Ll_transcript_106247

• Id Trinity: FTRINITY_DN52986_c5_g1_i9
• Name Transcript: Ll_transcript_106247
• Sequence: AGGATCATCATTTGTTTCAATTAGCAACTAGGATCTTGGTGGAAGTAGTAGATGCTTATATTATGATTGGCATCTATTTTAATGATTGTGTGCCTTCAAG ATTTTGTTGGAAAGAAAAATACCAAAATTGTTACCCCACAGCGGGTGAACCATATGCATTCATTTCAAGAAATTTAGACTTTGCTACGTATGGTGAGAAA TGGATGTGATAGGAGTGGAATGGAGTTAAGTGGCCTTAGTTTTCCTTAAAATGTCCAATTCCACTTCATATTGCTATCTTTATATTTACCAAGTATAGTT GACAATATTGAAATTTACAGGGTAATCAATTTAGAGGGTATAGTTGACAATACGTAAGTATATTTGCTTCCCATTGGATCTTTTAAGTGAGTTTTTTAGT GTAATCAATTTCTTAGCAATATTAAAGTTTACAGGGTTTTAGCTCCACGCGTTTAATCACAATGGATTAGCACACATCCTTCAAGTAGGTGCTAATTAGC AAGGTTATGCTATGCATTTGACAAATAACAGCAACCGTAAGCCATTTGACACTAGGTGGGGTTGGTTAATTGTTGATCTGTTGTTTGCCTAACACAACTT TCCTTTTTTGACTGGGCGTCAGATTGATTGTGTAACGTGTGACTAAAACAGTTTGACATAGGCAAACATATGTCTTCAATTACTTCGATAAATCCAAATT CCATCGGGATCATTATCTTGATTCATAAGGGGAATATGCACATCACATGGATGCAACCTGTCTGAATACCAGAGAGTGCTTTTGCTATGATATCTACTAG TGCTTTTGCCAAAATAGAACGGAACCTAAAAAAGTTGCTTAGATTGGGTTGGGTAAATGTCATTTTGATCTTTAGAGCTGAACCAACCCGTTATTGATTG GGTTGGTTTCAAGGTATGTCCTAAAATATTTCGAGGCCAATGCGGGAAAAGTATGGACCCTAAATTTATTAAAAACATTTTTTCACAGGCAAAGTTTTCT ATGGGGATTTAGGAAATTGTGTAGCTAATGAGTGCTCTATTTATGTGCTGCATCTTTGCCAACCGAACTGAGTTTTTGGAGACTATGTAAAACTTTAACA CCAAAGTTTGAACAACTTACCAATTTATAAAATTTAAATTTCAAAAAGCTTTGAAGTTTTAATCTTTCCTCTATTATTATTATCATGTTCACCAAATGAA TATAAAGTAAAACTATGAACTGTAATAAAACCATTATATAATTTATAAATATAAACATAATAGTAAAATAAATCAGAAAAATAAAGGTGTTTAAATTGAA GGTACTGTTATGTAAAATGGACCCCTTATCATCGTGGGCCCTGGGCAGTCGCACTTGTTGCACCTCCCTTCCCTTGGTTTGGATAGTTCTATTGGATCTA ATGCGTAAAAGTAAAAAAAATTAGAAGATATAGTCAATGTAAAATAAATAATGCTGCTCTAAAGTAGCCATCTCAAATTGTTGTAGATCTACCAAAAATA AAAAACAACAAACAGTTATCATTCTAACATCGTCAAAAGAAATAGCATATACTATTATCTGATTGCAAACTGAAGTATATTTTTTAAAAACACTAAAGTT TGAACAACTTATTCAGTAAAATAAAAAAACATAAAAATAACTCAAATGTGAGAAAATCACTTCTAGAAAACAACTACTTGAAACAAACAGCCCTCTGTCA ATATTGATCAGTTGATGCCCTCTTGCTATATTTAAAATCAAATATCAGTCAATATTTACACTATTTTAGTTAAGGAGTGAGTGCGAGACAGTGTGTTTTG TGCATAATATTAGTAAAATGATGTAGCATTGTTAGTGTGGTTGTTTCTATTAGTTTTATGGGTTGGTTTGGTTCCATCTAAAGCCAAACCTAGGAACCAA GCCAACCATGACCAGTTCCCCAAAAAAAATCTGCAAACCAACTTATTAAACTGAACCAATCCAAAAAATGTTGTTTGGTTTGGGTTGCTTGGTTCTGACT GAACTATGTGCAGTTGTAGCCCTAATAACTACAAACTTTTTCTAATGGATATTTATTGATTCCCCTGTTTACATCAGTCCATTAACAGCTTTGTTCAAAA GATACTGATTGAAATAATGAAATTATAATTTAGAAGTATTGCTAAACTTTTGGTTCTTTTTTCCGAGAAGTTGGAATTGTAGGATGGGAGAGAGGCTGCT TGTTTCCGGTCTTATCAGTGTCAAGAAATAATGTCCTAGAGAAAACAACTGAAACTTGTAAAACATAAATTAGATTTACATCTTTCATCTTTCAGGCAGT ACATCTCATAAGTTCAAGGTTCATGTACTCGAGTTATTTATATTTACAGGCCTTCTCTGGCACCCAAAATGTATCTAGCCTACAAAAGGATGAAGCTTGG AGAGTAAATGTCCGTATACAAGGGTGCGACCTTGAGCATGGATATCTATGTGGCACCATGGAAGCCCTTAATGTTCCCATGGCAGACACGCCAGTAGTAA CATTTTGGGAAGGGGAGATTGTTGACACCAAGAATTATACTTTCTTCACTGGCAAATGGGAAGCAACACCGGAGGATGATATACGGCACTGGACTAAGTT CCCATCTTTTTCACCCCTCTTGGCCCAAGTGGAGGTTGATGGTGGCAAGACTTTGGACCTAAGCAACTATCCTTACATATTCATGAGATGGAAGGAGCAG TATTTTGTGAATGTTGGAACTGATTGTGGGTTAACCATTGCTGGCTTTTACTATGTATGCTTCTCTTGCAGTGATGGCTCTATCAGTGGGTTCTATTATG ATCCCAACAGCAGCCCTTTCCAGAAGCTTGAGTTGAAATCCACAAATGATGGTAGATCAGGTTTCAGTTTTTCATCATATGAGTTGCAATAGACTGTGAG TGAGACATATAGAACATGTTAAATTCATCATCTAATTGATCTTTCCTTGAAGTGTTTTATGAATCAAATCAAAATCTGGAAGTTATGCAAGTGTTCAAGA CTGTTAGTGTTGTATATAAGTGGGAAATGTGAAAATTTGAAGTTTGTGGTTGATTCAGTCATGTCAAAATAGGGAGAATATGATTCTAATTAGTGTTAGT AATATTGTACCCGTCATCAAACCAATGTATGATGGTATAATAGTTAAACATAACGGTGAAATTAAATATACATATATATTATATACTTTTATTTAAATCA TTTGTTAAAACAAAATGTGTTTGTTCCTGTAGTATTAATAAAGATAATAGTTGTGTGTTTGATTCAAAA
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_29735;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_106247

FPKM

• FPAB: 1.1
• FPNAB: 0
• LF1: 0.8
• LF2: 0
• LF3: 0.7
• LF4: 0.3
• UF1: 0.5
• UF2: 0.6
• UF3: 0.6
• UF4: 0.3

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_106247

• Blastp: Glucose-induced degradation protein 4 homolog from Mus with 36.59% of identity
• Blastx: Glucose-induced degradation protein 4 homolog from Mus with 34.64% of identity
• Eggnog: GID complex subunit 4, VID24 homolog (S. cerevisiae)(COG5073)
• Kegg: Link to kegg annotations (66771)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_004506631.1)
• Pfam: Vacuolar import and degradation protein (PF09783.8)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;