Id Trinity | FTRINITY_DN52906_c5_g1_i5 |
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Name Transcript | Ll_transcript_104716 |
Sequence | CAAAAACAAGATAATACAGAGTCAGGGATGAAAAGGGCCCAATAGCGCGAGAGAAAATGGCGCCGCTGAAATCTCTGGAGAATGAGTATCCAATTATCGA CTCTAATTTTCAAAGCTTTTGTGCTTCCCACACCATTTTCTCTGTTGAAGATTTCCTCCTTTACGATCTCGATGCACTAATCGCTTTTGCCGATAATGAT CACACTTGTTCACACACATTGAAGCAGGGAATTGATCAGCTTCTCTCAATAATAGATTCTCAGCAACCACCATTGCTAAACGGCTTGCAGCTATTTGAAG ATGCTAAGCAGAATAAACATGTTTTGCCCACTGGATTTGAAGGGATTGATGCATTGCTTGGAGGTGGGTTAAGTGAAGGACAATTAACTGAACTTGTTGG GCCATCCTCTTCTGGTAAGACACAGGCTTGCCTGCTGTCTGCCTCGACTGTTGCAAAACATAAGAGTTCAGTTATATACTTAGATACAAGCAACTCCTTT TCACCGCAGCGTATTGCACATTTGGTTGGTCAGACATCTGGTTATGTCTTTAACAGCCAGGCTGATCATAGATATCTCCAAGAAGTATTGGACAGGATAA TCTGCTACTCAGTGTTTGACCTCTATCAAATGTTTGATGTGCTGCATCAACTGAAGATGAAGTTGAAATGCCAGATTGGCAAATCAGATTGTCATGTTCG ATTGCTTATTGTTGATTCAATATCTTCACTGATTACCCCTATCCTTGGGGGCAGTGGTCCTCAGGGACATGCGATGATGATATCTGCTGGGAATTTATTG AAAAGGTTGGCGAATGAGCATAATATCGCAGTACTGGTAACGAATCATGTGGTGGGAGGAGAAGGTGGTACTTCCAAACCAGCACTTGGAGAGAGTTGGA AGAGTGTACCACATGTGCGACTTCTGCTTTGTCGTGACTATGGAAGCAATGTTGCCAATATTTCAATACTAAAACACCCATCTATGGCATCTGGTAAGAC AGCAAGTTGGACCATGTATTCTTTCGATGACAAAATGTAAGTATCATAACTTATAGTATTACTAATTGAACAAGAATGATCGGGTGAGTCAGTTTTGTTA TTACTGTTGGTATAAAAATTTATATACTCATTTGTGTTACTTATATAATTATATTTAAGAATTATTAATGGTTGATATGATATAGCACCAGTGTAAAAAC CCAAAGATTTATACATACAATGCATCATTAGGTACGTATTACTTGTATTTAAGAATTATAGTGTATACTTTTTGGCAATGCATAAATTTATGATTCCATG TCTTTAATAAATATAGATTCTCTTAATTGACTTAAATAGTATTTAAGAACAAAAAAATATTTTGGCATATAGAGAGATATTTAAGGTCGAAGTCCTCCAC GAAATTGTGAGAACTATATTCATTTTAGTACGTCAAAACATAAATCATGCTATATGATCCTTATTATCATCAGCCAGTTGCTTTTTTAGTATTATGAAAT ATATTCTCTGATAAAGAATTAATCTTTTTCGGTTGTGTCATTTTCTTTCCCAACAAGTATTGTTCTCAAGAATCAAAGTATTAACCTTTTGATCTTTTTG GGATCTAATAGAGACTTACATTACTTCACTAGGGCCTGATTGGTATCAATCATATGCTTTGGTGATACTTTTTATAATTTCTGAGAACATGACTGTTTTT TTTTATTTATCTGTCGTTATTAAAAACTTTAGTTCTCTCATTTTTGTCTTGGATAAGCCAATAGATCATAAACAGTGGGGTCAAAAGTGTTTAAGCTGCT CAAATTTTCTTATTACTTTCCTTATATAACATACATGGAAATGATTAAAAAGATAAAACTTCTGACCCATGCATTGCATTGACAAAAATTGCTAGTTCAC CACATTTTGACAAGTAATCTTGTTGCCGATGAGTTTTATCAACGTGGCCATTTCATTGAAAAGATCCTTAATGCACTATCAAGTATCAAGTGCACTTGTG GACAATTTCACATAAACGTTACACCAACCTTAGCACAAAAATCAAAATGGCAGGATATAAGTTATTGTAGGAAAGATTCAAATTCCAAAGCATCCACTCC ATTTATGGTAGGAAACAAGGTTTCACCTTCAAGAGTTGCAGAAGTAGGCTTTATATATGGATAGTGGCTAGTCAAAACTATTTCTTTCTCCTTATAGCAG CAGCAAACTAAGAGTTCAGAACGCTTTATTACCAAAACAACCATAGAAATAAAAATGGATCTTCAGCTCTTCCTCTCTTCCTTGCTTCTTGCACTTCTTT ACTTACTTTTCCGGTCCGTTTTCCACCGCCGCCGCCACCACCACCTTCCCCCTTCTCCTCCATTCCGCCTCCCAATCATTGGGCACATGCACCTCTTAGG CCCCATTCTCCATCAATCCCTCCACAACCTCTCCCTCCGTTACGGACCTTTATTCTCTCTCCATTTTGGTTCTGTCCCTTGTGTTGTTGCTTCCTCCTCT TTCTTCGCTAAGCAACTCCTTCAAACCAATGAGCTCTCATTTAACTGTAGAATTGAAACCACCGCTGTTAAACGTCTAACCTACGAGGCCTCTTTGGCGT TTGCACCATACGGTGCTTATTGGAAGTTCATCAAGAAGCTTAGCATGAATGAGCTACTAGGCTCTCGTAGTATCAACAACTTCCAACACTTAAGGGCAAG AGAGACTCTTCACTTTCTAAGGCTGTTGGCCATCAAAGGTGTGTGTTGGAGGAAGAAAAATGATGCAAGATCCAAATTGTCTTGCACTAATAATAACAGG GGAGAGATTAAGTTACTCCAAGGAGTAAGTCTAAACAAATTTACTCTTCGAGTAAGTCTAAAAAGACTTACTCTTGGAGTAAGTTGATCCCCTCCCTAAT AATAATAAAATAAAACAATAATAATAAAAAAGATTTTTTTTTTTTTAATTGTTCTCTTTTCAAACTATCCTTACTAGATTTGTTCTAACAATGTTTCCTG TAAAGATTCACAATGTAGTACTTAATGTTTAATGTATAACTTTACATATGACAGAAACGTACTTTCTTAACATTATATTTTCTATATATTTATTTGTAAT AGGTAAAGCTTGTGAGGCTGTTAATATAACTGAGGAGTTACTCAAGTTGACCAACAACGTTATTTCAAGGATGATGTTGGGGGAAGCAGAGGAGGCTAGG GATGTGGTGCGTGGCGTGACACAGATCTTCGGGGAGTTTAATGTTTCAGATTTTATTTGGTTGTTCAAGAAGTTGGACCTTCAGGGGTTTGAGAAGAGGA TAGAGGACTTGTTTCAGAGGTTTGATACACTTGTGGAAAGGATTATTAGCAAAAGAGAGGAGATTAGGAAAAATAAAAGGGTCAAAAATGGTGAAATAAG GGACTTTCTTGATGTCTTGCTTGATTGTGTGGAGGATGAGAGCTTAGAGATTAAGATTAACAGGATTCACATTAAAGCTTTAATTATGGATTTCTTCACA GCAGGAACAGATACCACAGCCATTTCAACAGAGTGGGCATTAGTAGAACTCTTGAAGCACCCAATGTTGCTTCAAAAAGCTAGAGAAGAAATCAACAATG TAGTAGGGAATACTAGACTAGTTGAAGAATCTGATTGTCCAAATCTTCCTTACCTCCAAGCCATAATCAAAGAAACATTTCGTCTACACCCACCAGTGCC TTTGGTTAGTAGAAGATGTGTTGAAGATTGTAACATTGAAAATTATGTGATCCCAAATGGGACAATACTCTTTGTTAATGTTTGGTCTATTGGAAGAAAC CCAAAGTATTGGGAAAATCCATTAGAGTTTCGTCCCGAAAGATTCTTAAAGAATGGTGAATGTGATAACATGGATGTAAGGGGTCAACAATTTCAACTTC TTCCATTTGGAACTGGAAGAAGAATGTGCCCTGGTGTATCCCTAGCCATACAAGAGGTACCAGCATTGCTTGGGACTATGATTCAATGCTTTGATTTTCA TGTGGTGGATCATAAAGGTAAGATTTTGAAGGGTGAGAATGGTGCAGTTATTGATGTAAGTGAGAGGCCAGGATTAACTGCTCCAAGGGCTCATGACCTT GTATGTTTCCCAGTTGAAAGATCTAACTGCCCACAGCTTAATGTCTTAGCTTCTTGATTTGTCTTTAGTATTGGCATGTCAGTGTGGTTTGGTTGTGTTA TTATGACTTTTAAGTGCATGTTCTGTCCGTGTACTTTTCTTGGAGTATTCTCGTTTCAATAAGATGTTGTAAACAAACAAAAAATAATGTACTCATTTGT TGTGATGGTAATAATTTTAGAATATCGACCAAGTGAAAGAAGCATATAAGTGGGTTTGACACTACATTTTGACCAAAAACCTTAAGGCATTAGGTCTATC ATCTATGGTCCATCAACTTATATTCTCTTTAACTCATCCACTTTTTCACACTGTGTGACTTCTTCATCACAACAGTTTCAAATGTGTTGTTTCTTCATCA TTAATGGAGTTATAATTCATAAGAGGCTTGCTTTCATCAAAGAAGATTCTTGCTAAATTGGTTTTACAAAAGCTAACATCAACACTAGATAGTTAGCAAC CAGTTTTCAGGCTGTTGTGTCTTTAACTTAGTAAGTAGTCAGTGTCATTTTAGATGCAAACAAAGTTAACCTGTTTATTGGGGCATGATAAACAAAATCA TGTATTTGATCCAATGCCAAAACATTTTAAGCTTTACTAAATTGTCATGATCCATAAATTGTTTTACATGGAATTTCACCATTATGGTGTGCAGGCGGTG GCTGGTTTCATGTCTCAAGTTATGGGAAAGTCAGTTTTCTTCAACCCCTCA BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_29041; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_104716
Blastp | Licodione synthase from Glycyrrhiza with 77.84% of identity |
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Blastx | Licodione synthase from Glycyrrhiza with 77.34% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | Link to kegg annotations (BAA22423) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019454023.1) |
Pfam | Cytochrome P450 (PF00067.21) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |