Id Trinity | FTRINITY_DN53160_c4_g2_i14 |
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Name Transcript | Ll_transcript_224414 |
Sequence | AATAGATTGTGTGGTGAGAGAAAGAATAGTTGAAGGAAAATAAGACAAGTCACAATGATGTTATCATTCTGTTACAATTCTCCTTCCATAACTCCATTTT CATCTCCAAACACCAATACCCCATTTTTGACCACTCTTAACTTCAACAATAGGACTTTGGCTTTCAATAATAGATTCAGAATTCTTTCAAATTCACAAAA ACAACAACAACAAAACTCTACTTCCCTTCTCTCTTTTCTCTGTCCATTGCTCAAGCTTTTCTCTGTAACTCACTATCCGTACCTTCTAATATTTTTATTA TTATTATTATTGTTGGTTTGTTATTGTGGGACCCACAATCTCCATGTTATTTAATATTATTTCTACTTAGGGGTGAACATAGGTCGGGTTGGGACACGTT ACCGAGTCTAACTTTGAACCCAACACTAGACCTGATGAAATTGGGGCATACCGGATGAGTGGATAGGATTGGGTCATGCTCACCCCTATTTCCGGTGTTT AAAATTGTAGTTACATTGCGTTTATCATAATTGTTATTGTGGGAGTGTAATTTAAAACATTGGTAGAAAAAGTTGCACTTGTTAGTTGTTACTATTCCAG CTGAAAAAGTTGTTCTTTAAATTCAGTAACACACTTTGTACATGTTATTCTTAGTTTTATCATATTTCTTGTATATTATCTTCCTCATGTAACATACTTT ATGTGTTTCCTTTTCACATGCTATTCTTTAACTAGTATTGATTTTCTGATACATCACTTTGATGTTTAATAGTATTTTTCATCTGTTGCTTCTGGTAGGG AGGGGATCCTTCTGGACAACGCAATTTTACTTTGGAGGTGATCTCTTTATCCCATTAGGCAGGGTCGGCTACATGGATCGAATGATGTATTATATCAGAT AAAATGTACCTATTCACCATATTATGTTGTGTCAACCAACACGACGTCATTTGATCTATGTTATTGACTATCCTATTATGGTGTCATTTTATTAGAATAT GATTAGGATATGTTATTTCTTTAGTATTCACGGTTCCTATATATTGGAACCTTCGGTAACCTTTGTAATCATCAAAAATAAAATAGAATAATAAGAATAT TTCTATCCTCTCTTCTCTCTTCTTCTTTCCCAAATTCTTCTTCTCCTTTCTCACTCTCTTCATCACACAATACCTTCAGTTTCTTACTTTCACACATTTG AAGTGACTAACCTTTAGGTTTCCATAATCATACTGAATGGTAGGTAGCAACATCTTCCTTGGCTAGCTTGTCAAGGTTTGCTTGGGGATCAAACTCCAAA GTTGAGAGTTCGAATCTTCCTACCACTTTGCAGCTTTTCGAATTTGGTATGCTTCTTCCACTCTAGGTTGATGCTAAGGAAGAATCCTTGGTTATGCTGC TGATAATAATGTGCAAAATATTTTCCTTCTTTGAATTAGTTATTAAAATTCGTCAACATTCCGGTAGTTAATTCATTTATCCTGAATATATTACTATCGC CGAGCATTAGTCTTGGCCTCGATGTTTATAATACTAATCATGATGAAGTGGCTTCTTGTACTTGTCCTTCCCTGCATCTTTATTTCTTATGGCTCTTACC GCTTACATATTACTGTTAATGTATATCGTAAACTCTTCTAAATGTTCTATGTTAAATCGTTCGAATATTTTTTTGTCAACAGAAGCATGTCCTTTTTGTA GAAGGGTGCGAGAGGCCCTGACCGAACTAGACCTTTCAGTAGAGGTCTATCCTTGTCCTAAGGGTTCTGTAAGACACAGAGAGGTGGTCAGAAAATCTGG TGGCAAAGAGATGTATGTGGTTCTTTATAACATGCTGTTTCTTCTTATCTGCTGGTCCTACTAAAACAATTTCAATAGGACCATTTTTATTTGTACAGTA TTTACATGCATATATTTTCAACTTATCTTACACAACTAAAATAGATTGATGTTCTCCTTGTCTTTTCAAATAGTCCTATTTATAATATTTTGCAGGTTTC CTTTCCTCATTGATCAAAATAGTGGTATTTCTATGTATGAAAGTGGTGATATTGTAAAATACTTATTTGAGCAATATGGAGAAGGAAGAAGTCCATCACA GGGACTTTTGGAGAGGTATTGGATATAAATCTCATTTTGGATGAGAATATATAACTGACTATTAATCACATATTTAAGACACAAAGAGGTAAATGGAGTA CAATCTTCCTCAGAAAATTTCTGCATTTATAGGTTAGGATGAACTAGAATATTTTATGGTAATCGATACATCATATTAGCATGAAAGTAAGTTGTGTAGC ATGCTGTGACACCAATAGTATGTTCCTAATTCTGGGACGACTTGGAAAACAATTGTTATGTTGCTCTGAATAGATTTTCTTAAGATAATATAAATGATTT TTGTGACTGAGATTATGGCATTTACGGTAGACTTTCTGTGCTGAGATTGTTCCAGATTGCATAGATTTGATAAGGGTCGAATTTCGATTATTTTTGCTCT TAATAACCCTCTTGTGCAGCACTATTTTTACTGGATGGATGCCGACAATACTCCGGGCAGGTAGAGGAATGACACTATGGGAACGTTCAACGCCCGACCC TCCTCCAGGAAAGTTGGAGCTCTTCTCATATGAAAATAATCCTTATGCACGGATTGTTCGAGAGGCGTTATGTGAATTAGAACTTCCATACATTCTTCAC AATGTGGGAGAAGGATCTAGTCGAGTGAAGTTACTCGTCGACGCTTCTGGATCTAAAGAGGTTCCTTACTTTATTGATCACAGCACTGGATTTCAATCTG GGGACTACAAGAAGATCTTACATTATTTGTTTGAAACCTATTCAGCAGCAATTGTATAAATTTACACCTTGAGTAACTGAAGTTTTGTGCTTTGAAATCA ACACAAAGCCTAAATTATTTATTGTTAAGACAATGATGTGTGATGAGCAAAGCTCCCATGTATATGTAGGCTAGACAAGTTTGTAAAGAACTAATGACAC AAAAGCGATACTTATCGGGAGGGACAGTCACATACTCAAAAAATGATTAGTTCCTTACTTATAGGGTGACGTTAGACATTAAACATTGTTCTCCAACATC AATTAAACCTATTAAATGAGTTAGATCAATGTGTCTCAAATGTACCAAATATATAGAAAGGTATCATAACCTTGGTTTTCATAAAATTGATTGATTGTGA TAGTAATAAATGTCACTAAAATATGCTTGTCATAATGTGTGAA BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_31272; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_224414
Blastp | - |
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Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019439237.1) |
Pfam | Glutathione S-transferase, N-terminal domain (PF13417.5) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |