Ll_transcript_223316

Id TrinityFTRINITY_DN53193_c3_g1_i2
Name TranscriptLl_transcript_223316
SequenceCCGGGATCTTTCTCCATGTCCACCACAACACTTCACTCCACTTATCATCTCAAACTCACCGATTCAACTCGCCCTCACACCACTCGCAAACGCAAACCGA ACGAGTTACCATTCAAGGAGACTCAGCAAGGTTTCGTCGACTACGACAATGGCCACCACGACGTTTCCAACAAGGTCACCGGAATCCTCAAGGACGGAAT TCCCGCCCGGTACCGAATCCGAGTCGCCGGAAACCGATTCCAGAAGGATTGGACCGTTTCTGAGGTCGTTGAATTGGTTCTCAGCCTCGACCTTAGTGAT GATATTGACGGTTTATTGAACCGATGGGTTGGACGCTTCGCACGCAAGAATTTCCCTTACCTTATTAAGGAGTTGAGTCAGAGAGGGAATATTGAACATT GTAACCGCGTTTTCGAGTGGATGAAGAAGCAAAGGAATTACTGTGCTCGGAATGATATATACAATATGATGATAAGGTTGCATGCAAGGCATAATCGAGT AGACCAGGCACGTGGCTTATTTTTTGAGATGCAAAAGTGGAGGTGCAAGCCTGATGTTGAGACTTACAATGCAATTATCAATGCACATGGTCGAGCTGGA CAATGGCGTTGGGCTAAGAATATCATGGAAGACATGCTACGTGCAGCTGTGTGTACTCTGTATTTTTCTTCCCTAGTCAATCTTTAATAGCACCAAGTCG GTCAACGTATAACAACTTGATAAATGCATGTGGATCTAGTGGAAATTGGAAAGAAGCTCTTAATATTTGCAAGAAAATGACAGACAATGGAGTTGGGCCT GATCTTGTTACTCACAATATTGTGTTATCTGCATTTAAAAGTGGGGCTCAATATTCCAAAGCTCTGTCTTATTTTGAACTAATGAAGGGAACTCATATTC GTCCAGACACAACTACGCTTAATATCATCATCCATTGTCTGGTGAAGCTTGGACAATATGACAAAGCCATTGATATTTTTAATTCCATGAGGGAAAAGAA GTCAGAATGCCACCCTGATGTTGTAACTTTCACTAGTATCATCCACTTGTATTCTGTATGTGGGCAAGTTGAAAACTGTGGGGCTGCGTTCAGTATGATC CTTGCAGAAGGGCTGAAACCAAATATAGTCTCATATAATGCACTAATAGGTGCGTATGCTGCTCGTGGGATGGACAAGGAAGCATTTTCTGTTTTCAGTG AAATAAATCAGAATGGTTTACGCCCAGATATTGTATCCTATACATCTCTGCTTAATGCTTATGGAAGATCACAAAAGCCCCAAAAAGCAAGGGAAGTATT TGAAATGATAAAGAGGAAAAAGTTGAAGCCAAACGTTGTCAGCTACAATGCACTGATTGATGCCTATGGATCTAATGATTTGTTGGCTGAGGCAATTGAA ATCTTGCGTGAGATGGAGCAAGATGGTATTTATCCAAATGTGGTCTCAATATGCACTCTCTTGGCTGCCTGTGGGCGATGCAGTAAGAAGGTGAAGATTG ATACAGTGCTATCAGCAGCAGAGATGCGAGGCATTAAATTGAATACATTTGCATATAATTCAGCTATAGGAAGCTATATGAATGTCGGGGAATACGACAA AGCTACAGGCTTGTATAAATCTATGAGGAAGAAGAAAATAAAACCTGATTCTGTTACCTACACTGTGTTGATAAGTGGTTGTTGTAAGATGTCAAAATAT GGTGAAGCCCTATCTTTTATGGAAGAGATGATGCAATTAGAACTTCCTTTGTCCAAAGAGGTCTACTCATCTATCATATGTGCCTACAGCAAACAAGGCC AAATTGCAGAAGCAGAATCTACATTCAACTTGATGAAATCATCTGGTTGCTACCCTGATGTGGTTACATACACTGCAATGCTTGATGCATACAATGCAGC CGAGAATTGGGAGAAAGCATATGCTCTCTTTGAAGAAATGGAAGTAAATGGCATCAAGCTAGATACAATTGCATGTGCAGCCCTAATGCGAGCTTTCAAT GAAGGTGGCCAGTCTGGAAAGGTCCTTAGTCTTGCAAAGAATATGCGAGAAAAAGAGATTCCTTTTAGTGAAACCATCTTTTTTGAGATGGTATCTGCCT GTAGCTTGTAAGTTCAAATTTGTCCCTATATCTCCAGGGAAAACATTTTAATTAAACATTAAACCTGTCATTCTCTGGTTCTTAATTTTTTACTGGATTT CGTGGAGCTTCTAAAAATATTCATCTCCATAGTGCTTCCTCTGTTAGTGTAAGTTATTGCTAATTGAGGTTGAAGTTTGTTTACTATTTTCCTAATCTAG ACATGATGGCATTTTTCCACCAGATGCAAAATTCTTATGGGTTAATACTTCTCATAATTAGGTTATTACTTGCCACTTCGATTGCTGTTTAAGCAGTAGA TGGCCCTTATTCTTCAAGCACAATTTGTTGAAATTTCATATGTTTTCCTCCCATTTGATATATCTTTGTAGTCATTATTATTTTTTCACAATAATATTAT GTTAAGATTTTGTTAATTTTTTTATTGGTGGAACTTCGATTAGAATAACATATTCTGATGCTCAAAAGACTAGGCAAGAAGCATAGAGAATAGGCCCTAT TACTTAAACTGCTTTGATTAGATAAGCATATTTTATGGTATGATTTTTTTAATAGAGTTATTGTATTTTATTATTATTTCCCTGTTAAACTAAATGTGTC TTTTGGCGTAAGATTACATGATTGGAGGACAGCTGTTGATATGATCAAGTACATAGAGCCCTCACTTCCTGTAATTTCATCTGGATGTTTGAATTTGTTC CTGCAATTTTTAGGAAATAGCGGGAAAAATGAAACTATGTTGAAGTTATTCTACAAAATGCTTGCATCGGGTGCTGAAGTTAACTTCAATACTTATTCTA TTTTATTGAAGAACCTTTTATCCTCGGGAAATTGGAGGAAATATTTAGAGGTACTGGAATGGATGGAAGATGCAGGAATTTATCCATCAAATGGAATGTA CCGCGATTTATCCTCCTTTTCGCAAAGGTGTTGTGGGGAAGAAAATGCTGCAATCATAAAAGAAAGACTTGGTATGGATATGCTCATTGTATTTCCATAT GTGCATATGCATGTGTGCTTAATTCCTTTATATGTACTATGCTAGTTTAGAGGGGTTTATATTATTTAATCGACTTGTGTGATTAAATACAATTCACACA CCCCTCTCCCCATGGCGATTGACCTTATTTATGAGATCTAAAGATAACTTTCCTTCCTCACCCTCTTATCACATGATTTTCCTTCCTAATTCGTGTTTCG GCAGCCTTCGTCACATTTGGTCCTATTATCCGATCAGCTTCCAAGCACCTTATATTTAAGATGTCTAGTTTTTAGAAGTACCCAAGCACCACTTGCTCCT AATTTAACTGCTTTCTTATCAAGAGAAGATTCTTCTTCTCTTACTTTTTGTATACTCCTGATCCATGTTTGCTTTTTTTGGTATCAATTCTTATTTTTTC ATCTTATTGTTGATTAATATCATGGTCATGATAGTTCATCTTTCATCTATGCTCCTGCATCTACTCCACTGTAGTTTGCGGTTGCGGGCATTGTCACGAT GTTTAAAGATTCCTACCTAACATTTATCCTGGTTTTGACCTTTGACAGAATCCTTGAAAAGAAAATCAGGGAACCAAGTCTCTCCAAGCCAAACCGAATC TCCCACTCTTTGTTGATCATCATCATGGGATGGATATTTTGCTTACCATAACACTATGTCCCATACTACTGAGAGTATTTCATCCCAGAAGTTGGAACTC AATTTATTGGATCATTTGCTATCCTTTGTAACTCACATTATGTTCCTTTGTAGATAATAGTTTCAGACTCTAATTTACTCATTTTTACTTCTTTTCACGC ACTTGTAATTCACATGTACCTATGGCTTCATGTGACATGGAACTTATGGTAGAGATTCTCGTATAATATTTGATAATAAAGTATCTCATAGTATAAGGAG ATAAACTATTCCCTGCCAATAAAATTATAACATGTGTCATGTATCAACATTTTCTACAAAAATATTTCTAAAGTTAAAAAAATAGTGCACATGTCATATT TTTTGTTGGCCAAAGGAGATAAGTTATCTCCATGTTATAATATTCTTATATAATGTAATGATATATATGTATTAGTATTGATAGTGTATAAGTTTGATAC ATCATCAATTTATTATTTTAACTATTAATGTTCAATCATCATTGATTTTTCAAAA BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_31542; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_223316

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_223316
BlastpPentatricopeptide repeat-containing protein At2g41720 from Arabidopsis with 69.75% of identity
BlastxPentatricopeptide repeat-containing protein At2g41720 from Arabidopsis with 68.62% of identity
EggnogPentatricopeptide repeat-containing protein(ENOG410Z7Z7)
KeggLink to kegg annotations (AT2G41720)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019434154.1)
PfamPentatricopeptide repeat domain (PF13812.5)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;