| Id Trinity | FTRINITY_DN53310_c7_g1_i3 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_246839 |
| Sequence | AGATAACAGATTTATACATGCCGAAGGATCAAGGATCAAAAGCACATCGTGGAATTGGTTTTATCACTTTCGCAAATGCAGGTTTGGCCATCTATGTTTG CTTGTCTGCTAGAATCGTCCACATGTATTAAGTGTACGATTGTATCATATCTTAATTATGCTTTAATTGATAATTTTTAATTGGGATAGTTAACTTGGAT CTTGACTGACACTGGCAAATGAAGAACTTTGAGAGTACTTGCTGAAGCAGGGATGATATGCCCTTTTTCCCGATAAATAAATTTATAAAACGGAGTTGAT ATTGGCAGTTCACTTAAATTATGTCTTGATGTTAACATAATGGTTGGTTATAGCATCACTTCACTCCAACGACTATTTTCATTGTGCATGAAATCCTACC TCATTATTAAATTGATTCCAACACAAATAGACACATGTATCTTCGTTTATGGTGGAGATGAACTTCATATTTATTTGACCTATTGTTGGCTGAGAATTTT GTAGGAATTAGGTTAAGTTAAATTGTTCGGTGTTTAGTAATAAGTTTTTGTCACATCTGTTTGCATTTGGCATATTTCACATATAACTTCGTCTTCTGTT CAATGTCCATTTCATGCTTAGGTTTGTTTTTTATTATGGATTATGCTATATTGCGGATCTTTCTCAGCAAATCTAAATGATGTAATTGCACTACTCTTGC ATGATAAAGGACATGAAAGTCTGTCATCAATTGCTGTAAGGAAGATATTCTTTTTTGCAGATTCTGTAGAGAATTTGATGGTAGAAACCCATGAACTAGG CGGTTCCACTGTGGTGGTTGATCGAGCAACACCTAAGGCAAGATTAATTTTTTTTGAAAGATAACAAGATTATTTGGAGCATGTTCATTTACCAATTAAA AAAAGATTGTGCAAATTCCTTGTAAATTTATTCTCATGACCATTTTTATTGGTCATTCTGTTGAAGTAATCATCTATCGCAACAGGATTGCAATAACCAT AAAAGCAGTGCTTTGTGCACGTAAGTCGCCATTAAGTTAAAAATAACAAAAGTTTTTTTCCCACTAGGTGGGTTGGCTACATGGATCAAATGATGCCATT GTGTTTTGTCATAAAGATTATTTTGGAAAAACTGTTTAAATTTAACTCTTTTTAATGGTTTTTCTAGGATTTTTCTTTGACTTTCTTTGACTTCCTTTTG GATAGCTCAACATGTTAAAAAGTCACCATTTTGAAAAACAATACCATCGTATTTCTAATTAAGTAAAGAATTTCTTAGTTATAAAATTTAATGCGAGAAC ACTTTATCTAAGACTTATAAAATTTGGTTGCCATAGATCTGTAAGTCACAGCCTTTTTAATCTTTCAGTGAGTTTAGAGAACAGCTTCCATTTTGATTTT TAGGATCTGGTATGCACTTAAGCAGTTGAATATTAGATGGATAATAAATAGATAGATGTATTAGGGTCTGGGATGTACTAATATCAATGCATCTTGGGAC ATGTCACAGAGCCACTCAACCTAAGAATTTTTCTACTAGACATGAATCACATGATAGTCACTACGTTTGTCATTTCCACTCATGTTTATTGTATGTTATT GGTTTTAACCCACTGCTTAAACATTTGTACTTGTATGTTGTCTTTTCTCACACTTCCTAAAATTTCTGGGTTTGTCATTGATCAAGCGTGCAGCAGATTT CAGTTTCACATGTTAGTTTGATGATGGAAAGATAGTTGATAAACATACTTTTTCGTATGATTTTTGTTAATAAGGTTTTTGCAATTTTGACAGGAAGATG ACTTTAAGCCAATTGGTAGAATGCCACACTCACACATACGTTCACATTCACACTCACACTCACACTCACACTCACAGGGAGGATATGGTGCTTACGATGC ATATATTTCTGCAACAACTAGATATGCAGCACTTGGTGCTCCTACTTTGTATGATCGTCCAGGCCCCATTTATGGAAGGAGTGAACCTGTTCGTGGAATG GGCAACAAGATTTTTGTTGGCCGCCTTCCCCAAGAGGCAACCAGTGATGATCTTCGTCATTATTTTGGAAGATTTGGCCGTATATTAGATGCATATATTC CCAGGGTAAGAAATGAAATAAACTTAATTTGAGTGTTGAAAGCTTACTCACCTGCTTGTTTTCATTTAGGATCCTAAGAGATCAGGTCATAGAGGTTTTG GTTTTGTTACTTTTGCTGAAGACGGTGTGGCGGATCGTGTGTCTCGAAGGTCTCACGAAATCTGTGGACATCAGGTACTTTAATATGATTTGCTGCTATC ATGCATCACCACCCCTGCTTGAGTAAAATATGGTTTTGTTTGAAAATGATGTTGAGATTTCAATCAGAGATATGATGTTGAGATTTCAACGGGAGATATA ATGGTTGAATCCATTTTGGTTTTGTTTGGAATGATGGTGGAAGTATTTAGGAGGGAAGCTCCTCCACACACCCTTTCCTGGTGTAGGTTTGAAATTTTTG GAATAACACCAGGATAGCAGCTCAACTAGTTGGCTCCTTCAACTATTTTTGGGAATGAGTCATAAAAAGTGTGGGTTTGAGGTTCTGTTACTACCACGGA ATAACTGACATTGCATCACAGTAGTAATACATTTCATACAACAGACTTGTACAGTAGACCTATTCGTTTCATGAAAGTGCAGATTCTATTTATTATGAAT GCATGTGTATATAATGTTTGCACGTTTGTGATTCTTAAGTATGAGTTACCATGCATACCCTGTATTATATAAATGAATGCTTGAATACAAGTATAACTAT GTATTCTGGATATGTATACCATTCAATTTCTTAGCAACTTGCACCTGCAGGTGGCAATTGATTCAGCTACACCTCTTGATGATGCTGGACCTGGGGCTGG ACCTAGACCTCCTGGTGGGAATTTTATGTTGAACAGCATGGATGCTTATGGGGGATTCGGTGGTCCTATGCGAACTTATGGGAGAATGTATGGCAGCCTG GACTTCGATGATGTGAGTATATCAACACATTAATGATCTTATAACTAAATCATGTAAAAAATGACAAATTGGGTAATTTGCCCCTTTCAATATTTCTGGA ATCTAGGCACTTAGTAAATGTTGATCCATGTCAGCTGATGGTGCGAGTGCAGCAGTATCTGTTGTATGAATTGCTTAAGTTTTGTATCATTCTGTAAATG TTGCGTGTTATGAAGCACCTATACAATATGTTGATACACATAAAAAAATATGGACATAAAATTCATAAAAATAATAAACATAAAATTGTTGTTAAGAAAT TCCAAATAAAGAACATATTTTTTAGAAATCACAAAATGCAAAATGAAAGTCATATTTTCATAAGAAACCATTGCTTAGTGTCCGTAAATAGGAATAATGT CGATTCTGTTTAATCCATGATTAACATTACTTGCATGCCTTTCCTCTTCCTTTCTATGCAATACACATGCTGTTTTTGTCTCTACCATTTAATTGATTGT GTTTTTTCTCCCTCTTAATCACCCTTGTATGATAGTTTTGGGTGTCTGGGGGGTATCAGAAAATATTTTATAAGTATCATAGAGTATCCGGAAAGTATGA GATTTATAATTTATTTATTTTTCAAAAAAATAATâBLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_32620; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_246839
| Blastp | TAR DNA-binding protein 43 from Homo with 36.73% of identity |
|---|---|
| Blastx | TAR DNA-binding protein 43 from Pongo with 36.73% of identity |
| Eggnog | TAR DNA binding protein(ENOG410ZYQJ) |
| Kegg | Link to kegg annotations (23435) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019446782.1) |
| Pfam | RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) (PF00076.21) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |