Ll_transcript_246551

• Id Trinity: FTRINITY_DN53345_c1_g2_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_246551
• Sequence: CTTATTAAGAAACAAAAACCCTGGCCATAGCTTCTTCCACCTTTCTCTTCTATTCTCTGTCTCGCCTCCTTCACTTGAAACGACACCGTTTACTCACTCA ACCATTCACCTTCGAACGAAGATGGCACATAAACCGGGTTCGGTTCATGATTTCGAAGCACTTCGAGAATTGTTGAAACCTCACATAGAATCCTTCAATT ACATGGTCGATCAAGGTTTTGCAAACCATGTTTCAACACATTGCTCCGGTTCAACTCATCGACCCTTTCACCAACACCAACCTTAGAAATATCCTTTTTT TTCTATCTACTTATTTGTTTTAAATTCATTTTTATAAGCTTCAAAAAATGCTCTTTTTTCTTCATTTTCATGAATTTCAGCTTGTTGATCTTATTTTAGC CCAGGTCGTGTTTTCGGGTAAATATCTTAAGTGCTTATTGAAAAAGTTTTTTTTTTGTTGAAATGGGCTAAAGAGAACTTATTTTCATAAGCTTGTAGTT AAAGTTATTGAGATAAGTTGAAAAGAGCTCAAGAGAGGTCTTTTTTTTCTTCATTATTCGTTTTAAACACTGAATTTCGGTTCAAGAGTGTTATTTCACT TGCACCAATTTTGTCCTGTATTTTTTATTTTTTAATAAGCTAAAAAGAGCTTTTTTTATATGCTTGTCTGATAAGCTTATCGAGATAAGCAAGAGCTTAA GACATGCAATAAGCTGTTTTCACAAGTTTATTTCAATTTAATCCATTTTTTTACTCGCACCAATATGAGTAATTGATCTTAGTTTTATCCAATATTTTAA CTTATGGTGCTTTTGCCTAACCAACTTAATTAAGTGATTATTCAATAATTTTTTTGAATCTTTATAAAAAACAGCTTATTATCACAAGCTTCTTTAATGA GCTTATTGAAGTAAGTTAAAATAGCTTATGCAGATTTTATAACCTATTCCCGTAAGTCCAAATAAGCTTAAGCTCATTAATAGTTTATGGTGTTTGATGA AAATAAAGATTAATGGCTGAAATTAGTTATAACAATCAAGCCTTAGTCACACTAGGTTGGGTCGACTATGGCTGAAACTAGTTATAAGTAAAAATTGGTT TATAGTGGTGCAAATGGATTCCTCATCATTGTAAATGGTAGTTAAATTTATTTGGGGTTGCTTACCTTTTTCATGTAATTGGTGTTTGTGCTTAACTTGC ATCTTACTTTGGTTGGATCATCCGGTGCTGTATGGGCCACAGAAGGAACGGAATTCAAAGCTGCGGAAGGATACCTTATTTCCATTTGAAGCAAGTTTCA AAATTTCATGCTATATTATGCAAAAGTTTATTTTTTGTGTCTTCACCGAGTGACTGACTCGGTGCATTTTTGTCTTCCAACAGTGTAGACAGGCAAAGAT TTCATATACAGGAAAGTTCACTGCAGATGTTTGCTTTCAGTATGGTGGCGGGGCTATTATAAGAGAAAATATTGATTTTGGGCAGTTTCCCATAATGCTA CAGGTTCGATCTACTGGAACAATTGATCAGGTAACCAGACAGCCAATAAAAGGACGAAAGCGTGGTGGTGGAATTCGATTTGGAGAAATGGAAGTGATTC TCTACTTGCTCATGGAGCAGCATATCCTTTGCATGATAGGTTGCATACCTGTTCTGATCATCACATTGCTGATGTATGTTCCCTATGCGGAAGCATGCTC AACACAACTTTTATCCAGCCACTAAAGTGGCCAGTGCGAGAGATTGGCAGGCTACCCCCAGGAAGAGCTCCGAAAAAGGTCACTTGCCATGCTTGCAGAA CAAGTAAGGGTATGGAGACGGTCGCCATGCCCTATGTATTTAGATATTTGGCAGCAGAGTTAGCAGCAATGAACATAAAAATGACTCTTAAGCTGAGTAA TGGAAGTGGAGCCTGATATGATTGAAAGTCTAGTCTCATTGGCTGTGACAACAAATGCTTAAGTTGATTGGATGTGCTAAGGTTATCATTTGCATACAAG AATTTGTTATGGAACTCAGATCCTTGCTCTCATCATGGGGACTTCAAATTTTCCCAGCCTTAATCTGAATTGTTGGCTGCTTTTAACTGAGCCTGATAGT TGGGCTAGAATTGAGGTTCTTCCATGTTGTCAATGTAGAAATTCATGGTTTTAAAAAGTAGGATGAGATTCCAGATTTTGATGTATCCTTGTAACTTTTG AAGGGGTAGATAGGTTTTAGCATATTGTGGTATGTATCATAAACCTTGAATTTTGGTGAACTCATCTTTATTGTTTGAGAAGTATGCATACTTCCCCTAT TATTTTTTTCATATGAAATTGAATATGATAAGTCTCCATCTAAGGTGTGCAAGACATTGAGTATGGTTGAAATTTTATATTTTTAGAATGATCAAG
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_32971;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_246551

FPKM

• FPAB: 0.2
• FPNAB: 0.3
• LF1: 0
• LF2: 0
• LF3: 0.3
• LF4: 0.2
• UF1: 0
• UF2: 0.4
• UF3: 0.4
• UF4: 0.2

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_246551

• Blastp: -
• Blastx: DNA-directed RNA polymerase I subunit 2 from Arabidopsis with 73.83% of identity
• Eggnog: DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates (By similarity)(COG0085)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G29940)
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0002751)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019449317.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;