| Id Trinity | FTRINITY_DN52998_c1_g2_i5 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_105537 |
| Sequence | TTGTCTCCACTTTCTATTTTCATTTTACTTCTCTCTCTCTATTTTGTTTTTTTATTCAAAATGTTTCTTCATCTTCATCTGTTTAAACTTCAAACCATTT TATCCTTTTCAACTTATTTATTGTTTTTGTCTCTGAAACTGTAATATACAAATCAAGTTAAGGAATTTTATGATAATTTCAAGGAATAATATAATATGAT AATTTCCTAAATTTCATATTAATATAGTTAATGAATTTTAGTTTTTGGGGTTTGTTAATCTCTTCAGAAAGGGATCAAGTTGGAGTGAGTTTTTTTGTTG CGTTGATGAGATTTTTATTTGTTAGAATTTTAAGATTTAAGATATTATTTATTGTTTTTGTTTGACCCCTGCAACATTGAGATTCAACTTAAGGTCCTTT TATATTTCACGCAACTATTAAACAATTCGTAGTTGTATAGTATGATTCAACTTGTAGTGGAGTCTATGCCACTAACTAAGACGAGTGCGTATGCAACAGT GTCACCATAACATGTTTCTGTATTAACTATTAAGGCATGCTTATAGATAAAATAATTTAACATCATTTTATCATTTTCTAACTCAATTAACCCACTCTTA GAACTGTTTTGATCTGTGATTTGTGATTTTTGATTTTTGATGTACAATTAGAAAGCATAAATATTATGTCATCAACCGGATCTGAATTTCTTGTTACAAA CACTTTACTAATGTATTTTATCAGGTTCTTTAATCTTTATCTGCCTTTACCAAATTCCTTGATTATATTGCCAAAATTTGTTCCTTCTGTCAATATGGGA GGTTCTAGGTTTACTTGATACCCAGTTGGTTCAGGGAGGGATGAAGAACACATAAAACGAGTATATAAAAAATGTATATGTAGTAAATATCTTTGAAGAT GTGTTATATATATATAAAGTTAGATATGTACGACTATTTTTGAAAATATGTTCCCAGAGGGGATCACCCACTGTTGCCTCCCTCTAGTTCCGTCTGCGTT GGTTCATCATTTGACTCTCATGCCAAAGATGTTTTACCCGTGAGTTGGCTTTTGGAGTGAAGGAAGGGAAGGGGAATGGTTAAAGCCATATCATAAGTCT GTTTCATGGCTCCCAAGAAGTTCCCTTCGCCAACAGACCCTTAGACATGGAAAGTAAAGATTTGTCTCCATATAGTGGAAAATTTATATCATATATGTAA TAATAATACAGTTAGTTATTTGTTCTTTTGCTTTTATTTTTATATTTGGGAAGCCTACAGGAAATTAATGATAGCAAGATGTAGCTAATTGCTTACGCAA CAATCATGTCTTATTTACATCAATGATAATGACCTTTTTTCATCTTCTTTTGTAAAAGATAATTACCCTTTTAATACTAGGCAAACATATTCTTCAAATA ATCCATTTGTCATAGCTTTGGAATTTGTAGCTGAATTATTGTTAATCACTGGCATACTTTGTTTTTCATTTATTGTGAATTCATTTCCTTTTGGTGCTTA ATGTTCAGAAGCCCACAAACTGAACTACCTTTCTTTTCATAGGTTGTGGTGAATATGTTTTTGATCTGATATGTATGAATACTTGAAGCCAGGAAATCTA AGTTTCAAGTTTCAAATTAATAGTGTTGCATTAGTGAATGGTTTGCTTATCGTTTTGTTTCACTAATTGCAATTGCTAAATTAACTTGTCTAAATGCCTT TATAGCTATAAGATCCAAGCTAGCATGTGTTGGAATAAATCACAGAAAGAAGTAAGACATTGTAGAGAAGGTCTGCCCATCAGCCATGGCATCGAGATCA TTTGCTAATCTCCTAGACTTACTTGGAGATTTGCCAGATATTCCTCACACCCCAAGAACACTTCCAAGGGTTATGACAGCTCCTGGAATTATTTCTGACC TAGATGTTTATGGTAGAAATGATGTGGGTTCAGATGTTAGCTCTTCTGGTTCCGGGTGTCGAGAACGGAAAATCATAGTAGCGAACATGTTGCCGTTGAA GGCTAAAAGAGATATAGACACTGGTAAATGGTGCTTCAGTTTGGATGAGGATTCAATTTTATTGCAATTAAAAGATGGGTTTTCTTTTGACAGTGAGGTG ATCTATGTGGGGTCCCTCAAAGTTGAAATAGATGCCAGTGAGCAGGAAGAAGTTGCTAAGAAGTTACTGGAGGACTTCAATTGTGTGCCTACCTTTCTAC CCCATGACCTCCAGAAAAAATTCTATCTTGGATTTTGTAAGCAGCAGCTCTGGCCTCTCTTTCATTACATGCTACCTATGTGCCCTGATCATGGTGACCG GTTTGATCGCTCGCTCTGGCAGGCTTATGTTTCTGCAAACAAAATATTTGCAGACATGGTTATGGAAATAATCAATCCCGATGATGATTTTGTTTGGGTT CATGACTATCACTTGATGGTGTTGCCTACATTCTTGAGGAAGCGATTTAATCGAGTTAAACTTGGATTCTTTCTTCACAGTCCTTTCCCTTCATCTGAAA TTTACCGAACTTTGCCAGTAAGGGATGAAATTCTGAAGGGTTTATTGAATTCTGACTTAATAGGGTTTCATACATTTGATTATGCTCGCCACTTCCTCTC TTGCTGCAGCAGAATGCTAGGTCTGGACTATGAATCTAAACGAGGACATATAGGACTCGATTACTTCGGCCGTACTGTATTTATCAAAATTTTGCCTGTA GGCATTCACATGGGTAGGCTTGAATCTGTGTTAAATCTTCCTTCTACATCTGCTAAAGTTAAAGAGATTCAGGAAGAGTTTAAGGGTAGGAAGGTGATTC TCGGTGTTGATGACATGGATATTTTTAAAGGCATCAGTCTAAAGCTTCTAGCTGTGGAGCATTTGCTGCAGCAGAATCCAAATTTGCAGGGCAAAGTTGT CCTAATTCAAATTGTGAACCCTGCAAGGGGTTCAGGGAAGGATGTTCAGGAAGCAAAGAGGGAGACATATTTAATTGCCCAGAGGATCAACGATATTTAT GGTACAAACCATTACAGGCCAGTTATTCTCATTGATCGTCCCGTTCCTCGTTTTGAGAAGAGTGCCTATTATGCTGTAGCAGAATGTTGCATTGTTAATG CAGTAAGGGATGGTATGAACTTAGTCCCATACAAATATATTGTTTGTAGGCAAGGAACTGCACAAATGGATAAAGCACTAGGAAGAACAAGTGATTCTCC TCGTACGGGCATGCTTGTTGTCTCAGAGTTCATTGGTTGTTCTCCTTCTCTAAGTGGGGCAATCAGGGTCAATCCCTGGGATGTAGATGCTGTGGCTGAT GCACTGTATTCAGCCATCACAATGTGTGATTCAGAGAAGCAATTGAGGCATGAAAAACACTTCCGGTATGTCAGTTCTCATGATGTGGCGTATTGGGCTC GCAGCTTTATGCAAGATTTGGAGAGAGCATGCAAAGATCATTACACCAAAAGGTGCTGGGGAATTGGTTTGGGCCTAGGGTTTAGAGTTGTTTCACTTTC TCCTGGTTTTAGGAAGTTGTCCATGGACCACATTGTTTCAGCATACAAAAGAACCAATAGAAGGGCCATATTTCTTGATTATGATGGTACTGTTGTACCA CAATCTTCTATAAATAATATCCCCAGCCCTGAAGTGATATCTGTGCTAAATGCTCTGTGTAATGATACCAAAAACACTGTGTTTCTTGTTAGTGGAAGGG GAAGAGATTCTCTTAGTGATTGGTTTTCTTCATGCAAGAGGATGGGACTTGTGGCTGAACATGGGTACTTTTTAAGGTGGAGTGAAGATTCTGTATGGGA AACGACTAACGTGTTTGCGGACCTTGATTGGAAAAACATCGTGGAACCTATCATGCAATTGTACACAGAAACAACTGATGGTTCCAATATGGAAATTAAG GAAAGTGCGTTGGTGTGGCGTCATCAAGATGCAGACCCTGATTTTGGCAAGAGCCAAGCCAAAGAGTTGTTGAATCACTTGGAAAGCGTGCTTGCCAATG AACCCGCGGTTGCTAAGAAGGGCCAGCATGTTGTTGAAGTTAATCCTCAGGGAATAAGCAAGGGTTTGGTTGCTGAAAAAGTTCTTTCGACTATGGTTAA TGGTGGCAATCTACCAGATTTTGTAATGTGCATTGGAGATGATATTTCTGATGAAGACATGTTTGAGAGCATATTAAGGACTGTCTCATGTCCATCATTA CCAGTAGCCCCTGAAATCTTTGCCTGCACTGTTGGCCAGAAGCCTAGCAAAGCCAAATATTATCTTGATGATCCTTCTGATGTCTTAAAGTTGCTTCAAT GTCTTGGTGCTTCTTCTAATCCAAAGCCCAGACATCTAGCGCAATTCCAGGTTTCTTTTGAGAGCAGAGTTTGAGTTAAGACATGGCAACACATCATTAT TGGTCTTGTTTGAATCAGGGAATGTTTGGTTATTATCACTTAACATTACACATGGTGGGACCTTGCTGTTGCAGATCTGGTTCTTTGCATGTGAACCGTT TTGCATTGCCTCTGGAAACTTTCCTTTTTGGGTTAGACAGTGTAGTTCATGGATGACATGTCAAATCTTCTCATGTACATGGTAACATTAATTGTTTGTA TTTGCTGGTGTCTCATGTAGTTTTAGGTTAGGTGTGTTTAGTATTTTAGACCTTATAGCTGTTTACCTTGAATGTAGGACACCAATAACTTGTACAGTTA CACTATCCTTGTTAACAATACAAAAATGTCAATCTGTTTTGACATCTCTTGCTTTAGCCTAATGAGTAATCCGTGACCAAATAAAAACAAAATTCTTAGA AGGGTAACTTTAAGTCCCACCCAAGAAGCATAATGCAATCATGTTTATATATACTAGGAAATC BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_29844; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_105537
| Blastp | Probable alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase [UDP-forming] 10 from Arabidopsis with 72.65% of identity |
|---|---|
| Blastx | Probable alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase [UDP-forming] 9 from Arabidopsis with 73.47% of identity |
| Eggnog | synthase(COG0380) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT1G60140) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019421262.1) |
| Pfam | Glycosyltransferase family 20 (PF00982.20) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |