Ll_transcript_128960

• Id Trinity: FTRINITY_DN53403_c0_g3_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_128960
• Sequence: GTGTGACAGCCACTCGTGCTCTTTAGTTTTATGTCTCTCTCATCATCTTATTGCTACTTCAACTTCTTATTATTCTTATACAATCCTTATTCCTTGTTTA TTCTTTGCCAAACTCTATGTATTCGTTCATAGACCAATGAAGCAGTGGAATTTTTAGTTTAATGCCACCTTCATCTATTGCTTATATTCACACTCTTCTT TTGATGTTTCAAATCTTTTAGATTTCATTTTACTACGTACAATGGCTTTCCTTAATCATCAAGTTTTCATCTTTTTATCATTATGAATCTGGGTTTTCTT TCTTAACCTCTCTCCACGTGTTTGCTACTATGGTTTCTGTGTCTAAACCCATGGCTTTCACTTTCACCTTGTTCTTGAACACTTCCTTTGTCATGTTGTT ATGTGTCTTTGTGAATTTTCACTTCTATTCTTCTGAAAATGATGGTGCTGTGAGAAACAACTACGTATTTTATGGCAGTAGTGGTGAACAAAATTGTAAG AGTTTACATAGTTTAAGTGATTATAAAGCTAAGTGCTTTTATGTGAAATCCAATGACCCTTGTGTCTCTGATGGCTATGTTAACTACTTATACTTGTTCT ATTGTAAATTTGGGGAATTCCCTCTATTGGGTCACACCCTTTTGTTTCTATGGCTCTTAGTTCTGTTCTATCTTTTGGCCAATACTGCTTCAGAATACTT TTGTCCTTCCCTTGAAAACTTGTCCAATTTGCTAAGGTTGTCTCCCACAATTGCTGGGGTTACTCTTCTCTCTCTTGGAAATGGTGCTACTGATGTTTTT TCCACCCTTGTCTCTTTCAATGGCAGTGGAACCAATGGTGTTGGCTTTAACACTGTTCTAGGGGGTGGTTCCTTTGTGTCCTGTGTTGTGGTTGGAATTG TTAGCATTTCAATTCGCCATCGGGGAATTCAGGTTAAGAAGTCTGCTTTCATAAGAGATGTTTGTTTTCTTCTCTTGGTTCTTATGTGCTTGTTCACAAT TCTGGTCAGTGGTGAGATCAATTTTCTTGGAGCAATTGGTTTTTGTCTGCTGTATGTTGTGTATGTGGTTGTTGTTTATGTCTCGCCGATGCAGTTGAAA GGTGTTCGTGGAGATGCTGAAATTGATGGTTATTCAAGTAATGGCAATGATTTTAGTGTGCCTCTTCTCATTGGGATGGAGAAAGGGATACTTGGTAGTG CCGAAAATGGAGCTCAAGAATGTAACATAAAAATCAATAAGAAATGCTGCTCTAAGAAACCTTCAATATGTGGAATGTTACTTCATGTCTTGGAAATGCC ACTTTACTTGCCTAGGAGATTGACAATTCCTGTTGTTTGCGAAGATAGATGGTCTAAGCCGTACGCGGTTGCTTCCGCTATGCTAGCACCAATTCTCTTG TCTTCATTGTGCATCCTAAACAAGGACAACACTTTCTCCACCTCAAACATTATAATTTACGGAATCGGCTTCTCGGTCGCAATTATATTAGGCATAGTTG CATTTTTCACGACCGAGATGTCAAGTCCACCGAAAAAATACTTGCTCCCTTGGCTAGCAGGTAGGTTTGTGATGAGTGTGTGCTGGAGCTACATATCAGC TAAGGAATTGGTTGCATTGTTGGTCTCACTTGGTTACATATTTGGGGTAAGTCCTTCAATATTGGGACTAACTGTTCTAGCATGGGGAAATTCACTTGGG GACTTAGTCACAAATTTAACAATGGCTCTAAATGGTGGACCAAAAGGTGCACAAATTGCAATATCAGGTTGTTATGCTGGACCTATATTCAATACAGTTA TTGGATTAGGCTTATCTCTTGTAATCTCAACTTGGTCACAATATCCATCACCTTTAGTGATTCCTAGAGATCCATATCTATGGGAGACATTAGCACTTTT TGTTGTTGGGTTATTTTGGGCACTTATGGTATTGATAAAAAGGGATATGAAGCTTGATGCAGTATTAGGAGGAGGGCTTTTAGTTATTTACTTCATTTCT CTGTTTCTGAGGTTGATTCAGACTCTTGGTACTCTTCAACTTCAGGATATGTTAACCTTAGTCTTCAAAAGTTGATGAGTTATAGAGAAAATTACACTGA TGATTAGGTAGGTGCAAATTTGTTAGGTCTAAAACTAATACTCCCACTTCTACCTGTACATGGTTTTCTTGGCTTAATACCATTTGTAAAACATGGAATT GCATAATTGTTTTGCTCAATTATTATGAAGTTGGTATTTTTTTTTTGGGTAGTACTAAGAGTATCCCTTTACCTAATGAAAAAAAAAACTAATTTCTTTC GGGATGTAACTAACCCTTTCAATAAGTATTGCTCTCAAGAATTGAACTCTTGACCTTTTGTTTGTTTTGTGGATTCAATGGAGCTTTACACTACACGATT AGACCGATTAGTTAATATTTAACTGATCAAAATTTTTAGTAGTGTTAATTGCTTAGTGCACATTAAACTGTTATGCGTGTATGTTATTAATCAATTGTTC CATTGCACATGTTGAATTTGGATGATTGATAAGTCTTGTAAATAGTGACATTGCACATCAAGGAAATGCCAAAAGTGCAATTATCACTACTGATACTGAG GTATTATTCTAGACCTATCAAAGGTGATGTAGTAGACTTAAAGACATAATAATAACCACATTTGTCACGTAGCTTGTAAGATGTGAAATTATTCTTTGAA CATTTGATGAGTTTTTGTTTTTGGGACAATAATTACATGATATGTGACACGAGGATGTGATTTATTTGAATAAGTGGTTTATTAATTTTTAG
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_33476;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_128960

FPKM

• FPAB: 3.5
• FPNAB: 4.4
• LF1: 8.2
• LF2: 13.8
• LF3: 9.7
• LF4: 4.9
• UF1: 7.7
• UF2: 12.6
• UF3: 8
• UF4: 7

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_128960

• Blastp: Cation/calcium exchanger 1 from Arabidopsis with 47.97% of identity
• Blastx: Cation/calcium exchanger 2 from Arabidopsis with 51.75% of identity
• Eggnog: exchanger(COG0530)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G17860)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019433121.1)
• Pfam: Sodium/calcium exchanger protein (PF01699.23)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;