Ll_transcript_235047

• Id Trinity: FTRINITY_DN52893_c0_g1_i6
• Name Transcript: Ll_transcript_235047
• Sequence: GTCGGTGTAAACACTTTTGTTTTTTCCATTTAATTCAGTTATTCTATTCTGCTCCGTGCTTCTATTTGTTCATGTGTGAAACCCTAATTCCATTCTCTAT CGCCTTTTGATTTTTGGTTTTGGGAGGAATGGCTATTGCAGCACCAGGGCAACTGAACGTGACTGAATCCCCCTCTTGGGGTTCCAGAAGCGTTGATTGC TTCGAGAAATTGGAGCAAATTGGCGAGGGTACTTATGGTCAAGTTTACATGGCTAAAGAAATCAAGACTGGTGAGATTGTTGCCCTGAAGAAAATACGAA TGGATAACGAGAGAGAGGGGTTTCCTATAACTGCTATACGTGAAATCAAAATTCTAAAGAAACTACACCATGAAAATGTGATCAAGCTGAAAGAAATCGT GACTTCTCCAGGTGCTGTTGTTTAAGTATAATTATGCCTATTATTAAAATGATTTATGCTTAAAAGAATTGTTTCATTTGTCTAACATTTTGCTTTTTAG GCCCTGAGAAAGATGAACAAGGAAGGCCAGGCAAGTTATTTGTTCCCATGTTATTAGCCACCAGAGAATATGCTTTATAATTTAAGCTGTGAAAATATAC ATCAACACCCTTTCAATTCTCTTAGTTCCATACTAACCCAGTTACTCTGCTTTTCGTTTATGTTTATGTTTTGGGGAATGCAGATGGTAACAAGTATAAA GGTGGCATCTATATGGTCTTTGAATACATGGACCATGATTTGACAGGTCTTGCTGACCGTCCTGGGATGAGATTTACAGTTCCCCAAATTAAGGTGTTAC TATTAATATCGACTGTTCTTTTGTATTTGAATAGTTTTCATTGTAGTGTGGTCTGAGTTCTGCTTTCCTTTTGAAGTGTTACATGAAACAACTTTTGACT GGGCTTCACTATTGTCATGTAAATCAAGTTCTTCATCGTGATATCAAAGGTATGTGTATTAGCCTAGGAGATTTACTTTGAAATGTATGCCAGATTCATG GCAGATATGCACCACTAATGATACTAGAACAGATACTCAATAAATGTTAGTTTGCGTTGTACTTGCAAAAACTAAGACCTAAGCTGAAAAAAAAAACTTT TCTCTGCTCTTCCCTTCAATTATAAAGTTCCAGCTATTGTGCTTCATTTATGGCTCTTTTGATGCATTCATATGTTTTATGAGATGAATATATATTGTTT GCATGTAGACTGTCATATCTTACCACTATCTTAATTATTTTTATACAAAAGTTGTATCCCTATTTTGAACTTGTCTCGTACCTGACATCCATACTTGTTC GTCACAGATATTAACTTAGTAATGTTTAGTTTTTCATGAATATCTATTTCTCCTATTTGATGCATTTTGTCTTGCTGCAGGGTCAAATCTTCTTATAGAC AATGAAGGAAATCTGAAGCTTGCTGATTTTGGGTTGGCACGGTCATTTTCTAATGACCACAATGCAAATCTTACAAACCGTGTCATTACATTGTGGTACA GGCCACCTGAGTTACTGCTAGGGACAACAAAGTATGGGCCAGCAGTAGATATGTGGTCTGTTGGGTGCATTTTTGCTGAGCTTCTTCATGGGAAGCCTAT CTTTCCAGGAAAAGATGAGGTTAGTAATATTCCATGCATGCTGATTGAGTGATATAAGCAAAATGGTGAGTGATACATGTGATATTGTTTATTGGCTAGA TATTGTTTTATATTGTATATTGTCGGTACAGCTATGCATTAACAATGGCTGGAAAAAAAGATTCTTTAATATTTTATGGCTCTTCAATCCGCCTCTGAAT AATTATTGTCACATTTCTTTCTCTGCATATTTAATGCATCTCTTATCTCGGTTGCCACAATAACATGTTTATTACTTTGTTTGCTTCTAAAACTGTCATT TTGTTAAGAAGGTCAACGATGTTTATGTATTTTCAATATATGCATTCTATTCAGTTATTTTTACATCCATTCCAGATTTTGCTTTTGTTATATATCTGGC CTATGGTGTATATCCACATGGTAATTATTGTTTTCTTTGTAATTACTGTAGCCAGAACAATTAAATAAAATATTTGAACTTTGCGGAGCACCAGATGAGG TGATCTGGCCTGGAGTTTCTAAGATTCCTTGGTATAATCAATTTAAGCCCACAAGGCCAATGAAAAGACGTCTGAGGGAAGTTTTTAGGCAGTAAGTATG AGTATCAGCAATCATATATACTTATTATCCTACAAAAAAGTAAGTGTATCATCCATCTTCTTTGGTTTTATACTTACCTAAAAGGATTTTCTTCCATGAG TTGAATATAGTTTTGATCGTCATGCTTTGGAATTGTTGGAGAGGATGCTGGCACTTGATCCAGCGCAGGTATAATTTCTTCAATCACGGATCTGATTTAA TGAATCTTGAATGCCTTTTCAAGCACTTCAAATACCTGTTGTCCCAAATGTATTTTGTATTCGACCTGTTCTAGTTTGACAAGGTTGACTGTATCCACTA TTGTTTTGTAATTATTATGTCTTTTAATCGACAAGTTTTGTATTAAACGCAATATAAAAATTGTGTGTCTGTTTTCATTTTTAGAGGCATGTTTAATGTT TTAAAAATGGTGCAAAAAGCATAACCTTTACTATAAATGAGTTTTGAATGTTGGTCTTTATGCTATTCACATATCATTTGTAAAATATGAAGGTATGGGT TGTTTTCGGTGTAATCCAATCATAAATTATTATTCATTGCTGGACCATATACTTTTATGATGATTACTTTTGTTATGACCTGCAGCCTAATACATGGTTG TCAATTTTATTTCTTACTTTATAGAGAATTACTGCCAAAGATGCACTTGATGCTGAATATTTCTGGACTGATCCATTACCGTGTGATCCCAAGAGTTTAC CCAAGTACGAGTCATCACACGAGTTTCAGACAAAGAAAAAGCGTCAGCAACAACGGCAAAATGAAGAAATGGCTAAGCGCCAGAAAATGCAACACCCACA GCAGCACACCCGTCTTCCCCCCATTCAGCAGTCTGGGCAACATGCCCAAATGCGGTCAGGACCTAACCAACAAGTTCATGGCTCTCAACAAGTTCATGCT GGAGGACCTGGTCATCATTATGGGAAGCCTAGAGGTCCATCTGGTGGGCCAGGTAAATATCCTCCAGGCGGGAACCCCGGCGGAGGATACAATCACCCGA ACCGTGGAGGTCAAGGAGGAGCAGGAGGATATGGCAGTGGGCCTTATCCTCCTCCAGGGAGAGGGGCACCTTATGGGTCCAGTGGTATGCCTGGTGGCAG CGGTGGCTTTGGAGTAGGAGCTCCAAATTATACCCAACAAGGTCCATATGGTGGGTCAGCAGCTGGCCGTGGTTCAAACATGATGGGTGGAAACCGCAAT CAACAGTATGGTTGGCAGCAGTGAAACCACTTTCATATGATTTGGCCATGCTCTAATAAAACTTGATCAGAAATGAGTGATAGAAAGGCCAGACAAATTA ATGAATCAAGTCATAGAGAAAATGATTTGGCCTCTATGAATTTTACATTATTGAGACATCATATTCTCATTACTTGATGTATCAAAAAGAATATTAGTTT CTGGAAGAAGCCTTTGTGATGCACTTATGTTCTGTGATCCTTGCCATAAGGGGACTAGAACCTTTGATTAAGTAGTTTTTCGTTATGAGTAATATATATT AATTATAAATGTAAAACCCATAATGCCATAAATTGATTTGATTTTCGTTAAAAA
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_28931;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_235047

FPKM

• FPAB: 0.6
• FPNAB: 0.3
• LF1: 0.2
• LF2: 0.1
• LF3: 0.3
• LF4: 0.1
• UF1: 0.3
• UF2: 0.3
• UF3: 0.2
• UF4: 0.2

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_235047

• Blastp: Cyclin-dependent kinase C-1 from Arabidopsis with 52.56% of identity
• Blastx: Cyclin-dependent kinase C-2 from Oryza sativa with 90.62% of identity
• Eggnog: Cyclin-Dependent Kinase(ENOG410XPIR)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G10270)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019460261.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;