Id Trinity | FTRINITY_DN52932_c1_g1_i7 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_105623 |
Sequence | AAAAAATAGTTCATTTAAGAACATGAAATATGGTTGTTGTAATCGGTCAACGGTTGGACCAATTCGGGCCGTCCAAGCTCATAACATTGTTAAAAATGGA AATCGAAAAAAAAATATTTGTTGAACTTTATTTTGAGAGAAGTTTCTGAAGAAGTTCTTTTCATAACACCTTCATCAATAAAAAGGAGGTAGAAGTTCTT GAGCTCAAGGAGGAGAGCATGATAGTCAATTATTATGAATCTAAGTTTGAATCTTTGTCGAAGTACATATCATACCTTAACACTATGTTTTGTACAACAG AAAATGGAAGGAAAGAAAATGGGTGAAATGAAAAGAGGAGGAAAACTTACATTTCTCTTGTTTGGTTGACAAGGGAAAAGAGGAGGAGAGAAAAAAATAT GTTGGCCCATGCTAAATCTTTTCCGAGCAAATGTGAGCGGAAAAGTGGAGGAAAAGCAAAAAAAAAAAAAAAATATGTAAAGTACCATGTCTCTTTTTTA TTATCTTTCTTCATCACAATTAAGTATTCACACGCTGCACTTTCATTGTCTACCTAAACACAATGCGATCTCCCTCTACTTCATTTTTTCTCCTTTTCTA ATTACAACCAAAAAGGTAATTTCTTTCTCACTTATTATACTTGCAACCTCATTTAAATTTGTATTTATTTATTTTATTATTTCTGATTCATGAATTCTCC CTCTATCTATTTTATCTTATGCAATTTCTGTTTAAAAATGATCCATTGTTTTCTCAAAGTGTTGTGTTCCTTTTCATTAACAATTTTTTTCACCTTAAAA TCTATGTATTGTTATCTTCTTTTACCATACATTATTTATTTACTTAAAAATAATTAGTTTTCTAGTTTTGATGGAAAAATTGGGTTACTCTGTTGAAGAG GTAAGGATAACAGTATGTAATGTGCACTCTGTGTTTGTTAGTGTCTGAAGAATAAGTATGCATGCTATGTGTTTGTTAAAATGTCTGAAAATAGCTATGC ACACTATGTGTTTGTTAAAATGTCTGAAAACAACTATGCACATATTGAAAACAAGTGTTGGGCATGCAAATCCTAATTATTTCATAGTCAATCTTTTAGA TGATGCACATTATGTGTTTGTTAAAATGTTTGAAATAGAAATTTAACTTGGGGACTCATAAATTTAATTTGGGCATGCAAATCCTTGTTTTTTATTTATG AATTGTGTGATATTGTTCATATGATTGCCACCAGCTAGAGCTTGACTTATATGCTTCATAACGTTCTCAATACATGGCTATAGTTTGACTTCATAATGTT CTCAATACATGGTTGTAGCTTGACTTCATAACGTTCTCAATACATGGTTGTAGGTTGACTTATGTTTTTCAAAAGTTGACCAGCAACTATGTTACTTGAT CTTAGAGGTTCTTGTACCATGTAAATGACCAATTCCATCAAAAGATTAAGTTGTTAGATCTTTACCAAAAAGTCATCGTTGGACATAGGGAATTAGATCT TTACCAAAAAGTCATCGTTGGACATAGGGAACACCAGGTATGCACCAAAACTTTTTTCCTACAAAGTACATCTATAAAAATTGCTTGTCATATTTTCCTA CAAAGTACATCAATATAAATAGCTTGTCATGTTTTCTTAAAGTATCATTCTTAATATCTAAAATTATGTAACCTTAACTAAATTAACATTTAATAGTGGA ATATGGTGACATGCATGAATTTTTTTAATACTGAAGATGATGAGTTTGGCAATGAATTTGATATAAATGAAGTATTGTTCAAAGTAAAACAATTGACTAA TATTGGCATGTCACTTGACATACAAATTCTAAGTCATTTTCGACAAGAGTTATGAAGGCGAGAGCGTCTTTGTTTTATGGTCCTATTATGTTATATTGTC CATGCATTGCATGTGCTTCAAATTATGTCATCTTACATGCACAATCCAATAAATGAGAGAAATCAAGGTAGCATAGGCGTCTTTATCTAATGAGAGAATT AGTGCAAACTGAAAGATGTCGAGGCATCATACGAATGGGCCCAGAAGCATTTATGTTGCTATGTCATAAGTTAAGAGGAACTAGGATTGTGAAGGATACT ATACAGTCCATGGTGGAAGGGCAAGTTGCTAAATTCTTGCACATCATAGGTCAAAATTGGAAAAAATTTGCTTTATCATTTTACTTCCACCGAAAATGTT TTACGTGCCATAGTTTCATTAGAAGATGAGTTCCTTGTCCAACCTTCTTCCATAGTGATGTACCTCAATATATATTAAATAATAGCATATTCCAGCCCTT TTTTAAGGTACCATTTTTTCATTTTACTTTGCTATAGTCACTCTTGAAATTTATGATAAATTATACAAGTTTATAACAATCAATACAAAAAAGGATTGTA TTGGAGCTATAGATGAAACACATTTTCGGGTGAAGGTCCCAAGGATAGAACAACCTCGGTTTCATGGAATAAAGGAATTCCCTACCCAAAATGTATTGGT TGCATGTAACTTTGACATGAAATTTACATATGTGTTAGCGGGGTGGGAACGCACAACATCTGATTCTAGAATTTTGAAAGATGCTTCAAATAGGGAAGAC CCATTAATACTCCCTGAAGGGAAATATTACATTGAGGATGTGAGATTTATGTTAAAATGTGGGATCCTTACACCATATAGAGGTGTTCGTTATCACTTGG AGGAGTACTCAAGACGTGGCCCACAAAATCCTAGAGAGTTATTCAATCACCGCCATGTTTCACTTTGAAATGTAATTGAGCAAAGTTTCGGGGTATTAAA AAAAATCCCCATTATCTCTAGTGGCACCGAGCCTCATTACTCTTTTGATGTCACAAAAGACATTATCCTTGCTTGTTGTATTTTGCATAACTTTCTAATG GGGGTTGATGTTGATGACGAATTAATTGTTGAAGTGGATCGTGAGTTGCTTGAACAAGAAGTAGATAATTCTCAAACACAACAATGTAATGAGGACTATA GACAGGGAGCAATTTTAAGGGACAAAATTTCTATGGAAATGTGGATTCTTATTAATTTTGATGACACATTAGTACATTGTATTGCTAGTATATCATTATA TTTTGTCATGTAAAGTATGCTATCATGTGAAGACTGTTATAATTAAGTAGAGATGTGTATTATTAAGTGTCATGTAGAAACAACTTTTATTATTTTACTT ATATTATTATTGTTTTGTATGAATTTATCACATTTTCTATGGAGAATATGTAC BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_29250; |
Additional information | - |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_105623
Blastp | - |
---|---|
Blastx | Protein ALP1-like from Arabidopsis with 25.5% of identity |
Eggnog | transposon protein(ENOG411206Y) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT3G55350) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019415865.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |