Ll_transcript_252451

• Id Trinity: FTRINITY_DN52581_c3_g4_i5
• Name Transcript: Ll_transcript_252451
• Sequence: CAACAAGCCTCACTCTTCTCTTACAACTCTTCATTCTCAACCATGGTTTCAACAAATGAAGTCCCTAATAAACCTCTCCAAGGAGTTTCTCTTCAGTCAA CAGATCCCACCTTTCTTTCTTCATCTAAAAGGTACCTTGGAAGCAATTACAACTCCACAATTTTTATAACTTCCACCACATTAATTACAATACTAGGATC ATCTATCTCCGACGCTGTCTCATTCCATGTCTCATGCCAATTACATATTATCATATGAATAAAAGATTTTTTTTAACAATATTCCGCCAAATGGAGCTCC TAGAAAGCAAAAATGCTACTTTTTATGTGTTTTTGTTTTCCTTAACAATTTAGTTTTACGTTTAAAATTAATGTTTTTAAGCACAGTGTAATTAGATATA TTAAATTAGTCCTGCTAGATTATGCCAATAAACAAATAACAAAATTTAGCATATTCTCATATTATGTTGATTTTGTTATTTTATGTACTTACCTAATGCT TGATATTTTGACCTTGTAGTATGTTGGATATCCTAAGGTTATAAATATAATTTTGAAAATGTTATCTAAATGAATAATTGGTTTGGATAATTTCTCATGA TACCTGAAAGTTCATGAGTAAATTACATATACTTTGTTTTAACATTATATGGAATGATTATCATGGTGAGAAGTTTTCTAAATCAGTTTCTTATATGGAA TGAACATAAAATTAAGTATAAAAAGAAGTTGATCATATTCTATACAATTTAAATTTGCTTAGTCTATGTTCTTGTGCAATGATTCATAATGCTCTAGGTT GGAAGGCAAAGTTGCAATTGTAACTGGTGGTGCCAGAGGCATAGGTGAAGCAATTGTGAGAGATTTTGTGAAGCATGGTGCAAAAGTGGTGATTGCTGAT ATTGATGATGAAGAAGGAACCAAGCTTCAAAGTTCACTATCTCCTTCAGCAACCTATGTGCATTGCAATGTTAGTTCAGAAGAAGAGGTTGAGAACCTTG TAAGATTCACAGTTTCACACTATGGACAACTTGATATCATGTTCAACAATGCTGGGGTTCTTGGAAACCAATCAAAGAACAAAAGCATAGTGAACTTTGA CCCTAATGAATTTGAGAAGGTGATGAGTGTGAATGTGAAGGGCATGGCTTTAGGGATCAAACATGCAGCAAGGGTTATGATTCCAAGAGGAGTTGGGTGT ATTATATCAACATCTAGTGTAGCTGGTGTTATGGGAGGGCTTGGACCTCATGCTTATACAGCTTCAAAGCATGCCATTGTGGGGATTACAAAGAACACAG CTTGTGAGTTGGGAAGGTATGGAATAAGGGTCAATTGTATTTCTCCATTTGGGGTGGCAACATCTATGCTTGTGAATGGATGGAAAAATAAAAGTGGAGA AGAAGATGATGATGACATTAACAATTTTGGTGTGCCTTCCCAAGAGGAAGTGGAGAAAATGGAAGAGTTTGTGAGAGGGCTTGGGAACTTAAAAGGAGCA ACATTAAGGCCTAAAGATATTGCTGAGGCTGCAGTGTACCTTGCTAGTGATGAATCTAAGTATGTTAGTGGTCATAATCTTGTTGTGGATGGTGGCATCA CCTCCTCAATAAATTGTATTGGCCTTTAAATTGTTTCATGTTCATGTTCCTTAATCAAACTATATCAAAGTTGGGTCATCAAGATTGTGTAATGACTTTC TATTAATTAATGTCTACTCTTGTATAATAATAATAATAATAATAATAGTAATAATAATAATGGAGAGTTAGACGAGGAGCAAAAAAATTGCATTGCAAAT GATAGAGGAACTTCTTAATAGGAACTAAGGTATAGAGAATTAAAGTGTTTATTTAATTCCACGTGGGGATTCATTGAAGATGTTTCTAGTCCCATGTATA GTTGTACCTTTCATTTTGATTTATTTGTTTGTTTGTCCTAAATAGGATATTGTTACATTTATTACATTAGGAATGAGGATGTGGAGTTCTTGTGGTTGTG ATTTGTGAATGTGTCCCTAATGTGTTGTGTAAGGTACCTAGATTGTGGTTAAGATTGATGTACTATGTAAAAAAAACTGTCCAGGTTATTGCCTTAGCTT AGAATTAAGGTAGTAAGAGAAAATGTATACTGTACTACTATATTACAAGCAAATTTTCTTATGTTTATTTGGCTTCAAGATATTTGGTTAAATAAATGTA TTTAAAATTTTCAATATTAAAA
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_26617;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_252451

FPKM

• FPAB: 0
• FPNAB: 0
• LF1: 0
• LF2: 0.3
• LF3: 1.5
• LF4: 0.8
• UF1: 0
• UF2: 0.3
• UF3: 0
• UF4: 0.1

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_252451

• Blastp: Short-chain dehydrogenase reductase 2a from Arabidopsis with 70.56% of identity
• Blastx: Short-chain dehydrogenase reductase 2a from Arabidopsis with 66.43% of identity
• Eggnog: Dehydrogenase reductase(COG1028)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT3G51680)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019450532.1)
• Pfam: Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase (PF13561.5)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;