Id Trinity | FTRINITY_DN53303_c2_g3_i8 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_244891 |
Sequence | TTTACGTGTTTTAAACTCACTCATCATCTTAACAATCAATTTTAGAGAAATCGAATGGTTTGAATTAATTAATAAATCTAAATTATTAGATTTATAATAA ACTGATGGCTAAGAGTAGAGTGAACTTTCCATGAAAAAGATCTGTATCAGCATGTTCTATTTGGATAGGGACACGAGAAGAACCCACTTGGTATTAAAAA AATAGAGAGATTTACATAACTCACTAGAATTAATCTTTCGAAATTTGTGTACGGTGGAGTATCAAGTAGTATAATGCTGAATGAGAATATACATTCTTTT TTTCTCTTTTCAAATATTACCAACAAACCTGATATGAACACTGCAAATTGGTCTGCGTGGAAATGACATATAATTGTTGGATTGTGAAACCCTAATTCCC AATTGAATGGAGGAAGAGGGTGTAATAGAGTCTTCAATTCCAGATGCAAGTGAATGTGATGTCTCAATTCCAAGGGGTGGACCCATTTATGTTCCTAACA TGCTTTCTCCTTCCACTACCCTCAACCATTTTCACTCTTCTCTTCTCTATCAACTTCAGGATATAGAAGCAGAGCTACTTAATCATCTTCATCATGAACA TGAACATGAAAATGATCTCTCCGTTCATGACCTTAAACTATTCACAGACCATGACTTAATGGATATGGCTTTGAAGCAACTCTTTCATGACAGGGACAAC AACAGCAACAACAACAACAACAACAACAACGAAAATCAGCCACCACTTTTGGACCAATCCAATGCCAACAACTCTACAACAAAGAGAAAGAGAAAGACAA GAGGATCAAATAATGCCATTCTTCAAGTATTTCTAACTCATTATATTTCATTTCATTTTCCTCTTCACCAATAAACTTTATTCAATTTTATTTGAGGTGT TATCCGTGTTTTAAATTGCGATTAGGGTAACGGTTGCTTTTACGGTGTGAATTATGTTATGATTAAAAAATACTTTTTGAATTTGATGCAGTCCAAATAC GGTCCGTTACGGCCCGTTACGGCCACGTCACTGTGATTCGGACCGCAATTGCGGTGGTCACCGCATGTTATGTATAATATGGTTGGTGTCAAGTTGTCAA TATTAGATGATGCTGTGACTAATTATTTTAGTTCCACTACCTGAGATGCACTTCAATGATCCAAATGGCTTTAAGCTTTATTTCAACATGATTTCATTCC ATTCTGCTGCACTGCATCAGATATAGTTTAATGGTTAAGATCATGTAGATAGAAATAGATAAATACTTATGCATCACAGCATTGTTTTAACAAAGCATCT TAATTAGGTTTTCAAACCGCTTTTCGAAATGGATTCTGAAATTGTGTCTAAAGCTTAGCTGGTTTTCAGAATGGTACGGTTCTAAAATCCCTAAACTGGT TCTGAAACCTGTTTTGGAAGTAGAATTAGTTTGGTTTGGGAAAACCAAAACATTGGTTTTTCATGTGAAACAAAACCATGCCCATTCCTTGCTATAATTT TGTATAAATTCATTTCCATCATCTAATAGTGATTCACCATTCTTGGTCTCTACAAATAACTCAGACCAAAGAATCAATATATGTCACCAGATCACATATA ATTCAACCTATGTGCAGAGTAAACAAAATCGTTAATTATTTTTACCACAAATTAAAGCATCGAATACTTATCTTTAATATCCAGTTTTTTATGCAATTTT GTAGAGTGATTGTCTAGAAAAGGCGGAGCAAATTGTGAGAATTAAACATAAGCAGGAAGAAGACAAGGAGGCAGTCAGACTTAATTCATTTAATCCTGCT TGCAAGATCACTGAATCAGCTCAAAGTTCTACAAGAGTGGAAAGGATGAGATCCCTTAGGTCTACGAGTTCCATTAGAAAGGTCAACACAGTGAACCTTC AGGAACAGATACCTGTGCAGCATCCAGAGGTTGTTCTATCTGTTGAAGTTTACCATAATGTTCGAAAGCGTGTCAAGACCCAGGAGTTGTTAGTTCTTGG AGGACAAACTCTTAGTGCTTTAAGGGACAAGATCTATTGCTCAATGGACCATGTGATGCAAAAAGCTGGGCAGGGCGACCCTTCTGGTTATTTTCTCATT GAAGATGTATTCTACAATGATTTGAGGGATCCATCTGCTATTGATTATTCCAGACCTATACTGGATTGGCTTCAAAACTCCAAGGAGGAGGTACAAAAGA AATGGGAATATATTATGAATGGGGAAGTACAGCAGAAACAAAAAGCAATCATGGGAGAAGTATCTGCACCAGACTTGCCTCACTTCACGTCCGTGGAGAT GCACAAGATACGTTTTTGTGACTTAAGAATTCGACTCGGCGCTGGATATCACTATTGTCATCAGGGTGATTGCAACCATACCTTAGTAATACGAGATATG AGGTTACTTCATCCCGATGATACGCATAATCGGGCTGTTTATCCAATAATCACTTTTCAACTGAAGTTGCGTTTTCAGAAATGTAGCGTTTGCAATATAT TCAGAGCTACAAGGGTTACAGTGGAAGACAAATGGACGCCAAAAAACCCTTGTTTCTTTTGTGATGAATGTTTCGCCCTACTTCACCTTGATGAGGATGG CTCTCCATTGTATCATGGCTATAAAGAGTACGATTATAACCATGAGTAGTTGTTGTTTGTTAGCCTAGGATTGAACAAGTTTTGGCATTTTAATCGAAAT AAGCATTGATTGGCTCAATCTCTTTTCCAGCTGAAGCAACCATAAAGAAACTCCAAGATAAATGGGATGTTCCCAGGGCCAACAATTTATGTTAGAGAAG GAGATAGAGTACAAGTGAATGTCACTAACCATGCAAAATACAACTTGTCAATTCACTGGCATGGACTTAAACAATATCATAATGGATGAGCTGATAGACC AGCTTATATTACACAATGTCCAATCCAGACTGGGAACAGCTACACTTATGACTTCAATGTCACAGGGCAAAGAGGACCTTTTTATGGCATGCTCATTCTT TGGTTGAGGGCCACTGTTTATGGTGCAATTGTTATCTTGCCTAAACCAGGAACCTCTTTTCCTTTTCCACAGCCAGCCAGGGAATTTGAAATTCTGCTAA GTAACATCAGTTTCTGAGCACAAAGAGTAACCACCTTGAGATTCTAATAGTTAAATCAAGAATTTTAATTTTCGTGACTTATGTTACAGGATAATGGTGG AACAATGACGTGGAAGGGGTTGGAATGCAAGGGTTCAAGATGGGGTTGCCACCAAATATGTCTGATGCACATACCATTAATGGGAAGCCAGGATCATTCT TCCCTTGCTCAGAGAAAGCTAAGCAAATAAAATATTTGCCTAAGTTTGTTTTAATGTAAAGGAAAAGTCACTATGCATTTGGGTAAATATGCCTAATCAT AAAGTATCTTTGCTCTAAAGAAAACGAATGTTAAGCATTCAAATTTAACTTAATTTCCCCTTCACTCATTAGTCTCCAAATTTTAAAATAATGCTGCTAA GTACCCTGCTAATGATGCAGTATACACAAAACCATGCAGCACACAAGCAAAAGGCATTCCAAACTCTGCTAAGTACCCTGCTAATGTTCCACTCAAAGTT TAAGATATAACTAGGCCAAATACAAAAGTAATTTTAATGTCCAAAAATTAATCTCGAAAAACGCGAGGAAACAACTAGAGAAATTTTGATTTATGTTATT TCTAATCACGTTTGAGCCTTTGTAGCTTATAGTATTGAAATAAAAACAATTATTTATCTCCAAAAAATAATTTGAATCAAACACGATTACAAGCATTTTA TGATGAGACAAACTTGTGCCAGCAAATAATAAAAGACAAACTTGTATTGGAAAAAAACAATGCTCTGTGATATAAGCCACAATTCTCCATTTGAATAATA AAATAAATAAATAAACAATGATATGAAATTTGTGTGTCCGAAATGTTAAGGGTTGTTGAAAGGAATATCCGAATTTGAGGGGGCACCACTGCAATATAAG GAGCAGTTGAGATGAGATGAGAAAATAATGGCGATGATGATATCCATGTCATTCTGTGTCAACACCAACAACACCTTCACGTTTTCGAATCCTCGCCCAC TCTTCAAAAGGTGTCGCGGAATGTCAATTGCAAGTTTAAGCAACAAAGAAAGCACCACACTTGGTGTTCATCTCACTGAAGGAGAAGGGAATTTACCAAA ACTTGTTCTTTCTTCACCTGCTGGTAGTGAGGCTGAAATATACCTGTTTGGAGGATGTGTTACCTCTTGGAAAGTTCCCAATGGAAAGGACCTCCTTTTT GTTCGTCCTGATGCTGTTTTCAATAAGAAGAAACCTATCAGTGGAGGCATCCCTCATTGTTTTCCGCAGTTTGGTCCCGGCCCTATTCAACAGCATGGAT TTGGCCGTAATTTGGATTGGACTGTTGTTGATTCTGAAAATGTGGAAGGAAATCCTGTTGTAACTCTTGAACTCAAGGACGAGCCTTATACTCGAGCCAT GTGGGATTTCAGCTTTCATGCCTTATACAAGGTCTCACTAGATGCTAAAAGTCTTTCGACTGAGTTAAAGATTAAAAATACTGACAATAAGGCGTTTTCA TTTAGTACAGCCTTGCACACGTATTTTCGTGCTTCTGTTAGTGGTGCATCAGTAAAGGGACTGAAAGGTAGCAAGACATTGAACAAAGATCCAGATCCTA AAAATCCAGTGGAGGGTCAGGAAGAAAGGGACGTGGTCACTTTCCCTGGATTTGTTGATTGTGTTTATCTCAATGCTTCCAATGAACTACAACTTGACAA TGGCTTGGGTGATTTAATATCTATCAAAAACACAAATTGGTCAGATACTGTGTTGTGGAATCCATATCTTACAATGGAAGCAAGTTACAAAGATTTTGTT TGTGTTGAAAATGCTAAGATTGGAAGTGTCCAGCTTGAGCCAGAGCAAACTTGGACAGCTGTGCAGCATCTTAGTGTTGCTTGAACCGCTCAACTTGTAC ATCATCCACTTTTTTGTCTTGTTTTATTTGCCAACAATAATCTTCTGTATTAATAATTTTCTAAGCCATTAATTGTGGGATACTTTGTGAGGGATTTGAT AGTTTGCTGAGAGGTCGTTGCTCATTTCATAAGGACAAACCTTAGTTTAGTGACACCTATGAAGCACTCCATCATTTTGTCCATACGCTTGAAACTTATG GCTAACATCTCCCTTAATTTCTCTCATCTTGTTGTATGGTATGACATGACATCCAATTTTTATCTCTGTAATAAAGTTTGTCTATTCTCTTGCTAAAATT TGGCTTTCACATTTGTAGTTTCCTATTTAATTATTCTATCATGTTCCCAGTTAGGATAATATTATTTACAAAAAGTGTGTATTGTGACATTGCTCTCATA TTGTGTCACCTTATGTTATTGATTGCTCGAATTTAGACAATTC BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_32521; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_244891
Blastp | Putative glucose-6-phosphate 1-epimerase from Cenchrus with 34.36% of identity |
---|---|
Blastx | snRNA-activating protein complex subunit from Arabidopsis with 52.4% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019444772.1) |
Pfam | Aldose 1-epimerase (PF01263.19) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |