Id Trinity | FTRINITY_DN52557_c4_g4_i3 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_253079 |
Sequence | ATTTTTTATTACTCATGTTTCTTTTTTTTTTAAGTTTAAGTTGGTCACAAAAGTTCTGTTATTATTTATCTGTTGTTTTTAAATTTGAAGGCAAATAGGC AATATTAATTTTTTTATCAAATTTATATTCACACTTATTTAATATTTATTTACTATGAAGATAGAGAATGCCATTGGTATTGTAAAATGAGGAGATGAAA TGACATACGAATATATGGAGAATGTTAACATCTGCCCTAGGTCAATAACTCATGAAAAAAGAGGCATTTCATCTTGAAAATAAATTATTTAATACTTTGA GAATTAGTAAAATGCTCTTACTATACTTGTTAAAAATATACCTAAAAACAAACAAAAGAAATAATACTTTCTTCGTTAGTATAGGCAAAACTTACATAGA TGAAGTATATGTTGTCATCAAATCTTCTATTATCATTACGTAGGATTTTTCCTTTCACACCATATTTACCAAGAGAATGATTTTGTTTTGGTATTGAATT TATTTTTCACCTGGCTCTCTTTATTTAAGAGGACCCAGTCAATGTCACTCAACTTCAAATTTTCAGTTATGTAATAGCATATTGAGTCTGTTTGTGATGT GAGTGGTGATGGAAATTATGGTTTACATTCAATTTCAATGTGCCATTTTTGAAGTGAAGATGATAATTTTTTTTTGATAAGCAAAGAAATCGATAAAAAA GGCACAAATGAAGATGATAATATATTAGTCCATGATGAATGAGATGACATTTTACCATGGATATAAAAGTATTCTCCCAAACCATATGTTAAATTTTGTC TTGAACTAATAAAAATATATCATATTAATAAATAAAAAATATTTCTTTTTTTCTTTTTTTTCTTCAACGTTACTAATGAAGAATATCTTTTAAAACATAT TTTGGGATAACAGTCTTATTGGTTATTATAATGCTACCTTCAAGAAGCTAAGTTTGATAGAAATGGAAATGCATCATGTGATAAGGGGTTGAATCTACTG ATATATGGGACATGTGATAGCAACAAAATATAAGGTTGCATTGATATTTATTCATCATACCCAAATTGAGAACTAAATTATTATCACCTCTAATTTTTCA AAGTTGAAATATTTATTTTGAAAAGGTTGCAACATCTTGGGAAAGTGGACTACACGACCATCTATAATTGTTCAAGCTATTATTGCCAAAACCAATTACA CATGAGTCAATTATGAAACTTGCAAAAAAATATTTTTCTATAAATCTTGGAAACACTACAGATAGTGTACATGTCGGATAGTTTTGACATCAATTTTTTT GAAATGAAAAATATTATTTCAATCCTATTATGAATGGATATTAATTGAGAGATTATTTCACTTGTGGATGCATAGACATAGATATTGTATATGTTATAAT AATATATATTTTTATAGAAAGTAAATAAATTTGTATTTTGACTAACCACCATTGAAATAGAGTTAGTGCATTGTGGCTGTAGGCTGTTAGAATGTAAAAA GTAAAAAAATACATTCTAATTAGTTAGTGTTAGTTTTCATTATTTACTATAGAATTTGTTCTAACATTGTGTAGCTCGAATGTAATTTTTTAATCTATCT GGGCAGACAATTTAGAATATAATTTATAGTAAACGATATAATCCGACAATGAATAGTCAAAATGTATTTTTTTAAATTATGTAAACTTTTCATATTCTTA TCTTTCACTCAATCCAAATAACATAATGGAATATATAAAATACTAATGCATCCTATATAGAGCTGTATAAACAAACTCAATTTTTTTTGTATCTTAATGA AATATACATGCAACTAGCATAATAGAAATCAAGTAGCATGTTACAAAAAAATATGAGGTCGAAATTTAAGTTGTTATAAAAATGCATGTCACTAGCACTT TTAGCACTTTTAGGATGAAGATTTATCGTCCCAAATATGTCCCCAACCATGTACCAAGCCAATCGAATAAAGAAAAATAAATAAAGTATTAATATATTTA TTGGGTGGACATAATGGAAGGAGTTATTTAAATTAATATACGTAATTTCTTAATTCTGAGGGTATTTAACCCTTTGTCAATAGGTAGTAGATATAAATGT GATTCTTGATGTATCCAATCCAAATAACGCACTGCTTACTCCCTAGGCGAACTCACATGTGATTCTTGACCAGTTAAAAAAAATTATGTGACACCTGTGA GTATATGCATCTGGTATTAAACTTTTCAATACTAGAGAGAATCACTACTTATTATTAGGTATTTCAAAAAGAATGGGTTCAACATTAAAAATTGAGTTAA AAATAATCGTAAAAATTTGACTCTTAATCAAGCTTAGACAAATAACTTTCAAACCAAATAGCATCCGATTTTTTGGGCATGAATGATCATGACCCTAGTC CAAATTAAACTAACCCTAATCCGAGTAAGTAAACAGTATATAAAATCATAAAAGCTCAGAAGAAGCTCAACATTTGTAATATCTTTGAAACACAAGTTGC TGTTATAAGTTTGAGCTAATTATGACATTAGATAGTGGCAATAAAATTAAGTTATAAGGTGGTTTGATGGTTAGGATGAAAGAGGTTGAGGTGGTATCTC ACCCACAACAAAATACTAACATTTATATTCAAAAAAAATAGCGGGAAAAAAAAAGATAGTGGCAGTAAACAAATGGTTTAATAATTTATGTAAGGATTAA TAATATACTGATGTAAGGGTAAAAGCGGTCCCCTCAACCAAATTAGATTTTGATCACACGTCCGCTTGTTGGCATCTGAAATTTGACATAATGATTATAT TATTAAATTGTTTCAATAATCTGACAAAACCAGTGGAATAGAAGCTCTGGGGAATGGAATAGAAACGGGATTTTCGAATTCTGAGAAGCCTTAAAAGTTA AAAGAAATAATATAATCTCAAGTTTTTCTAACTGGAATTCACTGTTCAATTATATATTTTAGCTTGTTTTGGAATCTGGTTCAGTCCCTTGTTTCCATAT GATATTTCAAAGTTTCAAGCACTACACATAAATAAACTTTATTTAAATTTTCTTGGAACTTTGCTTTGTCTTGGATTTTAGCTGATAAGCCTAAACTGTC ACGAGATTAATACTTCTGTAATCAAAGTTTAGATTATGGGAAATATGTATCATAAGACAAAGAAGATCATCAACCTCAAATAATATTTATAATAAATTTG AGAAATTTACATATCATCTATAACAAAGAAAACTTGACTGATATAATCTTAAATGTATATGATTGATTCCCTTTAAGCAAAGTCTCGAATTCGAGTCTTA TGAATGAAAAAATGTCTGATACGAGATACATATGTGAAACTAAAAACCACATCATAGTGAACTCCACCAGTTGTTCATGAGATTATTATTTTAAAATGGT AAATATATGATCGTAATCCCAATGAGTTCTAGTTTGGCGGTTTATTGAGATTCCACTTTTTGTGTTATGAACAATTATTGAGATTCCACTTTTTGTGTTA TGAACAATTCACACAAAAATGGTTATTTGAAGGTACAACTTACAACATACATGTAAGAAACGATACTACAACTTTGAAATCATAAAATGTCTATTCTCTT GCTTGGATTTCTTCCTTGGTAGGTGCTCTCTTTTTAAGAGCCTTGTCCTTCGCTCCTTATGTATATGGAACCAAAGCATCCTCGCAAAACACATAGACCA TTTTAAAATTCATTTAGTCACCAGAAATGGCGGCTGAAGCTTCGGATGCAGATCCCTTCTCGGGAACCATATAATGTATTCAACTTGAGTCTAACCTCAC TCTCTTCTTCCTCTCTTTTGTCTATCAAAGCTCTTAGGGTTTTATACCTTCAAAGTTTTTCGGGTTCTCTTGAAAGCAGCTTTCACTTTGTTATTTCTAG CTTTTACTTTTCACTGTTTTGGTTAACATCTTGAGGAGAGATAGGGTTTGTTTCACTAAGAAAATAGGTAGGTTAAGATATGGGAGATAGAAATGAAGCT GAGAAAGTTGATGAAGTTATGCTACCAGGGTTCAGGTTTCATCCAACTGATGAGGAGCTTGTTGGGTTTTACCTGAAGAGAAAGATTCAGCAATGGCCTA TGTCTATTGAGCTAATCAAACAACTTGATATCTATAAATATGATCCTTGGGATCTTCCAAAGTTGGCCTCAACTGGAGAGAAAGAGTGGTATTTCTATTG TCCCAGAGACAGGAAATACAGGAATAGTGCAAGACCTAATCGGGTAACAGGAGCTGGGTTCTGGAAAGCTACAGGGACTGATCGACCCATCTACTCCTCA GAGGGTTCTAAGTGTATTGGCCTCAAGAAATCATTAGTCTTCTACAAAGGTAGAGCTGCCAAAGGGGTCAAAACTGATTGGATGATGCATGAGTTTAGAT TACCTTCTCTCACAGACTCATCACCATCTCCAAAGAAGTACATAGACAAGACCATTCCCACAAATGACTCCTGGGCAATATGCAGGATATTCAAGAAAAC CAATGCTACAGCTCAAAGAGCTCTCTCTAACTCTTGGGTCTCTCCCTTACCCGAAACAAGGACATCTGATATGCTAACCAATGATGGAAACAGCACCCAT TTTTGTTCATCAAACATGCTACTGACAAATCAAACTGGCTTAGCCAGACAGTTTTGTAACATTAACCACAATGACACACATCACTTAACCACTAGTATTA GCACTCTTTGTCCTTTAGATGTTGCTTCTTATAACAAATCCATTATTAACCCATTGCTTTACAAGCCCTTTGATCAGTTACCCAATTCAAATGGACACAT TAGCACAGGCTTAATGTTTTCAACTCCTCTTGAAACATCTACAACTAGTGCCAAATCTACAGTTGATGTTTCTTCCTTGCTGTTGAATATGTCATCTTCT GTGCTAGGAGATTTTAGTAAACCCTGTGAGGGAACAACTACAAATTTTGGTGTGCTGCAAGAGCACAATCATGGTTACTCAATACCATTACAACGTGAAA TGCAAGAGACCATTGGCAACCAATATGACAGCGTATTGGTGAAGATTCCTAATATAAATGTGCCTTGTGTTGATGAACAAGAGTTGGAGAAAGTACGATC CATTGGTTTTCCACTCAGTGTGCCTAATTTCAACATTGGAGATGCATGGAAGTCAAATCTGCTTTGGGATTCTTCCTCTTGTGATTATGTGTCATCTAGT TATTCCACTACTAAGTGTTATACTTAGTCCAATTTATACCAATTAGAAGCCATTTTGTTTATAGCTTCTAATAGGTAGGGACTAGATGCTGGAGTCTGAC TTTTGTTTTTACTTATACTTATGTTCAGTTTAGATTAGCTTGTAGAAGAATCTTTGTTAGGAGTTAGGACTTTGAACTCTTCGTGATTCAATATAAGATC TGAACTAAAATGTTTGTGGAATATAATTTTGGAAGCAATCTTAAGTTTCAAACAATTGATTAGAAAAAAA BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_26476; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_253079
Blastp | Protein FEZ from Arabidopsis with 55.34% of identity |
---|---|
Blastx | Protein FEZ from Arabidopsis with 66.17% of identity |
Eggnog | NAC domain-containing protein(ENOG410YHVU) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT1G26870) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019445942.1) |
Pfam | No apical meristem (NAM) protein (PF02365.14) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |