Ll_transcript_247171

• Id Trinity: FTRINITY_DN53336_c0_g2_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_247171
• Sequence: GAAAGAAATATGCAACAAGTATTTTAGAAATGGGCCAAGTCTAACCGAAGAAGATTGAGTGAGCGAAGAGGGTAGCCCAGCCCATTTGGGCCCATTTGGA AAGGTCAGAAACCCCGTTTTACCCTCCATCTGAAGCGGGATATACAACCCGACCACTAGGTAGGAATCTGTGTGAGGTGGAATAGAGAAGAAGAAGAGAA GAAAGTAAGAATCGGAGAGAAATGGGAACTCTAGGGAGAGTAATATACACCGTTGGATTCTGGATTCGTGAGACTGGCCAGGCCGTTGATCGTCTTGGTT CTCGCCTTCAGGGAAACTATTACTTCCAAGAGCAGTTGTCTAGGCATCGAACTCTGATGAACATATTTGATAAGGCTCCTTCTGTTGATAAGGATGCATT TGTTGCGCCGAGTGCCTCGGTCATTGGTGATGTTCACATTGGAAGAGGCTCATCAATTTGGTATGGATCTGTCTTGAGAGGTGATGTTAACAGCATTAGT GTTGGAAGTGGAACTAACATACAGGATAATTCCCTTGTTCATGTTGCAAAGTCAAATTTAAGTGGAAAGGTTTTGCCCACTATTATTGGGAATAATGTTA CTATAGGTCATAGTGCTGTTATACATGGTTGTACTGTTGATGATGAGGCATTTGTTGGTATGGGCGCAACGCTACTTGACGGTGTTGTTGTTGAGAAAAA TGCCATGGTGGCTGCTGGAGCACTTGTGAGACAGAATACAAGGATTCCAAGTGGTGAGGTAAGTTTGTGGTTGTGCTGTTTGTTTGGCCTATCCAATTAA TGAGATTTAGGATCCTGCTCATGTTTATCTGAGTATCTTTGGGATTACCTAGTAACTACTCCCTGCAATAAGGGACATGCTCTTAATGTTTTGTCTGACA AATTGACCAATCATGAACCAATAATTTAATGCATTTTTCATCCATTACCTAATAACAATTTATAGTATGCAATATCCAACCATTTTTATTTATTATCATG ATTCTGATTTGCAACAATTTTCTTTTATGATTTTTTACCATATTTTTGGGACACATGGAGTAATATTATTGTCATTGGGTTAGCATATTTCTAACGGTTA CTACTTACTGCTAATCCTGTTGAGGGAAAGATGGTAAAATCGCACCTAATATGATTTGGACATGTGAGTAAAAGACTCGTAGAAGTCCAGTTAGAATGGT TGATTAGATGGAGGAGATAGCCCCATAATTAAATGGAGAGGAAGAGCAAGAAAAACATATATTAGAGCCATTATAAAAAGATCTAGACCTAAATGGATTT TTGGAAGGTTTGGTTTCTTACAGGACATGTGACTTGGTTTGATCCATGCATACGATCCCATATAGTTGGAGGGATTTGCTTCTTGTTATTGGTTGTTGTA ATTTCTCATGAAATTTTAGGTTTTTCATTGTTACTTGGATCATTTATAATAATTATTGTGGAATAGAGATCTTATAATATGGATATGCCTTAAAAACATT CTCAAGAGTTGGTTTTTGTCAGTCTTTTATAATGCCTTCCATTGTGTTTTTTAATCTTATCCACCAGTCTTATGATATTTTGGTATCTAAGAGGTTTATG AAACATAAAGCCCTTATTCTTTCTTCAAGCTTTGTCACCTAATCTCAAGCCTGCTGCCAAGAGCACTTATGTTGTCCAAAAAAATGTGTTACTTACTGTG ATTGATTGGAAAAAAATTTAACTTCAAAATTTATTAATTAAATATTTTTTTGACCAACTACAACATGTAATACGCTTTTTGGGACAACAGATGTGCTCCG ATGGTGTCTGCCACTCTGGCAAAATTTTGTATCAGCACTATTACCCTATCACCATGGCGTGTACAAAAAAAACTACAAACCTAGTGTCTATTGTGCATTA TAACTTTGGTTCTAAACCTTATTTGGACTAGACTCTAATCCATAATACCAGACCACATTTATTTAACTGTTATACAGAAACCTTTAAATTGACTCAGGTT AGGTACTTTTGTAGTATTTGATGATGTTAACCTTTATGTTTGAGATTTAGACCCATTAAAAAAATGGTGTGGATTCTAGAGAGTAAACTTTAGAATCTGT AGATTGTAAAGCTGACGAGAAAATTAAGGGAGTGGATTCGCACATCCATGCTTTACCCTTTAGTTGCTTATACTTTATATAAAAAAAATTAACAGTTTAT TTTCTCATTAATGCATTTCACTGTCCCAAGTGTGCCACTTAATTTTGACTATCCAAACCCTATTGTGTATGTGATTTTAGTTCAAATGATAGTCTTTGTT CATAAAATATTTATCATCGGATGAAAACCTTTCCTTTGTCATGCTTTTATTGTTGCCTGGGCTAGATATTTAAGTTGTTGTGTATTAGTTAGGCTGCTTT TTTCAAATGTTTGCTATAATAATATTATAATCCATGATTTATAATCACAACCTTTTTTTATAGGCACAAGCTTTTACACATTTTGCAGGTCTGGGCAGGA AATCCAGCGAAGTTCCTGAGAAAGCTCACTGA
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_32844;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_247171

FPKM

• FPAB: 0.8
• FPNAB: 1.3
• LF1: 0.4
• LF2: 0.3
• LF3: 1.1
• LF4: 0.6
• UF1: 0.6
• UF2: 0.4
• UF3: 0.3
• UF4: 0.7

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_247171

• Blastp: Gamma carbonic anhydrase 1, mitochondrial from Arabidopsis with 87.78% of identity
• Blastx: Gamma carbonic anhydrase 1, mitochondrial from Arabidopsis with 87.78% of identity
• Eggnog: Transferase(COG0663)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G19580)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019416688.1)
• Pfam: Bacterial transferase hexapeptide (six repeats) (PF00132.23)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;