Ll_transcript_208003

Id TrinityFTRINITY_DN52625_c4_g1_i8
Name TranscriptLl_transcript_208003
SequenceCAAGTTTATGCACTGTTCTTCTCCACTCCTCCTTGTCTCATTACCCTGAACCTCTTCATTAGGGTTTTTCCGTTCTCTCTCATTTCCAACACCAAAATGG GAACTCGCTACACCCTCGCTGGTAAGGAAGTCCCCATAACCGGAAGCGACGCCGTTCGCTGGATCGAACTTTCCATTCCCTCTTCTCCCAACATCGCTGT TGACGGCGCCGCCGCCCCTCTCGCACCTCTCACCACCGACGACCGGGCTTCCTGCTTCGTCACCGACAATCCCGCTTCTTATCTCCTCTGGAGAATTCAC CAGACGCAGCCTCATGCTCTCGAGTTACTCGAGCTCGATGCTTCCAAAGAAATCCCCAAAGTTGGACTTAGGTTCAATTTCCCCGTCGCGCTCTGCCCCT TTGCCTTTATCTGCAAAAACCAGATTACTACTGGCTCTTCTATATACCCTTACTCGCTTTATGTGCTGACTGTGACTGGTGTGGCCTATCTTTTGAAAAT TCGAAAAGTTTCGGTATATGCATCCAGCTCCAGCACCATTTTACCAGTGGATGAACTTTTAGAGCTTGATTTGAAAGATTATATTCCCTATAATGTGACA ATAACCGCCATCGCAGCTACTACCGGGTGTCTTGTTATTGGCAGAAGTGATGGTTCTGTTTTCTGTTTCCAACTCGGTGGACTTGACCCAAGTGCTCCTG GTTTTGTGCATGAGCTGAGAGATGAAGCTGGAATCAGCCGTTTATGGGGTCTCATGTCACGGGGTAAACCGGTGGGTACTGTACAAGACATGGTTATATC CGATTTGGATGGGAAAAGATTTGTGTTTGTACTTCATTTGGATGGGACATTACGAATTTGGGATCTCGTGTCTTATAACAGGGTCTTTAATCATACCATG GCAGGTGCTATGTTTTTAAGGTTATGGGTGGGTCAATACAACCCTGATTCAAGTACATTTCTGTTGGCAATCTTGTACAGGGATACTTTGGATGAAAACT TGGAGATGATCTCTTTGCATAGCATCCAACTTAATTTTGGGGATAGAATTGTTTTCTCTATGGAGCCTCCAGTAAAAAATATTCCATTAGACGAGGGACG ATGCCTTGATGCTAAATTGACGATGGATAAGTTATGGATACTGAAGGATGATGAATTAATATCACACACATTCTCTACAAATATTGACGAGTTAGAAGCA CTGTCCTATGCTTTACAGGAAGAATTTGTTGCTGACCAGCTATTTCAAAGTTCAGAACATCTTGCAGATGAAATTATGCGGATTGGACATTCAATATTTT CATCTTCGAAGGATGATATTTTGCCATTTGTATCATCTATTTTCTTACGCAAGCTGCTTCTTCCTGGGGTGCATCATAATGCTGCTTTGCATGCAACTCT TGTTGAGTATGGCAGGCATTTAGTTGAGTCTGAGTTACAAACGTTAACTGCTGATGGGCTAAAAAAGGAGATACTTTCACTTATAGAACATGAGGTTGGT GCTGGAAAAGTGTCCACATTGTGTTGCTGGAAATCTTTTTTCACCCGCTATTTCCATAATTGGTGCAAGAGCAATGCCGTATATGGTTTGCTTGCTGATT CCTCTGTTGGTGCTGTCGGTCTAATAAGAAAAAGTTCAGTCTCACTTTTTCGGTCTTTGGAAGATATTGAGCGGATTTTAGAGGGCTCTTCAGATGAAGT GGGTGCGCTCACGGGCATTGTGGATTTATTTGATGATGATCATGATTGTGAAATTCTGACTGAATTGCTTAGATGTGTAATAAGTTTCAGCCAACAGTTG GGCAAAACTGCTTCTTCCATATTTTATGAGTCACTTTTAACTGCACCAGCAATCTCTTCTGATGATATTATTCGCTGTATAGTAAAAATTCTACAAACTG GGTATTGCATATCAAGTTCAGTTATCGCTGGGGATAGTTTAGTTGTTCTGGATAATGAGCTAGCAGATCATAAAAGTTTGAGGAAACTTTCGGTTGACAT GTTCTTGACACTTCAAGGCTTGTACAAAAAGGCTTCTACATGGGGCAGAATTTTAGATGTGATCGAGGGTTTCCTGAAATTTTTGGTTCCACGAAAAATC ACACATAATTTTGATACTGAAATGCCATCAAATATAAATTCCTCTATTGCAGTTCATACCACTTATCAGATTGCAGAAGTGATGTTTGAATCTGCCTGGG ATTTTCTTCTATTTTTAAGCTATCTGGTGGACATCAGTGGTCAGGTCCATTTGTCCCATGATGATATAACGCGAATACAGCTCGAGTTAGTTCCAATGCT TGAAGAAAATATTTTTGAGTGGTTAATCATCATCTTCTTTTCCATCACACCGTCTGCTCCAGCTGCAATTGAGGACTTCAATTTTAAACTTTCATCATTA CAAATAGATGGAAACATGGGGAAACGATTATGGAATGAGAAGCTTGGCCAATGTGACTTCACATTGGCTTTCATATTCTTTCTAAATGCTGGAAGTTCAT CTGCAGACCATAACCACTTTTATTCAGAACGTTTTTCAAATATGCAGAGCTTTATTAATAGGACAAGAGACTTTATCAGTTGGATAATATGGGGCCAAGC TGGAGGATCTTCTACTTTCTTAAGCCGTTCAATTGATCTTGCCTTTATCCTTTTCAAGCACGGCCAGTATGGTGCTGCTGAGCAATTACTTATGATGGGG GAAACACATTTGCTAAAGGAGAGAACATCCCAAAGTATTCAAGATGCTGATGGTGGATGGTGCATACGTCATCACCTTATAGGATGTTGCCTACTTGCCC AGGTGCAGTGTGGATTGCATGCAACCCAAAAGGATAAGAAAGTCTATGATGCCATTCGCTGTTTCTTTAGGTCTTCATCTGGAAATGGTGCATCTGAGGC TCTGCAGAGTTTGCCTGATGACATAGGAATTCCATTTCTTGGTTTTAGTGGTTGTGAATCATCTGCTGCATGGAGGCTTCAGTATTATCAATGGGCAATG CAGTTATTTGAACGATATAATATTAGTGAAGGTGCTTGCCAGTTTGCTCTTGCTGCACTCGAGCAAGTTGATGAAGCTCTTTGTAGGAAAGATGAAAAGT TCATGAGCAACTCAGTTGACGAATCAATGACGATCAAGGGACGACTGTGGGCAAATGTCTTCAAATTTGCATTAGACCTTTGTCGCTATTATGATGCGTA TTGTGCAATAATTTCAAATCCAGATGAGGAGAGCAAATACATTTGCTTGAGGCGTTTCATAATTGTTCTTTATGAACAAGGTGCTATAAAGATTCTATGC CGTAATAAAATTCCCCTTATTGGTTTAGTGGAAAAGGTAGAGCAAGAGCTTGCTTGGAAGGCTGAACGGTCAGATATTTCTGCGAAGCCAAACTTGTATA AGTTGCTCTATGCGTTTCAAATGAATCAGCATAATTGGGGACGAGCGGCAAACTACATGTACCTTTATTCAGCTCGTTTGAGAACTGAAGCCGCTTTGAA AGATCACCAAGGTGGTTCCTTGATGTTGCAAGAGAGGCTTAATGCACTTTCTGCTGCTGTCAATGCACTGCATCTTGTTCATCCTGCATATGCTTGGATT GATCCACCGTCTGAGGGAAGTTCTGCTTTGAGTGAACATTATCCGAGCAAGAAAGCAAGAATAACACCAGATGAACATTCTGATAATGATTTTGAGTCTC AAAGCTGGAAGCCCTCTATCGATATTGAAAAGCTTGAGAATGAGTTCGTTCTAACTTCAGCAGAGTATATGCTGTCCCTGGTAAATGTCAAGTGGACATT TAATGGAAAACATGGAGCCCTATCGGATTTGGCTGATCTTCTTGTCCAAAACAATTTATATGACATGGCCTTTACAATTGTTCTCAGATTTTTCAAGGGT TCAGGACTGAAGAGGGAACTGGAAAGAGTTCTATCTGCCATGTCATTGACATGCTGTGTTGATAAAGTAGAATCCACTCGGGTTGAGGAACATGGTCATT TCTTGACATCATCAAAGCTTGAGATGGTTGTCCATGGTTCACCTGTTACAGGTCCTACAACTCCACAAACTGACAGAAATAGCTTTTGGGCAGCTCTCAA GCTTTACCTCGTTCGTATCTTCTCCATCTTCTAATGTGCTGGCCCTTATTAGATTTTAGCCTGTTTGTCAGCCTTGAAGGGACGGCGGATGCATGATTGG ATGAAATTTCACACCATACTGCTCCAACCTTCTCCTCTCTTGCCTTCTGATTCCTTTTGAAATTCTTAATTCTTTGGTTTTTTACTTAGTAGTGTTTTTG GCACATGATATGGTTAGTATATGATATTATATTAGGTGAATAAGGCATAAATCGGGTGTTAAAAAATTGGATTTAAGCCAGATTCACAGCAAAGATCATC ATATACCTTCTCAAATCTAAACACTTACATAACTAGATTGAGTGCATTTAGTTCTCAGATAACTCAAGATGATCTAGACTCTGGAGTCTATCATTCACAA GGATTCCATGGTCAGGTTATTCAATAGGCTTTAGTTATTTTAATGGTCTACTATCCGACTTAGATATGTACATCTAGCTTGTGGAAAGAGATGGTTGGAT TGGATCAGAACCACCATGATTTGTTTTTTGGAATGATAATTTGGTTTGGAAGTTTGAGACATTTCTTATCTTTCCCCCTATCATCATCGTGATGCTTAGA CTATTCAGGACTGGTTTTCTAATTGGTCTTTTGCCTTATTCAATGAATAGTGAATGTCCCTTTACACACTTGGGCATCTATAATAAGATTATTGCAGTCA TCTGGTGTATCATGTTTAGATATATGTTCTTTTTCAGTAAACATTAGCATTTGCTAGGACATTGTCATTTTCATTTAGGCTTGTTCGAAATTCATAATGG TTGTCTTGATACTTAATAAGTTGGTCCAGGACTTGAGTTTCTAGTATTTCACCCATACATTTAAAGGATGTAGTGTGAAACTTAATCCGCTTGCAACTTG TTGTATTGGAGAAAATGTAAGTCCTGCTCCATGTCAGCAAGACGATATTCATTAGAATTGCATTCAGCCATGTAGATGGTTACAGATGAAGTATTCCACT ATTAAAAGGTTTTTCTAGTTTTGTACCAGTTACTCAATAGGTTTTCTTCATTTTAGGCAACCTCATGTTATTTTGTTGTGGTGGTGGGGTGAGATTGTTT ATGTTGAGATTTGTTAAGACTTAAAATTGATGATATCATTATCCGATTCTGTTATTGATTAGGATATGATTATGTAATTATCTGTGATTCTTTTCCCTAA AGTCAAGGGATTTATGCTTGTATCCTTGTATTATAAATAGAGAAGCTGTGTACACAAACTACTCAAGCCATTCAGATATATTTTTCATCCCTCTCAAGTG TTTAACTCACATGTGTATCTCTGCTTAAATTTTTCTGTGTCTCTGGTTCACTCTTTCCTTCGGATTTCTAAATTGCAGGAAAAGTATAAGGAGTATCATG GTAGATTACCAGTTATTGTTGCTGAAACTCTTCTACGCACTGATCCACAAATTGAATTGCCTCTTTGGCTTGTTCAATTGTTCAAGGAGGGTCAAAGGGA AAGGATGTGGGGAATGACTGGCCGGGAGTCAAATCCAGCATCCTTATTTCAGCTTTATGTTAACTATGGTCGATATGCAGAAGCTACTCATCTTTTGCTA GAGAGCATAGAATCATTTGCTTCAACGGTAAATTATTTTTTTACTATTTTTTATAGGCAAGATTTTGATGGGGAGGGAAAATTTGTGCAGCTACCAGTGT TTGAAACCAGAAGCTCAACTTTATATACTGTTGCTCTACCAACTAAGCTATCTCGGGAACATTATTTTTTACTATTATAGATGGAAATTAATGCAGTAGC TCATTCTGATATTTGTATGTTCAGCTGTTGTGATTGTCTAGAGTGATTATTTTTATAACCTGATTTTCCTAGGAACATGGGTTGTATGCCTCTACCACCC TGTATATACTTTACACTGTATAAGATTGTTTAGGCCTTGTCATTTGATTTTGTTAAACTTTAACAGCCATCTATCAACCCATAGTTTAAATTGGTTACCT TTGCACTATGCTGGGTAGGTAGGCTGTAGAATGCTTTACAATTGTACCAATACATAATGGATAATTAGTAAGGGTGACAATGATGCATCCTTTAGCCAGT TATCTATGTAGGGGAAATTAGAAAATGATTGTGACTTGAGAAAATTATAAAAATTCAATAAACTGTTATTATTTTCAAGAGTTTAATATCTGTGATGTCA ACAAAAAGGGCGGCCCAGTGCATGATACTCCCACTTAGTGGAGTATGGAGAGGGTAGATGTATGCAGCTTTACCCCGACAAGCAGAGACTGTTTCTAGGA TTTGAACGCATGACCTCAGTCACTAAGCAACAACTTTACCGTTGTGTCAAACTCATCCTCCAATATTTGTGCTGTCAATGTAAAATGTAAAAGTATTCAG TTTAATTATGTTATTTATTATGTTTTCTTAAGATCATTAGTTTTAATTATGGTCAACATATGGAAATTATGAGGTTAAAGGATACTAGCAACTTGCCAAG AATATTGTATGAGGTGAAATTATAGTAATTATAGGTTGAGTATGTTGTGAGATTGCAGCATTAGATATACATGTCAAAACTCATGCCATAGGGATATTTC ATGATATTATAATGAGTGTAATATCTATGCCTGACAATATAAAGATTTATACATATTCAATGCATCATCCATCCTTCACATGGATTATTTTTTTTGAAAA GTCAATGATGATTGAAAATGAATGGTGGATGATGCATTGACAGTATAAAAAACTCTTACACGGTCCGTTATACATCTTTTCTCTATTATAATATGATATG ATAACTAGCAAGTTTATGTATAGCATGTTCTGCATGCATGGTGCAGCAAAAGTTATCTCTTTTTCTATTGAAGACTGTCACTAATATCAAGCTTCTACAG AGACCAGCAGATATAATTAGAAGGAAAAGACCATTTGCTGTTTGGTTCCCATACACAACAATTGAGCGTCTACTGTACCAACTTGAGGAATTAATCAAAT TGGGTCACATGGTAGATCAATGTAACAAGCTCAAAAAGATGTTGCATGGTTCTTTACAAAATCACCTGAAGACGTTAAAGGTGGACTCAGATGATGCAAT TTCTGCTTCTTCTTGACTGCATCTTTAAACTGGTTACTAAAGGCTCTTACTGATAGATATACAAGTATATTCATTCTGCTCTGGTGTTGATCTCTCTGCT GAACAGCATAATATCCAATGTGAAGTGCTAGACACATAATGTTAAAATTGTGGTGGAAGAACCATGCTCAAACTAAATCACCCTCTTACCACAGAAACAA CAAAACTAATCGAATTGCGGCCGCCTCATCTTCTCAGGAGTAGGAGGTGTACTAGTCTCCAGGGAAACTCGTCCGGAAATTGTATGTGCGTTATCTGAAA ATTGTATGTGCCTTTGTTTGATCTTCGATGTTATGGCTATATTGGTACAGTACAGTTCAACTGATTGCTGGGAAATTTTGATTATATAATTATTTGTGTA TGAATATGCGTCTTATTCCACCTGATTCCTGGGGCTGGCTTAATGCGATGATGTGAAAATCACAATTTTAACAATTTTAAAGTGATGTGAAAATCAACTC AAAAATATGTAAGTCTCTATTTGGATAATCAAAAGGAGAATTTGGCAATTCTGATATTTTT BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_26964; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_208003

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_208003

BlastpNuclear pore complex protein NUP160 from Arabidopsis with 45.44% of identity
BlastxNuclear pore complex protein NUP160 from Arabidopsis with 45.4% of identity
EggnogNucleoporin 160kDa(ENOG410YYM5)
KeggLink to kegg annotations (AT1G33410)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019461186.1)
PfamNucleoporin Nup120/160 (PF11715.7)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;