Ll_transcript_242740

• Id Trinity: FTRINITY_DN53039_c2_g2_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_242740
• Sequence: AGTTAACCCTCCCCCGTCTAAGTTTTGTACTCCCAAACAAGGGAAAGGATAACCCTCCTTTCCCCTTCCCTTCATCCCCTTCCTAACCCTTTGATTCCTT TCCTTCCCTTCCCCTCACGACTCCCAAACAGACCCGTACTTTTCTCTGTTTGGTCTCTAAATATTTTTGCATTTGATAAGTAGCCTGACAATTAAGCTTA TTGCATTAGAAGCAGTGAGAGAAATTCAGTTAGTTTTACTTGATGCAACTGGAGAACCTAGTGTTCCTCTCATGTTACATGAACTTGCTTTTTTGCTGCA AACTTGTGGTAATTTTGGCATGTATGCCTTTATTCCCTTTTACTTTTATGCCTTGATAGCTACACTGACTCTATTTCACACATAAAGATGTATTTTATCC CCTTTAATTTTTTTCAATAAATATTTCATCATTGTTTAAGCAATGCTGCTACTAATTGTTGGCGGGAACGAGCATATATGTTGTACTTTATGACTGATTG TTGTGAATCCCTTGCAAGTTGCAACGTTTTTTTTCGTTGTTTGCAACTGTTTTGATTTGTAATTTGTAATACTTTTCAAATGTTACTTGTGTAAGATCTT TGGATTTGAGTTATTGTAATTAACCTTTGTCTTGGAATTTCCATAATATATTGAACATACACAATGGCATCAGTAAGAATGATGGGTTGAACCGCTCAGG AATGGCTGTGATCAATTAGCTTAGCCATAGTGGTTTTTCTTCTATATCCAAATCTTTTATGCCTCTCCTTCTCTGATTAGTTTATCTTATTAGATGTTCT CCTTTTGTAATTATCATTACATCTTGGAAGGAGCTGGTCAGAAACGGCTACGTGCTTGAGCTTTAGATTTCCTGTTCTGCACCTTAAACCTTGAGATCTT TACACTTCTCTTGCAGTTGAGCTGCATTGAATCTGTGATAGAGGGATTTGTGTTACTGAATGCTATTTTTAGATGTCAGCATTTTAAGCATGGTTAGTAT GATTAGTCCTAGTGTTGATGCCTACTGCAAGATAGCAAGTGCTGTTAGTATCTCTGTATGTTATATTTTCAAGAAAAATAAAGGAATTGTTTTGAGTGTG ATCAAATACAATTAGGAGACCAGTGAAAGAACTGCCATGTAGATAGCAAAGACCAAAAGTTTTCTTAATGATTATTAGTAGAGATCAGTGTGTGGAAGTT AGGTTTGATGTTGGTCTTACTTGGTCACTTCTTCCTTTGTATATCAATGATATGCAAGCGGCCTTGCAAATGGTCTTGGTTTGCACAGTTAATCAGGCGA TTGTTCGGGTCATTTTGGACCATTCAAAATCTGGTTCGAACGGGTTAACTAGGGATAACCCAAGTTAGTGAACCATACAGTTTCTTTAAAATAAAAAAAA ACATTTGCTAGAACGAGAAGAACATAATTTTCAACCAAGGCCCGTGATATGGAAGAGTGGAAGGGAACAATGTGAGAGAGTGAAGATATGTGCACTGTGG TGGAAGAAGTGGAGGCACATGGTGGTAGTCGGCGAGATGGGTTGTGTAGGGATCCGGGTTTGCACGAATGGAAGAATGAAGGATTTGGTACCTAGTGAGT ATGGAAGAAGAAGGCGTGTTTTATAATTGAAGAAGTACTGCGTTACTAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGCAATGCTGCTACTTTTAGGTTTAGTTTT TTCAATTAACTATAATGTGTAGTTGGACAGGATCATTGGGCTTCTGTTTTTTATGGATGTGTTTTTATTATATAATTATATTATTATTTTATATATATGA TGTGGTATGGTCCGATCAGACGATTTAACAGGCCAGACCTTATACGGGACCGCTTTCACTTTGACACCCAGCTCGAGTTTCATAACATTGTAGTATATTA TTCACCAAAATAAGTGGTCAAGGATTTTGGCTTATTAAATTGTGGAGACAATATATTAACAAATGGAAAAATCAATTAGATTTCCAGGTATTGAAGTGTC TATGATTCTTTAACTCAAGCATATGGTTTAACTACTTCCCGATGAACTATTTTAAATTTAGGACAAGTTGATCGGTTATATGGTGTGCCTTCAAAGGCTG GGGAGACATGAAATTGGATTTATTGAGAAATCACTTGTCTATCACTCCATTGTTGTGTTTCACTTTCGACTTTGCAACTTTTCTAAATAAATAAATTTTT GATTACTTATCTCCATTTAATGTTCATTTTTTTTTCACGAACCTGTTTGTATATGTGCATTCAATATCTTTTGTAAAAGACATGTAAAAGAGAAAAGACT GTATACATTAACCCTCCTCATACCCTACTAGGTACATGCCTCGTGCATTGTGCCTCTCCTTCATAGAAATGAATTGTATAATGGCCAAGCTCACCCCATT TTTCGCTCAAGCTCACCCCATTTTTTGCTCAAGCTCACCCCATTTCCTGCCAAGCTACCCGTTTTCCAGCCAAGTCACTGCCTTTTTGGCAGCTAACTTT TCTTTTTTGGTTGTCTTTTTTATGCCAACACGAGTGTGTTACCTTTCTAATTCTTTCACTCTTGTGTAATTCTATATTCTCATTTCTTGTTTTTTTAACT TGTAAAGAAAGTCCCCACAAAGACCAAAACTTGCAGTTCTATTTTTTTCAATCTAAATCATGTAGGGATGTTATAAATTAATGGTCGGCACTGCATTCTT TTCTTTTGGGCAATTGATATGATTGTGTCTTTATATTTCCAGCCTCTTTGTTAACTACTACAATGTAACTGACCTAGTGGAGATATCAGATATGTTTTAT AAAAATATTTGTTGTCAAACTTGTAATAATAGAGGCTTGACGTGTCTTCATGCTATGATGAGTGTGTCCTAGCCATATGCCTTTTAAGTATTAATGTTTA AATGATTAAATGTATTAAGTTTTTGTCTATTTTTAGTTTTTAACATGTGGTGTGTTTACTAGAAACTATTTGCACTGTATCTTACCAATCTTCAGTATAG CAGCAGCTCCACAATATGCTACTATCCCACTAATATATCATTCTTCGGGGCTGGTCACTCTGCACTGTCCAGGATTGACTACTATGCTTTTGATATGACT TAAATCTTCATAAATATTACACACCTTGAGTTTTTTTGCTTTATGGATTATCTTTTTGCAGGTTAGAAGTTTGACGAACAACATTCAGGTGATACTGGAC TCAATGAGAGCTTCCACTGTTGTGGAAGTACAAGGTGACAAGTTAAGGAGACATAATGAGTGGGAGAAATGGGTGCCCTCTTCCAAGCTTCAGGCTGATT CTGGTTCAATATCTCCTGGTGGATCAAGACACGATAACCTAGCCGCTGATTTTCAAACTATAGCCCTGGAAAACGCAACTATCGAGGAAGGTCCAGCAGA GTCTTCCAATCAGTCTCAACTCCCAAATGGTGATGCTGCAAGAAACAGCAATTGAAACTATACTTACATAATCTACCCCACCCGAAATTTCTGGGCCTTG TCTTCTGTCCAGTATTCAGCCGGTCCCTGGATTCTAATTTTGTGTGTGTGCGGAAGGTGATGGAAATAGAGGCGGTGTGGGAAGTTGATTATTTCTACAG TCATAGCTCGATTTTGATAGTAATTTTGAGTAAGTAGTAGAAACAAATAAGAATTTTGAGGCTGTGTGGCTTATAATGCTTTAAATGTTTCTGCCGTGAT TCCTCCAAATGTTATTCTTTTTCATCACACTTGGGAATGGAAGGGGCCACAAAGGATCAAGATTTTCACGTCAAAACTTTCATCTGGTTGTTGGTGTGGT TGCAATCATGATTTTCATGACTCCCTAAACATTGATGTTACGAACTATTGAAGGGGCCACAAGGGTTGTGGTTTCCATAACTCTCAACTTTTACATTTTG GTGTTTGTAGCGATCGTAGGTTGGAATGAAAACCGTAATCCTCTCTAAAAA
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_30252;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_242740

FPKM

• FPAB: 0.2
• FPNAB: 0.1
• LF1: 0
• LF2: 0.1
• LF3: 0.4
• LF4: 0.3
• UF1: 0.1
• UF2: 0.1
• UF3: 0.1
• UF4: 0.2

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_242740

• Blastp: -
• Blastx: La-related protein 1B from Arabidopsis with 51.22% of identity
• Eggnog: La ribonucleoprotein domain family member(COG5193)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G66100)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019449481.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;