| Id Trinity | FTRINITY_DN53326_c1_g1_i24 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_244785 |
| Sequence | GGTATATATGACCATTCAGGTGTCTTACTTATAAAGTAAATCTAATTATAATTAAATATGAATGGTCACAATATAAGATACTGAGTGATGTATAAGCAAT AATAGTATCTGAATATTAGTGGGTGAAATGGCACGTCTTTAATATTATCTTAGCGGCAAGGATTGTGTGGCACATAACAGAAAACAAGGTCACTCACTTT TTTTCTTGGTTCTGTTTAATGTACCAGAACAGAATGGGTCTGAAAGTTGTGTCAACAAATGTAGGGTTTCAATTCTCATCTCCATGTTTTACTTCTCCTA AGCTCTTAAATCTACGCAAAGACAGTTTCATGTTACGGTCAACTCAAGTTGAACAAATTTCATTCACACAATCTGAAAACTCACTCATTGAAGCCCTTCT CGGTATTCAAGGACGTGGACGATCTTCTTCTCCTCAACAACTCAATGCTGTTGAGCGTGCTGTTCAAGTCCTCGAACGTTTAGGTGGTGTGCCTAATCCG ACAGACTCAAATTTAATCGAGGGTCGCTGGCAGCTAATTTTCACTACAAGACCAGGAACAGCATCCCCTATTCAGGTTGTGTGTTGGCTTTTTGGTGCTG GATGTCCTAATGAAACTTTGTTTTCAACCTTTTATTGACTTTTAGTTCTTATATTTTGGTCATTGCCTTAATTATATGTGATCTTTGAAAATTGCTCCTA GGGTTCATTTGTGAGTTGAATTTTCGATGGGAATGAATGGAAAGAGAAGACTTAAGAGTCGTATCATAAGTGTATTTCATGGCTCCCAAGTCTTTCATTT CCATTCATTCCCCTCTAAAACCCAACTCGCAAACGAATCCTAAATGATTATTAAAGTAGGTGCAAATCATCATGGAATCACCAAGCTCCCAAAGTTGATT CACATGTCATATTGTTGATACACTCTGCATAGAGAAATTATTGTATCTTCCTGTATCACAATAAACGTATGCTCCAAGATATATCTTTGCCGTTGATTTT AAAAAAACATAAAATTAAGCTCATTAATTTTAAATTTTTTTATAGGCATTCCCCTTTATCATGTTACAATTTCTCCTTGGGAGAATGTTGCCAAAGTTGA CAGTGATTTAAACCCACTGAAAAATAAAAGTTAAAGAGTGACTCGTTTTAAACAATTAATTTTTCAGGGATCTTTGTTAAAGTTTGTGTATTTTCATGTG TGTGAAGTTTGAAATATTGTGCATTTTCCAAAACTGAATTGTTCGAGACGCACCCAATAAGTTGTTTAATGATATGTCACAAGCTGGTATTCTATATTGC TCTTTCAGAGAACATTTGTCGGGGTTGACTTTTTTAGTGTATTTCAAGAGGTTTATCTTCGATCAAATGATCCACGAGTATGCAATATTGTGTCATTTTC TGATGCCATTGGTGAGCTCAAAGTGGAGGTATTAACTTTTTATAACCATTGAGACCATTTTAGATTAAGAGGCTTTGCCAGATAGTCAAAATATTGTTAG ATGAATTTTGCTGCATTGTATCCAAAGTGGTGTTTGGTTTGTTTTATGATTTCATGTTTGGTTGATATGTGTCCCCAAGAGGCAACTGATTTGATAGAGT AGTTTACATAAAGTGTGAGCACATGGGTTCATTTTTCCGTCTACCATTTCCAGTCAAAAGCTTCAAAGAATTATTTGGTTGATACATTTTCACTTATAGT TATAAAAATATCACTTTATTTACTTTTTTATTTATTTTATCTTCTGGATTTTGTCTTCCTTAATCTTGACAACAAGAAATAAAGTTGAAAACAAGATAGT GTTTTTGTAATTATAGGTTAAAATAGAAAAGAAGCCAAACATGTACCCTCTGGGTTTTTCTTTGTTCACAAATGATTTACTTGCTACGTGCTTCTAAAGA GTCAAAAGTTAATGTGCATATCTAGAAGAGTCAAGAGTTGATATGTATATCTTTGAGGATTTTTCTTTTGTTTATTTATGTCTAGCATAGTAGTTGAATT CTCATTTTTGTTAGTCCAAGGTTATATAGAGAATACAATATCATATTGTTGGACATATATTTTGTTCTATGTCTGTTCTTCTATTTATATTGAAAATTTG GTTTATGCAAGAATCTAGTTGTGTTTTGTTTGGTCCATGCACCTGACCCCACCTGGTGGAATAAAGCTTTATTGTTGATGACGTTCTTCTTCTATTAATT TATCAGGCAGCAGCATCAATTGAAGATGGAAAAAGAATCCTTTTTAGGTTTGACAGAGCTGCCTTTTCTTTCAAGTTTCTTCCATTTAAAGTTCCATATC CAGTCCCATTTAAGCTACTTGGAGATGAAGCAAAGGGTTGGTTAGACACCACATATTTGTCGCATTCGGGAAACCTTCGTATCTCGAGGGGAAATAAGGG AACTACATTTGTGTTGCAGAAGCAAACTGAACCTAGGCAGAGGTTACTGACAGCTGTTTCCTCGGGGAAAGGTGTTAAAGAGGCAATAGATGAGTTTATT TCCTCAAATCGGACCACGGGCGATGAAGATCCAGAACTAAAAGAGGGCGAGTGGGAGATGATATGGAATTCACAGACCACCACAGATAGTTGGATAGAGA ATGCGGCCAATGGTCTGATGGGCAAGCAGATTATCGGGAAGGGTGGGCGAATTAAATATTTGGTGGACATCTTGCTTGGGCTCAAGTTCTCTATGACAGG AAGTTTTGTGTAAGTTATCTCAGTGATGCCCTGAAAGAAGGCAGAGGAAGAAATGCATATATTGTCTATATGTTTATCCATTTTTTATACTCAAGTTCAA TCAACATTATTCTCATTCATTAGTTTGTGAATGAGCATTTAGGTTAGCAAGAGATTCTAGAAACTATTGGGAAGAGAGGATAACAAAATATGCATGACGA TGATGTATGGAGCGAGCTGGAGAATTTGATAGGAGCAGACTAAGAAAATAAACTCCTTCATTTAAAAATACTTCGAATAATGAAATTTATGTTCCTTTAT CTATAGACATCAAAAGGAAAACCACTTGAAATTTATGTTCCAAAACTGACAGGAAAACTGGCTCCAAAACATTTGACATTACAATGGATGATGCAGCAAT AATTGGTGGTCCATTTGGATATCCCGTAGAGTTGAAAAACAAGTTTAGCTTGGAGCTTCTATACAGTGATGAAAAGATTAGAATTACGAGGGGTTACAAT AAAATTCTTTTCGTACATACACGCACGGGGTGAACTAACTTACATGGGTTGTTTGAGAAGAATAGTTGAAATAGCAGTCTCAAGATTTGTGATCAATGTG TATAACGCGGAAGGTTATTTTTGTGGCTTCTATCACGTCTTTCTTAGTTAAATTACCTTTTCCCCCTATATCCAATTAAGCATGTTATTATTTTGAGTTT AATATAATATTTTTATACCATCATTGTCTTAAAAAAAACTGATGGTAAATATTAGATAAAATACGTACAGATATTTGGCACTTCAAAAAAAAAATCGACG TGCCGCAATTCACATGTCTTCAATGATAGGAGCCCAAATATCATCACAGAATGATATCCAAAAGAGACGTGGATAAGTCAGTGTTTCACTGTTAAATTTC TTTCTTAATTTCTCGGGTCCTAGTATTTGATTTTTCTGAGATTTTTATGTTGTGAAAGCTATATTGGTCTGCC BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_32745; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_244785
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Probable plastid-lipid-associated protein 12, chloroplastic from Arabidopsis with 71.51% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0002381) |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_006606582.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |