Id Trinity | FTRINITY_DN53014_c0_g2_i2 |
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Name Transcript | Ll_transcript_242226 |
Sequence | CGTCATCTTCTTCTCTGTGCCACGTCCTCTCCTTTTTCTTTAGCTATCTGACATTTTCAAAGCATGGATTTCTCTGGTGGTCACAAAAATAGAGGGGAAT TGAGAATTCATGAGAGTTTGGATGAGCTAAGGACTGATTTGGCAGATCACATTGCTGAATTATCAGATGCATCTGTGAAGGAGCGCGGATATTTTTCCAT TGTTTTATCTGGTGGTTCTCTCATTGGCTTAATGGGAAAACTCTTTGAAGCACCTTATATCAAGACAGTGGACTGGTCCAAGTGGTATATATTCTGGGCC GATGAGCGTGTTGTGGCGAAAAACCATGCTGATAGCAATTATAAGCTCGCCAAAGATGGCCTTCTGTCCAAGGTTGTACCCTCAAGTCAGCATGTTTCTT TAAAGAATGGTTGTTCTCGGAATATTTTGGAGGATAATCAGATAATGATACAATCAAGTTTTGAGTATTTAACTGTTCTTTACTAATTTAACTTCTTTCC TGGTTGCTTCTTAAAAGGGAAAATCAAACAAAAATGGAACTAGTATATCAAATTTTCAAAAGTTGATGGGCTTTGATTTCTTCTTTTATTGCTAAATGAC TGAGAAAATTCAATTGCTGTTTTAATTTTGAGCATCTTTAGATAACCTTCTTGAATTGCTTTGTTCACATGAAATATAAGATTTTTACTTCAAGGTAACT CTTTTTGAATGTCCATTTATTTATATATTCAATATTGAGTACTTTTTGAATGTCCACTTATTTAGCTGTTTGGGTCTCATTTTAACTAGTTACCTTATTG AGATTTACATTTATTCTGATGTGGATGTTGAGCGTACTGAGAGTTGATAATGATATTTTGTTTACCCTTTCTAGTTCATTGAATTTGGAGACATACATAA 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Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_30000; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_242226
Blastp | Probable 6-phosphogluconolactonase 1 from Arabidopsis with 65% of identity |
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Blastx | Probable 6-phosphogluconolactonase 2 from Oryza sativa with 68.9% of identity |
Eggnog | Catalyzes the reversible isomerization-deamination of glucosamine 6-phosphate (GlcN6P) to form fructose 6-phosphate (Fru6P) and ammonium ion (By similarity)(COG0363) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT1G13700) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019428719.1) |
Pfam | Glucosamine-6-phosphate isomerases/6-phosphogluconolactonase (PF01182.19) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |