Ll_transcript_222466

• Id Trinity: FTRINITY_DN53198_c0_g1_i6
• Name Transcript: Ll_transcript_222466
• Sequence: GCCAAGCTTTTCCGGTAACCACAGAGAGAATATTTCTTTAAACTTTCTCAAGCGTTCCAGGCCACATTTTATCCGTTACTATTCTGAACTCATCCAAAAA TCCCTTTCGTATTCTGCAAAGTTTCAAACTTCGTATCTTTCATCACTTCTACGTGTAACGTGTTCAATTATGCACCCCAATTTCTTATTCTAATTTTTTG AGGCTAAAGTTCACTTTTTTAATCTATTTTTATCTGAACAAGCTTCATACTTTATCTGGGTCTGTGTCTCCTAACAAATGCAAATGAGCTTTCCCAACTT TGGTTTTGTTGCTTCATGAGCACTACTACCATGTTGGAGTCTTTACCTTATTGTCAAAGCTTTAAGGGCTATGACCCTAATAAACAGAAAAGTCCTGGTT ACTTCCGTGCCATTTCACGTACCTGTAGAAGTTCTATTTTCATGCTTCATTCAGTTAACAAGCAAGTGTCACAACTATCACATGGTGGTAGTCGCAGGAT AGTTCATAGGACTCATGTGTCAGAAAATTTACTTAAAAGCACGCCTCTCATTGTTCCATCATTTTCAAATTGGAAAGGATTCAGTTTCTCTAAAGATAAG CCATTGCGCTGGGAACGGTTACTAACAAATGTAGCATATGATATTGCTGGTGCTGTTGAAGTCATTAACGATCTAGGATCGGATACTCTTACCTTCTTGG CTGTGACTGTCATAATTGTGCCGACATTCAAGTTACTTAAAGCCAGCCCAATACTTGGTTTCTTCTTTGCTGGGGTGGTACTCAATCAGTTTGGTTTAAT TAGAAACCTTGAAGATGTTAAGGTTTTGTCTGAATGGGGGATCCTTTTCTTGGTAAGATAAATCTCAGTGAAGTTCGAACTGCTGCTATTTTTGCTATTA CTATTATTATTGTTTTTCTTTTTATAATTGTTTGTCATCCTCACAAGTTTCTGAAGAGAGTTTAGATGGAGGGAATAACACTACACTCAGGCTTATACTG TTTTCGACTTTTCATACGGCAGGCTTGTACTGTTTCTCCTTTGCGATTGTACTCTTGATTTCCATTTGTATGAACTGCTTTTATTTTTCGAGAAAAGAAT AGGAGTCCTGAGATCTTAGTCATTTACATGAGTTTCCTTAATTATTTTTGCAACATTAACTATTGAATGAACGGTGGAACCTAACCATATCATTTACATG CTGTTTAACAATGTAGCATGTACATTAGAATATGATTGAAGGTTTAGGAAGAATCTCTTAGAGCTTTCAAATATAAGTTTTGATAAGCTATATTCTTGTC ATGGCGATAATCTTCGTCAAACTCTTGAAAAACATGGTGTATAATTGCTCTGTTTGTTTCTTTACAGCTATTCGAGATGGGTTTAGAGCTTTCACTTGCA CGTCTGAAAGCTCTAGCAAAATATGCCTTTGTGCTGGGATTGGCTCAGGTTGTACTCTCTACTTTAGCATTTACTGCTTTCGAACTTCCACCAAATGGGG CTATTGGAACAAAAGTTTTGGAATTCCTTTTCCACTCAAGGCCTGATCTGGTGAACATCAGAAGCGTTGATGAAGCTGTAGTGATCGGTGCTGCTCTCTC TCTGTCATCTTCTGCATTTGTTCTCCAGCTTCTTGCAGAGAAAGGTGAGCTACCTACAAGATTTGGTTCAGCAACTCTGGGAATACTTCTTTTGCAGGAC TTAGCTGTTATCCCTCTTCTAGTCATTCTTCCGATACTGGAGAGCCAGGTGAGATGTAACTATAAACAATACTGTGTCTCTCTTTTGATTTTCAAATTAA CATGTTGCCTTTTTTGTTGCTTCTTTATGAACTGGTGGAGTTAACAGTTTTAGGTTTAGTAGAGCTCTTTGTCTAGTCTTCGACTATTTCTCGGCCCACC TACATATTGACATATGTGCACATGCATTCCTTTGTTGGTGGTTTCTAACTTTCTTTTAATACCACATTTTTTTCAATTTCTCACCATCCTTTTGGATATG CATTTTTGACACATGCAGCAATTAATTTTGTTCTTTTACGCTTCCTACATTTAAATGGTAAGTTTGTCTTTCCTTTATTATCAAAAGGAATAATTTGAAG TTATATGTTGTGCTTTCTTATTTTTCATTGTAGACAATGTCTGAGGAAAGTATTTGGCCCATGCTTGCTCAAGAAAGTTTAAAGGCATTGGGTGGATTAG GTCTGCTTTCTTTCGGAACAAAGTACATTCTCAGAAGAGTTTTCGAGGTTGTTGCAGAAACAAGGAGCTCAGAGGCTTTTGTTGCTCTTTGCTTGCTGAC TGTTGCTGGGACTTCCCTAATCACGCAGCATTTGGGCTTCAGTGATACAGTTAACTATTTTCCAAAGCATAGGCTTTAATGTTGGGTTGGTTATGGGATA GTAATAAATCCTTAAAATTGAATATCTGCTTGCAGCTTGGAGCATTTTTAGCTGGGGCCATCTTAGCAGAGACAAATTTCAGGACCCAGATCGAAGCTGA CATAAGGCCATTTAGAGGCTTGCTTCTTGGGTTATTTTTTCTAACTACAGGGACTTCAATTGACATGCAGATCCTTTTGCGAGAGTGGCCAAATGTACTT GCACTGTTGGCAGGTTTAATTGCTATCAAGACACTGATCATAACTGCAATTGGTCCTCGTGTTGGGCTTACTTTACAAGAAAGTGTAAGAATAGGGTTGC TTTTATCCCAGGGAGGCGAGTTTGGATTTGTAGTTTTCTCTTTAGCAAATAGGCTTGGAGTGCTTCCACTTGAGCTCAATAAGCTGCTCATTATTGTTGT TGTATTGTCAATGGCATTAACACCATTTCTGAATGAAGCTGGAAGAAGGGCTTCTAGTTTTATTGACGACAAATCGGATGCTGAGAATGTATGTCCTATT CATAACATTTGTAATTTTAGAAGCTATGTGCGCACACACACGTGCATGCATCTAAGAATTGTGAGTAGCCATGGTGGATTATGATTTTGAAACAAAATGT TACGTAAGAAATGCAACTGATGAACACGAGAAAATTCACATGCTGTGGTATGAATAGGTCCTTTTGGTACATATTTGATGCTCTGGATTTTATGCATCAA TCTCTTTCACTTACTTTTTCTTTATTAACTAAATTGTTATAGAAACGACTATTGGATTTAAAGAACAAATTTTGACTTCAAGACATATATAGCAGTCTTA TGCTACTTGATTTCATTTTAACTACACGTTTACATTGGCTGATTACTAAGTTTATTGCAGAAAGCTTCTGAGGCGGTTAACTTTGATGCCAGTGAACCAG TTGTTATCCTTGGATTTGGACAAATGGGCCAGGTCCTTGCCAATTTCCTGGGAAATCCGTTGGCTTCAAGAGGAGATAGTGGTGCAATGGGATGGCCTTA TGTGGCTTTTGATCTTGACCACAAAGTAGTGAAGGTAAGTGCATCTGAGCATTGTGCTTGGCTGTTGTCCGCATATGACACCTTTTCTGAGGAACTGTTT GAAATTCATGAATAGAAATATGTTTAGAATATCTCCAATTTGGAATTGAGGAATTAGATATTGAAACATTCTCTGTCTCTGATGCCTTAAATGAGGTAAG GAGCATACAGACAAGCTTCTTTATATGGACGAATTCTCTATATCTGTATCTGCACCAGATGTACAGGCTTCTCTGTTTTAAAAAACACATGAGTAAGTCT AAGATTGCCAATTGAGAGTGTTGACCTATTAACCATTCAGCATCTACATGTTCATAGCTTTTCCTTTTCTTTGTTTTATCAAGAAAATAAAACCATCCTT TCGTACCTTTTCTTACTAGTCTCATTTATCCACCATTCATTTACTTTATTCTTCTATCACTAACTGCTGGGCAGGCAGCTAGTAAAATTGGTTTTCCAAT TCTGTTTGGAGACGGATCACGTCCAGATGTTCTTCAATCTGCCGGTATCAATTCTCCAAAAGCTATCATGGTTATGTACACGGGGAAGAAGAAGACAATT GAAGCTGTTCAGAGGCTACGCTCAACTTTTCCTGCGGTCCCAATCTACGCCAGAGCTCAAGATCTCAAGCATCTTTTGGATCTGAAGAAATCAGGTGCAA CAGATGCCATTCTGGCAAATGCAGAGACTAGCTTGCAGCTGGGTTCTAAGCTTATGAAAGGCCTTGGTGTGATGTCGGATGATGTAACATTTCTCAGTCA GCTTATTAGAGATTCCATGGAGTTACAAGCTCAAGAAGCGGTCAACCAGTCTGAATATCGTGAATTAGATATTATGAAACCGCTGCAGGTAAAAGTTTCT GACTTGATGGAGGCACGTGTACCGGTAGCTACTACTTCCCCAGAATATGAACTATCAGAACTGAAAGAGAAGGATCCAGCTTCTTTGAGTAGAATTCAAA AGGAAGTAGTTGCTATAGAACAAGATTATGAACTAAATCAAACTGTGAATTCAGAAGGAAATGGTGTTATATGTAGCAAACAAGGTACTAAAGAAAGCTC AATAGTTGAAACTGAAGATGGTCTATGACAAATAAATCAGGTGGACCCATCAATTACTTCCCATACTGCCATGGAGGAACATTGACATTGTTAGGCAGTG ATTTTATCCATTAATTTTGCATCTCTAACCATATATATATATATATATATATA
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_31552;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_222466

FPKM

• FPAB: 0.3
• FPNAB: 0
• LF1: 0.1
• LF2: 0
• LF3: 0.1
• LF4: 0.1
• UF1: 0.1
• UF2: 0
• UF3: 0.2
• UF4: 0

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_222466

• Blastp: K(+) efflux antiporter 3, chloroplastic from Arabidopsis with 52.6% of identity
• Blastx: K(+) efflux antiporter 3, chloroplastic from Arabidopsis with 84.46% of identity
• Eggnog: Sodium hydrogen exchanger(COG0475)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT4G04850)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019421719.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;