Ll_transcript_164421

Id TrinityFTRINITY_DN53222_c5_g3_i5
Name TranscriptLl_transcript_164421
SequenceCGAACATGCTGAAGTGTTAGAAATTACAGTATAAAAGTTGAAGGATGAACTAGAAGAATGCTTCCATAGATTGCCCTGTCCTAACTTGATCTGCAATTAA TTATATCGCGATTAGGTATATTTAGTGGCATAACATTTAACTGTTTTTCGTTATTATTGTGGATGAAAAAGAATTGGGGCATGTCATTGAACAATAATGA AGACAGCAAAAACTATAGTTGACTTTGTTATTTTGTGTTGTAATGGGACACATAATCGCAATATTAAAATCAGTGACTGACTCCATTGTAACATAATTAA GTATTTGAAAATATGACCGACTTGCTTATTTAGTCGTTGTTTTTCCTGTTGGCCCACGTGTTTGTATAACGTGATGTTCATTATTGCAACGTGTATGAAG ATGTGAGTCTGAATCTGTACGCTGTTGAAACTTCAAGTCAGAGCTCAAAGGCAAAACCTTTCTTTCTCCCTTTATGCCACCAACTTTTCAGTATCTCTTA TCAATTTTGTTTACTTATGACGATTTCTTCCTTTTTCATCAGAGCCTCTAGGTCTCTCAATACTTCCAACTTTCTGCTTCTTTGCACCCTCAGGTCATTC TTTACTCTCCTCCTTCCTTCTTTTTATGTAACTTTAGTGCTTTTCTTTTCCTCCATTTCAATAATCTTCTGGTGGCATCTGGGAAGGTTCCAATTCTAAA TAAAATGGAGCTCATGATATTGGGGTTTATGACCTTCATCTTCACAAATCTGCAAACTTATAGAAACATATTGCTAAATTCATTTTTTTAGCGGAAGATA GAAGAAATCTGCAAATCAGTTTAATGCGCACGTTGACCAAGTTTTGACTGTAACAATTGCTTCTACATACACATGAAAGTTCCAACATCATTGTCTTTCT TTAGAGTATTGATCAACTCACATCCACAAGTACTAAGAAGGCTTGGTTTGTCTTATAAAATATAAAAATAGGCTTGATTTGATATTTGGAACTAGTCATT CTTCATGTGAGATTAACATTGTCACTGCGTCCAAGCAATTTTACGTCACATATCCATGTTAGTATTGAGCCTGTAGCCTTTATCCACCCAAGAGGATTTT AGATCTTGAAAGAAAAAGCTTAAACCAGTGAGTTTCGCCGCGATTCAATTAAAATAGTGACCCAATGTTGCTTCAAATAGGGGGATGATCTACCAGAGGT GAAACAATTTTGAATGGATTGAATTTAACAATTTAAGGCAATATTGCAATTAGTTTTATTCTGCAAATGGCATAAACTTAAATGCTTGATTTCTAATGCG TTATGAGCTTCTATGTATTTTTCCATCCATAGTTAGAGTGGAAGTTATATGTCTGTCAGTAAATGTATTGGATATACCATTTGGTAACAACTCCGTGATA TACCATTTGGATAATATATTGGCATTTTTGTGAAACAAAGAAAAACCTAAGTATGAAGATAAAAAATGGCTACAAGGTAGGCAATATGAGCTTTGGATGT AAAGTAATCTCATTTCTTCAGTAAATAGAAAAAAAGGTTTGAGATCATGGACTTCTAAAAGCTAGCATACATTTGTAAGTACCTTGACCGCAAGATTTCA TCTTAAACTATCCCTTTTCTTGCTCTTACTATTTCTTTAAATAATTTTGGTTAGAGATGGCCAGTGTGCGATTTCGGATTTTTTTTGTTTCTTCCTTACA TAGTTCCAAACAAATACAGTCAGCCTGAACCGAGTTTCGATTGTTGTCTATATATGAATTCATTCAATAATGTCTTTCTTGCTTCTTGCCTGCACTTAGG CTACATTAGATAGTTTTTAGGTAACAATGTTTTCTGTTTCATTGAGTTTATCTTCCCTTGGAAACTACAGTGGTGGAGGTGTGGTGGCATACTCAGAATT ACAATCAGAAACTCAACATCCTACTATTGTTGCTACTGAGCCCCGAAAAAAGAAAGTGGTGGTTCTTGGAACAGGATGGGCTGGTACCAGTTTCCTTAAG GGTCTGGATGCTTCGTTATATGACGTTCAGGTTGTTTCACCTCGTAACTACTTTGCATTTACTCCCTTACTACCCAGTGTAACTTGTGGAACAGTTGAAG CACGGAGCATTGTAGAGCCAGTCCGGAACATCATAAAAAAGAGAAAAGGAGAAATAAAATTTTGGGAGGCAGAATGTGTCAAGATTGATGCTGCAAACAA AAAGGTGTTTTGCCGGTCTAATATTAAACACTTAGTGGGAAGTGGTGACTTTTCTTTGGAGTATGACTTCTTGGTTGTAGCGGCAGGAGCACAAGTAAAT ACTTTTAACACCCCTGGTGTCAAGGAGAACTGTTATTTTCTGAAGGATGTCGAGGATGCTCAGAAAATTAGATTGTCTGTGATAGATTGCTTTGAGAAAG CTGTTCTTCCTAGTCTATCTGAAGAAGAGCGAAGGTCAAATCTTCATTTTATAGTTGTTGGAGGAGGTCCAACTGGTGTGGAATTTGCTGCAGAACTGCA TGATTATGTCCTGGAAGATTTAATCAAATTATATCCTACTGTCAAAGATATAGTGAAGATAACATTGATTCAATCAGGAGATCATATCTTGAACACGTTT GATGAAAGAATAAGTTCATTTGCGGAGCAGAAGTTTGGAAGAGACGGTATAGAAGTTCAAACAGGAAGCCGTGTTGTCAATGTTAGTGACAAGGAAATTA CAGTGAAGGCGAAATCAACAGGAGAGTTTTGCTCTGTGCCCCATGGATTGGTTGTTTGGTCCACTGGCATTGCAACTCTTCCATTTGTGCGAGACTTTAT GGAAGAAATTGGTCAGGCCAAAAATCGTGTACTAGCAGCTGATGAATGGTTGCGAGTGAAGGGATGTGAAGCTGTGTATGCCCTTGGTGATTGTTGTACA ATAAATCAACGTAAAATCATGGTATCTTTTAAGCCTTTAACAATTTTTTCAAAACATGAGCTTATTATATACTGTAAGGAGCTCTATGAATACGGATTTG AGTATTTGACCAACTCGATTTAGGAGCTGATGAATAAATTATTCTCATTATGCTCTTTGTTCCATTATTTTCAAGTAATTTCAGTGAAGCTGCTCTACGA ACTAAATTGCTACCGTTTTCTTCTTGTGAAGAGAATGGAAGAAATTATGAGTCCCTTTGACAGTAACATAAATCATGATTGTGTTTACTCATTACCTCTG TTTTCTAGGATGACATCTCAGACATATTTAAGGCTGCGGACAAAAATAATTCCGGCATCTTAACTATTGAAGAATTCAAGGATGTGATGGGTGATGTCGT CTTAAGATATCCGCAAGTTGAACTTTATCTAAAGAAAGAACATCTGCTTGATTTGACCACTCTGTTGAAAGATTCACAAGGAAACCAAAGAAAAGAAATA GACATAGAAGGGTTTAAGCAGGCCCTTTCTAATGTGGATTCACAGGTGAAGGTTCTGCCAGCGACTGCACAGGTATGGATAATTTCATCAGTAACTGAAT GCTTGCTCATGCAAGCTCTGTTTGCAGTCAAATATATTATAGTTAGTACGCTTTTAATGCATTGGTATATCTAGGTTGCTGCCCAACAAGGTGAATATCT TGCAAGATGCTTTAACCGCATGGATAAATGTGAAGATCACCCTGAAGGTCCTCGACGATTTAGAGGACCTGGACATCATCAGTTTCGACCATTCCAGTAA ACCATATACTTTTTTATGCTCATATTTTATGTTTTCTATAGTTCCTGTCTGCTGAGTGAATATTGGAAAAGTGTGGTCTATCTAAATCAGACACCCAAGG GAACCTGGTTAATTGTTATGATTGCTTCAAATTTGAAAGCAGTTGATAAGGAAAACTTGGATACACTGCAGAAGTGCACACATAGGTAACAAATTTGATG TACATTTAAGCGAACTGTGCACAAAATAAATAAGCTACTATTCTTCAGAAAGTGCATCTTTTAGTGGATTGTAAGGTAAATTCTGATAATTATTTAGGTT GGAGTTCCATGCTTCAACTTCCCCCCAGAGGATTTTTTTCAACTGCTGGAGATGATTTTTTTTTGGTAGAAACCAAGTTCCTATGATGAGTTTCTGAATT TAAGTTCTGTCACATATCAGACCTATTGCTCAATCAAGATAATTAATGTCATTCTATGTTAAAATAGCTTTGAAAAGATAGAATATTTGACCCATTTAGA GATTAGAGGTATGTTTGGGAGTTTCATTATGGAGGGAAGGAAATGGAAGGTTTAGTTTATCAATTTAAGAATGATTTGGATAAATTATACAAGGGGGTTT ATTTTGTGATGAGTTATGAAGAGGGCATCACAGTAATGGGTATGATTCAAACTTAAAATACTAGTTTTTATGAGCACCAAAAACCTTATCATGAGTGAAA TGATGTTTTGAGAACCATTTGGATTAGTTTTTGCTTTAATCAAGTACTTAATTGCTTATCTTGATTTCCTACCTTTAGCTAGGTTAATCCATAACTAATC ATTAAGTTGGTGATTACTTATTATCAAAGGTATAAGCATTTTGGACAATTTGCTCCTTTGGGTGGGGAGCAGGCAGCAGCAGAACTTCCTGGAGACTGGG TTTCCATGGGTCATAGCACTCAATGGCTTTGGTATTCTGTATATGCAAGCAAGCAAGTGAGCTGGCGCACAAGGGTGTTGGTTATATCTGATTGGACAAG AAGATTCATCTTTGGGAGGGATTCAAGTGGTGTTTAATGTGAATAGCAAACAACGTCTTAATTATTTTGTGGAACTTTGTCCCTGTTCATTCTTATACCT ATTAAGGTACAACATGTTTGTCCACTTTCAATTGCAAAAAACACTTGGAGAATTGTCATGTATTTTTGGTTGAGAATGCTTCTGTTTGCAGCTTCCATTT TGTGTCAGAATATATATACTTTGGGTGGGTTAATGTAATCCTGTCTTGGATACAGTTTCCTAAATGCCCAACCACATTCAGCTCAAAATAAAATGTCATG CTGATATAAACACATTGAAACACAATTATGATTCTCTCGTCATGGTTCTTTTGTGAACCGTGGTTTCCTTTATGACCCAACTCAACTCTTATCTACAAGT AAAAGATAA BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_31753; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_164421

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_164421
BlastpExternal alternative NAD(P)H-ubiquinone oxidoreductase B1, mitochondrial from Solanum with 72.35% of identity
BlastxExternal alternative NAD(P)H-ubiquinone oxidoreductase B1, mitochondrial from Solanum with 73.49% of identity
EggnogNadh dehydrogenase(COG1252)
Kegg-
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019448973.1)
PfamPyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase (PF07992.13)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;