| Id Trinity | FTRINITY_DN53075_c5_g1_i28 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_241991 |
| Sequence | ATAACACACCCTTCCCTTAAAATTATGGAGCAATAATCTTGTTGCTGAATATTTTTTTCGCTACTTTGTTTTGGCTAAGCTAAAGCTCTTCCAAAGTGCA GGTTCAATATTGTGACACTAATGGGTCACCTTCTGAATCTACTCCATGTAACATCTTTCTTAACCAAACTAACTTTCTATCACTTCCCCAATTTACTTCA CCACAATACATGTTCTTATCCTCCAAAAGTTTCCAAATTTCAGAAATATCATGCTACCCCATTGGCTTTGCAAGGTAGTGGGGATATAGCAGGTCATGTT GAGAGCCCATTTAAGCATAAGGTAATATGCAGTCTAGGCTCCAATTTTGTTTGTTTTCGAGGATAAAATTGCGTACATCTACCATTTCCGGAATCCGGAC CTCACTGGGTGGAGCCTCGCGGGTTAAGCCATGCTTTGATATTCAGTTTGTTATGATTGAATGCCCCATAATTTTAACATTTTTTGAAGTTTTATACAAT TACTAATGCTTATACTTGGAGTATCAGTATTTGTTTGCTTCAATAACTTGTAAGAAGGAAAGAAAAATGCGAGTTTGTTTTGCATAGCTAGTTATTAAGG TAGTTGAAATGTTGTAAGATAAGCCCCTAACTTATAAGTCCATAAGTTATCTCTATTCTCTAGTAGCTAATCAAATATGGGCATATAAGCTCCTAGCATA TTGAAATAAGCCCTTTACCAAACACCTGAAAGTAGCTTATTTTTTGTCAAATAAGTTAATTGAATAGCTTATAAGTTGTTTGATGGTGTTGCCAAACACA CTCGTAAAGCTTCAACCACTCCCTCTAACAGTCATTTTGTGCTCTCCTCATGAGTGTTTCAAGCAGAATTCAATAACTCTATGGTTGATATGAAGGGAAT GGGGCAGCATTGTTGCATTTTTTAGCATTGTAGGTTGCTCTTTTTTCCATTTTAGGATAGTAGGGGATGCCAAGTTATCTCCCGGATGCATTTTCTTTCC TTTTTACATCAAGGATCAACTGTACTAAAAGTTTAAGTTGCTGGGACTTGGGTGTAGGTTAACAGTAGTTATATAAAAAAGGAAGATTTTCTTTCCTTTG GGCATGAAAGGTCGATAAAGCAAAAGACAATCATGTCTTGTGCTAACATTTTAATTGAATTATGAAGGGCAAGTTTTGCAAGTATCACAATCCTGACTAT TAGGTCATAAAAGCTTCGATACTATGTCAACTACTTTAATGCAACGGTAAGGTTGCTGATTAGTGACCATAATCTTGGAAACAGTCTCCCCACTTGTGGG GTAAGGCTTTGCATATCTACTCTCCCCTGACCCCAGTAGTTGGAAGTCTCGTGCAATGGGTCACCCAATATGTCGAGTACTAGATCTCCTAAAAGCTTAA GCTATTAGATGTGTACATTATATCTAACATGACCTTCTATGCAAAAACCACTTTTGGATTGAGGTGTAGACAAATGATATGCCTCTCATACATTGTGCTG AAACTTAATTTAATTATGAAGAAGCTTTAATGCCACTTCAAAGAACAACCATTCTAGAAACCTAGATTGTCAGGTGCTTCCCAGTAATGATAATTTTTTT CTTCTGGCGTAATGGTTATTGCCATTAATTTCAAAACAAATATGCTTTGGTTGTTTAAAACTGAAGTTCTACCATTTCGTTTTAGTTTTGCTCTTAAATT GTAAAAATCAAGTCTTAGTAGATAAAATCAGAGGTCATTGGTATCTCTATTAGCTAATCAAATATGGGCATATAAGCTCCTAGCATATTGTAATAAGCTC TTAAATTGTAAAAATCAAGTCTTATGTAAAATATTTTAGCCTAATCTTGCTCTTCGTATTCTTACATGATATAGAGTGATAAGTACAATTATTGGTTGTA GATTTTGTTGTGGCTCTAAATATTATGGTTTTACTCTTAGATTTACATTAATAATGGAGGAGAGTTGAATGGTATTCCTCATATACAAACTCTTAGAGAA TTTCCCAGGGCGGAGCTTTTTGAAAAGGTAGTCATGGTCCGATTTGATTCTAACATATTGCTCAAGCAAGAGTCTAACCAGACGACTCCGTCAGGTTTTA ATGCACTTTTTACGATTAAATATTTATATGAAGCTGGAGCAAAGGTAATCCTTGTAAGTGACTGGAATAGAAATGGTTCAGAGCTTCACACAGAGTCAGT TGCAGGTACATCCTTAAAACCTTTTCTCGCAATCGGTGTCTTTAGTTGCCACTGTGAACTGTGAATTTTAGCTAATGGCTATTATAAGATATGTTTATTG CAATTCTACCTTTATCTAAGGCCAGGAAAGGCAGAAGAAAATTGTCTAATGTCGAAGCATGAAGCTGTTATGAATATAGGCAACGAAATTGGCAAATCCT TTCTTTTATATAAGGGAGCTTCCATTTATATAGTTAACAATCTTTACTCTATATTGTAGATTTCTTATCAGAAATTCTCCAAATACAAGTTGTTCCAATG CAAGGCATTTCTTGTAACAAGCTAAAAAACGTGAAAGACCACATTAAAGAGAATATCCATCTTCTGGAGAATCTTTCTTATTTTAAAGACGAAGTTTCCA ATTGCTTGGAGTTTGCTAGAGTATTATCGTCGGGAGTCGATATCTTTGTCAACGACTCCTTCTCCAACTCTCATAAAGTTCTAGCATCAACGGTTGGTGT TACCCGCTTCTGCTATGCCTGTATAGCTGGTTTTCACTTTGAGGAGAGGCTCTGTCTACTGAAGAATGTCGGAGAAGCCAGCAAGAAACCATATGTTGCA ATTATTGGTGGGGGTAATCTCTATGATAAAGCAGCATCTTTTCATTTTTTAGCATCCAAGTGCGAGGGTTTCTTGTTTGTTGGAATGATATCATTTCAAA TAATGTATGCATTAGGAGTATCAGTTCCTCTTAATTTGGTGGACCGAAAGGCACTTGATGAAGCTCTAGACATAGTGAGACTTGCTCAAGATACAAATGT ACAAATTTTGTATCCAAAAGATTTTTGGTGCCGGAATAAACAGAATCCATCACAACTGCAAGTATTTCCTTCTCATGGAATTTCTGATGGTTGGGTGCCT GTTGACCTTGGACCGGTATCATTGGATGAAATAAGTTCCTTTCTTACAAATTGTAAGAAAATCATGTGGATTGGTCCAGTGAAATTTGTTGATTCAAGTA AATACACAAATGGGGCATCTAGATTGGCAGAAGTTCTTGATCAGCTAAGCCAAAGTAACTGTGAAATAACTGCAGTTGGAACTACGGCATGCCAACTAAT GAGGCAGAAAAAAAGTTCATTATCCTTTATAAGTATGATTGAGAATGCTACAGTTGTCTGGGAATTTCTTAAAGGAAGAAAACTGCCCGGTGTTATGGCA GTAGACAGGGCATATCCTTTTGAAATCAAGTGGAATGATGTTTATTCTGATCCAGCTCAACCTCTTGTTGTTGATATCGGAAGTGGTAATGGGCTTTTTC TCCTCGAAATGGCTAGAAGGAAGCGAGATTTGAACTTCCTTGGTTTGGAGATTAATGAAAAGCTTGTTTTGCGTTGTCTGGATTCGACTCATCAATATGG CCTTAAGAATGGGTATTTTATTGCTACTAATGCAACATCAACATTTCGTTCCATCGTTTCTTCTAACCCAGGAGAGTTAGTTCTTGTCTCAATACAGTAA CGACTAAACTTACTGGAAGGATCTAGATGTAAACCTTAATTATGAGCCAGTTTGAGTTTGATGTGAAAGACTGATATTGTCCAAACCCCGATTTCAATAA ACCTGGGCATAGATGGAGAATGCTGCAGAGGTCTTTAATTGAAGCCATAGTGGATCTTCTAGCATCTGATGGGAAGGTCTTTCTGCAATCTGATGTAGAA GCTGTAGCAATAAGCATGAAAGAACAATTTCTCAGATATGGCAAGGGTAAGCTTGATTTGGTGCATGGCCAAAATGAGTGGCTTGAGGAAAACCCTTTTG GAGTTAGATCAGACTGGGAAAAACATGTTTTAGAGCGCGGGGCCCCGATGTATCGAATGATGTTTTCTAAATCATCTGATATTAGTGAAGTTTCAGCTGC AAATGATGTAATCCAAAAAGATGATTAATCCATGAAACCCCTCCAAGGGATTGCTGCTTTTGCAGAATCTTTCTATCACAGAGCTAATGGTTTCTCCCTG TCAGGCAATGTTGCAGGTACACTGTTTTTTCATGAATTTTATCTTATTATGACATGGATAAATTATGAAATAATAAGAGGCTGAGTCTCGGCACAACAGT AAGATTGTTTGTCTTGTGACCTGGAGGTCATGAGTAAAAAATTCGAAAACAGTCTCTTCACTTTCTAGGATAAGATGGCCTACACTTATGGTCTGCAATC TCCACTAGCTGGGAGTTTCGTGTATTGGGCTGCCCTTTTTGGTGTTTGTGCATATTTTATTAGGATTCTTTTCCATTTGAGTAGCTTGAGCTGGTTGAAA ATGCTTACATCCAGCTTTTCTTTCTTTTCCTGACCATTTCGTATGTTGATCGAAATGGCAGCTGGAAGTATACA BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_30558; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_241991
| Blastp | Phosphoglycerate kinase, chloroplastic from Spinacia with 31.53% of identity |
|---|---|
| Blastx | Phosphoglycerate kinase, chloroplastic from Spinacia with 31.83% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019442815.1) |
| Pfam | Phosphoglycerate kinase (PF00162.18) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |