGTGGGGGAGTTATTAAAGTTTTGTCTATACCTTCTGGTGCAAAAAGATACTCAAATTCAGCTCTTAAGAAAGGTG ATATTTATAGTGAAGCACTCAAATCTGGTGCAAGGGGTTTGCCTTTTATCAAGGTCTTGGATAATGGGGAGATTGAGGGGATTTCGGCATTAGTATCGAG TATGGATTCTACAACAAGGGAGAATTTGTTACAGCGATGCTCTGCAGGGCCTGGTGATCTCATTCTATTTGCAGTGGGTCCTCATGCATCTGTAAATAAA ACTCTAGACCGACTTAGAACTCGCGTGGCCCATGACCTAGATTTGATTGACCATGGCAAGCATTCAATTTTGTGGATCACTGATTTTCCAATGTTCGAGT GGAATGATTCAGAGCAGAGGTTTGAGGCTCTGCATCATCCTTTCACTGCACCAAATCCCGAAGACATGAGTGACCTTGCATCTGCTCGTGCATTGGCTTA TGACATGGTTTACAATGGAGTAGAGATTGGTGGGGGAAGCTTGAGAATTTATAAGCGCGACATACAGCAAAAGGTTCTTGAGATTGTTGGCATCTCAATA GAGCAGGCCGAAGCCAAGTTTGGTTACCTTCTTGAAGCACTTGACATGGGGGCTCCACCACATGGAGGCATAGCTTATGGTTTAGACAGATTGGTGATGA TGTTGGTTGGTGCTAATTCCATAAGGGATGTGATTGCATTCCCAAAAACAACTACTGCACAGTGTGCCCTCACAAGGTCACCATCTGAGGTGGATCCCCA ACAGCTTAAAGATCTTTCAATAACTATTTAGATATATACACACCCCATTTTTGCATTATCCTAAGGAACACTTGATTTGTATGTTTTATTAAAAAAATAA TTATAACATTATTGATGTATATCAAGTGGAGTTTTAATTTATATGTATTTTTTATGGAGGGGTTCCAGTTGTGGATTGTATCATTGGACTTGTACTTGTT CATGTTCTTGGTGGTGTATTCTAGCCAAAAATAGTTATGCCGATTAATTTATTTGAATTCTCAAGAGGTAAAAAA
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_24999;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_231090

FPKM

• FPAB: 0.1
• FPNAB: 0.4
• LF1: 0.5
• LF2: 0.3
• LF3: 0.6
• LF4: 0.5
• UF1: 0.4
• UF2: 0.5
• UF3: 0.6
• UF4: 1.1

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_231090

• Blastp: Aspartate--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial from Arabidopsis with 77.22% of identity
• Blastx: Aspartate--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial from Arabidopsis with 81.25% of identity
• Eggnog: aspartyl-trna synthetase(COG0173)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT4G33760)
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0000141)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_020220208.1)
• Pfam: tRNA synthetases class II (D, K and N) (PF00152.19)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;