Ll_transcript_106011

• Id Trinity: FTRINITY_DN52916_c3_g1_i5
• Name Transcript: Ll_transcript_106011
• Sequence: CCTTACTTAAAAATTAAAAATAAAGCAAAGGTGTTAACATAAGTTTTCACTTAACAAAATAAATGACGAGAAGGAAATATTATAGAAATTGGTGGAAGCG GAATTTCTAGAAGAATCGGTCGTCGTGCATAAGAAGAGGATTTCGCTATTTAAAAACCCAATTTCTCTTTTCATCTTCTTCAATTCAATCTTTTACCGCA AAACCAAAACCCTAGCTTTCTCTGTTATTGTACACCAAGGTTTCAACATAATGGTAAGCCCTTCTTCATTATTCATCGAATTACATCTTTTTACTTTAAT TTCAATCATCGAAATCACCCTCAATTGAGAATTTCTAAGATTAACGTTTTACCTATCGTTTATTGGTGCAAGTTATATAAGTTATTTATCGAATTAGGTT TTTTTTAAGTTCTGAGTTTGGAGAGGGTTTGGGAATGGGAATTCACATGCTTGTTTAAATTAGAGGCTGGAATTGTTTTCCTAATTTTTTTATAATTGAT ATTATTTGGGAGGGTGAGTCTCGGCGTAACATTAAGATTGCCTCGGTAATATGTTCAAATCCTAGAAACAGTCTCTCCTTTTGTAGGTAAGGCTGCATAA TGTACCAGCTCCATACTCCACTAGGTGAGAGCCTCATGTACTGGGCTCCTATTAGGATGATTTGGACTTCAGATTTCCGGGTTTTAGTTTTGAAGTTTGT TCAATTTTCAAATTGTGATTCTTTCATGAAACTGAAATTAAAATTTGGAACAGGCTACACCTTTGATGGCAGGACTTGCTGTAGCGGCTGCTGCTTATGC CGGTAGGTATGGTATCCAGGCTTGGCAAGCATTCAAGGCAAGACCACCTACTATGCGTAAATTTTACGAAGGTGGTTTCCAGCCTACCATGACTAGGAGG GAGGCAGCTCTCATACTCGGTGTTAGGTATTGAAATTTTTGTTTGAGGATTCTGGTATGTTTGATTTTGTATACTCATTGACGTTTTTTGTATGAAGATT CTAATATATTTGATGTGTAGACTCATTGTGATTAAAACTTGAAAAAGGAAAGGAAAAATCTAGACATTAAATTGTCGTTAATGATAAGCTGAAGCTTTTT CTTTCAATTGAATATATTTATTGTATTTCTTAATTTGAAATGTTGCTCTTTCTCCTGATATCTCTACAATCCTCAAGATAGTAATGCCCGATACATAATG AAACTTAAGGCTCTTAATGTTAAAAATTAAACGTCAAAATATCAGTCCTAATCATTTATTCGGCCTAGGCTGAGTTGCAATGATATAAGTTATAGGGAAT TCTAAGGACTACTGCAACCATAATGCAGGTGTGCATTACATGTCTTTCATTAATTATTTAAGGACCACGGGGCATATAACCAAGGTTGTCAAGTTTGAGG CATAAGACCAAAAAATGCAGTTAGACACATAAAATGTGAGATTGTAACATGGACTTGTAAGGTCATATACCTATAATAATATAAATTATGTTTCTTGATC TACTAGTTGAAAGGACTAACTTATTGCAAACTTAAAATATGCTATTAGTCCACATTTAAAGATTTCATCAAGCTATTAAAGAAACCCCGTATATCAGCCC AAGGCTGCATCTAAAACTAAACAACTAAACTGTGCATTTTATAAGAAGCTATTAGGTTTTTCTATGCTTCCTCCACCTCTATTGCAGTGCCGCTCATGCT TATGCAGTTCTTCCTCGTAATTTCTCTGTTCCTTGTCTTTGTCCTTTGACTATGGAGTTCCATATAATTCAGCACAGCTCACATTTTCTGATGCTATCCG TCCTTGCTTCTGCTTTTGTTAAATGCTTGGGTCCAATTGTTACTTCTTTCACCAAATTCCAAAATGCAGAATGTGTTCTATGTCCAATTGAGGAGATAAG CAGAACCAGTTCTGCAGTTAAAGTTCAGTGATGGTTGTACATTTTTTTCCTAACATTTCCAGTTTTCCCATGTGATTCCATTGTTCCTGTAATCTGCAGA CTGTAGTTCTACACTGTGTACTGTTTTCTGTTCCAGTGATGTTATTTATTAAGGACCATTGTCAAAACTGTCCATGCAATGAAGGGGGCATGGCTTCTAC AAGCTCCAAAATGCCGAGCCAACACCCTTTATATTTCCTAGTAACAAATCTTTCGTGTCATTAATCTTTGATGCCGGGTAATGACTACCCTCCTGTGAGC TTCTTTGATTTTATCTGTTGGAGTGCACTCTCTGCAATAATCGCAATTGAAAATCAAAACAAGGAAAAAAGGACCGTAAATAAGCACACAAAAAATCCTG TACGAATCTTGATATGCCATATGATATCATATTCTTAAATATGATAGGACATTATGTATATGCCATATCATATTCCATTTTTTTACTTGACTGCATTTGA GTTTTATTGCATTGTTATTGCATCCCATCTCCATGCTTCATAAGAGATTATGGTTCATGATTGTGAAATTATGTTACTATTGATAATATTCACCTTTCTG TTCTGTATTAGTATCGACATTCACACATACATGGTGGGTTTTTGCTTATCACCTGCATTGTGTCTTTCTTTGATTATATTTTCATTTCATCTTGTATCTA ATGGATCATTATTAATATATATTTTTTGTTCTTAGACGTCCAACAAATATTTTACCAAATGTTTTCTTTTTGCATTTAATTTTTCTGTTGATTTTTTTGA CACTATGCAGAGAGCGGACTCCAACTGATAAAATCAAAGAAGCTCACAGAAGGGTGATGATTGCAAACCATCCTGATGCCGGTGGCAGTCATTACCTGGC ATCAAAAATTAATGAAGCAAAAGACATGTTAGTAGGAAAGACAAAGGGTAGTGGCTCAGCATTTTGAAACTTATACTTGGCCATATCGCCGAATGTATCG ACAGTTTTGACATTGATTCTTATCAAGTAAAACCATGAATGTTTTGGTCTTCTACCAATTATTTCTTGTAGACTTGATCACATTGTGAGAAAATTAGACA TGCTTATGAATTTATCTATATGCTACAGCTCTGTTGTTGTAACTTGGGTTTATCAATTATTGTGCTTGTACCAAAAAAACAGAATTGTACCAAAAAAACT TGGGTTTATCAATTATTGTGCCCACTACGACATAATTGAGTCTATACCTTATCCAAAAGTGCAAAATAGAAATTTATGATGTTTGCTTGCTTTTAAACAG ATGGGAATTTCGGTTATTAATGTACTGGTTTTAGTTTATTTGTATGGCAAAACTCACAAGACATTGTCTTCAGACCTTGTCTCTTTTTTCTTTCTATTAT ATAAGAATGAGG
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_29116;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_106011

FPKM

• FPAB: 0.4
• FPNAB: 0
• LF1: 0.2
• LF2: 0.6
• LF3: 0.3
• LF4: 0.4
• UF1: 0.5
• UF2: 0.3
• UF3: 0.5
• UF4: 0.2

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_106011

• Blastp: -
• Blastx: Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM14-2 from Arabidopsis with 79.25% of identity
• Eggnog: DNAj domain protein(COG2214)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT3G09700)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019459165.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;