Ll_transcript_182041

• Id Trinity: FTRINITY_DN53541_c1_g1_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_182041
• Sequence: AAAAAAGAGGTTGAATGAAGTAGAAGCCAAACACAAGTGAAAACCCTAATCGCAGAGAGAGTATTTTCTCTCTTTCTCATCACCGCAGAGGTAACACTCC TTTCTTCATTTCCTTCGATTCTCTTGTAATTTCTCCAATTTCACGTTCTAGATCTAGATTCTTCCATCGAATTACGTCTTTTCAATTCGCATACCTATCT ATTTGTTTTGTTTTTTTTTATATAATTGTAATTGGGTTTTATCCACTCGTTTTTATTTGTTTAATTCATCTTTTTTTTATTTGATTTGATTTGTTTATGT GTGTTGTTAGTAGTACTGCAGGAAAACGCATCTGAGTATTTGAGCTGGTTGATGCAAGAATTTGTAATTTTATTTGATACAAAAATTTCTGATTTTGAAG CACTTTGAGGGTCTCACAATTTTGGTTTTTTTTATGAGAGTGGTTTAAAAAATCTGAAGGAATATGAGTTGATCAATTTTGCATGGTTATTTGTGGTTCT TCGAATGATGATTTCATGGGTTTTAACCCAAAAAAGTTAAGTTTGGTCGATCCACTTCTTCTTGGTATTGATCTTTGCAATTGGTTGCTTTTGAATACAT GCTTTAAATTGATTCAATCAAAAGTTAAACTTATTCTGCAATACTTTGTAGTTAAAAAAAATCCCTGAAGTCTCATGTTTTTTCCTAGTGTTATTGCTGT GGAACAGTTTTTTAAATTGCACTCAGCAACCGTAATTGTGGTCACAATATTGCGGTTTTGGGATTCTCCGCAAGGGCATCCTGACCACAATTACGGCTGC AACAGCCACATTTTCCTGCAATTGCGGTAAACACAAAGTAACCGCAAGCACAACTGTAATTTAAAACAGCCGTGAAATTTCTGTTATTGTGGCACAGTAC TGATTACACAGTCCCTTTGATATTTCGGGGTGGGTGGTGATACTAATTGCAGATAGGTTAACCTTTTCTTTTTGTTGACGTTTTCAGTTTCCATAGAATT CTTTCTCGAAGCCAGAACACATTCACACCTTTGGCATTGAATGTTTTTCAACTAAGTGTTTGAAAAAGTTTTTTAAACGTTCAGAATGTTTTTTAACTGA GTGCACATACTTTTTGTAATAAGTATTTCATTTAAAGATGTTATGCTAAGTGTAATTGATAAGATTTTGGTGCTTGAATCTAAATTGCAATTGCATTAGA AGACGCGTTGTATAAATGCTAAATAAAAATAGCTACCTTTGATTATTTTTGGGACAGTTTCTTGGAGGTGTGGATTTGTATTTTTGTCGTGATGTATGAT TTTAAGTTTGCAAACTTGCTGTTGCGACATATCACAAACACACCTAAGCACATGAGAATGCTGATGATATATATGGAGCCGTTGCTTTTTTAATGTCCAT GCATAAACACATTAAAACGTTGCATGAAAAAATGATTGTTTATGCAAGAAAAAGTAAATTTACTTTGTATTTTTTCATCATATACGGAAGTTTTCACACA TTAGGAGCCATTTATGCAAATAAGTACTTCATTATTGGAGAGGTTATGGTTATATTCTACTGCTCTCTCTTGCATGTTTTAATCATTTTTTTTGTTCCTT ATGGGATCACTTTTATTTGTCAAATAGAATGCCATATTAGCTTGTGGGTATCACAAATATGATGCAATATGTAAGGCACAAATGATCAAGGTGTTATGTC TAATGCACTGGTATATCTGAACATTATTCAAGACCAGGCTTCCTTTTATCATCAACAATGGCTGATGGTCAAGAATCAGACAAGAACATCGAGATATGGA AAATCAAGAAATTGATCAAAGCATTGGAATCTGCTAGAGGTAATGGTACCAGCATGATTTCTCTGATAATGCCTCCCCGTGATCAAGTATCTCGGGTCAC TAAGATGTTGGGAGATGAATTTGGAACTGCTTCAAATATCAAGAGTAGGGTGAACAGGCAGTCAGTGTTGGGAGCCATTACTTCTGCACAGCAGAGGTTG AAGCTATATAATAAGGTCCCTCCAAATGGATTAGTTCTTTACACTGGAACCATTGTCACTGACGATGGTAAGGAAAAGAAGGTTACAATTGATTTTGAAC CTTTCAAGCCTATCAATGCATCACTCTACCTCTGTGATAACAAGTTTCACACAGAAGCTCTGAATGAACTTTTGGAATCTGATGACAAGTTTGGTTTCAT TGTTATGGATGGAAATGGCACCCTCTTTGGGACTTTGAGTGGAAACACCCGTGAAGTGCTTCATAAATTTACTGTTGACCTGCCAAAGAAGCACGGTAGA GGAGGTCAGTCAGCTTTGCGTTTTGCTCGTCTTCGGATGGAAAAGAGGCACAACTATGTTAGAAAGACTGCAGAACTTGCTACACAGTTTTACATCAATC CTGCTACTAGTCAGCCTAACGTTTCTGGACTCATACTTGCTGGTTCAGCTGATTTCAAGACTGAACTTAGTCAGTCAGATATGTTTGATCCTCGCTTGCA GGCAAAGATATTGAATGTAGTAGATGTTTCTTATGGTGGGGAAAATGGATTTAACCAGGCTATTGAGTTATCTGCAGAAATTTTATCAAACGTGAAGTTC ATTCAAGAGAAACGTTTGATAGGGAAGTATTTTGAAGAGATAAGCCAGGATACTGGGAAATATGTCTTTGGGATTGATGACACGTTGAAGGCTCTGGATA TGGGTGCTGTGGAGATACTTATTGTGTGGGAAAATTTGGATATTAATAGGTATGTGCTGAAAAATAGTGCCACTGCTGAGATAGTCATAAAGCATTTGAA CAAGGAACAAGAGGCTGATCAAAGCAATTTCCGAGATCCAGCGACCAATGCAGAGTTGGAGGTGCAGGAGAAACTACCCTTGCTTGAGTGGTTTGCCAAT GAGTACAAACGATTTGGATGCACTCTGGAATTTGTGACAAACAAGTCTCAAGAAGGATCGCAATTTTGCAGAGGGTTTGGTGGCATTGGTGGTATCCTTC GCTACCAGCTTGACATCAGATCATTCGATGAGCTATCTGACGAGGAAGTGTATGAAGATTCTGATTGAAGTGTCTTTCACCGTGGAACCATTACTTGGCT TTCGATGATTGGATGGTAGCTCTGTTGCTCCTATGATTAAGACTTCCAAAGTTCACCTGGATTTTATGGTACCTAAGACTTTGCCATTTGGTTTTTGATC CATCAGATATGCTGTACTGTTCAGTTTTCATTAACTATGCTTTATACATTTAATTTTTCATTGTTCAATGTAAGTTAATGGCACTGGCAACTCTACTAGA TTGTGGTTGATTCCTCAAGAAAGAGCAGCTAGACATTTCTCATGACTCAATTTAAAGATATGAATGTTTTAAAGACTTTTGATATATTGATGTTGGTGGT ATTTGTTTGTTATGCTCGTTCTTTGTTACATGAAAGTGGCCTAGCACAGTCCTGCT
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_34615;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_182041

FPKM

• FPAB: 0.7
• FPNAB: 0.1
• LF1: 0.2
• LF2: 0.3
• LF3: 0
• LF4: 0.1
• UF1: 0.1
• UF2: 0.2
• UF3: 0.2
• UF4: 0.1

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_182041

• Blastp: Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1-3 from Arabidopsis with 92.89% of identity
• Blastx: Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1-3 from Arabidopsis with 92.91% of identity
• Eggnog: Peptide Chain Release Factor(COG1503)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT3G26618)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019442901.1)
• Pfam: eRF1 domain 1 (PF03463.14)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;