Id Trinity | FTRINITY_DN53192_c1_g1_i14 |
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Name Transcript | Ll_transcript_224138 |
Sequence | CTAAGTTGTAAAATTCAAAAGGCACACCCACCCACATTGGTCAAAAAACTAACACTTCCTTCTCTTTCACGTCTCTTTCATTGATGGCTGGTTGAGCAGA AACAAAGAAAAAAGGATCACATTTGAATTCTCGTCAAAATACTGTTCGTTTATTTGGAATTTGTGTGGCACCACTTATTTCTTCAACCTATTCCATCAAC ATCTACTCTCTCTATCTCTCTTCCTAGTTAAAATTGGGTTTGTTCATACCAAAGGTGAGGAAGGTGACACTTGGAAAGAGATGGCTCAGAAGGAAAGAGT TATGCCAAATTGTGTATATGCTTGTAATCCATATCATGAATGCACAGAATTTTGCTTGCAGAAGAGCAAGGATACCAAGCCCACTAAAACTAAAAAGGGT GCAGGTTAGGGGTCAATATTCCTGCTTTCTCTGTGTATGTACATGTATATAACTCTGTTGTGTGAATCATAACATCATTTCTGCATTAATAGTTGCCAAC CCTGAAAAAACAATTTCTCCTTAAGGATTTTAGTTAGAAATATGTATCCCTTTTAAGTTTTAACTGATGTAAAAAGGCTTGGCACCCTTTTTGATATGTT TTAAACCAAATTTAAGAATCACTTATTTAGTGCTATCAATTGTAACTGCTGTAAGTAGCTGTTCTTTTGTGCCTGTTTTCATTTTTACTTTTATTCTTAT TTTTTATTTTGAAATGCTCAAACTGTTCTGGTTTTTTCATACACTTTGAGCTCTGCTTGAAATTGCTGATAATTTATTTGCATTTCGTAATTGATATTAT ATAAAAATACTCTAATGGTTCAAATTCAGCCAATATATCTGGAGTGTGTAGTTAACAATCTTTGAACACATGTACAATCTGTCTTTTTTTGTCTTTTTGT TCAAAGATTATCGGAGAAGTGTTACAGATGATGATCTTGGCAAAAAGGTGAATGGAGAAAAACACACACACACAGGTTGCCCTAAAGCATCTAATCCTTA CCATGTCTGTAATGAACATTGCAACAAAAGAATGTCAGGAGCTGATTCAGGTACATTGCCGCTTGGCAGGAGAAAGAAACCAGGTCCTAAGCCAGAACTC CCTATTCTTGACAGTGTTCCAGCCTCAAAAATTGGGGCCATTTATCTATCTGATGCTTCATCACCATTATCAAAGTATTCTGAAGTGAAAAAAAAGTGGA GCCAAAGCAAAGTGAGATAATACTAGTTTCTGGAGAAATACATATTCAAGATATCAAGGTAGTGGTTTCTCTTTACCCTCATGCTCTTAACACAGTTATG TTTCAAATTTTGAGCTAATGCAAGCAAATCAGTGTTCATAAGCTTACGTAGCACTGTGGTTCAAAATGGTTGTTGCACTAGTCCCGATATGTATCATATC TGATACCTCGTTACTTTTTTTTAGATATTTTTATCTATGTCTCTTTTAATTATTTTATGATTTTGCCTTATCAACATATCTCAATTGTGTTGTTTCTCTA TCTAGTGTCATCTATGCTTCCTAGTTAAGCAATAAACATATATTTGACTTGTCTCTTGTACTTGTTTTTTTGGACAACTTGTTAACCGCAAAGTCCTACC AAACAAGGACGATGATGAGTATGTTGTTGACAACCCAATAGGAATAAAGCGTGAAGGGGAAAAAATTCTTCAACTAAAGTTGTTCCAATCCCCAATGTTT ATGGCACAGGAGGTTTCATTACATCAGCTATTCGGTCCATGGACTTCAATTCATCTGACATCTCCAATGAGAATGACGAGAGTGATTGAGAGGAGACAGG GTCGATGGTTTCCGAGTCTCGTGTTCCTGTTGGAAGTTATCATGTGAAAGAAAGCTTTGTTCCCATCCTGATGTCCATGAGATATAGGAGCAAGCTGCCA CTTGGAATCCGTTGTCATGCGTTCTTATTACATAGAAAATGTGTGCTTTGTGGTCCAAGAGTTGCAATCAACCTCAATACTTTACCTAACAAACTCCAAT GTCAAAGAACTGTTGGCAATTCTTAAAGATGTAGAATCTGCTCAACTTAACGTAGCCTTGTTGCGTAGCGTACTCGACGGAATTGTTGAGAATATTGATT TCATCAATCAACATCGGGCCGCAGATGTGGCAAAGGCTAACTATGATCAAGAAATTGAACAACTGACGAAAGTGCTGGATTCAGAATTGGGAGTTTGGTT CAGAAAGAACAAGAGGTAACTGATACTAAAACAAGAATTGAAGAAATTAAGGAACGTTTGGATCAGCTTGCACTGAAGACTTCTGATGTGGACTTTTGAG TTTTTGCATGTTGGATTTTATTCTTCTTTCACTACTGTCTGTTATCTTCATTGTAAATTTGCACAATTTTATGATGCACTTTGCTAACATATGTAGCTGT ATCTCTATTGTCTTGATCACATCTTCTACTCCTACTCCCAGTTTCTCCACTTGTGTTGTTGTTGATGATTCTGATGAACTTTGTTGGCTAACAAACTACT TTGGACACATTGCATTTCATTCTGTAAACTTGTTTTTTGTGTTAATAATTCAAATTATGTATACACCAGCACAAAATATCATTCTTTCTCATTTGTGTTT GCGATCAAATTATTGATTTCTGATCTCATTTGTATTTGTGGTTCAAAATATTATTATGTTCCTCTTCCATTAGAGTTGGGACTGCAGGATCACACATGGA TTTGATTGGCCAGCTAAGTTTTTTCATCTCTCCTTTTGAGATAGTTCATCTGGATTCTCCCCTCTTATTAACAAAAATAAAAGTTGTTGAAGATTATTAT ATTGCATAAAAGCGTATAACCTTTCCATAATTTTTTTAGCATTATCTTGCACATAATTCTTGAATGCTTCAAATGGTCTTGCATTTATAATTGTTGTGCC CAGATTGCAGCTTTATTTACATAAGACCAGCTATGTATTTGTCCGCACAATTTCAATCCATCCATTGAACGGTTAGTTCTGAAACTTCTACAATAGTAAG TGGCCATTATTCAACCCAAAAACATTCCAAACGGCCAATTCTGGACGTTCTATAATTAGCAGCTTTGTATATCTATACATAAACCATGAGAAATTCAATT CTGCTTCTCTGCAACTTCCTTCCTCTCCTGGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGCTGTCCTTCTCAACAGCCAAAACCAAAATAAACCAAAACCCACCCCATTA GACCATTTGACATCATCATAAGATGGTTCGGTGCAGCAACAGCTTGATTGGTATACTGAATTTCTTGACCTTCCTTCTTTCCATTCCCATCCTGCTTACC GGTATATGGCTCAGCAAGCAAGCCCACACCGAATGTGATCGATGGCTCGAAATACCCATCATTGCATTCGGCGTCTTTCTGTTAGTTATTTCCCTTGCTG GCCTGATTGGAGCATGTTGCCATGTCAGGTGGCTCCTATGGTTATACCTGGTGGTCATGTTCATGCTCATCTTGATCCTCTCTGCATTCAGCATCTTCAT TTTTGTTGTGACCATCAAAGGCGATGGGGAGGAGCTTTCAGGTAAAGGGTACAAGGAGTATAGGCTTGGCAATTACTCCATCACGTTGCAGAATAGAGTC AATAACCCAGCTGCATGGAACAGGATGAAGAGTTGTTTGCAGTCTAGTCAAATCTGCTCCCAATTCCATAAACAATATGTCAATGACAATGTTGACCAGT TCTACAACGAAAAGTTATCAGCCCTTCAGGTATTTATCCAATTTCTATTCATTTTTAAAGTCGCCAGAGCATGAATATTTTTTCCGTTTTGAATTGGGCT AGAGGGTAAGTCTCAGCGCAACACCACAATAATAATATTGCTACTTAATGACACAAAGGTCAGGAGTCCAAATCCTAGAAAAAATCGTAGATATTGACTC TAGAATGGTTGGTGTATGTTATCCGACTTTGCTTATATTTGGATGTTTTATGCAGTCTGGATGTTGTAAGCCATCAAATGACTGTGGTTTCACCTATCAG AGCCCAACCAGATGGACTAAAACAGGAAATCTTTCTCATACCAACCCTGATTGTGATTCTTGGAGTAATGATCCAAACATTATGTGCTTCAATTGTCAAT CTTGCAAGGCTGCCTTACTCCAAAACACTAAGACTGATTGGAGGAAAGTGTCTCTTGTCAATGCCATAATCCTCATCTTGCTCAGTATTGTTTACTCCAT TGGTTGCTGTGCATTCAGGAATATCAAGAAGGACAATTGGAAGGGATATTAGTGTCATTACTCATTAGATTCAGAATTATTATCATGTAGATGATAAGAG TCATTTGGTTACTTTGCTGAATTGTTTAAGGGAGGGGGAGTGTTTCACATATGCAGGAGTTTATACTGTTTTCAGCACAGTCTGTTAGGTAATTTGCACA TTTTATAATGCAGTTTCCTAACATCTGTAGCTAGTTGGTTATAGTCTTCATCAAATCTTGTACTCCTAGTTTGAGTACACTGAATAAAAAATATCATTTT CTTCTTATTTGTGTTAGTAATCTAATTATTCATGCTCTGCCTCATTCACATGTCTTAAGGGTATGTGTTGATCACAATTACAGTCACATCAATTGTATTT TTCCCTCCATATTTGTCCATGATTACTATAAACAGAATCTAATAGTTACAGCTAAAATATGTAATTGACATGGTCCAGAAGCATTTTAGAAATCTGGGAT AAGTATGAAATGTGTGATTGAGATG BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_31527; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_224138
Blastp | - |
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Blastx | Tetraspanin-8 from Arabidopsis with 59.76% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019453824.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | - |