| Id Trinity | FTRINITY_DN52581_c3_g4_i3 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_252442 |
| Sequence | CAACAAGCCTCACTCTTCTCTTACAACTCTTCATTCTCAACCATGGTTTCAACAAATGAAGTCCCTAATAAACCTCTCCAAGGAGTTTCTCTTCAGTCAA CAGATCCCACCTTTCTTTCTTCATCTAAAAGGTACCTTGGAAGCAATTACAACTCCACAATTTTTATAACTTCCACCACATTAATTACAATACTAGGATC ATCTATCTCCGACGCTGTCTCATTCCATGTCTCATGCCAATTACATATTATCATATGAATAAAAGATTTTTTTTAACAATATTCCGCCAAATGGAGCTCC TAGAAAGCAAAAATGCTACTTTTTATGTGTTTTTGTTTTCCTTAACAATTTAGTTTTACGTTTAAAATTAATGTTTTTAAGCACAGTGTAATTAGATATA TTAAATTAGTCCTGCTAGATTATGCCAATAAACAAATAACAAAATTTAGCATATTCTCATATTATGTTGATTTTGTTATTTTATGTACTTACCTAATGCT TGATATTTTGACCTTGTAGTATGTTGGATATCCTAAGGTTATAAATATAATTTTGAAAATGTTATCTAAATGAATAATTGGTTTGGATAATTTCTCATGA TACCTGAAAGTTCATGAGTAAATTACATATACTTTGTTTTAACATTATATGGAATGATTATCATGGTGAGAAGTTTTCTAAATCAGTTTCTTATATGGAA TGAACATAAAATTAAGTATAAAAAGAAGTTGATCATATTCTATACAATTTAAATTTGCTTAGTCTATGTTCTTGTGCAATGATTCATAATGCTCTAGGTT GGAAGGCAAAGTTGCAATTGTAACTGGTGGTGCCAGAGGCATAGGTGAAGCAATTGTGAGAGATTTTGTGAAGCATGGTGCAAAAGTGGTGATTGCTGAT ATTGATGATGAAGAAGGAACCAAGCTTCAAAGTTCACTATCTCCTTCAGCAACCTATGTGCATTGCAATGTTAGTTCAGAAGAAGAGGTTGAGAACCTTG TAAGATTCACAGTTTCACACTATGGACAACTTGATATCATGTTCAACAATGCTGGGGTTCTTGGAAACCAATCAAAGAACAAAAGCATAGTGAACTTTGA CCCTAATGAATTTGAGAAGGTGATGAGTGTGAATGTGAAGGGCATGGCTTTAGGGATCAAACATGCAGCAAGGGTTATGATTCCAAGAGGAGTTGGGTGT ATTATATCAACATCTAGTGTAGCTGGTGTTATGGGAGGGCTTGGACCTCATGCTTATACAGCTTCAAAGCATGCCATTGTGGGGATTACAAAGAACACAG CTTGTGAGTTGGGAAGGTATTGTTTATAAAATATTTATATTTGTTTATAAGGGTAATGATTTTCTTTAAGATATAGACACAATTTTCTAATTTGATGGAA TCATTTTCACAATTCAACCATGTAAACTTCATAATTTCTTCCCTTAAGTGCATGATTTCAAGAGTTTGACTTTACTCATCTTTTCGACCACAAATCCTCG AACCTTTGTATTTTTGATCCGCTTCACATTCTTGTAATATATTGTATCTTCTTGTAACTCTGATTTACATTTAATAATATTATTTTTGTCGATAAAAAAA AACCTTATAGACAATGTAATCACATTGTAATGGAGGGTCAATTTATTTTCATTGATCTAAATAACATTTTTTTAAATAGGTATGGAATAAGGGTCAATTG TATTTCTCCATTTGGGGTGGCAACATCTATGCTTGTGAATGGATGGAAAAATAAAAGTGGAGAAGAAGATGATGATGACATTAACAATTTTGGTGTGCCT TCCCAAGAGGAAGTGGAGAAAATGGAAGAGTTTGTGAGAGGGCTTGGGAACTTAAAAGGAGCAACATTAAGGCCTAAAGATATTGCTGAGGCTGCAGTGT ACCTTGCTAGTGATGAATCTAAGTATGTTAGTGGTCATAATCTTGTTGTGGATGGTGGCATCACCTCCTCAATAAATTGTATTGGCCTTTAAATTGTTTC ATGTTCATGTTCCTTAATCAAACTATATCAAAGTTGGGTCATCAAGATTGTGTAATGACTTTCTATTAATTAATGTCTACTCTTGTATAATAATAATAAT AATAATAATAGTAATAATAATAATGGAGAGTTAGACGAGGAGCAAAAAATTGCATTGCAAATGATAGAGGAACTTCTTAATAGGAACTAAGGTATAGAGA ATTAAAGTGTTTATTTAATTCCACGTGGGGATTCATTGAAGATGTTTCTAGTCCCATGTATAGTTGTACCTTTCATTTTGATTTATTTGTTTGTTTGTCC TAAATAGGATATTGTTACATTTATTACATTAGGAATGAGGATGTGGAGTTCTTGTGGTTGTGATTTGTGAATGTGTCCCTAATGTGTTGTGTAAGGTACC TAGATTGTGGTTAAGATTGATGTACTATGTAAAAAAAACTGTCCAGGTTATTGCCTTAGCTTAGAATTAAGGTAGTAAGAGAAAATGTATACTGTACTAC TATATTACAAGCAAATTTTCTTATGTTTATTTGGCTTCAAGATATTTGGTTAAATAAATGTATTTAAAATTTTCAATATTAAAA BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_26617; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_252442
| Blastp | Sex determination protein tasselseed-2 from Zea with 59.82% of identity |
|---|---|
| Blastx | Short-chain dehydrogenase reductase 2a from Arabidopsis with 65.75% of identity |
| Eggnog | Dehydrogenase reductase(COG1028) |
| Kegg | Link to kegg annotations (542246) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019450532.1) |
| Pfam | Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase (PF13561.5) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |