| Id Trinity | FTRINITY_DN52634_c0_g2_i3 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_207683 |
| Sequence | TGATGAGCAGGCTTGATAGGTTTCTTCTTTCTGAGGAGTGGTTAAACATGTGGTCGGAGTCGAACCAAAGAGCTATTGATAGGTATATCTCAGATCATTG TCTGATTATTCTTAAAATTTCTTATTGCAAGCATGGTCCGTCTCCTTTTAGGTTTAATAATTATTGGCTCTCCCATCATAGTCTTAAGGAGTTGGTGGGT TCTGTTTGGAATGAGGTGGGTATATCTGGTTGGTCAGCCTTTATTGTTAAGGAAAAGTTAAAGTTGAAGCTAAAGGAGTGGAATAAGGAGGTCTTCAGCT GTTTGGATACTAAACTTGGGGAGATATCTAAGCAAATTCATCTGCCGGATATTGAGGGGGAAATATCAGTGTTATCGGAGGATCACTTGTTCTTGAAGAA AAAGCTTCTGGCAGACTGGTGGAATATTGCTAAGTGGAAAGATAGTCTGGTGGTGCAGAAGTCGAGAACATGTTGGTTAAAGGAGGGTGATGCTAATACT TCATACTTCCATGCTTGCATTAATAGTAGGAGGAGGAGGAATCATATTTTTGGTGTCTGGATTGATGGTGTTTGGGTGGAAGAAGATATGGGACTTTTGG AGGCCATTGCTGATCACTTTGGAAAGACTTTCTCCAATTCTCTTCCAACCTTACCCAAACTAGATGGTGTGGATTTCAGTCGTCTTTCGGATGATCAGGG TTTTAGCCCAGATGCGGGATTCACTAAAGACGAAATCAAAGAGGCAGTTTGGAGTTGTGCGACTGATAAGTGTTCAGGGCCTGATGGGTTCAACTTCAGA TTCTTTCAGGAGTTCTGGGAGACAATAAAGAAGGATGTGGTGAATTTCTTACAAGAATTCCAGGTAAATTGTAAAATTACTAATGGTTTGAATTCCTCCT TTATTGCTCTTGTACCTAAATCCAACAATCCAACAAAGATCCAAGACTTCAGACCAATTTCTTTGGTGGGTTCTCTTTATAAAACTTGGCTAAAACTTTG GCGGGGAGACTAAAAAAGGTGATGCCATCATTGATTTCTGCTTCACAATCGGTGTTCATTCAGGGAAGGAGCATCCTTGATGCTACTATTATGATTAATG AAGTAATTCATTCGGCCAAGAAGGTTAGAGATGGTTGTATGTTATTTAAAGTGGACTTTGAGAAGGCTTATGACTCAGTTAATTGGGGGTTTCTAGACTA TATGATGTCTAGATTTGGGTTCTCAGAAAAGTGGCGAAAGTGGATACATGTGTGCATCTCTTCTACTAGTATGTCAGTTTTGGTTAATGGTACGCTGTCG CCTCTGTTTTCAGTTACAAAGGGTTTAAGACAGGGAGATCCGATGGCCCCTTTCTTGTTCCTTATGGTGGCGGAAGGCTTTGCGGGCCTAGTACGCATGG CTAAAAATGGTGGTTTTTTGGAGGGATTTAAAATGGGGCCTTCAGAGTTTGTAGTTACAGATCTTCAATTTGCTGATGACACAATAATGGTCTTCATACC TACTACTCAGAATTTGTGGGGGGTGAAAACTATTATTAGATGTTTTGAACTTGTGTCTGGTATGAAGATAAATGCCAATAAAAGCTCTCTCATGGGTATT CAGGTTCCTAGTAACTTTATGTCTATGGCGGCATCCTTTTTTTCTTGTAAGATTGGCTCTATATCCTTCTCTTATTTGGGGATTCCAGTTGGGGCAAATC CAAGGAGCCTCAGTACTTGGAAGAGTGTTGTTGATTCTGTGGCTGGTAGACTTGCTCCTTGGAAGCGGAGGCATATTTCTTTTGGAGGCAGGGCCATTCT TCTAAACTCAGTGTTATCTAATATTCCGACGTATCTTTTGTCTCTTTATAAAGCTCCCAAGAAGATTATTCACAGGCTTATTTCTCTTCAACGTAGATTC CTTTGGGGAAACAAGCGTGATAGCAGGGGCATCCCTTGGGTTAAATGGTCTGATGTTTGTAAGCCGAAGAAGTATGGAGGTCTGGGTGTAAAGGACATAG CGAAGTTTAATGAAGCTTTATTGGGCAAATGGAAATGAAGAAGGTTGACGGAAGAGAGTTCAGTTTGGGTTAGAGTGGTTGATGTGAAATATGGCTTTCA ATTTTCCTTATCTGGTTCCAGTCAGGCTTCGAAATGGTGGAGGGATTTGGGAAGGATTGGTAAATTGCATGGGAATCAAAGTGGGTGGTTAGACACTCAT ATGTGGAAGGAAATTGGTGATGGCTCCTCCACGTTGTTCTAGGAAGAGGTCTGGTTTGGTCAACAATGTATAAAAGATATGTTTCCGAGACTGTTTTTGT TAGCGGAGGACAAAAAGGCTCTGGTAGCTGACTATGAAGTTTGAATAAATGACTCGTGGACTTGGAATATTACTTGGAGAAGACATTTGCTTCAACGGGA ATAAGTCTTAGTGGCGAATCTATATGATGTGATTAATCCGCATGTGGGTCGTCGGGGAATTCATGATAGATGGAGTTGGGGGTTGGATGCTTCAAGGATC TACACGGTTAAATCAACTTACATGGTGCAAGTGGATAGAGGTAGTATGGTTCTAGATAATACGTTGAGTAGGTGTTGGATACCATGTGCGCCTTTCAAAG TGTGTTGTTTTATTTGGAAATTGTTGAGGGGACGATTGGCTACGAAGGAGGAATTACACAAAAGAAGCATTGTTAGTGGAGGGGATATGAACTGTGTTCT GTGCATGGAGAAAATGGAGACAATTGATCATTTGTTCTTAGTCTATCCTTTTGCTAATTCTGTGTGGAAAGGTGTTTACTCTTGGCTACAGGTGCCTATA CTTCTTCCTAACTCTATTTCTAATCTTCTGGTGTTGCATGATTCTTTCTACTCTTCGCCAAAAGGTAAAAAATGGTGGAGGATGTTGTGGTTCACTGTAG TCTGGTCAATTTGGCTGATGAGAAATGACGTTGTTTTCTCAGCAAAGGACCCTAGTTTTACTCAGATAATGGATTTGATTCAGGTTCGTTCTTGGACCTG GATTTGTTCTAAAGTGGACATAAGTTGTTTTGATTTTGCTTAGTGGTGTAATAGTCCTAGGTCTTGTATTTTGCAATTCAAAAAGAGTAACTGAATTTGT TTGTTGCTCTTTGTTATATTTGGGTTGACACACCTTGTGCCCTTTAATGAAACTTTTGCTTATCAAAAAAAATTTATACTGACATCTCATAATATGCGTG TGTCAGTGCCAAATGAAATTAAACTAAATCTCAGAGGAGCTTAGGGTAGTTTTTTCCATGAATGGAAGAGTTTTGAATAATGTACTAAGGTTAAGATTGC GGAGTGGAATTCTGAGAAGTACTTGCTGACAATCGTTACTGATGAATCTAACGATGGAAGTATGGAACATTGTCACTCTATGATGTTGAGGTGAGTAATA TTTTGTTTGCTCACAAATAATGCATTTTTAATTTAGGGTCCCTGATATGGCTGAACACAGAAAGACGCATTGGTGTCAACCATAAGCCTAACTGATTATC CAATTATGTGGTGCGAAATTAATGAATGCAATTTTACATTTTATGTATTTTCAGGCCTTATGCTGTTAGC BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_27017; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_207683
| Blastp | Transposon TX1 uncharacterized 149 kDa protein from Xenopus with 24.01% of identity |
|---|---|
| Blastx | Transposon TX1 uncharacterized 149 kDa protein from Xenopus with 26.51% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019447318.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |