Ll_transcript_87003

Id TrinityFTRINITY_DN52459_c3_g1_i4
Name TranscriptLl_transcript_87003
SequenceCAGAAAACAAAGATCTTTCAGGGTTAGACAATTTCTCTCTCATTATAACTTCAATAAACGATGATTTTTGTTTTTAAAATTAGCCCTTTTGTGGCTTCTT TGTATTGTTTTAAATCGTGGCTGCGGTTGTGGAAAAATATGGCTGATGCGGCTGCAATTGTAATCATGCTGTTGGGGCTGTTGTGTACCACTATTTAAAA CAATACTATCTTTGAAAGGGTTGATCCTGTTTATGTACCCAACCCTCTACCTCATTTCCATCTTCTTCTAACTTGACTTAAATTTATATGATGGGTGGAA GTTCTATTGATGATGATTGGTTGCTTGCTTCATCAACTAAGACAGTGGTCTTGGTTGGTCGTACTGGCAACGGCAAGAGTGCAACGGGTAATAGCATCCT TGGAAAGAAGGCCTTCAGTTCAAGGTTAAGCTCCTCTGGCGTCACAAGCACTTGTGAATTACAGAAAACTGTTCTAAGTGATGGACAACATGTTAATGTT ATTGATACTCCAGGTACAGTATCGAAACTTCTAATTACATGATTCTATATTTGATTTAAGTAAGGGGAGTGGTTGTGTTGCTTCTTTTTTGCGTGGTTCT TATAATTCTCATCATATCTCAGTCTAACCTAACAAGCTCTGTAGGACTGTTTGATTTTTCGGCTGGATCTGACTTTGTCGGGAAGGAAATAGTCAAATGT ATTGATTTGGCGAAGGATGGGATCCATGCCGTCCTTGTAGTGTTCTCTGTAAGAACCCGCTTTACTCAGGAAGAGGAGGCTGCTTTACGTAGCTTGCAGA CTTTGTTCGGAGACAAAATTGTTAACTACATGATTGTGGTCTTCACTGGAGGGGATGCTTTGGAAGATGATGGGGAGACACTGGATGATTATTTGGGTCG CGAGTGTCCTGAGCCTTTGCAGGTATCTTTGAGTATAATGATTTGGATTTGCTCTGTGAGCTTGGTTTTGGGGTTATAAGTTGAATAATGGATAAATAAA TCCTTGAAATACCAGAACTTTAAGGTTGAATATATTCTAGATTGGGAAAGCTACTTTTAGACATACAAATACAATTTTGTTAATGTTGCACATCAAAAGT ATGATACTTGACGCTGTTAAGAAAGAAAATAAAATGGACAATGCACGTCAAAAGTATGATATTAGGTGATGCAAATCTTCGGACTTGAGGAGATGTAACA TATGACCATATGGGTGAGCTCAGTGATAGGTATACTTTCCTTAGTAAATCAAGTTGCCGTTGTTTCAGACTCCTGAGGCCAAGCTAGTTGAGGTTGTATG CTAATTTTATTTTTGTGGTATTCTAGCTGCATTGTGTGTGGGCTTTTAAGCTTCTAGGAAACATGGTTGTTTCTCCTTTGTCCCTTTCTATTGGCAGAGA TTTTCTTATGGAAATTGAGTAGTTACAGCATATTCAGTTTATATTAGCTTTCTTTTATATTCTGTAGAGAGTTTTTGTATTATAAGTGAGACTATTTTCT TGGTCTGGTGTTCTTTCTATGTTCACCATATGAATGCTTTAACTGGGTTGTTTGCTATTTTTTAATTTGAGAATATATTAACCTTGAAGCTGAAGGCTAT TCTACTGATTTGGCGATACTCAATCAATTTGTGAGATAATTGTGTTCAATTGTTGATGGCTTTCAGTTTTGAAATAAATAGCTGAGATGTCTTTCCTAGT TTTGCTTTTATATCATTCTTTTTGCTTTATTATGGTGCTTTAAGTAGTATAAGACTGTTGTATTGCATGAATATCTCGGAATATTGGACTATTCGATTTA CAAAACTTTAAATGGAAAACTTGTTGATCTTTAATTGAATTTTAACATTTTGTAGGAAATTCTTGCTCTGTGTGATAATCGCCGCGTGCTTTTTGATAAC AAGACTAAGGATGGAAAAAAGAAGTTTGAACAAGTTC BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_25691; 
Additional information-

Expression of Ll_transcript_87003

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_87003

Blastp-
BlastxImmune-associated nucleotide-binding protein 9 from Arabidopsis with 59.62% of identity
EggnoggTPase, IMAP family member(ENOG4111GYZ)
KeggLink to kegg annotations (AT1G33970)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019461220.1)
Pfam-
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;