Id Trinity | FTRINITY_DN53326_c1_g1_i6 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_244757 |
Sequence | GGTATATATGACCATTCAGGTGTCTTACTTATAAAGTAAATCTAATTATAATTAAATATGAATGGTCACAATATAAGATACTGAGTGATGTATAAGCAAT AATAGTATCTGAATATTAGTGGGTGAAATGGCACGTCTTTAATATTATCTTAGCGGCAAGGATTGTGTGGCACATAACAGAAAACAAGGTCACTCACTTT TTTTCTTGGTTCTGTTTAATGTACCAGAACAGAATGGGTCTGAAAGTTGTGTCAACAAATGTAGGGTTTCAATTCTCATCTCCATGTTTTACTTCTCCTA AGCTCTTAAATCTACGCAAAGACAGTTTCATGTTACGGTCAACTCAAGTTGAACAAATTTCATTCACACAATCTGAAAACTCACTCATTGAAGCCCTTCT CGGTATTCAAGGACGTGGACGATCTTCTTCTCCTCAACAACTCAATGCTGTTGAGCGTGCTGTTCAAGTCCTCGAACGTTTAGGTGGTGTGCCTAATCCG ACAGACTCAAATTTAATCGAGGGTCGCTGGCAGCTAATTTTCACTACAAGACCAGGAACAGCATCCCCTATTCAGGTTGTGTGTTGGCTTTTTGGTGCTG GATGTCCTAATGAAACTTTGTTTTCAACCTTTTATTGACTTTTAGTTCTTATATTTTGGTCATTGCCTTAATTATATGTGATCTTTGAAAATTGCTCCTA GGGTTCATTTGTGAGTTGAATTTTCGATGGGAATGAATGGAAAGAGAAGACTTAAGAGTCGTATCATAAGTGTATTTCATGGCTCCCAAGTCTTTCATTT CCATTCATTCCCCTCTAAAACCCAACTCGCAAACGAATCCTAAATGATTATTAAAGTAGGTGCAAATCATCATGGAATCACCAAGCTCCCAAAGTTGATT CACATGTCATATTGTTGATACACTCTGCATAGAGAAATTATTGTATCTTCCTGTATCACAATAAACGTATGCTCCAAGATATATCTTTGCCGTTGATTTT AAAAAAACATAAAATTAAGCTCATTAATTTTAAATTTTTTTATAGGCATTCCCCTTTATCATGTTACAATTTCTCCTTGGGAGAATGTTGCCAAAGTTGA CAGTGATTTAAACCCACTGAAAAATAAAAGTTAAAGAGTGACTCGTTTTAAACAATTAATTTTTCAGGGATCTTTGTTAAAGTTTGTGTATTTTCATGTG TGTGAAGTTTGAAATATTGTGCATTTTCCAAAACTGAATTGTTCGAGACGCACCCAATAAGTTGTTTAATGATATGTCACAAGCTGGTATTCTATATTGC TCTTTCAGAGAACATTTGTCGGGGTTGACTTTTTTAGTGTATTTCAAGAGGTTTATCTTCGATCAAATGATCCACGAGTATGCAATATTGTGTCATTTTC TGATGCCATTGGTGAGCTCAAAGTGGAGGTATTAACTTTTTATAACCATTGAGACCATTTTAGATTAAGAGGCTTTGCCAGATAGTCAAAATATTGTTAG ATGAATTTTGCTGCATTGTATCCAAAGTGGTGTTTGGTTTGTTTTATGATTTCATGTTTGGTTGATATGTGTCCCCAAGAGGCAACTGATTTGATAGAGT AGTTTACATAAAGTGTGAGCACATGGGTTCATTTTTCCGTCTACCATTTCCAGTCAAAAGCTTCAAAGAATTATTTGGTTGATACATTTTCACTTATAGT TATAAAAATATCACTTTATTTACTTTTTTATTTATTTTATCTTCTGGATTTTGTCTTCCTTAATCTTGACAACAAGAAATAAAGTTGAAAACAAGATAGT GTTTTTGTAATTATAGGTTAAAATAGAAAAGAAGCCAAACATGTACCCTCTGGGTTTTTCTTTGTTCACAAATGATTTACTTGCTACGTGCTTCTAAAGA GTCAAAAGTTAATGTGCATATCTAGAAGAGTCAAGAGTTGATATGTATATCTTTGAGGATTTTTCTTTTGTTTATTTATGTCTAGCATAGTAGTTGAATT CTCATTTTTGTTAGTCCAAGGTTATATAGAGAATACAATATCATATTGTTGGACATATATTTTGTTCTATGTCTGTTCTTCTATTTATATTGAAAATTTG GTTTATGCAAGAATCTAGTTGTGTTTTGTTTGGTCCATGCACCTGACCCCACCTGGTGGAATAAAGCTTTATTGTTGATGACGTTCTTCTTCTATTAATT TATCAGGCAGCAGCATCAATTGAAGATGGAAAAAGAATCCTTTTTAGGTTTGACAGAGCTGCCTTTTCTTTCAAGTTTCTTCCATTTAAAGTTCCATATC CAGTCCCATTTAAGCTACTTGGAGATGAAGCAAAGGGTTGGTTAGACACCACATATTTGTCGCATTCGGGAAACCTTCGTATCTCGAGGGGAAATAAGGG AACTACATTTGTGTTGCAGAAGCAAACTGAACCTAGGCAGAGGTTACTGACAGCTGTTTCCTCGGGGAAAGGTGTTAAAGAGGCAATAGATGAGTTTATT TCCTCAAATCGGACCACGGGCGATGAAGATCCAGAACTAAAAGAGGGCGAGTGGGAGATGATATGGAATTCACAGACCACCACAGATAGTTGGATAGAGA ATGCGGCCAATGGTCTGATGGGCAAGCAGATTATCGGGAAGGGTGGGCGAATTAAATATTTGGTGGACATCTTGCTTGGGCTCAAGTTCTCTATGACAGG AAGTTTTGTGAAAACTGGCTCCAAAACATTTGACATTACAATGGATGATGCAGCAATAATTGGTGGTCCATTTGGATATCCCGTAGAGTTGAAAAACAAG TTTAGCTTGGAGCTTCTGTAAGATTATGTTCATTCTTAGTTCATGTCATGCTGTACATATGTATTGAATTTTCTGTTTAAATTGGTAGGTTTTACATGCT TATGTTTTTGTTCCCTTTCTTCTATCTACATCTTCACTAGTTGAGTTTTTCCTTTGCAGATACAGTGATGAAAAGATTAGAA BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_32745; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_244757
Blastp | - |
---|---|
Blastx | Probable plastid-lipid-associated protein 12, chloroplastic from Arabidopsis with 69.23% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0002381) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019428989.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | - |