Ll_transcript_244790

• Id Trinity: FTRINITY_DN53326_c1_g2_i7
• Name Transcript: Ll_transcript_244790
• Sequence: TTTTCCCATAATATTAACGTTTTTGCTCTGCTAAATTTCTTCGGTATGCAAATTGGTTAGGCTAAAACCCTCAAACCCTAGGTTCACAACACAAGTACCA CATCTTCACTTCACGCTGTGTTTTGTGTTGTCATCTTTTTTATGCACACAAGGTGTTTGAAGAAACGGGTAGTTGAAAGAACAGCATAATATTATTACTA GTCTCAGTGATTTTGTTTTTTCTGAGTTTGTAGTTATCTAATAAGTGGTATAGCATGGGCAAAGCATCAAGGGATAAAAGGGATATTTATTACCGGAAAG CAAAAGAAGAAGGTTGGCGTGCTCGTAGTGCCTTTAAATTGCTTCAGATAGATGAAGAATTCAACATTTTTGAAGGAGTGAAACGTGTTGTAGATTTATG TGCTGCCCCAGGTAGCTGGAGTCAGGTTTTGAGCCGTAAGTTGTATCTCCCAGCCAAGCTTGCACCTGATGAAAAGTAAGTTCACTTTCCTTGGGAGTTC TCTGTTGGTTAAGGATTCCTTGATGTTGAGGTCTCACATCTTGTAATGTATACTCTGGCTTTTTATTTTTTAAATACTTTTTACCTTATAATTTTATTCA ATTTTTTTATGTACTTTAGTTGGCGTATTTCTTATAAATAATATTAATATTTTAGAACATGTTTTAGGTTTTAGTATACTTTAATTTTTTATTATTCGTA TTTAGTAGTTTGTAAGTAAAATTGTGTCAATATCTTTGTCTGTGTGGTAAATGGAGGATAACAATTTCATGATATACACAACCCATGCTGTTATTTTGTA TGCCAGGACTTGGTAGTTGGGATTAAAATTAAGCTATATTTACTTCTAAGTTTTCTTTTTGGTTGTATGAAGTTATCTAAACATGTTTTACTCTAACGAT AATGAGCATTTATATGATTGGGTTGCCTTTGCTCTAGTGGAAACCGGGAGATTGCAAGTTTGCAACATGGAGGATAAGCAATACTGAAGTACTTTATATG TATCTTATATTTAATTTTCTTTTGTTTTGTAATACATTGTGTGTTTCTGTTTGAATGTTTTTATTTTATTTTATTAATATTTGTTTTTAAAATACTGGGT GCAGCACACTTTTAGGAGGTAATTTTCATTTTTTTCAAGATCAACGTCGCTAACCATGTATAAAACCATATAGCATATAGTTTTTAATAATTATGTTTTT CAATGACTGTTTTAGTAGAAGTAAAAGAAATTTGTTGGGTTAAAAGGAGGCAGACCATATCTGAGACTGTGAGGAGGATTATTTCTCTTCCAAAGTTGAA AAACAGGTCACATCAAAGAATACAGAATAAAAAATACAAAAAAATTGTCCTATCTTTATGCATATATGATATGACAACCTCGTCAAAACAGCTAGTATAG TATTCTATGCAGTGGATATGTCGTGTTTAGTGCTGTTCAAATGAGTGATAAAAGATGCAAAGAGTGAAGAAAGACATTGGACTCAACTCTAAATGTTTCT GTATAATGTGATGATACACAATCTGTAGTAAACATTAATCTAATACACCTATTGATACAAATGTTACACCTATTGATACTGATAAGACTCCTAGCATAAT AATTGATAATCCTAATATTCTAACGTCTCTGGTTGCTCATGTTCTGTTGTTTAATCATAGAACACACCTTCTCCTACTAATACATTTCAAAAATTTAGAA GGCTTTGTTAATGCATCTTGGTAACATTTATGTCTATAAGGTGGAAAAATAACCAACTCAGTGTTATTGACTATTGAAGGTGTTGTGTTTTATGTTTTTG AAACTTGAGGTAAATCAATTTGTCAGCCTGTCTCTATCAAAATCATAACTGTCTTGCTGCTTCATGATTTGCAGGGATGGAATTATTCCTCTTATTGTAG CTATTGATTTGCAGCCAATGGCTCCGATTGAAGGTGTTATTCAAGTTCAGGGTGATATAACTAATGCGCGAACTGCTGAAGTGGTATATAAAGCTATATT TCTTAATTCCTTTCACATACATCATTATATTATTTACATGATGGGTTGAGTATGTTTCACATTTCAGAAGAATTCGAAATGATAACAACTCTCTTGCTTA TCTAAATTTTTCCTAATATTTTATCAGGAGCTCATGTTTTTCTTGTGTCATTTCTGTTTCCTTTTATTATTTTATTTCTG
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_32746;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_244790

FPKM

• FPAB: 0.1
• FPNAB: 0
• LF1: 0.3
• LF2: 0.2
• LF3: 0.1
• LF4: 0
• UF1: 0
• UF2: 0.2
• UF3: 0
• UF4: 0

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_244790

• Blastp: -
• Blastx: Putative tRNA (cytidine(32)/guanosine(34)-2'-O)-methyltransferase from Dictyostelium with 82.43% of identity
• Eggnog: Specifically methylates the uridine in position 2552 of 23S rRNA at the 2'-O position of the ribose in the fully assembled 50S ribosomal subunit (By similarity)(COG0293)
• Kegg: Link to kegg annotations (DDB_G0280483)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019465097.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;