Id Trinity | FTRINITY_DN53075_c6_g1_i5 |
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Name Transcript | Ll_transcript_241998 |
Sequence | GTGAAGCGAGAGAAGAATGGAATGCTTGCATCATTTTTGCTGAAATATTTAAACAATTGGGTTGTTGGTATCTATTGTCACAAGGTAAGTTGTTATATCC TCAGGGACAATAACATATACCCAGTATTTTTCTTGACATACTGGCTTTAACTATACAGTAAATGAAGATAGAACTGAGATTGTTACATCTTGACTTTTCA CTTGCAAAGATGAATTGAGTGATTATTTAGTATCAGGCTCCAAAATTGTAAGGAAAAGTAATGAAGAATCCATTGAATCAGCTGGGTTGGCCTGTTAGTT GGCTAGAATTACTTGATACTATTGATACGGCAGTTCGAGTTAACTAAAATTGTTAGATGTACCATTAATTTATCAGAAAAAAGAATATAAGTAGAGGGAA GGAAAGAGATTGAGGCATTGAGTAAGATAGATAGTTTTGGAGAGAGAGGTCAAGCTCTGTCTTATTCCTGAAGGTAACTTTGTTGTATTCATCCTTTCTC TTCTCAAGCCTAGTTTTCCATTATTCCAGGTGTGGAGAAGGGTCTATCAATATTATTCCACAGTTTCAGTAGTTTTTTCCTAATTTCTGATCCCGTTCCT ATCATGCCGTCTTCTTAGTGGAACTGCTAACAATTAGATTAACTGGTGATGCTATTGAATGAATTTTTCTGCTTGGTATTCAATAATAAACATATTGTCC TACCTAAAGTATATATAAATGATTGAAAGAATGCAAATATCCATGAGATTTTTTCACAGGCCTTAGGGATGGAGCAATGTGCAATCTATGCTGCTAGTTT TAGTTGGAGCATAACATAGGTATTTTAAAGGAGGGTTTCTTTGGTTCATAAAATTGACTTGGGATAAGCTTAGATGATGATCTTCTCTTTGATAAAAAAC ATGGTCTTTCTAAGATGGTTTCTCTAGCCGATATGCATAGAGATTTGGCCGCATTGTATCATTGATGTTGTCCTTTCTTTGTTGTTCAATTTAATTTTTT TATAAAAGGATAATATATATACACACACATATAAATAGATAGAGAAGGGAATAGTACAATAGTAGGAGGATAATGAATCCTAAAGAACTCGAGGAAAAGC TAAGCCAAAAATACAATGTGATTCCTAAAAAAGCTAACCAAAAACATGCAGCACATCATGCCAATAAAACTTCTTACCTTTCTGTTAATCTCTATATTCT GAACCAATATCTATTAGAACCCTCACCTTCATCATGGTGAACTTCTTCCTTGATTAAGAAAGGAAGACAATAGATTGTTTGAGCTCGGAATTCATGGTAT TCTAAATTGATTTTCATTAATCAGTGATTGCTTTTATTTGAAATTTTCCACTTCTTTTCCACTTTATTAGACCTGTGTGTATCTCTGTATTTGTCTTATC TCGGTAAAGACTATGCTTTGATGATGCTTTTTGGTGTGTTCACTTGTGAGGGGATGAAACCAATACTTCATCTAAAATAACATGAAGCTGTCCTCTAGGT TGCAGGCTTGCAGTTTTTCATGCTCTTGCTAAATAAGTTAATATGAGCTTCGTGACAAACGATACTTCATTCTTATTATTAGTCGTGAACACGATATTAA CAATGCTCACTCTCTTGGAATTAATTGACTGTAAAAATGCAGGTAATTAGACTATCTGCTGCCACCCAGGATTACGACGGGTCCATCATCTGTAATGTTC ACGGAGTTAATCCGAAGTTCCTTGAGATTGGCAAGAAAAAGAGGGAGCAACAACAGAATGGAGATAAGGCCTTTACCAAAGGTGCCTACTTTATTGGGAA GATGGTATGGAGCAAAGGCTACAAGGAGTTGCTTCAACTTCTTCGTGATCATCAAAAGGAATTAACTGAGCTCGAGGTTGATTTATTTGGTAGTGGAGAG GACTCAAATGAAGTTCAAGATGCTGCGAAAAAGTTGGATCTGGCAATTCGAGTTCACCCAGCTCGTGATCATGCCGATTCTCAATTTCATGAGTAAGTTG TTCTGCTCACAATGTTTGGATTTCATTTCAGTTTGATGATGTTTTACAGAAGGTTTATCTTATTGGTATTAATATGTGCCTGTGGTGCATAAGTTGGAAT AGAAAGTAAAAGAAAATAGGAATGGTTGGAAGTTAATGAATCAAATATTGACATCATAAGATTTAAGCAATGGAGTCAAGTTAAAAATACATGTTTATTA GCTGAAATAAGAATAATTGATTCAGACTTGTTATATGATATTTTTTGTCGGGCCCACACTATGTGGACAAATTTTTTATCTGATGATTTGTATGAACTCG GCCTTTTCATTTATAGTAGAAGAGTTCATACTTGAATTCCTTAATTTTATGGAAATAAAATTAGAAAGATAAATATATGATATGATTTGATAATCATATA TTAGTCAGATATAGAATCTTCTAATTATCTCGAAAAATTTCTATTTATTTCAACAGTCTCAACAGTTTGAAATCTTATATCACTTTGAAGTTGACGACTC TTTATTATGAATAGATCACATTTTGCAATTTTACATTATATCAGTACTAATTGTCAGGAAAGTGAGCACATTTAAGCCTTTTTTCCTCTAATCTGCTCCA GTTGCTCCATTAACCTTTTCATCTTTTTGGTAGTTGTGAAATAAAGGACCTTTGACAGCATATTGATGAGAACTTGTATATATATGTTAACACTTGATTT CCTGTGTCCTAGTTACAAATTGTTTCTTAATCCAAGCACAACAGATGTGGTTTGCACAACAACAGCAGAAGCTTTAGCAATGGGCAAAATAATCGTGTGC GCGAACCACTGTTCGAACGACTTTTTTAAGCAGTTCACAAATTGTTGGACATATGATGACAGTGATGGATTTGTTAAACTCACACTTAAGGCACTGGCTG AAGAGCCTGCCCAGCTTACTGATGCCGAGACACATGACCTTTCCTGGGAGGCTGCAACCGAACGGTTTCTCAAGGCTGTTGAACTCGATAAGCCATATGA GCGAAGATTGTCAAGAAGCACTTCCATCTACATGTCTACCTCATTAAGCTTGCAACAGACAGTAGAGGATGCATCAGCATATGTACATCATGTAGCTTCT GGGTTTGAAGTATCGCGAAGAATATTCGGTGCTATTCCAGGAAGCTTGCAGCCGGATGAACAGCTACGCAAAGAGCTTGGATTGACTGATGCCGCCAGTA AACAAGAAAGAAATTAATATTGAATGCTGTGATATTAGCATAGGAATTACTTTTTATTTTGGTCTTAAGGTTTGTTGCTAGGAATAAACATGTAAAGAAG GCATCCCCTTAGAAGATTAATATGTTTAGAACCCTGTTCTAGGCAAAAAATTTGTTTGTAGGTGTTGGAAAATCTTAATATGATGGCATGGCTATTTCAT TTTCATCTGCTGTATTCCCTATTGTTTATTGCTTTTAATTCTAATCCAATGAACAATTAAGAATTCATTATTATTTCGGTCCTAAGGAAGTGCTACATAT ATACTATGTGATTGAATAATGAAAATTTTC BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_30559; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_241998
Blastp | Digalactosyldiacylglycerol synthase 2, chloroplastic from Lotus with 84.75% of identity |
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Blastx | Digalactosyldiacylglycerol synthase 2, chloroplastic from Lotus with 82.84% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019461398.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |