Ll_transcript_241952

• Id Trinity: FTRINITY_DN53075_c2_g1_i4
• Name Transcript: Ll_transcript_241952
• Sequence: ATAATACCGAACCCACTACACATTAATAATTCATTCCTATCTGCGGTTTCACGACCCCAAGATACAGAGAGAGCAACGAGCCTCTTCTCCCGTTGGTTGC AAAACCCGGCAAACCAGGCCGACAGATTCACATATAATATCCGTAACCGAGTCAAATTCACTGTTCGGGAGAAGATCCATCTTCTCTCTCTTTGCATTTC ACAACAATTCTAATTCAGATCACATCACCGTAGCGTAACCTTCAAATCTCAGCAAAGGCTAAAAATGAAATAAACTTTATTAACAGATCTCTCTTTTTCC CTCACTTTTTACTATACGCTATTTCCCTCGCAATTCTAACAAAAAATACGATGAATCGAAGAATCGTTCTCGCTATTTACTTCTTCATCTTCTTCAACCT CGTGCTGATAACGTTTTCTCAGGATTCTCTGGTGAAGGAAGATTCTGGTGGATCTGTGGATCTAGGTCGTCGTGGCAAAATTGTGAATAACCAAGAGGAT GATGGGTGGAACAGTGGTGGGGTTGATCTTGGCTTGGAGGCTGGCCTTGGAGTCTTTGATGCTTTTTTTGCCAGTCTATCCATGATCCTTGTCAGTGAGG TTAGTTTTACATTTAACAACACTGCCCATTGAATTTGACGAACTTGCGAGTTTGTCTTCTGTTTACAAAACTCGTATCATGTTGGTCCTTCCTCACATAC TAAAGTTTACAGTGAGGACCAACAAGGCAAAAGTTTTATAAATTTAGGTACAGTTTAGTCTATGTGTTAGATCAGAACCGAACATAATATGTTTGGTGCA TTTTATAAATAGAGTAGAACATGATACGTGATTAAATGCTGAGACATTTTGGTTCCACTAAAAAGGGTGGAACCAATGAGAATAAAATGATTTTATTGAT TCTTACTCCTTTTATTCCATTTTATTTCATTCTGATCTAACTATGTTCTGATTTCTATGTTAGGGAAGGACTAACTTACATACTCATTCGCCATATTAAT CAATAAATTTGATCTGTCTATAACTAGTGGGCGGTTGTCCAGGATTCTCACTTGATCCAATTTGGTTTAAGTGGAACAACATTTTTTTTAGTTGCATTGT AATTTTTATTATCAATTTTCAAGGAATTTTAAGTTGCAGAGTGTGAATCCTTAATGGTAGGAGTAATCAAGTATATTAAGAATGCTTTTCTTGCTTATGT GCGCCTCTCTTCTATGCTTGGGTTATGCATTTTAACTGAAGGTTTTGATGCTAGATTGGGGATGAGACATTTATAATCGCAGCTCTTATGGCCATGCGTC ACCCTAAGTCAATTGTCTTGTCCGGTGCACTGTCTGCCCTCGTTATAATGACAGTGCTTTCTACCGGATTAGGCAGGATTGTGCCAAATTTGATTTCGAG GAAGCATACAAATAGTGCTGCTACAGGTAAAATTTCTGGGTTTGATGCTTACCTTTGATCAGATTTCTATATTATAATTTCTGAAAAATCCGTAAAAAGA GGGGGTAATAAATATTGTCTGCATTCTGCCTCTGTTATAGAAGCTTCTATAATTAGTATCATTGACATGATTTTGGGATGCGACATTTGTGCGTGGTAGA TGCTTTTCAATTCCATGTTCTATTCTATGATCCAATATTAGTTGGTTATGTCTGTTTATTCCCGTATGGTGATTATTATTTTGATTAAAAAATTATTTCT TCATTTTCCTTAGTCAGGGTTCTATTTGTGCCGAGCCTTCAGGCAAAATCTGGCTCTTTATTATATCAAGGATACAGAGTTATTATAGATTTGGCTTCTT TTTCTGTCAACTTTAGTTATGTTCCCATAAATTGTTTGTATTTTTGCTTCTATAAAGTCCATGAGGATTCTTGTCATCAATATTAAGGCTGCAGGTATGA ACTTTATTAATATGTGCATTCATGTGAATATTTCGTATGTACTACTCAACCAATTTTGTGCCATTTATTTGATTTCCGTTTATGCCCTAATCATTTACAC TTCTCCAAATTTCCATTCATTTTCTTGTGTTAAGGCTGGGTTTTACTTTTCTGTACAAGTTAATTTTTGTTAAAGATAATATGACGCTAAGCCTGTCCTT ATTTTGAATTATGCAGTTCTTTATGCTTTCTTTGGGTTACGACTGCTATACATTGCTTGGAGATCATCAGATTCAAAATCTTCACAAAAGAAAGAAATGG AAGAAGTATGTTTCTATTGACTCTTCACAAAGTTAAATTCTTGCACACTTATTTGCCTTTATCATTTATAATACCGGGGTGGAGATGTATTGCTTCAGGC GCCTATGTTCTGAATGACGCATTTTTAAAGGGTGAACTTGGCGCAACATTAAGGTTATTGCATAGTGATAATGAAGTTACGGGTTCAAATTGTTGAAACA GTCTCTCCACTTGCAAGAACAAGGCTGCGTACATCTACCCTCTCTGGACCATACTTAAGCGGGAGCCGCGTGTATTGTGTGCCCTAATGATTGTTGTATA TGGCCAGTTCTGTGTGTGTTTGTCTGGAGTTCAATGTATAGTTGTATATTGATGTTGGCCTTTTGGTTATGAATGTTACAATATGCTAACAGCTACAATC TTGACATAGATTCAAGTTTCAATTCTACTTTTTTCTTTTTTTAATTATAGAATCCCTGATTCTCGACATGGTCGATTTGCCATGAGAAGAGGTGAGTATT AATTACATGTGAACATATTATCAGAGTTCGGGGGTCCTAAAATCGTTGAATTGTTTGGCTCAATGTTTTTTCTTTGAAAAGGTTAAATACTGTTCTTGCT AAAAATTTGCTCTTTCTGTTAACTAGGTAGAAGAGAAACTTGAAGGTGGGCAAGGGAAAACTGCAGTTCGACGTTTCTTTTCAAGATTTTGCACACCAAT ATTTTTGGAGTCTTTTATTTTAACGTTCCTTGCTGAGTGGGGTGACCGAAGCCAGATCGCGACAATTGCTCTTGCAACACATAAAAATGCAGTGGGAGTA GCAGTTGGTGCCACTATAGGACACACCATCTGCACTTCAGTAGCAGTGATAGGAGGAAGCATGCTGGCATCTAAGATCTCCCAACGGACAGTAGCCACTG TTGGTGGCTTGCTCTTCCTCGGCTTTTCGTTGTCTTCGTACTTCTACCCTCCTGTATGATTAATAATCGCAGATTAATCTGATTCTTATTTGTTTGTAGT CTTTCCACCTTGATTTTTTCACTTAAAGTTGTATTAAAGAATTTGTACTTACCTGCATAGAAAGCTCGATCCTAGCTGAAACTGAAACTTCAGATTTTGA ATGTCATTCGATTTTTTTTGTAATTGCATTCGCACCTCTATCCATTTACACTTAAACAAATGGTATTTATCATTATTACAAAAAGAATGGG
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_30554;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_241952

FPKM

• FPAB: 0.4
• FPNAB: 0.7
• LF1: 0.9
• LF2: 0.3
• LF3: 0
• LF4: 0.2
• UF1: 0.5
• UF2: 0.7
• UF3: 0.1
• UF4: 0.1

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_241952

• Blastp: -
• Blastx: GDT1-like protein 3 from Arabidopsis with 88.35% of identity
• Eggnog: transmembrane protein 165(COG2119)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G36290)
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0002327)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019431238.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;