Id Trinity | FTRINITY_DN53103_c1_g1_i6 |
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Name Transcript | Ll_transcript_223795 |
Sequence | TTTATTTTTGGGTCTTGAGCTGGCTGAAAATTTTGCGATGATTGTTTACTCAAAGTAATGAATTTTCTAGTCCAGTCTTCTTTTGAGTAAATGATTATTT TAGATTGCATTTGTGTTTGTTTTTTAATCTTCTTCAAAGGCTCCAATTGGCCAAAAGAATATGCATATAAGAACCAATGACCTGTTTGTTTATGCTGATT ATGTTGATAAAAATCACTTCTGAATTCTGATATATGCATATTTGCTTGGATGGGGTCCCCAAGATCCAACTCTGATGGTAGAGCTGCAGGACATGGAATG TTAGCACCCAGGTTCAAATCATGGGAAGTGCACCCCCTCCCCTAAAAAAACGAAAAAAAAAAAACGTTTGGCTATAAAAAAACATTTGTGTGGTTGGGGT TTTATAAAAAAACCAGAAACTGCAAAAAACACTGAAATTCAGCTTTTTTGAGAACCTATATTTTTAAGTGCTTCTAAAAAAACTACTTTTGCCAAAATTA CTTCTGTATGGATAATTTTTAAGCCTAAAGAAATGATCCCTAAATATTAGTACCTTTCCATAATCTAGTTGTGTTTCAATTTAAATGTGTGCATTTAATA TTTAAAGAGAAATAAAGACGTGATCTAAATGCGTTTGTAAATGTTGCTTCTCCGGTGCTTATTTGTCAGAAGCATGCTGGTAAATTCTTATTTAAACACC TTTTAAAAGTTATGTCTGCTTCAATTTCATGGGATCATCTTTGACCACTTTTGCATAAACATATGAAATGTTATATGATGGCATACGAGAAGCTTTTGTT GCATGTTTTGTATCTTAAAGGATTTCCACTACATTTGATTCATGTTGAAGCATTAAGCTGTTACTTTTGCGTGTGCAATGTCTTTTTTTGTCTTTAGTTG 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TTATGGCCCACAGGGTCATCGTGGGATGAGTGTTTTGATATTTGAAGCCTCGGGTAGTGGTTATCTAGAGGCAGAGCGTCTGCACAAACATTTTTCGGAG CAAGGAACTGATAGAAATGCTTGGTTTAGTAATCGACGTATTTTATTTCTCCCTGGTGGGAACCGGCAGCTCTTTGGATACATGGCTACTAAAGAAGACC TGGAGAGTTTCAACAGGCATTCCCAAGGTAAGTCCAGACTCAAATACGATATGAGATCATATCAGGAGATGGTTGTTAACCATATCCGACAAATGAGTGA GGAAAACCAACAACTTATCTACCTTAAGGACAAGGTTGCCAAAGGACAAAAACATACTAAAGCTCTTGAAGAATCTTTCGGTATTGTGACTGAGAAGCTG CGTAAAACAATGGAAGAAAATCGCATTGTGAGGCTAAGAGCTAAAATGCAGCACGAAGAGAACAAAGAAGAGATGTACATGCAAGAGCAATTCTTTAGGG ACCAGATCAAAGTCATTCATGATTCAAGGAATGCTAAGGAGGAAGATTTTGAGAGGATGCAGCAGGAGGAACGCGAGAAGGTGAAGCAGTCAAGCAATGG TCCTTTAAATGCAGAGGAAAGGAAACTCAAGGCTGATGAATATCTAAAATTTGTGGAGGTCCAAGACAAAGAGATGGAGAACTTTGTTGCTGAGAAGGAG AAACTGTGTCATGCTCATGAGGAAAGTCTTGCTGCAATGAGGAAGAGGCATTGGGAGGAAGAGGTGCAGATGGAGACAAAGTTCAATGAGGAACTAGCCA AACTCATGGAAAAGTACTCCCCATCTCACTTGGAGATTAAGTCCAATGGTAACTGATGGTTGTTGAGTGTTGCACTGTGACACAAACAGATAGACACAAA GTTTCTAAGTTGAAAGATAGAGTGAACTTTAATAAGTTGAAGACCCAGACAAAGTTTCTAGTTTCTAGAATTTGGGAATTTCAAAACTCTTTATGTTGTT TTCTTTTTTCAAGTACTCTTTGACAGGATTTTCCTTGAGAAATTTGTTGTGGAATCTATACCACCAAACAATATTGGGATAATAGAGTATATCCTCAAAT TGTTGGCTAAAATTTCTATTTTACAAATTGCATGGCTAGTCAGCAAATTCAAATGGAGCTAAGTGTGCATTGAATGCATCTTATGGCTTCTATTAGGTGC ACCATTTCTGCCAATTAATGGTAGTTTGCAGATTCTATGATGCACCTTTTTGTGTTTAGTATATCATGCTCCCCCGC BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_30796; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_223795
Blastp | Protein SUPPRESSOR OF GENE SILENCING 3 from Lycopersicon with 52.74% of identity |
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Blastx | Protein SUPPRESSOR OF GENE SILENCING 3 from Lycopersicon with 53.35% of identity |
Eggnog | Protein SUPPRESSOR OF GENE SILENCING(ENOG4111E45) |
Kegg | Link to kegg annotations (100134882) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019429760.1) |
Pfam | XS zinc finger domain (PF03470.13) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |