Id Trinity | FTRINITY_DN53435_c0_g1_i16 |
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Name Transcript | Ll_transcript_127650 |
Sequence | CATGTTCAACACGACATTCCAGTTCTTATTTCTTCTCTTCTTTTTTGGTTCCACAACTCATTTTTACTCTCTCTCAACAACAACCACCATCGCCGCCGCC ACTACCGCTCCTCCTTGCTCCTCCTCGGCGTTTGAAACCTAACGGCCACACCCATCAACAGCAACTTCGTGAATTTATTAATTATTGCTGATGCTTCCGC TTCATTCTTTCACTGTTGTTACGAGTCTCATCATCCTCATTCTGGGTTAAGGTGCAAATGCAATTAGGGTTAGGAAGATGCAGTCAAAATATTCCAGGTA ATTAATTAACAACCTGTAGGACTCATTGCCCTTCCGTAAGGGAGTGGGAAACGCTACATCACCCTATATTTAGAACCACGTATTCATGCCCTAAGCGTTG CATGTGACCTTATCAGCTGTAATCTAATAAGTTGACCCCTCCAAACTACAAAACCCTTGTACTATAATTTTTTAACCAACCCACTTACGTGAAATTATTG TGTAAATTTTCTGTCTAGAAAAAAAATCATTTTCCCCTTTCTACTAATCAATTAAATTTCATCAAGTAATATAAAATATAACCTTTTTTTTTAAGACTTT TCTTTTTTATTTAAACAACACTTTCTAATTTGACCTGAGTTGAAATGAGATAATGAGACATGTGATCATATTCTTGATTCGGGACATATGAATATGTTTG AGACTTATGCTAATATAATTTCTGTTATGTCTCAATTTTTTCATAAATCTGAAAGAAGTACAAAAGAAACAGGGATGTTTATAATTCAACACTGTTGTTT GTACAATAATTTGTTTAAAAAGAGCTTAAGAAATTCTTTTCAAATAAATTTGTTAGCCACTTATGCTTCTTCTTGTGCTTTAAGACATCTAGTCCAAGAA TAGAAAAGTAATTGCTTCACTTTCTCAACTTGTTCTTAACCTCTTGTGTCTTATCACTTGACATGCCTTTCCATGTGAAAACATGCACCATACATATGAA TCTCTTTTGTTTGGGTCCATTGATTCAAAATTTGATTGTGATCCAAGAATAACGTAGCACCACCTTTGTTTTGGTGACATCATTGCTTATACTATATAGC TTGTGTTATGTGTCTCTTTCTTTTCTTTTTTGTATTTTATGTATGTCTACATAGTTTGTGTATAAAAATTATTCTGTGAATCTGTAGTCATCGATGGTGT GTACTGTGTATTAAAAGTTTAATTTATTGATGTCACAGAAAAGTCAAGAAAAATATATTAGGATGCAATATTTGATGATTTGTGTCTGTATTTTTTGTAT TTATTTTCTGAAACTATTATTCCAATTCATCTGTTAGGCCTTTGCCACCTGAACTCACATCCCCACGTTCCACTGATGCACTAGTGGCTTCTCAAGACAC AAAACAAGAACCTCGTAAAGATTTTCCAGTGTGGCTGGACTATGCTTCATGTATGGCTCAATTAGCTGTTTTTGGAATTTTTGGGGTCTTGACAAGATAT TTACTGCAAAAATTATTTGGCCCTGGGAATGCTGCTGTTACAAGCAACCATACTCTTCTTTATCTCGACCTTCCTTCTAATATGGTTGGTTCATTTCTTA TGGGATGGTTTGGTGTTGTATTCAAAGGAGATATCATAACCCATGTGTCAGAGCATATAGCCATAGCAATTACAACTGGTTACTTAGGGAGCCTTACAAC CTTCAGTGGTTGGAACCAAAAAATGCTGGAACTTGCTGTTTTGGGTCATTGGCTCTTTGCTGTACTTGGATTTTTTATAGGCATGCTTCTTGTTGCTTCT TCCATTGTCTTTGGAATTGAAACTGCCACAGGTTTCAGATATCTTCTCAATAAATTGAATATAAGTTCAGGAAATGCTAGCTCTAAGATCAAGTCCAAAT TGGACACCTATGCATGTCAGTTAGCAGTTATGGTATTTTTCTTGGTAATTTTGGCCATATTATGGGGAGTCAGCGGCGCATTTGTAAAATCCGAATTCAA GCATGGTGGTAGTGCTGCTCAGCTATGGTTTGCATGCTTGGTTGGTCCATTTGGTGTATGGATCAGATGGTTCTTAGCTCGGCTCAACGGACGAGGGTTA GGAAAGGCAGGGTTGTTAAAATGGATTCCATTTGGGACTCTAATTGCAAATGTATCAGCTGCTTGTGTTATGGCTGCACTTGCATGTTTGAAGGAAGCAG TAAGTTCTTTTGTCATCAATCATATTCATTTCAATCCTTCCATATTTAGCTGCATTGGCTAATATCTATAAGCTGGTAATCATATCAGAATTAGATTGAA GAGTAAGATTTACCACTATTGGGAAATTTGTTTTCTTTCAACTTCCCTAGAAATGAGGAATGATATTTACATAATAGCATACTTTTACTTCACAAAACCT CTCAGGACTCCGGGGTGAACTCATCTAAAACATTGAAAACAAGTTATAGTGGAATGAATGTGGGGATAATTATGTAAAAGTTCCACTTTCCTTTTTAGTT GCATTGGATTGTTTTTTCTTACTTCTTAGCTCTAAATGTGTTGATCATCCTATTTCGTTTCGGATAATGTGGATCATATATCCGTAATTCCTTATATAGA GATCAAAGTATTTATTTTTTGATGCAGGTTAACACTAGGGATTGTGATACTGTTGTAGCAGGAATACAGTTTGGTCTGATGGGGTGTTTAAGTACTGTCT CTACTTTTGTTGCTGAGTTTAATGCAATGAGAAAAGGCACTCATCCTTGGAGAGCTTATGCATATGCTATTATTACAATATGTGCCTCATTTTCTTTAGG AATCTTAATATATTGTGTTCCTGTTTGGACAAAAGGGTTTGATATTGATACTTAACAATTAGGAATAACAAACAGTCTTGCTTTCATACTTATGTTGACA AAGAAGTTTCAGGATGTTTTGGTTCTGACATTATTAAGGTTATTTGAGATCAAAAGAAGTCTCAAGAGAAAAAGGGTCAACAAAATTATATGAAGAATCT ATGGAGCTTCCTTTTGCTTAACTGCAAAATGTATATGCTGAAAACTTGCCAGTGAAGTTTCTAGAGTTGAAGTAGAGGCCTCGCTTAATGTCCAACAAGT GTAAGGGCTACGTGATTCACAAGGCTCCTCCATCTAGTTGAGTACGGGAGGGTAGAAGTACACAATCTCATTTATTTAGGCGAATAGGTTATTTTTAATG AGTCTCGCCCTCTAATGTCCTAGAAGTGTAATGGCAAAAAGTAACTAGTAAAAAATTATCCTGCGTTTATCTGCTTAAAGATGAAAAGCTGTTCTATTGC TTTTCTATGTACGAATTTATGTATGATGTTGCTGGAAATAAATATATGCAAGGTACAACAAAGGTTCGAAGAAAAGGAACAAAATAAGCACTATATTTAT AGTTTAA BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_33715; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_127650
Blastp | - |
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Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019433153.1) |
Pfam | CrcB-like protein, Camphor Resistance (CrcB) (PF02537.14) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |